Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000474088
Subject:
XM_017015791.2
Aligned Length:
969
Identities:
872
Gaps:
78

Alignment

Query   1  ATGGATTCGAAATACCAGTGTGTGAAGCTGAATGATGGTCACTTCATGCCTGTCCTGGGATTTGGCACCTATGC  74
           ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGATTCGAAATATCAGTGTGTGAAGCTGAATGATGGTCACTTCATGCCTGTCCTGGGATTTGGCACCTATGC  74

Query  75  GCCTGCAGAGGTTCCTAAAAGTAAAGCTCTAGAGGCCGTCAAATTGGCAATAGAAGCCGGGTTCCACCATATTG  148
           ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||..||||||||||||.|||||.||.||||.||||||||
Sbjct  75  GCCTGCAGAGGTTCCTAAAAGTAAAGCTTTAGAGGCCACCAAATTGGCAATTGAAGCTGGCTTCCGCCATATTG  148

Query 149  ATTCTGCACATGTTTACAATAATGAGGAGCAGGTTGGACTGGCCATCCGAAGCAAGATTGCAGATGGCAGTGTG  222
           |||||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  ATTCTGCTCATTTATACAATAATGAGGAGCAGGTTGGACTGGCCATCCGAAGCAAGATTGCAGATGGCAGTGTG  222

Query 223  AAGAGAGAAGACATATTCTACACTTCAAAGCTTTGGAGCAATTCCCATCGACCAGAGTTGGTCCGACCAGCCTT  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  AAGAGAGAAGACATATTCTACACTTCAAAGCTTTGGTGCAATTCCCATCGACCAGAGTTGGTCCGACCAGCCTT  296

Query 297  GGAAAGGTCACTGAAAAATCTTCAATTGGACTATGTTGACCTCTATCTTATTCATTTTCCAGTGTCTGTAAAGC  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||   
Sbjct 297  GGAAAGGTCACTGAAAAATCTTCAATTGGATTATGTTGACCTCTACCTTATTCATTTTCCAGTGTCTGTAA---  367

Query 371  CAGGTGAGGAAGTGATCCCAAAAGATGAAAATGGAAAAATACTATTTGACACAGTGGATCTCTGTGCCACATGG  444
                                                                                     
Sbjct 368  --------------------------------------------------------------------------  367

Query 445  GAGGCCATGGAGAAGTGTAAAGATGCAGGATTGGCCAAGTCCATCGGGGTGTCCAACTTCAACCACAGGCTGCT  518
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 368  -AGGCCGTGGAGAAGTGTAAAGATGCAGGATTGGCCAAGTCCATCGGGGTGTCCAACTTCAACCGCAGGCAGCT  440

Query 519  GGAGATGATCCTCAACAAGCCAGGGCTCAAGTACAAGCCTGTCTGCAACCAGGTGGAATGTCATCCTTACTTCA  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 441  GGAGATGATCCTCAACAAGCCAGGGCTCAAGTACAAGCCTGTCTGCAACCAGGTGGAATGTCATCCTTACTTCA  514

Query 593  ACCAGAGAAAACTGCTGGATTTCTGCAAGTCAAAAGACATTGTTCTGGTTGCCTATAGTGCTCTGGGATCCCAT  666
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 515  ACCAGAGAAAACTGCTGGATTTCTGCAAGTCAAAAGACATTGTTCTGGTTGCCTATAGTGCTCTGGGATCCCAC  588

Query 667  CGAGAAGAACCATGGGTGGACCCGAACTCCCCGGTGCTCTTGGAGGACCCAGTCCTTTGTGCCTTGGCAAAAAA  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 589  CGAGAAGAACCATGGGTGGACCCGAACTCCCCGGTGCTCTTGGAGGACCCAGTCCTTTGTGCCTTGGCAAAAAA  662

Query 741  GCACAAGCGAACCCCAGCCCTGATTGCCCTGCGCTACCAGCTGCAGCGTGGGGTTGTGGTCCTGGCCAAGAGCT  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 663  GCACAAGCGAACCCCAGCCCTGATTGCCCTGCGCTACCAGCTACAGCGTGGGGTTGTGGTCCTGGCCAAGAGCT  736

Query 815  ACAATGAGCAGCGCATCAGACAGAACGTGCAGGTGTTTGAATTCCAGTTGACTTCAGAGGAGATGAAAGCCATA  888
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 737  ACAATGAGCAGCGCATCAGACAGAACGTGCAGGTGTTTGAATTCCAGTTGACTTCAGAGGAGATGAAAGCCATA  810

Query 889  GATGGCCTAAACAGAAATGTGCGATATTTGACCCTTGATATTTTTGCTGGCCCCCCTAATTATCCATTTTCTGA  962
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 811  GATGGCCTAAACAGAAATGTGCGATATTTGACCCTTGATATTTTTGCTGGCCCCCCTAATTATCCATTTTCTGA  884

Query 963  TGAATAT  969
           |||||||
Sbjct 885  TGAATAT  891