Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000474103
- Subject:
- XM_017027261.2
- Aligned Length:
- 2197
- Identities:
- 1574
- Gaps:
- 422
Alignment
Query 1 ATGATTTCACCTTCACTTGAACTGCTTCATTCAGGACTCTGCAAATTCCCTGAAGTAGAAGGAAAAATGACCAC 74
||||||||
Sbjct 1 ------------------------------------------------------------------ATGACCAC 8
Query 75 ATTCAAAGAGGCAGTGACATTCAAGGATGTGGCTGTGGTCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCTGGACCCTG 148
.|||||.||||||.||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||
Sbjct 9 GTTCAAGGAGGCAATGACCTTCAAGGACGTGGCTGTGGTCTTCACTGAGGAAGAGCTGGGGCTGCTGGACCTTG 82
Query 149 CCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTAGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTAGGGA-ATCAACCATT 221
|.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||| |||| |||||.||||
Sbjct 83 CTCAGAGGAAGCTGTATCGAGATGTGATGCTGGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGT-GGGACATCAAGCATT 155
Query 222 CCACCAAGATACTTTCCACTT-CTTAGGGAAGGAAAAGTTTTGGAAGATGAAGACAACAAGCCAAAGAGAAGGG 294
||||...|||||||||||||| ||.|||||| ||||||.||||||.||||||||||.|||.||||||.||||||
Sbjct 156 CCACAGGGATACTTTCCACTTCCTAAGGGAA-GAAAAGATTTGGATGATGAAGACAGCAATCCAAAGGGAAGGG 228
Query 295 AATTCAGGAGGCAAGATCCAAATTGAGATGGAGACTGTTCCAGAAGCAGGACCACATGAAGAGTGGTCCTGTCA 368
||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||..||
Sbjct 229 AATTCAGGAGACAAGATCCAAACTGAGATGGAGACTGTTTCAGAAGCAGGAACACATCAAGAGTGGTCCTTCCA 302
Query 369 GCAAATATGGGAACAAATTGCAAGTGACCTAACCAGGTCTCAAAACTCCATAAGGAACAGCTCTCAGTTCTTCA 442
||||||.||||||.|||||||||||||..||||||||||||||.|||..||.|..||.|||||||||||||.||
Sbjct 303 GCAAATCTGGGAAAAAATTGCAAGTGATTTAACCAGGTCTCAAGACTTGATGATAAATAGCTCTCAGTTCTCCA 376
Query 443 AAGAAGGTGATGTCCCCTGCCAGATTGAGGCAAGACTATCTATAAGTCACGTGCA--ACAGAAACCTTACCGTT 514
|||||||||||.||||||||||||.|||||||.||||||||.|||.|||| .|| |||||||.|||.||...
Sbjct 377 AAGAAGGTGATTTCCCCTGCCAGACTGAGGCAGGACTATCTGTAATTCAC--ACAAGACAGAAATCTTCCCAGG 448
Query 515 GTAATGAATGTAAACAGTCCATCAGTGATGTTTCTGTCTTTGATCTTCATCAACAATCACACTCAGGAGAGAAA 588
|.||||.||.|||||..|||.||||||||||.||...|||||||.||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 449 GCAATGGATATAAACCATCCTTCAGTGATGTCTCCCACTTTGATTTTCATCAACAATTACACTCAGGAGAGAAA 522
Query 589 TCTCATACATGTGGTGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACAGCCCAGCCCTTCATATTCATCAGAGAGTCCATAT 662
||||||||.||||.||||||||||||.|.|||.|||||||.|.|||||||||.||||||||||||||||||.||
Sbjct 523 TCTCATACGTGTGATGAGTGTGGAAAGAACTTTTGTTACATCTCAGCCCTTCGTATTCATCAGAGAGTCCACAT 596
Query 663 GGGAGAAAAATGCTATAAGTGTGATGTGTGTGGTAAGGAATTTAATCAGAGCTCACATCTGCAAACTCATCAGA 736
||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|.||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 597 GGGAGAGAAATGCTATAAGTGTGACGTGTGTGGTAAGGAATTCAGTCAGAGTTCACATCTGCAAACTCATCAGA 670
Query 737 GAGTCCATACTGGAGAGAAACCATTCAAACGTGGGCAATGTGGGAAAGGCTTCCATAGTAGATCAGCACTTAAT 810
|||||||.||||||||||||||.||||||.|||.|.|||||||||||||||||..|.|||||||||||||||||
Sbjct 671 GAGTCCACACTGGAGAGAAACCGTTCAAATGTGTGGAATGTGGGAAAGGCTTCAGTCGTAGATCAGCACTTAAT 744
Query 811 GTTCATTGCAAATTGCACACAGGAGAGAAACCTTATAATTGTGAGGAATGTGGGAAAGCCTTCATTCATGATTC 884
||||||...|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 745 GTTCATCATAAATTACACACAGGAGAGAAACCTTATAATTGTGAGGAATGCGGGAAGGCCTTCATTCACGATTC 818
Query 885 ACAGCTTCAGGAACATCAGAGAATCCATACTGGGGAGAAGCCATTCAAATGTGATATATGTGGTAAGAGCTTCC 958
.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 819 CCAGCTTCAAGAACATCAGAGAATCCATACGGGGGAGAAGCCATTCAAATGTGATATATGTGGTAAGAGCTTCT 892
Query 959 GTGTTAGATCAAGACTTAATAGGCATTCCATGGTTCACACAGGAGAAAAACCATTCAGATGTGATACATGTGGC 1032
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||.|||||||||.||||||||||.||||..
Sbjct 893 GTGGTAGATCAAGACTTAATAGGCATTCCATGGTTCACACGGCAGAGAAACCATTCCGATGTGATACGTGTGAT 966
Query 1033 AAGAACTTTCGTCAGAGATCAGCACTTAATAGTCATTCCATGGTCCACATAGAAGAGAAGCCATACAAATGTGA 1106
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||..||||.||||||.||.||||||.||||||||||||||
Sbjct 967 AAGAGCTTTCGTCAGAGATCAGCACTTAATAGTCATCGCATGATCCACACAGGAGAGAAACCATACAAATGTGA 1040
Query 1107 GCAATGTGGAAAAGGCTTCATTTGTAGGCGAGATTTTTGTAAGCATCAGATGGTCCACACAGGAGAGAAACCAT 1180
|.|.||||||||||||||.|||||||||||||||.|||.||.||||||.|||||||||||.|||||.||.||||
Sbjct 1041 GGAGTGTGGAAAAGGCTTTATTTGTAGGCGAGATCTTTATACGCATCATATGGTCCACACGGGAGAAAAGCCAT 1114
Query 1181 ATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGACCTTCAGATGGTCCTCATGTCTTTTGAACCATCAGCAAGTCCACAGTGGA 1254
|||||||||||||.||||||||||.||||||||||.||||.|||||||||||.|||||||.|||||||||||||
Sbjct 1115 ATAATTGTAAAGAGTGTGGGAAGAGCTTCAGATGGGCCTCGTGTCTTTTGAAACATCAGCGAGTCCACAGTGGA 1188
Query 1255 CAAAAATCCTTCAAATGTGAAGAATGTGGGAAGGGATTTTATACAAATTCACGACGATCTTCCCATCAGAGATC 1328
.|||||.|.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||.|.|.|.||||||.||||||||
Sbjct 1189 GAAAAACCATTCAAATGTGAAGAATGTGGGAAAGGATTTTACACAAATTCACAATGCTATTCCCACCAGAGATC 1262
Query 1329 CCACAATGGAGAAAAGCCATATAACTGTGAGGAGTGTGGTAAGGACTATAAAAGGAGGTTGGATCTTGAGTTTC 1402
|||.|.|||||||||.|||||.||.||||.|||||||||.||||.|||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1263 CCATAGTGGAGAAAAACCATACAAATGTGTGGAGTGTGGGAAGGGCTACAAAAGGAGGTTGGATCTTGACTTTC 1336
Query 1403 ACCAGAGGGTCCACACGGGTGAGAGACCCTATAATTGTAAGGAATGTGGCAAGAGCTTTGGCTGGGCCTCCTGT 1476
|||||.|.|||||.||.||.||||.||..||||||||||||||||||||.|||||||||.|..|||||.|.|||
Sbjct 1337 ACCAGCGCGTCCATACAGGAGAGAAACTGTATAATTGTAAGGAATGTGGGAAGAGCTTTAGTCGGGCCCCATGT 1410
Query 1477 CTTTTGAAACATCAGAGACTCCACAGTGGGGAAAAACCTTTCAAATGTGAAGAGTGTGGAAAGAGATTTACTCA 1550
||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||.|||.||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1411 CTTTTGAAACATGAGAGACTCCACAGTGGAGAAAAACCATTCCAATGTGAAGAGTGTGGGAAGAGATTTACTCA 1484
Query 1551 GAGTACACAACTTCATTCCCATCAGACATGCCATACTGGAGAAAAGCTATACAAATGTGAGCAGTGTGAGAAGG 1624
.|.|.||||.||||||||||||||||.|...||.|||||||||||||.|||||||||||||.||||||..||||
Sbjct 1485 AAATTCACATCTTCATTCCCATCAGAGAGTTCACACTGGAGAAAAGCCATACAAATGTGAGAAGTGTGGAAAGG 1558
Query 1625 GGTACAACAGTAAATTTAATCTTGACATGCACCAGAGGGTCCACAGGGGAGAGCGACCCTATAATTGTAAGGAA 1698
|.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||.||||||||..||||||.||||.||.||||||||||||
Sbjct 1559 GCTACAATAGTAAGTTTAATCTTGATATGCACCAGAAGGTCCACACAGGAGAGAGACCATACAATTGTAAGGAA 1632
Query 1699 TGTGGAAAGAGCTTTGGCTGGGCTTCATGTCTTTTGAAACATCAGAGACTCCACAGTGGAGAAAAGCCATTGAA 1772
|||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1633 TGTGGGAAGAGTTTTGGCTGGGCCTCGTGTCTTTTGAAACATCAGAGACTGCACAGTGGAGAAAAACCATTCAA 1706
Query 1773 ATCTG--GAGTGTGGGAAGAGATCTACTCAGAATTCACAGCTTCATTTACATCAGTAAGTCTATGTG------G 1838
||.|| |||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||..||||| ||| .||| |
Sbjct 1707 ATGTGAAGAGTGTGGGAAAAGATTTACTCAGAATTCACAGCTTCATTCTCATCA--AAG----AGTGCACACTG 1774
Query 1839 GAGAAAAGCCATA------------------------------------------------------------- 1851
|||||||||||||
Sbjct 1775 GAGAAAAGCCATACAAATGTGATGAGTGTGGGAAGGGCTTCAGCTGGTCCTCAACTCGTCTGACCCATCAGAGA 1848
Query 1852 -------------------------------------------------------------------------- 1851
Sbjct 1849 CGCCACAGCAGAGAAACACCTCTCAAATGTGAGCAGCATGGGAAGAACATTGTACAGAATTCATTCTCTAAAGT 1922
Query 1852 -------------------------------------------------------------------------- 1851
Sbjct 1923 GCAAGAAAAAGTTCACAGTGTAGAAAAGCCATACAAATGTGAGGACTGTGGGAAGGGCTACAACAGGCGCTTGA 1996
Query 1852 -------------------------------------------------------------------------- 1851
Sbjct 1997 ATCTTGATATGCATCAGAGGGTCCACATGGGAGAGAAAACATGGAAGTGTAGGGAGTGTGATATGTGCTTTAGT 2070
Query 1852 --------------------------------------------------- 1851
Sbjct 2071 CAGGCCTCAAGCCTTCGACTTCATCAGAATGTTCATGTTGGAGAAAAACCT 2121