Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000473823
• Subject: NM_001331120.1
• Aligned Length: 963
• Identities: 828
• Gaps: 6

Alignment

Query   1  ATGGCCATGGCAACCAAAGGAGGTACTGTCAAAGCTGCTTCAGGATTCAATGCCATGGAAGATGCCCAGACCCT  74
                 ||||.|.||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|..|||||||||||||||||
Sbjct   1  ------ATGGAAGCCAAAGGAGGAACCGTGAAAGCTGCTTCAGGATTCAACGCAACTGAAGATGCCCAGACCCT  68

Query  75  GAGGAAGGCCATGAAAGGGCTCGGCACCGATGAAGACGCCATTATTAGCGTCCTTGCCTACCGCAACACCGCCC  148
           ||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||..|..||.|.||||||.|.||||||||||
Sbjct  69  GAGGAAGGCCATGAAAGGCCTCGGTACTGATGAAGATGCCATTATCGGAATCTTAGCCTACAGAAACACCGCCC  142

Query 149  AGCGCCAGGAGATCAGGACAGCCTACAAGAGCACCATCGGCAGGGACTTGATAGACGACCTGAAGTCAGAACTG  222
           ||||||||||||||||||..|||||||||||||||||.|||||||||.||||.||.|||.|||||||.||.|||
Sbjct 143  AGCGCCAGGAGATCAGGAGTGCCTACAAGAGCACCATTGGCAGGGACCTGATTGAGGACTTGAAGTCGGAGCTG  216

Query 223  AGTGGCAACTTCGAGCAGGTGATTGTGGGGATGATGACGCCCACGGTGCTGTATGACGTGCAAGAGCTGCGAAG  296
           ||..|||||||.|||||||||||..|||||.|||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct 217  AGCAGCAACTTTGAGCAGGTGATCCTGGGGCTGATGACACCCACAGTGCTGTATGACGTACAGGAGCTGCGGAG  290

Query 297  GGCCATGAAGGGAGCCGGCACTGATGAGGGCTGCCTAATTGAGATCCTGGCCTCCCGGACCCCTGAGGAGATCC  370
           |||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 291  GGCCATGAAGGGAGCTGGCACGGACGAGGGCTGTCTGATTGAGATCCTGGCCTCTCGTACCCCTGAGGAGATCC  364

Query 371  GGCGCATAAGCCAAACCTACCAGCAGCAATATGGACGGAGCCTTGAAGATGACATTCGCTCTGACACATCGTTC  444
           |.||.||.|.|||.||.||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||..|||||||||||||.|||
Sbjct 365  GTCGAATCAACCAGACATACCAGCAGCAATATGGAAGGAGCCTTGAAGAGGACATCTGCTCTGACACATCCTTC  438

Query 445  ATGTTCCAGCGAGTGCTGGTGTCTCTGTCAGCTGGTGGGAGGGATGAAGGAAATTATCTGGACGATGCTCTCGT  518
           ||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|.|||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||..|
Sbjct 439  ATGTTCCAGCGAGTACTGGTGTCCCTGTCGGCGGCTGGCAGGGATGAAGGAAATTACCTTGATGATGCTCTTAT  512

Query 519  GAGACAGGATGCCCAGGACCTGTATGAGGCTGGAGAGAAGAAATGGGGGACAGATGAGGTGAAATTTCTAACTG  592
           ||..|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||.||||...
Sbjct 513  GAAGCAGGACGCCCAGGAACTGTATGAGGCTGGAGAGAAGAGATGGGGGACAGACGAGGTGAAATTCCTAAGCA  586

Query 593  TTCTCTGTTCCCGGAACCGAAATCACCTGTTGCATGTGTTTGATGAATACAAAAGGATATCACAGAAGGATATT  666
           |||||||||||||||||||.||.||.|||.|.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||
Sbjct 587  TTCTCTGTTCCCGGAACCGGAACCATCTGCTCCACGTGTTTGATGAATACAAAAGAATCTCACAGAAGGACATT  660

Query 667  GAACAGAGTATTAAATCTGAAACATCTGGTAGCTTTGAAGATGCTCTGCTGGCTATAGTAAAGTGCATGAGGAA  740
           ||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||.||||||||||.|||||||||.|||.
Sbjct 661  GAACAGAGCATTAAGTCTGAGACATCTGGAAGCTTTGAAGATGCCCTGTTGGCTATAGTGAAGTGCATGCGGAG  734

Query 741  CAAATCTGCATATTTTGCTGAAAAGCTCTATAAATCGATGAAGGGCTTGGGCACCGATGATAACACCCTCATCA  814
           .|||.||.|||||||.|||||.|..||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 735  TAAACCTTCATATTTCGCTGAGAGACTTTATAAATCCATGAAGGGCTTAGGCACTGATGACAACACCCTCATCA  808

Query 815  GAGTGATGGTTTCTCGAGCAGAAATTGACATGTTGGATATCCGGGCACACTTCAAGAGACTCTATGGAAAGTCT  888
           ||||||||||.||..|||||||.|||||||||.||||.||||||||...|||||||||.|||||.||.||||||
Sbjct 809  GAGTGATGGTCTCAAGAGCAGAGATTGACATGCTGGACATCCGGGCGAGCTTCAAGAGGCTCTACGGGAAGTCT  882

Query 889  CTGTACTCGTTCATCAAGGGTGACACATCTGGAGACTACAGGAAAGTACTGCTTGTTCTCTGTGGAGGAGATGA  962
           .|||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 883  TTGTACTCTTTCATCAAGGGTGACACTTCCGGAGACTACAGGAAGGTTCTGCTCGTTCTCTGTGGAGGAGATGA  956

Query 963  T  963
           |
Sbjct 957  T  957