Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000474127
- Subject:
- NM_001261392.1
- Aligned Length:
- 2064
- Identities:
- 1986
- Gaps:
- 78
Alignment
Query 1 ATGCAGGTCTCCAGCCTCAATGAGGTGAAGATTTACAGCCTCAGCTGCGGCAAGTCCCTTCCTGAGTGGCTTTC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCAGGTCTCCAGCCTCAATGAGGTGAAGATTTACAGCCTCAGCTGCGGCAAGTCCCTTCCTGAGTGGCTTTC 74
Query 75 TGATAGGAAGAAGAGAGCGCTACAGAAGAAAGATGTAGATGTCCGTAGGAGAATTGAACTTATTCAGGACTTTG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGATAGGAAGAAGAGAGCGCTACAGAAGAAAGATGTAGATGTCCGTAGGAGAATTGAACTTATTCAGGACTTTG 148
Query 149 AAATGCCTACTGTGTGTACCACTATTAAGGTGTCAAAAGATGGACAGTACATTTTAGCAACTGGAACATATAAA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AAATGCCTACTGTGTGTACCACTATTAAGGTGTCAAAAGATGGACAGTACATTTTAGCAACT------------ 210
Query 223 CCTCGGGTTCGATGTTATGACACCTATCAATTATCCTTGAAGTTTGAAAGGTGTTTAGATTCAGAAGTTGTCAC 296
||||||||
Sbjct 211 ------------------------------------------------------------------GTTGTCAC 218
Query 297 CTTTGAAATTTTGTCTGATGACTACTCAAAGATTGTCTTCTTACATAATGATAGATACATTGAATTTCATTCGC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 219 CTTTGAAATTTTGTCTGATGACTACTCAAAGATTGTCTTCTTACATAATGATAGATACATTGAATTTCATTCGC 292
Query 371 AATCAGGTTTTTACTACAAAACCAGAATACCAAAGTTTGGGAGAGATTTCTCTTACCACTATCCATCCTGTGAC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 293 AATCAGGTTTTTACTACAAAACCAGAATACCAAAGTTTGGGAGAGATTTCTCTTACCACTATCCATCCTGTGAC 366
Query 445 TTGTACTTTGTTGGTGCAAGTTCTGAAGTTTATAGGTTAAACTTAGAACAAGGACGATACCTGAATCCTCTACA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 367 TTGTACTTTGTTGGTGCAAGTTCTGAAGTTTATAGGTTAAACTTAGAACAAGGACGATACCTGAATCCTCTACA 440
Query 519 AACTGATGCTGCGGAGAATAATGTTTGTGACATAAATTCAGTGCATGGCTTGTTTGCCACAGGAACCATAGAGG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 441 AACTGATGCTGCGGAGAATAATGTTTGTGACATAAATTCAGTGCATGGCTTGTTTGCCACAGGAACCATAGAGG 514
Query 593 GTAGAGTGGAGTGCTGGGACCCAAGAACTCGAAACAGAGTTGGCCTGTTAGACTGCGCCTTAAACAGTGTCACA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 515 GTAGAGTGGAGTGCTGGGACCCAAGAACTCGAAACAGAGTTGGCCTGTTAGACTGCGCCTTAAACAGTGTCACA 588
Query 667 GCAGATTCAGAGATAAACAGTTTACCAACAATCTCTGCTTTGAAATTTAATGGTGCCTTGACCATGGCAGTTGG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 589 GCAGATTCAGAGATAAACAGTTTACCAACAATCTCTGCTTTGAAATTTAATGGTGCCTTGACCATGGCAGTTGG 662
Query 741 AACAACCACAGGGCAGGTTTTATTATATGACCTTCGATCTGATAAGCCATTGCTAGTTAAAGATCACCAGTATG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 663 AACAACCACAGGGCAGGTTTTATTATATGACCTTCGATCTGATAAGCCATTGCTAGTTAAAGATCACCAGTATG 736
Query 815 GGCTGCCCATTAAGTCCGTTCATTTCCAGGATTCATTAGATCTGATTTTGTCTGCTGACTCTCGAATTGTCAAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 737 GGCTGCCCATTAAGTCCGTTCATTTCCAGGATTCATTAGATCTGATTTTGTCTGCTGACTCTCGAATTGTCAAG 810
Query 889 ATGTGGAATAAGAACTCCGGAAAAATATTTACTTCCTTGGAGCCAGAGCATGACCTTAATGATGTTTGTCTCTA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 811 ATGTGGAATAAGAACTCCGGAAAAATATTTACTTCCTTGGAGCCAGAGCATGACCTTAATGATGTTTGTCTCTA 884
Query 963 CCCCAACTCAGGCATGCTTCTGACGGCCAATGAAACCCCCAAGATGGGCATCTATTACATTCCAGTTTTGGGTC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 885 CCCCAACTCAGGCATGCTTCTGACGGCCAATGAAACCCCCAAGATGGGCATCTATTACATTCCAGTTTTGGGTC 958
Query 1037 CTGCTCCTCGGTGGTGTTCCTTCTTAGACAACTTGACCGAAGAATTAGAAGAGAATCCAGAAAGCACAGTCTAT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 959 CTGCTCCTCGGTGGTGTTCCTTCTTAGACAACTTGACCGAAGAATTAGAAGAGAATCCAGAAAGCACAGTCTAT 1032
Query 1111 GATGATTATAAATTTGTCACCAAGAAAGACCTTGAAAATTTAGGGCTCACCCACCTCATTGGATCTCCTTTCCT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1033 GATGATTATAAATTTGTCACCAAGAAAGACCTTGAAAATTTAGGGCTCACCCACCTCATTGGATCTCCTTTCCT 1106
Query 1185 CCGGGCATATATGCATGGGTTTTTCATGGATATAAGACTCTATCACAAGGTGAAACTGATGGTAAATCCATTTG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1107 CCGGGCATATATGCATGGGTTTTTCATGGATATAAGACTCTATCACAAGGTGAAACTGATGGTAAATCCATTTG 1180
Query 1259 CTTATGAAGAATATAGGAAAGATAAAATACGACAGAAAATAGAAGAAACACGTGCACAGAGAGTCCAGTTAAAG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1181 CTTATGAAGAATATAGGAAAGATAAAATACGACAGAAAATAGAAGAAACACGTGCACAGAGAGTCCAGTTAAAG 1254
Query 1333 AAATTGCCAAAAGTTAACAAAGAGCTGGCACTTAAATTAATTGAGGAAGAAGAGGAGAAGCAGAAATCTACATG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1255 AAATTGCCAAAAGTTAACAAAGAGCTGGCACTTAAATTAATTGAGGAAGAAGAGGAGAAGCAGAAATCTACATG 1328
Query 1407 GAAAAAGAAAGTTAAGAGTCTTCCTAATATTCTCACCGATGATCGATTTAAAGTTATGTTTGAGAACCCTGACT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1329 GAAAAAGAAAGTTAAGAGTCTTCCTAATATTCTCACCGATGATCGATTTAAAGTTATGTTTGAGAACCCTGACT 1402
Query 1481 TCCAAGTAGATGAAGAGAGTGAAGAATTTAGGCTTCTGAATCCACTTGTTTCAAAAATTAGTGAAAAAAGGAAG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1403 TCCAAGTAGATGAAGAGAGTGAAGAATTTAGGCTTCTGAATCCACTTGTTTCAAAAATTAGTGAAAAAAGGAAG 1476
Query 1555 AAGAAACTAAGACTCTTAGAGCAACAAGAACTTCGTGAAAAAGAAGAGGAGGAAGAGCCGGAAGGAAAACCAAG 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1477 AAGAAACTAAGACTCTTAGAGCAACAAGAACTTCGTGAAAAAGAAGAGGAGGAAGAGCCGGAAGGAAAACCAAG 1550
Query 1629 TGATGCAGAAAGTTCGGAGAGTTCAGATGATGAAAAAGCCTGGGTTGAAGAGGTCAGGAAGCAACGCAGACTCC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1551 TGATGCAGAAAGTTCGGAGAGTTCAGATGATGAAAAAGCCTGGGTTGAAGAGGTCAGGAAGCAACGCAGACTCC 1624
Query 1703 TCCAGCAGGAGGAAAAAGTGAAGCGGCAGGAACGACTCAAGGAGGACCAGCAGACAGTCCTAAAGCCCCAGTTT 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1625 TCCAGCAGGAGGAAAAAGTGAAGCGGCAGGAACGACTCAAGGAGGACCAGCAGACAGTCCTAAAGCCCCAGTTT 1698
Query 1777 TATGAGATCAAAGCAGGAGAAGAATTTAGAAGCTTCAAAGATTCTGCCACAAAGCAGAAACTGATGAACAAAAC 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1699 TATGAGATCAAAGCAGGAGAAGAATTTAGAAGCTTCAAAGATTCTGCCACAAAGCAGAAACTGATGAACAAAAC 1772
Query 1851 CCTTGAAGATCGTTTGAAAATTGAAGCAAAAAATGGGACATTGAGTGTATCCGACACCACCGTTGGCAGCAAAC 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1773 CCTTGAAGATCGTTTGAAAATTGAAGCAAAAAATGGGACATTGAGTGTATCCGACACCACCGTTGGCAGCAAAC 1846
Query 1925 AATTGACATTCACGTTAAAGAGGTCTGAACAGCAGAAGAAGCAACAGGAGGCTGAGAAACTGCATCGACAAGAA 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1847 AATTGACATTCACGTTAAAGAGGTCTGAACAGCAGAAGAAGCAACAGGAGGCTGAGAAACTGCATCGACAAGAA 1920
Query 1999 AGGAAAAGACTCCGTCGTTCGGCCGGACACCTGAAGTCAAGACACAAAAGAGGACGGTCGTTTCAT 2064
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921 AGGAAAAGACTCCGTCGTTCGGCCGGACACCTGAAGTCAAGACACAAAAGAGGACGGTCGTTTCAT 1986