Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000473948
• Subject: XM_017010311.2
• Aligned Length: 1853
• Identities: 1493
• Gaps: 349

Alignment

Query    1  ATGGTACCTGTTGAAAACACCGAGGGCCCCAGTCTGCTGAACCAGAAGGGGACAGCCGTGGAGACGGAGGGCAG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTACCTGTTGAAAACACCGAGGGCCCCAGTCTGCTGAACCAGAAGGGGACAGCCGTGGAGACGGAGGGCAG  74

Query   75  CGGCAGCCGGCATCCTCCCTGGGCGAGAGGCTGCGGCATGTTTACCTTCCTGTCATCTGTCACTGCTGCTGTCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGGCAGCCGGCATCCTCCCTGGGCGAGAGGCTGCGGCATGTTTACCTTCCTGTCATCTGTCACTGCTGCTGTCA  148

Query  149  GTGGCCTCCTGGTGGGTTATGAACTTGGGATCATCTCTGGGGCTCTTCTTCAGATCAAAACCTTATTAGCCCTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTGGCCTCCTGGTGGGTTATGAACTTGGGATCATCTCTGGGGCTCTTCTTCAGATCAAAACCTTATTAGCCCTG  222

Query  223  AGCTGCCATGAGCAGGAAATGGTTGTGAGCTCCCTCGTCATTGGAGCCCTCCTTGCCTCACTCACCGGAGGGGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGCTGCCATGAGCAGGAAATGGTTGTGAGCTCCCTCGTCATTGGAGCCCTCCTTGCCTCACTCACCGGAGGGGT  296

Query  297  CCTGATAGACAGATATGGAAGAAGGACAGCAATCATCTTGTCATCCTGCCTGCTTGGACTCGGAAGCTTAGTCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCTGATAGACAGATATGGAAGAAGGACAGCAATCATCTTGTCATCCTGCCTGCTTGGACTCGGAAGCTTAGTCT  370

Query  371  TGATCCTCAGTTTATCCTACACGGTTCTTATAGTGGGACGCATTGCCATAGGGGTCTCCATCTCCCTCTCTTCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGATCCTCAGTTTATCCTACACGGTTCTTATAGTGGGACGCATTGCCATAGGGGTCTCCATCTCCCTCTCTTCC  444

Query  445  ATTGCCACTTGTGTTTACATCGCAGAGATTGCTCCTCAACACAGAAGAGGCCTTCTTGTGTCACTGAATGAGCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATTGCCACTTGTGTTTACATCGCAGAGATTGCTCCTCAACACAGAAGAGGCCTTCTTGTGTCACTGAATGAGCT  518

Query  519  GATGATTGTCATCGGCATTCTTTCTGCCTATATTTCAAATTACGCATTTGCCAATGTTTTCCATGGCTGGAAGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GATGATTGTCATCGGCATTCTTTCTGCCTATATTTCAAATTACGCATTTGCCAATGTTTTCCATGGCTGGAAGT  592

Query  593  ACATGTTTGGTCTTGTGATTCCCTTGGGAGTTTTGCAAGCAATTGCAATGTATTTTCTTCCTCCAAGCCCTCGG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACATGTTTGGTCTTGTGATTCCCTTGGGAGTTTTGCAAGCAATTGCAATGTATTTTCTTCCTCCAAGCCCTCGG  666

Query  667  TTTCTGGTGATGAAAGGACAAGAGGGAGCTGCTAGCAAGGTTCTTGGAAGGTTAAGAGCACTCTCAGATACAAC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTTCTGGTGATGAAAGGACAAGAGGGAGCTGCTAGCAAGGTTCTTGGAAGGTTAAGAGCACTCTCAGATACAAC  740

Query  741  TGAGGAACTCACTGTGATCAAATCCTCCCTGAAAGATGAATATCAGTACAGTTTTTGGGATCTGTTTCGTTCAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGAGGAACTCACTGTGATCAAATCCTCCCTGAAAGATGAATATCAGTACAGTTTTTGGGATCTGTTTCGTTCAA  814

Query  815  AAGACAACATGCGGACCCGAATAATGATAGGACTAACACTAGTATTTTTTGTACAAATCACTGGCCAACCAAAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAGACAACATGCGGACCCGAATAATGATAGGACTAACACTAGTATTTTTTGTACAAATCACTGGCCAACCAAAC  888

Query  889  ATATTGTTCTATGCATCAACTGTTTTGAAGTCAGTTGGATTTCAAAGCAATGAGGCAGCTAGCCTCGCCTCCAC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATATTGTTCTATGCATCAACTGTTTTGAAGTCAGTTGGATTTCAAAGCAATGAGGCAGCTAGCCTCGCCTCCAC  962

Query  963  TGGGGTTGGAGTCGTCAAGGTCATTAGCACCATCCCTGCCACTCTTCTTGTAGACCATGTTGGCAGCAAAACAT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  963  TGGGGTTGGAGTCGTCAAGGTCATTAGCACCATCCCTGCCACTCTTCTTGTAGACCATGTCGGCAGCAAAACAT  1036

Query 1037  TCCTCTGCATTGGCTCCTCTGTGATGGCAGCTTCGTTGGTGACCATGGGCATCGTAAATCTCAACATCCACATG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCCTCTGCATTGGCTCCTCTGTGATGGCAGCTTCGTTGGTGACCATGGGCATCGTAAATCTCAACATCCACATG  1110

Query 1111  AACTTCACCCATATCTGCAGAAGCCACAATTCTATCAACCAGTCCTTGGATGAGTCTGTGATTTATGGACCAGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AACTTCACCCATATCTGCAGAAGCCACAATTCTATCAACCAGTCCTTGGATGAGTCTGTGATTTATGGACCAGG  1184

Query 1185  AAACCTGTCAACCAACAACAATACTCTCAGAGACCACTTCAAAGGGATTTCTTCCCATAGCAGAAGCTCACTCA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AAACCTGTCAACCAACAACAATACTCTCAGAGACCACTTCAAAGGGATTTCTTCCCATAGCAGAAGCTCACTCA  1258

Query 1259  TGCCCCTGAGAAATGATGTGGATAAGAGAGGGGAGACGACCTCAGCATCCTTGCTAAATGCTGGATTAAGCCAC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGCCCCTGAGAAATGATGTGGATAAGAGAGGGGAGACGACCTCAGCATCCTTGCTAAATGCTGGATTAAGCCAC  1332

Query 1333  ACTGAATACCAGATAGTCACAGACCCTGGGGACGTCCCAGCTTTTTTGAAATGGCTGTCCTTAGCCAGCTTGCT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ACTGAATACCAGATAGTCACAGACCCTGGGGACGTCCCAGCTTTTTTGAAATGGCTGTCCTTAGCCAGCTTGCT  1406

Query 1407  TGTTTATGTTGCTGCTTTTTCAATTGGTCTAGGACCAATGCCCTGGCTGGTGCT--CAGCGAGATCTTTCCTGG  1478
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||..|  .|||   |||||||    
Sbjct 1407  TGTTTATGTTGCTGCTTTTTCAATTGGTCTAGGACCAA-----------GTATTGAAAGC---ATCTTTC----  1462

Query 1479  TGGGATCAGAGGACGAGCCATGGCTTTAACTTCTAGCATGAACTGGGGCATCAATCTCCTCATCTCGCTGACAT  1552
                  |||||                |||.||.||     |.|||                      |||.||
Sbjct 1463  ------CAGAG----------------AACATCAAG-----ATTGG----------------------TGAGAT  1487

Query 1553  TTTTGACTGTAACTGATCTTATTGGCCTGCCATGGGTGTGCTTTATATATACAATCATGAGTCTAGCATCCCTG  1626
            |     |||..|||| |||                   |||||.                              
Sbjct 1488  T-----CTGGCACTG-TCT-------------------TGCTTC------------------------------  1506

Query 1627  CTTTTTGTTGTTATGTTTATACCTGAGACAAAGGGATGCTCTTTGGAACAAATATCAATGGAGCTAGCAAAAGT  1700
                                                                                      
Sbjct 1507  --------------------------------------------------------------------------  1506

Query 1701  GAACTATGTGAAAAACAACATTTGTTTTATGAGTCATCACCAAGAAGAATTAGTGCCAAAACAGCCTCAAAAAA  1774
                                                                                      
Sbjct 1507  --------------------------------------------------------------------------  1506

Query 1775  GAAAACCCCAGGAGCAGCTCTTGGAGTGTAACAAGCTGTGTGGTAGGGGCCAATCCAGGCAGCTTTCTCCAGAG  1848
                                                                                      
Sbjct 1507  --------------------------------------------------------------------------  1506

Query 1849  ACC  1851
               
Sbjct 1507  ---  1506