Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000473796
- Subject:
- XR_941575.2
- Aligned Length:
- 2583
- Identities:
- 1922
- Gaps:
- 654
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 GGAGCTCGGCAGGGTGGGGGAAAGGGATGGAGTTTCGGCCTGGGGCGGCGGGGGCGGCCCAGAAAAGGCCTAGC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GTCCTGGGCTGTGTGGGTGTAGCGTCCAGGGCGCGTCGGTCTCTATGGCAACGCTCCACACGCGGAGGTCGGGT 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 ACGGTTATCTGTGGCCACAAAGAAAGTTATTTGTCTCTGTCTTGGCAAGGCTGGGAGGAAAGTTTTAGCTAAGA 222
Query 1 --------------------ATGGATAAGTACGATGTGATTAAGGCCATCGGGCAAGGTGCCTTCGGGAAAGCA 54
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AACTCAGCCCATTGGAGACCATGGATAAGTACGATGTGATTAAGGCCATCGGGCAAGGTGCCTTCGGGAAAGCA 296
Query 55 TACTTAGCTAAAGGGAAATCAGATAGCAAGCACTGTGTCATAAAAGAGATCAATTTTGAAAAGATGCCCATACA 128
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TACTTAGCTAAAGGGAAATCAGATAGCAAGCACTGTGTCATAAAAGAGATCAATTTTGAAAAGATGCCCATACA 370
Query 129 AGAAAAAGAAGCTTCAAAGAAAGAAGTGATTCTTCTGGAAAAGATGAAACATCCCAACATTGTAGCCTTCTTCA 202
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGAAAAAGAAGCTTCAAAGAAAGAAGTGATTCTTCTGGAAAAGATGAAACATCCCAACATTGTAGCCTTCTTCA 444
Query 203 ATTCATTTCAAGAGAATGGCAGGCTGTTTATTGTAATGGAATATTGTGATGGAGGGGATCTCATGAAAAGGATC 276
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ATTCATTTCAAGAGAATGGCAGGCTGTTTATTGTAATGGAATATTGTGATGGAGGGGATCTCATGAAAAGGATC 518
Query 277 AATAGACAACGGGGTGTGTTATTTAGTGAAGATCAGATCCTCGGTTGGTTTGTACAGATTTCTCTAGGACTAAA 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AATAGACAACGGGGTGTGTTATTTAGTGAAGATCAGATCCTCGGTTGGTTTGTACAGATTTCTCTAGGACTAAA 592
Query 351 ACATATTCATGACAGGAAGATATTACACAGGGACATAAAAGCTCAGAACATTTTTCTTAGCAAGAACGGAATGG 424
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACATATTCATGACAGGAAGATATTACACAGGGACATAAAAGCTCAGAACATTTTTCTTAGCAAGAACGGAATGG 666
Query 425 TGGCAAAGCTTGGGGACTTTGGTATAGCAAGAGTCCTGAATAATTCCATGGAACTTGCTCGAACTTGTATTGGA 498
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TGGCAAAGCTTGGGGACTTTGGTATAGCAAGAGTCCTGAATAATTCCATGGAACTTGCTCGAACTTGTATTGGA 740
Query 499 ACACCTTACTACCTGTCCCCAGAGATCTGTCAGAATAAACCCTACAACAATAAAACGGATATTTGGTCTCTTGG 572
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ACACCTTACTACCTGTCCCCAGAGATCTGTCAGAATAAACCCTACAACAATAAAACGGATATTTGGTCTCTTGG 814
Query 573 CTGTGTCTTATATGAGCTCTGCACACTTAAACATCCTTTTGAGGGTAACAACTTACAGCAGCTGGTTCTGAAGA 646
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CTGTGTCTTATATGAGCTCTGCACACTTAAACATCCTTTTGAGGGTAACAACTTACAGCAGCTGGTTCTGAAGA 888
Query 647 TTTGTCAAGCACATTTTGCCCCAATATCTCCGGGGTTTTCTCGTGAGCTCCATTCCTTGATATCTCAGCTCTTT 720
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TTTGTCAAGCACATTTTGCCCCAATATCTCCGGGGTTTTCTCGTGAGCTCCATTCCTTGATATCTCAGCTCTTT 962
Query 721 CAAGTATCT-CTCGAGACCGA-CAT-CATAAATTCCATTTTGAAA--GCCC-TTTTAGAGAATCTTATTCCC-A 787
||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |
Sbjct 963 CAAGTATCTCCTCGAGACCGACCATCCATAAATTCCATTTTGAAAAGGCCCTTTTTAGAGAATCTTATTCCCAA 1036
Query 788 ATATTTGACTCCTGGAGGTCATTCAGGAGGAATTCAGTCACATGCTTATATGCAGAGCAGGAGCGCCAGCTTCT 861
||||||||||||| ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ATATTTGACTCCT-GAGGTCATTCAGGAAGAATTCAGTCACATGCTTATATGCAGAGCAGGAGCGCCAGCTTCT 1109
Query 862 CGACATGCTGGGAAGGTGGTCCAGAAGTGTAAAATACAAAAAGTGAGATTCCAGGGAAAGTGCCCACCAAGATC 935
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110 CGACATGCTGGGAAGGTGGTCCAGAAGTGTAAAATACAAAAAGTGAGATTCCAGGGAAAGTGCCCACCAAGATC 1183
Query 936 AAGGATATCTGTGCCAATTAAAAGGAATGCTATATTGCATAGAAATGAATGGAGACCACCAGCTGGAGCCCAGA 1009
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184 AAGGATATCTGTGCCAATTAAAAGGAATGCTATATTGCATAGAAATGAATGGAGACCACCAGCTGGAGCCCAGA 1257
Query 1010 AGGCCAGATCTATAAAAATGATAGAAAGACCCAAAATTGCTGCTGTCTGTGGACATTATGATTATTATTATGCT 1083
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 AGGCCAGATCTATAAAAATGATAGAAAGACCCAAAATTGCTGCTGTCTGTGGACATTATGATTATTATTATGCT 1331
Query 1084 CAACTTGATATGCTGAGGAGGAGAGCCCACAAACCAAGTTATCACCCTATTCCTCAAGAAAATACTGGAGTTGA 1157
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332 CAACTTGATATGCTGAGGAGGAGAGCCCACAAACCAAGTTATCACCCTATTCCTCAAGAAAATACTGGAGTTGA 1405
Query 1158 GGATTACGGTCAGGAAACGAGGCATGGTCCATCCCCAAGTCAATGGCCTGCTGAGTACCTTCAGAGAAAATTTG 1231
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406 GGATTACGGTCAGGAAACGAGGCATGGTCCATCCCCAAGTCAATGGCCTGCTGAGTACCTTCAGAGAAAATTTG 1479
Query 1232 AAGGTCCACAATATAAGTTTGAAAGTGGAGAAGCAATTGGGTCTTCGTCCATCTCTTGCCGAGCCAAATTACAA 1305
|||.||.|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||
Sbjct 1480 AAGCTCAACAATATAAG-TTGAAAGTGGAGAAGCAATTGGGTCTTCGTCCATCTTCTGCCGAGCCAAATTACAA 1552
Query 1306 CCAAGAGACAAGAGCTAGNAAGTAATGGAGAAGAGCCTAGATTCCAGGAGCTGCCATTTAGGAAAAACGAAATG 1379
|| ||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1553 CC-AGAGACAAGAGCTAAGAAGTAATGGAGAAGAGCCTAGATTCCAGGAGCTGCCATTTAGGAAAAACGAAATG 1625
Query 1380 AAGGAACAGGAATATTGGAAGCAGTTAGAGGAAATACGCCAACAGTACCACAATGACATGAAAGAAATTAGAAA 1453
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626 AAGGAACAGGAATATTGGAAGCAGTTAGAGGAAATACGCCAACAGTACCACAATGACATGAAAGAAATTAGAAA 1699
Query 1454 GAAGATGGGGAGAGAACCAGAGGAGAACTCAAAAATAAGTCATAAAACCTATTTGGTGAAGAAGAGTAACCTGC 1527
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1700 GAAGATGGGGAGAGAACCAGAGGAGAACTCAAAAATAAGTCATAAAACCTATTTGGTGAAGAAGAGTAACCTGC 1773
Query 1528 CTGTCCATCAAGATGCATCTGAGGGAGAAGCACCTGTGCAGGACATTGAAAAAGACTTGAAACAAATGAGGCTT 1601
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1774 CTGTCCATCAAGATGCATCTGAGGGAGAAGCACCTGTGCAGGACATTGAAAAAGACTTGAAACAAATGAGGCTT 1847
Query 1602 CAGAACACAAAGGAAAGTAAAAATCCAGAACAGAAATATAAAGCTAAGAAGGGGGTAAAATTTGAAATTAATTT 1675
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1848 CAGAACACAAAGGAAAGTAAAAATCCAGAACAGAAATATAAAGCTAAGAAGGGGGTAAAATTTGAAATTAATTT 1921
Query 1676 AGACAAATGTATTTCTGATGAAAACATCCTCCAAGAGGAAGAGGCAATGGATATACCAAATGAAACTTTGACCT 1749
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1922 AGACAAATGTATTTCTGATGAAAACATCCTCCAAGAGGAAGAGGCAATGGATATACCAAATGAAACTTTGACCT 1995
Query 1750 TTGAGGATGGCATGAAGTTTAAGGAATATGAATGTGTAAAGGAGCATGGAGATTATACAGACAAAGCATTTGAA 1823
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1996 TTGAGGATGGCATGAAGTTTAAGGAATATGAATGTGTAAAGGAGCATGGAGATTATACAGACAAAGCATTTGAA 2069
Query 1824 AAACTTCACTGCCCAGAAGC------------------------------------------------------ 1843
||||||||||||||||||||
Sbjct 2070 AAACTTCACTGCCCAGAAGCAGCATTTACAGAACTGACTTGGCTCAGTTTCCTCTTCCTGGAATACTCTCTGCC 2143
Query 1844 -------------------------------------------------------------------------- 1843
Sbjct 2144 TCATTTCCTTCTGGAAAAATCTCCATTCAGCAGGCATCTTATTGAGGATCTCCTTTGTGCCAAAGACTGCTCAC 2217
Query 1844 -------------------------------------------------------------------------- 1843
Sbjct 2218 TGAAGGACTGGAGTGAGAAGGAAATGGAGCTTAGGACATAACCCTACCACTATATAAACAAACTTTGGAGAATC 2291
Query 1844 -------------------------------------------------------------------------- 1843
Sbjct 2292 AGGAGAGAGTAAAGCCAAAGGAGGAGAGACAGGTCATGGAGGAGGCACAGGAATTGGCAGCATCAACTGGAAGA 2365
Query 1844 -------------AGGGTTTTCCACGCAGACTGTAGCTGCTGTGGGAAACAGGAGGCAGTGGGATGGAGGAGCG 1904
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2366 GAAAGGCCAGATGAGGGTTTTCCACGCAGACTGTAGCTGCTGTGGGAAACAGGAGGCAGTGGGATGGAGGAGCG 2439
Query 1905 CCTCAGACTCTGCTGCAGATGATGGCAGTGGCCGACATCACCTCCACCTGCCCCACGGGGCCTGACAGTGAGTC 1978
||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2440 CCTCAGACTCTGCTGCAGATGATGGCAG---------------------------------------------- 2467
Query 1979 TGTGCTTAGCGTCAGTCGTCAGGAAGGGAAGACCAAGGACCCGTACAGCCCAGTGCTCATCCTGATG 2045
Sbjct 2468 ------------------------------------------------------------------- 2467