Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000473808
• Subject: XM_011526843.1
• Aligned Length: 2316
• Identities: 1886
• Gaps: 426

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAAGCAGCACTTGCTGGAGATTGACCACCGGCAGCAGCAGCAGCACACAAATGACAAGAAGCGGAGTGGCCA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CCCCAGGCAGGATACGTATGTGTCCACACCTAGTGAGATTCACTCCCTGAGCCCTGGAGAGCAAACAGAGGATG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  ATCTGGAGGAAGAGTGTGAGCCAGAAGAGATGCTGAAGACACCATCCAAAGATAGCTTGGATCCAGATCCTCGT  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  TGCCTGCTAACCAACGGCAAGCTGCCACTGTGGGCAAAGCGGCTGCTAGGGGACGATGATGTGGCAGATGGCTT  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  GGCCTTCCACGCCAAGCGCAGCTACCAGCCCCACGGCCGCTGGGCAGAGCGGGCCGGCCAAGAGCCCCTCAAGA  370

Query    1  -----------------------------------------ATGAAGCCCGAGAGTCTGGAGAACTCCATTCTG  33
                                                     |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCATCCTGGATGCCCAGGACCTGGATTGCTACTTTACCCCCATGAAGCCCGAGAGTCTGGAGAACTCCATTCTG  444

Query   34  GATTCACTGGAGCCACAGAGCCTGGCCAGCCTGCTGAGTGAGTCAGAGAGTCCCCAGGAAGCTGGCCGCGGGCA  107
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GATTCACTGGAGCCACAGAGCCTGGCCAGCCTGCTGAGTGAGTCAGAGAGTCCCCAGGAAGCTGGCCGCGGGCA  518

Query  108  CCCCTCCTTCCTGCCCCAGCAGAAGGAATCATCTGAGGCCAGTGAGCTCATCCTCTACTCTCTGGAGGCAGAAG  181
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCCCTCCTTCCTGCCCCAGCAGAAGGAATCATCTGAGGCCAGTGAGCTCATCCTCTACTCTCTGGAGGCAGAAG  592

Query  182  TGACAGTCACAGGGACAGACAGCCAGTATTGCAGGAAGGAGGTGGAGGCCGGGCCTGGAGACCAGCAGGGCGAC  255
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGACAGTCACAGGGACAGACAGCCAGTATTGCAGGAAGGAGGTGGAGGCCGGGCCTGGAGACCAGCAGGGCGAC  666

Query  256  TCCTACCTCAGGGTGTCCTCCGACAGCCCAAAGGACCAGAGCCCGCCTGAGGACTCGGGGGAGTCAGAGGCCGA  329
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCCTACCTCAGGGTGTCCTCCGACAGCCCAAAGGACCAGAGCCCGCCTGAGGACTCGGGGGAGTCAGAGGCCGA  740

Query  330  CCTGGAGTGCAGCTTCGCAGCCATCCACTCCCCAGCTCCGCCTCCTGACCCTGCCCCTCGGTTTGCCACGTCGC  403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCTGGAGTGCAGCTTCGCAGCCATCCACTCCCCAGCTCCGCCTCCTGACCCTGCCCCTCGGTTTGCCACGTCGC  814

Query  404  TGCCCCATTTCCCAGGATGCGCAGGTCCCACAGAAGATGAGCTGTCCCTGCCCGAGGGACCCAGCGTCCCCAGC  477
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGCCCCATTTCCCAGGATGCGCAGGTCCCACAGAAGATGAGCTGTCCCTGCCCGAGGGACCCAGCGTCCCCAGC  888

Query  478  AGCTCCCTACCCCAGACTCCGGAGCAGGAGAAGTTCCTCCGCCACCACTTTGAGACACTGACTGAGTCCCCCTG  551
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGCTCCCTACCCCAGACTCCGGAGCAGGAGAAGTTCCTCCGCCACCACTTTGAGACACTGACTGAGTCCCCCTG  962

Query  552  CAG---------------AGCTCTGGGAGACGTGGAGGCCTCTGAAGCTGAAGACCACTTCTTCAACCCACGCC  610
            |||               ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAGAGAGCTCTTCCCCGCAGCTCTGGGAGACGTGGAGGCCTCTGAAGCTGAAGACCACTTCTTCAACCCACGCC  1036

Query  611  TGAGTATCTCCACGCAGTTCCTCTCAAGCCTCCAGAAGGCATCCAGGTTCACCCATACCTTCCCTCCCCGGGCA  684
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGAGTATCTCCACGCAGTTCCTCTCAAGCCTCCAGAAGGCATCCAGGTTCACCCATACCTTCCCTCCCCGGGCA  1110

Query  685  ACCCAGTGCCTTGTGAAGTCTCCAGAGGTCAAGCTCATGGACCGAGGCGGAAGCCAGCCCAGAGCAGGTACTGG  758
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACCCAGTGCCTTGTGAAGTCTCCAGAGGTCAAGCTCATGGACCGAGGCGGAAGCCAGCCCAGAGCAGGTACTGG  1184

Query  759  CTACGCCTCCCCAGACAGGACCCACGTCCTTGCTGCAGGGAAGGCTGAAGAGACCCTGGAGGCCTGGCGCCCAC  832
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTACGCCTCCCCAGACAGGACCCACGTCCTCGCTGCAGGGAAGGCTGAAGAGACCCTGGAGGCCTGGCGCCCAC  1258

Query  833  CACCTCCCTGCCTTACGAGCCTGGCGTCCTGTGTCCCTGCTTCCTCCGTGCTGCCCACAGACAGGAATCTCCCA  906
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CACCTCCCTGCCTTACGAGCCTGGCGTCCTGTGTCCCTGCTTCCTCCGTGCTGCCCACAGACAGGAATCTCCCA  1332

Query  907  ACGCCCACATCTGCACCCACCCCAGGCCTGGCTCAGGGTGTCCATGCCCCCTCCACCTGTTCCTACATGGAGGC  980
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ACGCCCACATCTGCACCCACCCCAGGCCTGGCTCAGGGTGTCCATGCCCCCTCCACCTGTTCCTACATGGAGGC  1406

Query  981  CACTGCCAGCTCCCGTGCCAGGATATCACGCAGCATCTCCCTCGGTGACAGTGAGGGCCCTATCGTGGCCACAC  1054
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CACTGCCAGCTCCCGTGCCAGGATATCACGCAGCATCTCCCTCGGTGACAGTGAGGGCCCTATCGTGGCCACAC  1480

Query 1055  TGGCCCAGCCCCTCCGTAGGCCATCGTCCGTTGGGGAGCTGGCCTCCTTGGGCCAGGAGCTTCAGGCCATCACC  1128
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGGCCCAGCCCCTCCGTAGGCCATCGTCCGTTGGGGAGCTGGCCTCCTTGGGCCAGGAGCTTCAGGCCATCACC  1554

Query 1129  ACCGCGACAACACCCAGTTTGGACAGTGAGGGCCAAGAGCCTGCCCTGCGTTCCTGGGGCAACCACGAGGCCCG  1202
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ACCGCGACAACACCCAGTTTGGACAGTGAGGGCCAAGAGCCTGCCCTGCGTTCCTGGGGCAACCACGAGGCCCG  1628

Query 1203  GGCCAACCTGAGACTGACCCTGTCAAGTGCCTGTGATGGGCTCCTGCTGCCCCCCGTGGATACCCAGCCTGGCG  1276
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GGCCAACCTGAGACTGACCCTGTCAAGTGCCTGTGATGGGCTCCTGCAGCCCCCCGTGGATACCCAGCCTGGCG  1702

Query 1277  TCACCGTCCCTGCAGTGAGCTTCCCAGCCCCTAGCCCTGTGGAAGAGAGCGCCCTGAGGCTCCACGGCTCTGCC  1350
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TCACCGTCCCTGCAGTGAGCTTCCCAGCCCCTAGCCCTGTGGAAGAGAGCGCCCTGAGGCTCCACGGCTCTGCC  1776

Query 1351  TTTCGCCCAAGTCTCCCAGCTCCTGAGTCCCCTGGCCTTCCTGCCCACCCCAGTAACCCCCAGCTTCCAGAGGC  1424
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TTTCGCCCAAGTCTCCCAGCTCCTGAGTCCCCTGGCCTTCCTGCCCACCCCAGTAACCCCCAGCTTCCAGAGGC  1850

Query 1425  CCGGCCTGGCATCCCTGGCAGCACTGCCTCCCTCCTGGAGCCCACCTCCGGTGCACTTGGTCTGTTCCAGGGCA  1498
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1851  CCGGCCTGGCATCCCTGGCGGCACTGCCTCCCTCCTGGAGCCCACCTCCGGTGCACTTGGTCTGTTACAGGGCA  1924

Query 1499  GCCCTGCCCGCTGGAGTGAGCCCTGGGTGCCGGTTGAAGCCCTGCCCCCATCTCCCCTTGAGCTGAGCAGGGTG  1572
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GCCCTGCCCGCTGGAGTGAGCCCTGGGTGCCGGTTGAAGCCCTGCCCCCATCTCCCCTTGAGCTGAGCAGGGTG  1998

Query 1573  GGGAACATCTTGCACAGGCTGCAGACCACCTTCCAAGAAGCCCTCGACCTTTACCGTGTGTTGGTCTCCAGTGG  1646
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GGGAACATCTTGCACAGGCTGCAGACCACCTTCCAAGAAGCCCTCGACCTTTACCGTGTGTTGGTCTCCAGTGG  2072

Query 1647  CCAGGTGGACACCGGGCAGCAGCAGGCACGGACTGAGCTGGTCTCCACCTTCCTGTGGATCCACAGCCAGCTGG  1720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CCAGGTGGACACCGGGCAGCAGCAGGCACGGACTGAGCTGGTCTCCACCTTCCTGTGGATCCACAGCCAGCTGG  2146

Query 1721  AGGCTGAATGCCTGGTGGGGACTAGTGTGGCCCCAGCCCAGGCTCTGCCCAGCCCAGGACCCCCGTCCCCACCG  1794
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  AGGCTGAATGCCTGGTGGGGACTAGTGTGGCCCCAGCCCAGGCTCTGCCCAGCCCAGGACCCCCGTCCCCACCG  2220

Query 1795  ACGCTGTACCCCCTGGCCAGCCCAGACCTGCAGGCCCTGCTGGAACACTACTCGGAGCTGCTGGTGCAGGCCGT  1868
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  ACGCTGTACCCCCTGGCCAGCCCAGACCTGCAGGCCCTGCTGGAACACTACTCGGAGCTGCTGGTGCAGGCCGT  2294

Query 1869  GCGGAGGAAGGCACGGGGGCAC  1890
            ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GCGGAGGAAGGCACGGGGGCAC  2316