Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000474127
- Subject:
- NM_001008421.1
- Aligned Length:
- 2066
- Identities:
- 1831
- Gaps:
- 7
Alignment
Query 1 ATGCAGGTCTCCAGCCTCAATGAGGTGAAGATTTACAGCCTCAGCTGCGGCAAGTCCCTTCCTGAGTGGCTTTC 74
||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1 ATGCAGGTCTCCAGCCTCAACGAAGTGAAGATTTACAGCCTCAGCTGCGGCAAGTCTCTTCCCGAGTGGCTTTC 74
Query 75 TGATAGGAAGAAGAGAGCGCTACAGAAGAAAGATGTAGATGTCCGTAGGAGAATTGAACTTATTCAGGACTTTG 148
|||.||||||||||||||.||.||||||||..||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 75 TGACAGGAAGAAGAGAGCACTGCAGAAGAAGAATGTCGATGTTCGTAGGAGAATTGAACTTATTCAGGACTTCG 148
Query 149 AAATGCCTACTGTGTGTACCACTATTAAGGTGTCAAAAGATGGACAGTACATTTTAGCAACTGGAACATATAAA 222
|||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 149 AAATGCCTACTGTGTGTACTACTATCAAGGTGTCAAAAGATGGACAGTATATTTTAGCAACTGGAACATATAAG 222
Query 223 CCTCGGGTTCGATGTTATGACACCTATCAATTATCCTTGAAGTTTGAAAGGTGTTTAGATTCAGAAGTTGTCAC 296
||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||.||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||
Sbjct 223 CCTCGGGTCCGGTGTTATGACACATATCAGTTATCCCTGAAGTTTGAAAGGTGCTTGGATTCTGAAGTTGTCAC 296
Query 297 CTTTGAAATTTTGTCTGATGACTACTCAAAGATTGTCTTCTTACATAATGATAGATACATTGAATTTCATTCGC 370
||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|
Sbjct 297 CTTTGAGATTTTATCAGATGACTATTCAAAGATTGTCTTCTTACATAATGACAGATATATTGAATTTCACTCAC 370
Query 371 AATCAGGTTTTTACTACAAAACCAGAATACCAAAGTTTGGGAGAGATTTCTCTTACCACTATCCATCCTGTGAC 444
|||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||..||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AATCAGGCTTTTACTACAAAACCAGAATTCCCAAGTTCGGCCGAGACTTCTCTTACCACTATCCATCCTGTGAC 444
Query 445 TTGTACTTTGTTGGTGCAAGTTCTGAAGTTTATAGGTTAAACTTAGAACAAGGACGATACCTGAATCCTCTACA 518
|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||
Sbjct 445 TTGTACTTTGTAGGTGCAAGCTCTGAAGTTTATAGATTAAACTTAGAACAAGGGCGGTACCTGAATCCTCTCCA 518
Query 519 AACTGATGCTGCGGAGAATAATGTTTGTGACATAAATTCAGTGCATGGCTTGTTTGCCACAGGAACCATAGAGG 592
.||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 519 GACGGACGCCGCGGAGAACAATGTTTGTGACATAAATGCAGTGCATGGCTTGTTCGCCACAGGAACAATAGAGG 592
Query 593 GTAGAGTGGAGTGCTGGGACCCAAGAACTCGAAACAGAGTTGGCCTGTTAGACTGCGCCTTAAACAGTGTCACA 666
||.|||||||.||||||||.||||||....||||.||.||||||.||||||||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 593 GTCGAGTGGAATGCTGGGATCCAAGAGTAAGAAAAAGGGTTGGCGTGTTAGACTGTGCATTAAATAGTGTCACA 666
Query 667 GCAGATTCAGAGATAAACAGTTTACCAACAATCTCTGCTTTGAAATTTAATGGTGCCTTGACCATGGCAGTTGG 740
||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||.||||||||||||
Sbjct 667 GCAGATTCAGAGATAAACAGCTTACCCACCATCTCTGCATTGAAGTTTAATGGAGCCTTGAGCATGGCAGTTGG 740
Query 741 AACAACCACAGGGCAGGTTTTATTATATGACCTTCGATCTGATAAGCCATTGCTAGTTAAAGATCACCAGTATG 814
||||.|||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 741 AACATCCACAGGGCAGGTGTTGTTATATGATCTTCGCTCGGATAAGCCGTTGCTAGTTAAGGATCACCAGTATG 814
Query 815 GGCTGCCCATTAAGTCCGTTCATTTCCAGGATTCATTAGATCTGATTTTGTCTGCTGACTCTCGAATTGTCAAG 888
|||||||.||||||||.|||||||||||||||||..|||||.||.||||||||||.||||||.||||||||||.
Sbjct 815 GGCTGCCGATTAAGTCAGTTCATTTCCAGGATTCCCTAGATTTGGTTTTGTCTGCAGACTCTAGAATTGTCAAA 888
Query 889 ATGTGGAATAAGAACTCCGGAAAAATATTTACTTCCTTGGAGCCAGAGCATGACCTTAATGATGTTTGTCTCTA 962
||||||||.|||.|||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 889 ATGTGGAACAAGGACTCCGGGAAAATATTTACTTCGTTGGAGCCAGAACATGATCTTAATGATGTTTGCCTCTA 962
Query 963 CCCCAACTCAGGCATGCTTCTGACGGCCAATGAAACCCCCAAGATGGGCATCTATTACATTCCAGTTTTGGGTC 1036
.||||.||||||.||||||||.||.|||||||||.||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||
Sbjct 963 TCCCAGCTCAGGAATGCTTCTTACTGCCAATGAATCCCCCAAGATGGGCATTTACTACATTCCGGTTTTGGGTC 1036
Query 1037 CTGCTCCTCGGTGGTGTTCCTTCTTAGACAACTTGACCGAAGAATTAGAAGAGAATCCAGAAAGCACAGTCTAT 1110
|||||||..||||||||||||||.|.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1037 CTGCTCCCAGGTGGTGTTCCTTCCTGGACAACTTGACAGAAGAGTTAGAAGAGAATCCAGAGAGCACAGTGTAT 1110
Query 1111 GATGATTATAAATTTGTCACCAAGAAAGACCTTGAAAATTTAGGGCTCACCCACCTCATTGGATCTCCTTTCCT 1184
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1111 GATGATTACAAATTTGTCACCAAGAAAGACCTTGAAAATTTAGGGCTCACACATCTCATTGGATCACCTTTCCT 1184
Query 1185 CCGGGCATATATGCATGGGTTTTTCATGGATATAAGACTCTATCACAAGGTGAAACTGATGGTAAATCCATTTG 1258
|||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.|||||||.||||||||||
Sbjct 1185 CCGAGCATATATGCATGGGTTTTTCATGGATATCAGACTCTACCACAAGGTGAAATTGATGGTCAATCCATTTG 1258
Query 1259 CTTATGAAGAATATAGGAAAGATAAAATACGACAGAAAATAGAAGAAACACGTGCACAGAGAGTCCAGTTAAAG 1332
||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1259 CTTATGAAGAATATAGGAAAGATAAAATTCGACAGAAGATAGAAGAAACACGTGCACAGAGAGTCCAATTAAAG 1332
Query 1333 AAATTGCCAAAAGTTAACAAAGAGCTGGCACTTAAATTAATTGAGGAAGAAGAGGAGAAGCAGAAATCTACATG 1406
|||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||...
Sbjct 1333 AAACTGCCAAAAGTTAACAAAGAACTGGCACTTAAATTAATTGAAGAGGAAGAGGAGAAACAAAAGTCTACGCT 1406
Query 1407 GAAAAAGAAAGTTAAGAGTCTTCCTAATATTCTCACCGATGATCGATTTAAAGTTATGTTTGAGAACCCTGACT 1480
||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1407 GAAAAAGAAAGTTAAGAGCCTCCCTAATATCCTCACGGATGATCGATTTAAAGTTATGTTTGAGAATCCCGACT 1480
Query 1481 TCCAAGTAGATGAAGAGAGTGAAGAATTTAGGCTTCTGAATCCACTTGTTTCAAAAATTAGTGAAAAAAGGAAG 1554
||||.||.||.||.|||||||||||.||.||||||||.||.||.||.||.||.|..||.|||||.||.||||||
Sbjct 1481 TCCAGGTGGACGAGGAGAGTGAAGAGTTCAGGCTTCTCAACCCCCTCGTCTCGAGGATCAGTGAGAAGAGGAAG 1554
Query 1555 AAGAAACTAAGACTCTTAGAGCAACAAGAACTTCGTGAAA--AAGAAGAGGAGGAAGAGCCGGAAGGAAAACCA 1626
|||.|.||.||.|||||.|||||.||.||.|| .|| |.||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 1555 AAGCAGCTGAGGCTCTTGGAGCAGCAGGAGCT-----CAAGGATGAAGAGGAGGAAGAACCGGAAGGAAAACCC 1623
Query 1627 AGTGATGCAGAAAGTTCGGAGAGTTCAGATGATGAAAAAGCCTGGGTTGAAGAGGTCAGGAAGCAACGCAGACT 1700
|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||..|||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1624 AGTGATGCAGAAAGTTCAGAGAGCTCAGATGATGAGAAAGGTTGGGTTGAAGAAGTCAGGAAGCAGCGCAGACT 1697
Query 1701 CCTCCAGCAGGAGGAAAAAGTGAAGCGGCAGGAACGACTCAAGGAGGACCAGCAGACAGTCCTAAAGCCCCAGT 1774
|||.||||||||.||||.|||||||||||||||.|.|||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1698 CCTTCAGCAGGAAGAAAGAGTGAAGCGGCAGGAGCAACTGAAGGAGGACCAGCAGACAGTCCTGAAGCCCCAGT 1771
Query 1775 TTTATGAGATCAAAGCAGGAGAAGAATTTAGAAGCTTCAAAGATTCTGCCACAAAGCAGAAACTGATGAACAAA 1848
|.||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||.|||.|||||||||
Sbjct 1772 TCTACGAGATCAAAGCAGGCGAAGAGTTCAGGAGCTTCAAAGAGTCTGCCACCAAGCAGAGACTAATGAACAAA 1845
Query 1849 ACCCTTGAAGATCGTTTGAAAATTGAAGCAAAAAATGGGACATTGAGTGTATCCGACACCACCGTTGGCAGCAA 1922
||.||.|||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||.||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1846 ACTCTGGAAGATCGTTTGAAACTTGAAGCAAAACATGGGACATTGAATGTATCGGACACCACTGTTGGCAGCAA 1919
Query 1923 ACAATTGACATTCACGTTAAAGAGGTCTGAACAGCAGAAGAAGCAACAGGAGGCTGAGAAACTGCATCGACAAG 1996
.||.||||||||.||..|.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|
Sbjct 1920 GCAGTTGACATTTACTCTCAAGAGGTCTGAACAGCAAAAGAAGCAACAGGAGGCTGAAAAACTGCATCGTCAGG 1993
Query 1997 AAAGGAAAAGACTCCGTCGTTCGGCCGGACACCTGAAGTCAAGACACAAAAGAGGACGGTCGTTTCAT 2064
|||||||||..||.||..|.||||||.|.|||||||.|||.||||.||.||||||.|||.|.|||||.
Sbjct 1994 AAAGGAAAAATCTGCGCAGGTCGGCCAGCCACCTGAGGTCCAGACCCAGAAGAGGCCGGCCCTTTCAC 2061