Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000474102
• Subject: XM_011510020.2
• Aligned Length: 1726
• Identities: 1685
• Gaps: 29

Alignment

Query    1  ATGTTG----CTCTTATTC---AGTGTAATCC----TAATCTCATGGGTAT--------CCACTGTTGGGGGAG  55
            |||.||    ||.|.|..|   ||.| ||.||    .|||.|    |||.|        ||| |||    |.||
Sbjct    1  ATGGTGAAGCCTTTGAGACAGAAGAG-AAACCAGGAGAATGT----GGTGTTCCATAGACCA-TGT----GAAG  64

Query   56  AAGGAACACTTTGTGATTTTCCAAAAATACACCATGGATTTCTGTATGATGAAGAAGATTATAACCCTTTTTCC  129
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   65  CAGGAACACTTTGTGATTTTCCAAAAATACACCATGGATTTCTGTATGATGAAGAAGATTATAACCCTTTTTCC  138

Query  130  CAAGTTCCTACAGGGGAAGTTTTCTATTACTCCTGTGAATATAATTTTGTGTCTCCTTCAAAATCCTTTTGGAC  203
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  139  CAAGTTCCTACAGGGGAAGTTTTCTATTACTCCTGTGAATATAATTTTGTGTCTCCTTCAAAATCCTTTTGGAC  212

Query  204  TCGCATAACATGCACAGAAGAAGGATGGTCACCAACACCGAAGTGTCTCAGAATGTGTTCCTTTCCTTTTGTGA  277
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  213  TCGCATAACATGCACAGAAGAAGGATGGTCACCAACACCGAAGTGTCTCAGAATGTGTTCCTTTCCTTTTGTGA  286

Query  278  AAAATGGTCATTCTGAATCTTCAGGACTAATACATCTGGAAGGTGATACTGTACAAATTATTTGCAACACAGGA  351
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  287  AAAATGGTCATTCTGAATCTTCAGGACTAATACATCTGGAAGGTGATACTGTACAAATTATTTGCAACACAGGA  360

Query  352  TACAGCCTTCAAAACAATGAGAAAAACATTTCGTGTGTAGAACGGGGCTGGTCCACTCCTCCCATATGCAGCTT  425
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  TACAGCCTTCAAAACAATGAGAAAAACATTTCGTGTGTAGAACGGGGCTGGTCCACTCCTCCCATATGCAGCTT  434

Query  426  CACTAAAGGAGAATGTCATGTTCCAATTTTAGAAGCCAATGTAGATGCTCAGCCAAAAAAAGAAAGCTACAAAG  499
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  435  CACTAAAGGAGAATGTCATGTTCCAATTTTAGAAGCCAATGTAGATGCTCAGCCAAAAAAAGAAAGCTACAAAG  508

Query  500  TTGGAGACGTGTTGAAATTCTCCTGCAGAAAAAATCTTATAAGAGTTGGATCAGACTCAGTTCAATGTTACCAA  573
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  509  TTGGAGACGTGTTGAAATTCTCCTGCAGAAAAAATCTTATAAGAGTTGGATCAGACTCAGTTCAATGTTACCAA  582

Query  574  TTTGGGTGGTCACCTAACTTTCCAACATGCAAAGGACAAGTACGATCATGTGGTCCACCTCCTCAACTCTCCAA  647
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  583  TTTGGGTGGTCACCTAACTTTCCAACATGCAAAGGACAAGTACGATCATGTGGTCCACCTCCTCAACTCTCCAA  656

Query  648  TGGTGAAGTTAAGGAGATAAGAAAAGAGGAATATGGACACAATGAAGTAGTGGAATATGATTGCAATCCTAATT  721
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  657  TGGTGAAGTTAAGGAGATAAGAAAAGAGGAATATGGACACAATGAAGTAGTGGAATATGATTGCAATCCTAATT  730

Query  722  TTATAATAAACGGGCCTAAGAAAATACAATGTGTGGATGGAGAATGGACAACTTTACCCACTTGTGTTGAACAA  795
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  731  TTATAATAAACGGGCCTAAGAAAATACAATGTGTGGATGGAGAATGGACAACTTTACCCACTTGTGTTGAACAA  804

Query  796  GTGAAAACATGTGGATACATACCTGAACTCGAGTACGGTTATGTTCAGCCGTCTGTCCCTCCCTATCAACATGG  869
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  805  GTGAAAACATGTGGATACATACCTGAACTCGAGTACGGTTATGTTCAGCCGTCTGTCCCTCCCTATCAACATGG  878

Query  870  AGTTTCAGTCGAGGTGAATTGCAGAAATGAATATGCAATGATTGGAAATAACATGATTACCTGTATTAATGGAA  943
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  879  AGTTTCAGTCGAGGTGAATTGCAGAAATGAATATGCAATGATTGGAAATAACATGATTACCTGTATTAATGGAA  952

Query  944  TATGGACAGAGCTTCCTATGTGTGTTGCAACACACCAACTTAAGAGGTGCAAAATAGCAGGAGTTAATATAAAA  1017
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  953  TATGGACAGAGCTTCCTATGTGTGTTGCAACACACCAACTTAAGAGGTGCAAAATAGCAGGAGTTAATATAAAA  1026

Query 1018  ACATTACTCAAGCTATCTGGGAAAGAATTTAATCATAATTCTAGAATACGTTACAGATGTTCAGACATCTTCAG  1091
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1027  ACATTACTCAAGCTATCTGGGAAAGAATTTAATCATAATTCTAGAATACGTTACAGATGTTCAGACATCTTCAG  1100

Query 1092  ATACAGGCACTCAGTCTGTATAAACGGGAAATGGAATCCTGAAGTAGACTGCACAGAAAAAAGGGAACAATTCT  1165
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1101  ATACAGGCACTCAGTCTGTATAAACGGGAAATGGAATCCTGAAGTAGACTGCACAGAAAAAAGGGAACAATTCT  1174

Query 1166  GCCCACCGCCACCTCAGATACCTAATGCTCAGAATATGACAACCACAGTGAATTATCAGGATGGAGAAAAAGTA  1239
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1175  GCCCACCGCCACCTCAGATACCTAATGCTCAGAATATGACAACCACAGTGAATTATCAGGATGGAGAAAAAGTA  1248

Query 1240  GCTGTTCTCTGTAAAGAAAACTATCTACTTCCAGAAGCAAAAGAAATTGTATGTAAAGATGGACGATGGCAATC  1313
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1249  GCTGTTCTCTGTAAAGAAAACTATCTACTTCCAGAAGCAAAAGAAATTGTATGTAAAGATGGACGATGGCAATC  1322

Query 1314  ATTACCACGCTGTGTTGAGTCTACTGCATATTGTGGGCCCCCTCCATCTATTAACAATGGAGATACCACCTCAT  1387
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1323  ATTACCACGCTGTGTTGAGTCTACTGCATATTGTGGGCCCCCTCCATCTATTAACAATGGAGATACCACCTCAT  1396

Query 1388  TCCCATTATCAGTATATCCTCCAGGGTCAACAGTGACGTACCGTTGCCAGTCCTTCTATAAACTCCAGGGCTCT  1461
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1397  TCCCATTATCAGTATATCCTCCAGGGTCAACAGTGACGTACCGTTGCCAGTCCTTCTATAAACTCCAGGGCTCT  1470

Query 1462  GTAACTGTAACATGCAGAAATAAACAGTGGTCAGAACCACCAAGATGCCTAGATCCATGTGTGGTATCTGAAGA  1535
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1471  GTAACTGTAACATGCAGAAATAAACAGTGGTCAGAACCACCAAGATGCCTAGATCCATGTGTGGTATCTGAAGA  1544

Query 1536  AAACATGAACAAAAATAACATACAGTTAAAATGGAGAAACGATGGAAAACTCTATGCAAAAACAGGGGATGCTG  1609
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1545  AAACATGAACAAAAATAACATACAGTTAAAATGGAGAAACGATGGAAAACTCTATGCAAAAACAGGGGATGCTG  1618

Query 1610  TTGAATTCCAGTGTAAATTCCCACATAAAGCGATGATATCATCACCACCATTTCGAGCAATCTGTCAGGAAGGG  1683
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1619  TTGAATTCCAGTGTAAATTCCCACATAAAGCGATGATATCATCACCACCATTTCGAGCAATCTGTCAGGAAGGG  1692

Query 1684  AAATTTGAATATCCTATATGTGAA  1707
            ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1693  AAATTTGAATATCCTATATGTGAA  1716