Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000473994
• Subject: XM_006509969.3
• Aligned Length: 891
• Identities: 660
• Gaps: 150

Alignment

Query   1  ATGTCCTCTGCTCACTTCAACCGAGGCCCTGCCTACGGGCTGTCAGCCGAGGTTAAGAACAAGCTGGCCCAGAA  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  GTATGACCACCAGCGGGAGCAGGAGCTGAGAGAGTGGATCGAGGGGGTGACAGGCCGTCGCATCGGCAACAACT  148
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 149  TCATGGACGGCCTCAAAGATGGCATCATTCTTTGCGAATTCATCAATAAGCTGCAGCCAGGCTCCGTGAAGAAG  222
             |||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||||||
Sbjct   1  --ATGGATGGCCTCAAAGACGGGATCATTCTTTGCGAATTTATCAACAAGCTGCAGCCGGGTTCTGTGAAGAAG  72

Query 223  ATCAATGAGTCAACCCAAAATTGGCACCAGCTGGAGAACATCGGCAACTTCATCAAGGCCATCACCAAGTATGG  296
           .|||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  73  GTCAATGAGTCAACTCAGAACTGGCACCAGCTGGAGAACATAGGTAATTTCATCAAAGCCATTACCAAGTATGG  146

Query 297  GGTGAAGCCCCACGACATTTTTGAGGCCAACGACCTGTTTGAGAACACCAACCATACACAGGTGCAGTCCACCC  370
           ||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|
Sbjct 147  GGTGAAACCCCACGACATCTTTGAGGCCAACGACCTGTTTGAAAACACCAACCATACACAAGTTCAGTCCACTC  220

Query 371  TCCTGGCTTTGGCCAGCATGGCGAAGACGAAAGGAAACAAGGTGAACGTGGGAGTGAAGTACGCAGAGAAGCAG  444
           ||||||||.|||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.||.
Sbjct 221  TCCTGGCTCTGGCCAGCATGGCCAAGACAAAAGGAAACAAAGTCAATGTGGGAGTCAAGTATGCAGAGAAACAA  294

Query 445  GAGCGGAAATTCGAGCCGGGGAAGCTAAGAGAAGGGCGGAACATCATTGGGCTGCAGATGGGCACCAACAAGTT  518
           |||||||.|||.|||||||.||||.|.||||||||..|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 295  GAGCGGAGATTTGAGCCGGAGAAGTTGAGAGAAGGCAGGAACATCATTGGACTGCAGATGGGCACCAACAAGTT  368

Query 519  TGCCAGCCAGCAGGGCATGACGGCCTATGGCACCCGGCGCCACCTCTACGACCCCAAGCTGGGCACAGACCAGC  592
           ||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||||
Sbjct 369  TGCCAGTCAGCAGGGCATGACGGCCTACGGTACACGGCGTCACCTCTATGATCCCAAACTGGGTACAGATCAGC  442

Query 593  CTCTGGACCAGGCGACCATCAGCCTGCAGATGGGCACCAACAAAGGAGCCAGCCAGGCTGGCATGACTGCGCCA  666
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 443  CTCTGGACCAGGCGACCATCAGCCTGCAGATGGGCACCAACAAGGGTGCCAGCCAGGCTGGCATGACTGCACCA  516

Query 667  GGGACCAAGCGGCAGATCTTCGAGCCGGGGCTGGGCATGGAGCACTGCGACACGCTCAATGTCAGCCTGCAGAT  740
           ||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||.|||||||
Sbjct 517  GGCACCAAGCGGCAGATCTTTGAGCCAGGTCTGGGCATGGAACACTGCGACACACTCAACGTCAGCTTGCAGAT  590

Query 741  GGGCAGCAACAAGGGCGCCTCGCAGCGGGGCATGACGGTGTATGGGCTGCCACGCCAGGTCTACGACCCCAAGT  814
           |||||||||||||||.|||||.|||.||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 591  GGGCAGCAACAAGGGGGCCTCCCAGAGGGGCATGACAGTGTATGGGCTTCCTCGCCAGGTGTACGATCCCAAGT  664

Query 815  ACTGTCTGACTCCCGAGTACCCAGAGCTGGGTGAGCCCGCCCACAACCACCACGCACACAACTACTACAATTCC  888
           ||||.||||..||.|||||||||||||||.||||||||.|||||||.||||||.|.||||||||||||||.||.
Sbjct 665  ACTGCCTGAACCCGGAGTACCCAGAGCTGAGTGAGCCCACCCACAATCACCACCCGCACAACTACTACAACTCT  738

Query 889  GCC  891
           |||
Sbjct 739  GCC  741