Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000474127
Subject:
NM_001261392.1
Aligned Length:
2064
Identities:
1986
Gaps:
78

Alignment

Query    1  ATGCAGGTCTCCAGCCTCAATGAGGTGAAGATTTACAGCCTCAGCTGCGGCAAGTCCCTTCCTGAGTGGCTTTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCAGGTCTCCAGCCTCAATGAGGTGAAGATTTACAGCCTCAGCTGCGGCAAGTCCCTTCCTGAGTGGCTTTC  74

Query   75  TGATAGGAAGAAGAGAGCGCTACAGAAGAAAGATGTAGATGTCCGTAGGAGAATTGAACTTATTCAGGACTTTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGATAGGAAGAAGAGAGCGCTACAGAAGAAAGATGTAGATGTCCGTAGGAGAATTGAACTTATTCAGGACTTTG  148

Query  149  AAATGCCTACTGTGTGTACCACTATTAAGGTGTCAAAAGATGGACAGTACATTTTAGCAACTGGAACATATAAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
Sbjct  149  AAATGCCTACTGTGTGTACCACTATTAAGGTGTCAAAAGATGGACAGTACATTTTAGCAACT------------  210

Query  223  CCTCGGGTTCGATGTTATGACACCTATCAATTATCCTTGAAGTTTGAAAGGTGTTTAGATTCAGAAGTTGTCAC  296
                                                                              ||||||||
Sbjct  211  ------------------------------------------------------------------GTTGTCAC  218

Query  297  CTTTGAAATTTTGTCTGATGACTACTCAAAGATTGTCTTCTTACATAATGATAGATACATTGAATTTCATTCGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  219  CTTTGAAATTTTGTCTGATGACTACTCAAAGATTGTCTTCTTACATAATGATAGATACATTGAATTTCATTCGC  292

Query  371  AATCAGGTTTTTACTACAAAACCAGAATACCAAAGTTTGGGAGAGATTTCTCTTACCACTATCCATCCTGTGAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  293  AATCAGGTTTTTACTACAAAACCAGAATACCAAAGTTTGGGAGAGATTTCTCTTACCACTATCCATCCTGTGAC  366

Query  445  TTGTACTTTGTTGGTGCAAGTTCTGAAGTTTATAGGTTAAACTTAGAACAAGGACGATACCTGAATCCTCTACA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  367  TTGTACTTTGTTGGTGCAAGTTCTGAAGTTTATAGGTTAAACTTAGAACAAGGACGATACCTGAATCCTCTACA  440

Query  519  AACTGATGCTGCGGAGAATAATGTTTGTGACATAAATTCAGTGCATGGCTTGTTTGCCACAGGAACCATAGAGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  441  AACTGATGCTGCGGAGAATAATGTTTGTGACATAAATTCAGTGCATGGCTTGTTTGCCACAGGAACCATAGAGG  514

Query  593  GTAGAGTGGAGTGCTGGGACCCAAGAACTCGAAACAGAGTTGGCCTGTTAGACTGCGCCTTAAACAGTGTCACA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  515  GTAGAGTGGAGTGCTGGGACCCAAGAACTCGAAACAGAGTTGGCCTGTTAGACTGCGCCTTAAACAGTGTCACA  588

Query  667  GCAGATTCAGAGATAAACAGTTTACCAACAATCTCTGCTTTGAAATTTAATGGTGCCTTGACCATGGCAGTTGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  589  GCAGATTCAGAGATAAACAGTTTACCAACAATCTCTGCTTTGAAATTTAATGGTGCCTTGACCATGGCAGTTGG  662

Query  741  AACAACCACAGGGCAGGTTTTATTATATGACCTTCGATCTGATAAGCCATTGCTAGTTAAAGATCACCAGTATG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  663  AACAACCACAGGGCAGGTTTTATTATATGACCTTCGATCTGATAAGCCATTGCTAGTTAAAGATCACCAGTATG  736

Query  815  GGCTGCCCATTAAGTCCGTTCATTTCCAGGATTCATTAGATCTGATTTTGTCTGCTGACTCTCGAATTGTCAAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  737  GGCTGCCCATTAAGTCCGTTCATTTCCAGGATTCATTAGATCTGATTTTGTCTGCTGACTCTCGAATTGTCAAG  810

Query  889  ATGTGGAATAAGAACTCCGGAAAAATATTTACTTCCTTGGAGCCAGAGCATGACCTTAATGATGTTTGTCTCTA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  811  ATGTGGAATAAGAACTCCGGAAAAATATTTACTTCCTTGGAGCCAGAGCATGACCTTAATGATGTTTGTCTCTA  884

Query  963  CCCCAACTCAGGCATGCTTCTGACGGCCAATGAAACCCCCAAGATGGGCATCTATTACATTCCAGTTTTGGGTC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  885  CCCCAACTCAGGCATGCTTCTGACGGCCAATGAAACCCCCAAGATGGGCATCTATTACATTCCAGTTTTGGGTC  958

Query 1037  CTGCTCCTCGGTGGTGTTCCTTCTTAGACAACTTGACCGAAGAATTAGAAGAGAATCCAGAAAGCACAGTCTAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  959  CTGCTCCTCGGTGGTGTTCCTTCTTAGACAACTTGACCGAAGAATTAGAAGAGAATCCAGAAAGCACAGTCTAT  1032

Query 1111  GATGATTATAAATTTGTCACCAAGAAAGACCTTGAAAATTTAGGGCTCACCCACCTCATTGGATCTCCTTTCCT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1033  GATGATTATAAATTTGTCACCAAGAAAGACCTTGAAAATTTAGGGCTCACCCACCTCATTGGATCTCCTTTCCT  1106

Query 1185  CCGGGCATATATGCATGGGTTTTTCATGGATATAAGACTCTATCACAAGGTGAAACTGATGGTAAATCCATTTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1107  CCGGGCATATATGCATGGGTTTTTCATGGATATAAGACTCTATCACAAGGTGAAACTGATGGTAAATCCATTTG  1180

Query 1259  CTTATGAAGAATATAGGAAAGATAAAATACGACAGAAAATAGAAGAAACACGTGCACAGAGAGTCCAGTTAAAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1181  CTTATGAAGAATATAGGAAAGATAAAATACGACAGAAAATAGAAGAAACACGTGCACAGAGAGTCCAGTTAAAG  1254

Query 1333  AAATTGCCAAAAGTTAACAAAGAGCTGGCACTTAAATTAATTGAGGAAGAAGAGGAGAAGCAGAAATCTACATG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1255  AAATTGCCAAAAGTTAACAAAGAGCTGGCACTTAAATTAATTGAGGAAGAAGAGGAGAAGCAGAAATCTACATG  1328

Query 1407  GAAAAAGAAAGTTAAGAGTCTTCCTAATATTCTCACCGATGATCGATTTAAAGTTATGTTTGAGAACCCTGACT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1329  GAAAAAGAAAGTTAAGAGTCTTCCTAATATTCTCACCGATGATCGATTTAAAGTTATGTTTGAGAACCCTGACT  1402

Query 1481  TCCAAGTAGATGAAGAGAGTGAAGAATTTAGGCTTCTGAATCCACTTGTTTCAAAAATTAGTGAAAAAAGGAAG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1403  TCCAAGTAGATGAAGAGAGTGAAGAATTTAGGCTTCTGAATCCACTTGTTTCAAAAATTAGTGAAAAAAGGAAG  1476

Query 1555  AAGAAACTAAGACTCTTAGAGCAACAAGAACTTCGTGAAAAAGAAGAGGAGGAAGAGCCGGAAGGAAAACCAAG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1477  AAGAAACTAAGACTCTTAGAGCAACAAGAACTTCGTGAAAAAGAAGAGGAGGAAGAGCCGGAAGGAAAACCAAG  1550

Query 1629  TGATGCAGAAAGTTCGGAGAGTTCAGATGATGAAAAAGCCTGGGTTGAAGAGGTCAGGAAGCAACGCAGACTCC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1551  TGATGCAGAAAGTTCGGAGAGTTCAGATGATGAAAAAGCCTGGGTTGAAGAGGTCAGGAAGCAACGCAGACTCC  1624

Query 1703  TCCAGCAGGAGGAAAAAGTGAAGCGGCAGGAACGACTCAAGGAGGACCAGCAGACAGTCCTAAAGCCCCAGTTT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1625  TCCAGCAGGAGGAAAAAGTGAAGCGGCAGGAACGACTCAAGGAGGACCAGCAGACAGTCCTAAAGCCCCAGTTT  1698

Query 1777  TATGAGATCAAAGCAGGAGAAGAATTTAGAAGCTTCAAAGATTCTGCCACAAAGCAGAAACTGATGAACAAAAC  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1699  TATGAGATCAAAGCAGGAGAAGAATTTAGAAGCTTCAAAGATTCTGCCACAAAGCAGAAACTGATGAACAAAAC  1772

Query 1851  CCTTGAAGATCGTTTGAAAATTGAAGCAAAAAATGGGACATTGAGTGTATCCGACACCACCGTTGGCAGCAAAC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1773  CCTTGAAGATCGTTTGAAAATTGAAGCAAAAAATGGGACATTGAGTGTATCCGACACCACCGTTGGCAGCAAAC  1846

Query 1925  AATTGACATTCACGTTAAAGAGGTCTGAACAGCAGAAGAAGCAACAGGAGGCTGAGAAACTGCATCGACAAGAA  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1847  AATTGACATTCACGTTAAAGAGGTCTGAACAGCAGAAGAAGCAACAGGAGGCTGAGAAACTGCATCGACAAGAA  1920

Query 1999  AGGAAAAGACTCCGTCGTTCGGCCGGACACCTGAAGTCAAGACACAAAAGAGGACGGTCGTTTCAT  2064
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921  AGGAAAAGACTCCGTCGTTCGGCCGGACACCTGAAGTCAAGACACAAAAGAGGACGGTCGTTTCAT  1986