Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000474103
- Subject:
- NM_001260486.1
- Aligned Length:
- 1873
- Identities:
- 1399
- Gaps:
- 281
Alignment
Query 1 ATGATTTCACCTTCACTTGAACTGCTTCATTCAGGACTCTGCAAATTCCCTGAAGTAGAAGGAAAAATGACCAC 74
||||||||
Sbjct 1 ------------------------------------------------------------------ATGACCAC 8
Query 75 ATTCAAAGAGGCAGTGACATTCAAGGATGTGGCTGTGGTCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCTGGACCCTG 148
||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 9 ATTCAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGGTCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCTGGACCCTG 82
Query 149 CCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTAGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTAGGGAATCAACCATTC 222
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||.|||
Sbjct 83 CCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTGGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTGGGGCATCAACCGTTC 156
Query 223 CACCAAGATACTTTCCACTT-CTTAGGGAAGGAAAAGTTTTGGAAGATGAAGACAACAAGCCAAAGAGAAGGGA 295
|||||||||||||.|||||| ||.|||||| |||||||||||||.||||..||||.|||.||||||||||||||
Sbjct 157 CACCAAGATACTTGCCACTTCCTAAGGGAA-GAAAAGTTTTGGATGATGGGGACAGCAACCCAAAGAGAAGGGA 229
Query 296 ATTCAGGAGGCAAGATCCAAATTGAGATGGAGACTGTTCCAGAAGCAGGACCACATGAAGAGTGGTCCTGTCAG 369
|||||||||||||||||||||.||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||
Sbjct 230 ATTCAGGAGGCAAGATCCAAACTGAGTTGGAGTCTGTTCCAGAAGCAGGAGCACATGAAGAGTGGTCCTGCCAG 303
Query 370 CAAATATGGGAACAAATTGCAAGTGACCTAACCAGGTCTCAAAACTCCATAAGGAACAGCTCTCAGTTCTTCAA 443
|||||.||||||||||||||||..|||.|||||||||||||..||||.||.|..||.|.||||||||||||..|
Sbjct 304 CAAATCTGGGAACAAATTGCAAAAGACTTAACCAGGTCTCAGGACTCTATCATAAATAACTCTCAGTTCTTTGA 377
Query 444 AGAAGGTGATGTCCCCTGCCAGATTGAGGCAAGACTATCTATAAGTCACGTGCA--ACAGAAACCTTACC---G 512
|.|.|||||||||||||.||||.||||.|||.|||||.|.|.||.||| |.|| |||||||||||.|| |
Sbjct 378 AAATGGTGATGTCCCCTCCCAGGTTGAAGCAGGACTACCCACAATTCA--TACAGGACAGAAACCTTCCCAGGG 449
Query 513 TTGTAATGAA-TGTAAACAGTCCATCAGTGATGTTTCTGTCTTTGATCTTCATCAACAATCACACTCAGGAGAG 585
|.| ||| ||||||||||||.|||||||||||.|..||||||||||||.|||.||.|.|.||||||.||||
Sbjct 450 TGG----GAAGTGTAAACAGTCCTTCAGTGATGTTCCCATCTTTGATCTTCCTCAGCAGTTATACTCAGAAGAG 519
Query 586 AAATCTCATACATGTGGTGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACAGCCCAGCCCTTCATATTCATCAGAGAGTCCA 659
||.|||.|||||||||.||||||||||||||||.|||||||||.|.||||.||||||.||||||||||||||||
Sbjct 520 AAGTCTTATACATGTGATGAGTGTGGAAAAAGCATCTGTTACATCTCAGCTCTTCATGTTCATCAGAGAGTCCA 593
Query 660 TATGGGAGAAAAATGCTATAAGTGTGATGTGTGTGGTAAGGAATTTAATCAGAGCTCACATCTGCAAACTCATC 733
..|||||||.|||..||.||.|||||||||||||||.||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 594 CGTGGGAGAGAAACTCTTTATGTGTGATGTGTGTGGCAAGGAATTTAGTCAAAGCTCACATCTGCAAACTCATC 667
Query 734 AGAGAGTCCATACTGGAGAGAAACCATTCAAACGTGGGCAATGTGGGAAAGGCTTCCATAGTAGATCAGCACTT 807
||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||.|||..|.||||||||||||||
Sbjct 668 AGAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAATGTGGGAAAGGTTTCAGTCGTAGATCAGCACTT 741
Query 808 AATGTTCATTGCAAATTGCACACAGGAGAGAAACCTTATAATTGTGAGGAATGTGGGAAAGCCTTCATTCATGA 881
|||||||||.|.|||||.||||||||||||||||||||.|.||||||||.|||||||||.||||||||||||||
Sbjct 742 AATGTTCATCGTAAATTACACACAGGAGAGAAACCTTACATTTGTGAGGCATGTGGGAAGGCCTTCATTCATGA 815
Query 882 TTCACAGCTTCAGGAACATCAGAGAATCCATACTGGGGAGAAGCCATTCAAATGTGATATATGTGGTAAGAGCT 955
|||.||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 816 TTCCCAGCTTAAGGAACATAAGAGAATCCATACTGGGGAGAAACCATTCAAATGTGATATATGTGGTAAGACCT 889
Query 956 TCCGTGTTAGATCAAGACTTAATAGGCATTCCATGGTTCACACAGGAGAAAAACCATTCAGATGTGATACATGT 1029
||..|.||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 890 TCTATTTTAGGTCAAGACTTAAGAGCCATTCCATGGTTCACACAGGAGAAAAACCATTTAGGTGTGATACATGT 963
Query 1030 GGCAAGAACTTTCGTCAGAGATCAGCACTTAATAGTCATTCCATGGTCCACATAGAAGAGAAGCCATACAAATG 1103
|..||||.|||||.|||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||.||.||||||.||.||||.|||
Sbjct 964 GATAAGAGCTTTCATCAGAGATCAGCACTTAATAGGCATTGCATGGTCCACACAGGAGAGAAACCGTACAGATG 1037
Query 1104 TGAGCAATGTGGAAAAGGCTTCATTTGTAGGCGAGATTTTTGTAAGCATCAGATGGTCCACACAGGAGAGAAAC 1177
||||||.||||||||||||||.|||.||||||.||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1038 TGAGCAGTGTGGAAAAGGCTTTATTGGTAGGCTAGATTTTTATAAGCATCAGGTGGTCCACACAGGAGAGAAAC 1111
Query 1178 CATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGACCTTCAGATGGTCCTCATGTCTTTTGAACCATCAGCAAGTCCACAGT 1251
|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1112 CATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGATGGTCCTCATGCCTTTTGAACCATCAGCGAGTCCACAGT 1185
Query 1252 GGACAAAAATCCTTCAAATGTGAAGAATGTGGGAAGGGATTTTATACAAATTCACGACGATCTTCCCATCAGAG 1325
|||.|||||..|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||..||||||||||||||
Sbjct 1186 GGAGAAAAAAGCTTCAAATGTGAAGAATGTGGAAAGGGATTTTATACAAATTCACAACTGTCTTCCCATCAGAG 1259
Query 1326 ATCCCACAATGGAGAAAAGCCATATAACTGTGAGGAGTGTGGTAAGGACTATAAAAGGAGGTTGGATCTTGAGT 1399
||||||||.|||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||.||||...|..|.|||..|||||||.|
Sbjct 1260 ATCCCACAGTGGTGAAAAGCCATATAAATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTATGTTACTAAGTTTAATCTTGACT 1333
Query 1400 TTCACCAGAGGGTCCACACGGGTGAGAGACCCTATAATTGTAAGGAATGTGGCAAGAGCTTTGGCTGGGCCTCC 1473
|.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||.||||.||.|||||||.
Sbjct 1334 TGCACCAGAGGGTCCACACGGGAGAGAGACCTTATAATTGTAAGGAATGTGGGAAGAACTTTAGCCGGGCCTCA 1407
Query 1474 TGTCTTTTGAAACATCAGAGACTCCACAGTGGGGAAAAACCTTTCAAATGTGAAGAGTGTGGAAAGAGATTTAC 1547
.||.|||||||.|||.|||||||||||.|...|.|||||||.|||||||||||.||.|||||||||||..||
Sbjct 1408 AGTATTTTGAATCATAAGAGACTCCACTGCCAGAAAAAACCATTCAAATGTGAGGACTGTGGAAAGAGGCTT-- 1479
Query 1548 TCAGAGTACACA--ACTTCATTC--------CCATCAGACATGCCATACTGGAGAAAAGCTATACAAATGTGAG 1611
||||||| | |||.| |||.|.||.|..|.|||.|||.|||||.|.||.||||||||||
Sbjct 1480 -----GTACACAGGA---CATACCGTAAAGACCAGCCGAGAGACTATAGTGGGGAAAACCCATCCAAATGTGAG 1545
Query 1612 CAGTGTGAGAAGGGGTACAACAGTAAATTTAATCTTGACATGCACCAGAGGGTCCACAGGGGAGAGCGACCCTA 1685
.|.||||.||...|.|||||.||....||.|||||.|| ||
Sbjct 1546 GATTGTGGGAGACGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTGGA----------------------------------TA 1585
Query 1686 TAATTGTAAGGAATGTGGAAAGAGCTTTGGCTGGGCTTCATGTCTTT-----TGAAACATCAGAGACTCCACAG 1754
||.||.|| |||| |.||| |||.|||
Sbjct 1586 TACTTTTA-----------------------------TCAT-TATTTCTAAATGACACA--------------- 1614
Query 1755 TGGAGAAAAGCCATTGAAATCTGGAGTGTGGGAAGAGATCTACTCAGAATTCACAGCTTCATTTACATCAGTAA 1828
Sbjct 1615 -------------------------------------------------------------------------- 1614
Query 1829 GTCTATGTGGGAGAAAAGCCATA 1851
Sbjct 1615 ----------------------- 1614