Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000474127
Subject:
NM_001008421.1
Aligned Length:
2066
Identities:
1831
Gaps:
7

Alignment

Query    1  ATGCAGGTCTCCAGCCTCAATGAGGTGAAGATTTACAGCCTCAGCTGCGGCAAGTCCCTTCCTGAGTGGCTTTC  74
            ||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGCAGGTCTCCAGCCTCAACGAAGTGAAGATTTACAGCCTCAGCTGCGGCAAGTCTCTTCCCGAGTGGCTTTC  74

Query   75  TGATAGGAAGAAGAGAGCGCTACAGAAGAAAGATGTAGATGTCCGTAGGAGAATTGAACTTATTCAGGACTTTG  148
            |||.||||||||||||||.||.||||||||..||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   75  TGACAGGAAGAAGAGAGCACTGCAGAAGAAGAATGTCGATGTTCGTAGGAGAATTGAACTTATTCAGGACTTCG  148

Query  149  AAATGCCTACTGTGTGTACCACTATTAAGGTGTCAAAAGATGGACAGTACATTTTAGCAACTGGAACATATAAA  222
            |||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct  149  AAATGCCTACTGTGTGTACTACTATCAAGGTGTCAAAAGATGGACAGTATATTTTAGCAACTGGAACATATAAG  222

Query  223  CCTCGGGTTCGATGTTATGACACCTATCAATTATCCTTGAAGTTTGAAAGGTGTTTAGATTCAGAAGTTGTCAC  296
            ||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||.||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||
Sbjct  223  CCTCGGGTCCGGTGTTATGACACATATCAGTTATCCCTGAAGTTTGAAAGGTGCTTGGATTCTGAAGTTGTCAC  296

Query  297  CTTTGAAATTTTGTCTGATGACTACTCAAAGATTGTCTTCTTACATAATGATAGATACATTGAATTTCATTCGC  370
            ||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|
Sbjct  297  CTTTGAGATTTTATCAGATGACTATTCAAAGATTGTCTTCTTACATAATGACAGATATATTGAATTTCACTCAC  370

Query  371  AATCAGGTTTTTACTACAAAACCAGAATACCAAAGTTTGGGAGAGATTTCTCTTACCACTATCCATCCTGTGAC  444
            |||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||..||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AATCAGGCTTTTACTACAAAACCAGAATTCCCAAGTTCGGCCGAGACTTCTCTTACCACTATCCATCCTGTGAC  444

Query  445  TTGTACTTTGTTGGTGCAAGTTCTGAAGTTTATAGGTTAAACTTAGAACAAGGACGATACCTGAATCCTCTACA  518
            |||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||
Sbjct  445  TTGTACTTTGTAGGTGCAAGCTCTGAAGTTTATAGATTAAACTTAGAACAAGGGCGGTACCTGAATCCTCTCCA  518

Query  519  AACTGATGCTGCGGAGAATAATGTTTGTGACATAAATTCAGTGCATGGCTTGTTTGCCACAGGAACCATAGAGG  592
            .||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  519  GACGGACGCCGCGGAGAACAATGTTTGTGACATAAATGCAGTGCATGGCTTGTTCGCCACAGGAACAATAGAGG  592

Query  593  GTAGAGTGGAGTGCTGGGACCCAAGAACTCGAAACAGAGTTGGCCTGTTAGACTGCGCCTTAAACAGTGTCACA  666
            ||.|||||||.||||||||.||||||....||||.||.||||||.||||||||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct  593  GTCGAGTGGAATGCTGGGATCCAAGAGTAAGAAAAAGGGTTGGCGTGTTAGACTGTGCATTAAATAGTGTCACA  666

Query  667  GCAGATTCAGAGATAAACAGTTTACCAACAATCTCTGCTTTGAAATTTAATGGTGCCTTGACCATGGCAGTTGG  740
            ||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||.||||||||||||
Sbjct  667  GCAGATTCAGAGATAAACAGCTTACCCACCATCTCTGCATTGAAGTTTAATGGAGCCTTGAGCATGGCAGTTGG  740

Query  741  AACAACCACAGGGCAGGTTTTATTATATGACCTTCGATCTGATAAGCCATTGCTAGTTAAAGATCACCAGTATG  814
            ||||.|||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  741  AACATCCACAGGGCAGGTGTTGTTATATGATCTTCGCTCGGATAAGCCGTTGCTAGTTAAGGATCACCAGTATG  814

Query  815  GGCTGCCCATTAAGTCCGTTCATTTCCAGGATTCATTAGATCTGATTTTGTCTGCTGACTCTCGAATTGTCAAG  888
            |||||||.||||||||.|||||||||||||||||..|||||.||.||||||||||.||||||.||||||||||.
Sbjct  815  GGCTGCCGATTAAGTCAGTTCATTTCCAGGATTCCCTAGATTTGGTTTTGTCTGCAGACTCTAGAATTGTCAAA  888

Query  889  ATGTGGAATAAGAACTCCGGAAAAATATTTACTTCCTTGGAGCCAGAGCATGACCTTAATGATGTTTGTCTCTA  962
            ||||||||.|||.|||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct  889  ATGTGGAACAAGGACTCCGGGAAAATATTTACTTCGTTGGAGCCAGAACATGATCTTAATGATGTTTGCCTCTA  962

Query  963  CCCCAACTCAGGCATGCTTCTGACGGCCAATGAAACCCCCAAGATGGGCATCTATTACATTCCAGTTTTGGGTC  1036
            .||||.||||||.||||||||.||.|||||||||.||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||
Sbjct  963  TCCCAGCTCAGGAATGCTTCTTACTGCCAATGAATCCCCCAAGATGGGCATTTACTACATTCCGGTTTTGGGTC  1036

Query 1037  CTGCTCCTCGGTGGTGTTCCTTCTTAGACAACTTGACCGAAGAATTAGAAGAGAATCCAGAAAGCACAGTCTAT  1110
            |||||||..||||||||||||||.|.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1037  CTGCTCCCAGGTGGTGTTCCTTCCTGGACAACTTGACAGAAGAGTTAGAAGAGAATCCAGAGAGCACAGTGTAT  1110

Query 1111  GATGATTATAAATTTGTCACCAAGAAAGACCTTGAAAATTTAGGGCTCACCCACCTCATTGGATCTCCTTTCCT  1184
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1111  GATGATTACAAATTTGTCACCAAGAAAGACCTTGAAAATTTAGGGCTCACACATCTCATTGGATCACCTTTCCT  1184

Query 1185  CCGGGCATATATGCATGGGTTTTTCATGGATATAAGACTCTATCACAAGGTGAAACTGATGGTAAATCCATTTG  1258
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.|||||||.||||||||||
Sbjct 1185  CCGAGCATATATGCATGGGTTTTTCATGGATATCAGACTCTACCACAAGGTGAAATTGATGGTCAATCCATTTG  1258

Query 1259  CTTATGAAGAATATAGGAAAGATAAAATACGACAGAAAATAGAAGAAACACGTGCACAGAGAGTCCAGTTAAAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1259  CTTATGAAGAATATAGGAAAGATAAAATTCGACAGAAGATAGAAGAAACACGTGCACAGAGAGTCCAATTAAAG  1332

Query 1333  AAATTGCCAAAAGTTAACAAAGAGCTGGCACTTAAATTAATTGAGGAAGAAGAGGAGAAGCAGAAATCTACATG  1406
            |||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||...
Sbjct 1333  AAACTGCCAAAAGTTAACAAAGAACTGGCACTTAAATTAATTGAAGAGGAAGAGGAGAAACAAAAGTCTACGCT  1406

Query 1407  GAAAAAGAAAGTTAAGAGTCTTCCTAATATTCTCACCGATGATCGATTTAAAGTTATGTTTGAGAACCCTGACT  1480
            ||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1407  GAAAAAGAAAGTTAAGAGCCTCCCTAATATCCTCACGGATGATCGATTTAAAGTTATGTTTGAGAATCCCGACT  1480

Query 1481  TCCAAGTAGATGAAGAGAGTGAAGAATTTAGGCTTCTGAATCCACTTGTTTCAAAAATTAGTGAAAAAAGGAAG  1554
            ||||.||.||.||.|||||||||||.||.||||||||.||.||.||.||.||.|..||.|||||.||.||||||
Sbjct 1481  TCCAGGTGGACGAGGAGAGTGAAGAGTTCAGGCTTCTCAACCCCCTCGTCTCGAGGATCAGTGAGAAGAGGAAG  1554

Query 1555  AAGAAACTAAGACTCTTAGAGCAACAAGAACTTCGTGAAA--AAGAAGAGGAGGAAGAGCCGGAAGGAAAACCA  1626
            |||.|.||.||.|||||.|||||.||.||.||     .||  |.||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 1555  AAGCAGCTGAGGCTCTTGGAGCAGCAGGAGCT-----CAAGGATGAAGAGGAGGAAGAACCGGAAGGAAAACCC  1623

Query 1627  AGTGATGCAGAAAGTTCGGAGAGTTCAGATGATGAAAAAGCCTGGGTTGAAGAGGTCAGGAAGCAACGCAGACT  1700
            |||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||..|||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1624  AGTGATGCAGAAAGTTCAGAGAGCTCAGATGATGAGAAAGGTTGGGTTGAAGAAGTCAGGAAGCAGCGCAGACT  1697

Query 1701  CCTCCAGCAGGAGGAAAAAGTGAAGCGGCAGGAACGACTCAAGGAGGACCAGCAGACAGTCCTAAAGCCCCAGT  1774
            |||.||||||||.||||.|||||||||||||||.|.|||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1698  CCTTCAGCAGGAAGAAAGAGTGAAGCGGCAGGAGCAACTGAAGGAGGACCAGCAGACAGTCCTGAAGCCCCAGT  1771

Query 1775  TTTATGAGATCAAAGCAGGAGAAGAATTTAGAAGCTTCAAAGATTCTGCCACAAAGCAGAAACTGATGAACAAA  1848
            |.||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||.|||.|||||||||
Sbjct 1772  TCTACGAGATCAAAGCAGGCGAAGAGTTCAGGAGCTTCAAAGAGTCTGCCACCAAGCAGAGACTAATGAACAAA  1845

Query 1849  ACCCTTGAAGATCGTTTGAAAATTGAAGCAAAAAATGGGACATTGAGTGTATCCGACACCACCGTTGGCAGCAA  1922
            ||.||.|||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||.||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1846  ACTCTGGAAGATCGTTTGAAACTTGAAGCAAAACATGGGACATTGAATGTATCGGACACCACTGTTGGCAGCAA  1919

Query 1923  ACAATTGACATTCACGTTAAAGAGGTCTGAACAGCAGAAGAAGCAACAGGAGGCTGAGAAACTGCATCGACAAG  1996
            .||.||||||||.||..|.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|
Sbjct 1920  GCAGTTGACATTTACTCTCAAGAGGTCTGAACAGCAAAAGAAGCAACAGGAGGCTGAAAAACTGCATCGTCAGG  1993

Query 1997  AAAGGAAAAGACTCCGTCGTTCGGCCGGACACCTGAAGTCAAGACACAAAAGAGGACGGTCGTTTCAT  2064
            |||||||||..||.||..|.||||||.|.|||||||.|||.||||.||.||||||.|||.|.|||||.
Sbjct 1994  AAAGGAAAAATCTGCGCAGGTCGGCCAGCCACCTGAGGTCCAGACCCAGAAGAGGCCGGCCCTTTCAC  2061