Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000474127
- Subject:
- XM_011510399.2
- Aligned Length:
- 2065
- Identities:
- 1612
- Gaps:
- 452
Alignment
Query 1 ATGCAGGTCTCCAGCCTCAATGAGGTGAAGATTTACAGCCTCAGCTGCGGCAAGTCCCTTCCTGAGTGGCTTTC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TGATAGGAAGAAGAGAGCGCTACAGAAGAAAGATGTAGATGTCCGTAGGAGAATTGAACTTATTCAGGACTTTG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AAATGCCTACTGTGTGTACCACTATTAAGGTGTCAAAAGATGGACAGTACATTTTAGCAACTGGAACATATAAA 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CCTCGGGTTCGATGTTATGACACCTATCAATTATCCTTGAAGTTTGAAAGGTGTTTAGATTCAGAAGTTGTCAC 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 CTTTGAAATTTTGTCTGATGACTACTCAAAGATTGTCTTCTTACATAATGATAGATACATTGAATTTCATTCGC 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 AATCAGGTTTTTACTACAAAACCAGAATACCAAAGTTTGGGAGAGATTTCTCTTACCACTATCCATCCTGTGAC 444
.||||
Sbjct 1 ---------------------------------------------------------------------ATGAC 5
Query 445 TTGTACTTTGTTGGTGC-AAGTTCTGAAGTTTATAGGTTAAACTTAGAACAAGGACGATACCTGAATCCTCTAC 517
|||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 6 ---TACT---------CAAAGTTCTGAAGTTTATAGGTTAAACTTAGAACAAGGACGATACCTGAATCCTCTAC 67
Query 518 AAACTGATGCTGCGGAGAATAATGTTTGTGACATAAATTCAGTGCATGGCTTGTTTGCCACAGGAACCATAGAG 591
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 68 AAACTGATGCTGCGGAGAATAATGTTTGTGACATAAATTCAGTGCATGGCTTGTTTGCCACAGGAACCATAGAG 141
Query 592 GGTAGAGTGGAGTGCTGGGACCCAAGAACTCGAAACAGAGTTGGCCTGTTAGACTGCGCCTTAAACAGTGTCAC 665
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 142 GGTAGAGTGGAGTGCTGGGACCCAAGAACTCGAAACAGAGTTGGCCTGTTAGACTGCGCCTTAAACAGTGTCAC 215
Query 666 AGCAGATTCAGAGATAAACAGTTTACCAACAATCTCTGCTTTGAAATTTAATGGTGCCTTGACCATGGCAGTTG 739
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 216 AGCAGATTCAGAGATAAACAGTTTACCAACAATCTCTGCTTTGAAATTTAATGGTGCCTTGACCATGGCAGTTG 289
Query 740 GAACAACCACAGGGCAGGTTTTATTATATGACCTTCGATCTGATAAGCCATTGCTAGTTAAAGATCACCAGTAT 813
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 290 GAACAACCACAGGGCAGGTTTTATTATATGACCTTCGATCTGATAAGCCATTGCTAGTTAAAGATCACCAGTAT 363
Query 814 GGGCTGCCCATTAAGTCCGTTCATTTCCAGGATTCATTAGATCTGATTTTGTCTGCTGACTCTCGAATTGTCAA 887
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 364 GGGCTGCCCATTAAGTCCGTTCATTTCCAGGATTCATTAGATCTGATTTTGTCTGCTGACTCTCGAATTGTCAA 437
Query 888 GATGTGGAATAAGAACTCCGGAAAAATATTTACTTCCTTGGAGCCAGAGCATGACCTTAATGATGTTTGTCTCT 961
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 438 GATGTGGAATAAGAACTCCGGAAAAATATTTACTTCCTTGGAGCCAGAGCATGACCTTAATGATGTTTGTCTCT 511
Query 962 ACCCCAACTCAGGCATGCTTCTGACGGCCAATGAAACCCCCAAGATGGGCATCTATTACATTCCAGTTTTGGGT 1035
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 512 ACCCCAACTCAGGCATGCTTCTGACGGCCAATGAAACCCCCAAGATGGGCATCTATTACATTCCAGTTTTGGGT 585
Query 1036 CCTGCTCCTCGGTGGTGTTCCTTCTTAGACAACTTGACCGAAGAATTAGAAGAGAATCCAGAAAGCACAGTCTA 1109
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 586 CCTGCTCCTCGGTGGTGTTCCTTCTTAGACAACTTGACCGAAGAATTAGAAGAGAATCCAGAAAGCACAGTCTA 659
Query 1110 TGATGATTATAAATTTGTCACCAAGAAAGACCTTGAAAATTTAGGGCTCACCCACCTCATTGGATCTCCTTTCC 1183
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 660 TGATGATTATAAATTTGTCACCAAGAAAGACCTTGAAAATTTAGGGCTCACCCACCTCATTGGATCTCCTTTCC 733
Query 1184 TCCGGGCATATATGCATGGGTTTTTCATGGATATAAGACTCTATCACAAGGTGAAACTGATGGTAAATCCATTT 1257
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 734 TCCGGGCATATATGCATGGGTTTTTCATGGATATAAGACTCTATCACAAGGTGAAACTGATGGTAAATCCATTT 807
Query 1258 GCTTATGAAGAATATAGGAAAGATAAAATACGACAGAAAATAGAAGAAACACGTGCACAGAGAGTCCAGTTAAA 1331
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 808 GCTTATGAAGAATATAGGAAAGATAAAATACGACAGAAAATAGAAGAAACACGTGCACAGAGAGTCCAGTTAAA 881
Query 1332 GAAATTGCCAAAAGTTAACAAAGAGCTGGCACTTAAATTAATTGAGGAAGAAGAGGAGAAGCAGAAATCTACAT 1405
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 882 GAAATTGCCAAAAGTTAACAAAGAGCTGGCACTTAAATTAATTGAGGAAGAAGAGGAGAAGCAGAAATCTACAT 955
Query 1406 GGAAAAAGAAAGTTAAGAGTCTTCCTAATATTCTCACCGATGATCGATTTAAAGTTATGTTTGAGAACCCTGAC 1479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 956 GGAAAAAGAAAGTTAAGAGTCTTCCTAATATTCTCACCGATGATCGATTTAAAGTTATGTTTGAGAACCCTGAC 1029
Query 1480 TTCCAAGTAGATGAAGAGAGTGAAGAATTTAGGCTTCTGAATCCACTTGTTTCAAAAATTAGTGAAAAAAGGAA 1553
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1030 TTCCAAGTAGATGAAGAGAGTGAAGAATTTAGGCTTCTGAATCCACTTGTTTCAAAAATTAGTGAAAAAAGGAA 1103
Query 1554 GAAGAAACTAAGACTCTTAGAGCAACAAGAACTTCGTGAAAAAGAAGAGGAGGAAGAGCCGGAAGGAAAACCAA 1627
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1104 GAAGAAACTAAGACTCTTAGAGCAACAAGAACTTCGTGAAAAAGAAGAGGAGGAAGAGCCGGAAGGAAAACCAA 1177
Query 1628 GTGATGCAGAAAGTTCGGAGAGTTCAGATGATGAAAAAGCCTGGGTTGAAGAGGTCAGGAAGCAACGCAGACTC 1701
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1178 GTGATGCAGAAAGTTCGGAGAGTTCAGATGATGAAAAAGCCTGGGTTGAAGAGGTCAGGAAGCAACGCAGACTC 1251
Query 1702 CTCCAGCAGGAGGAAAAAGTGAAGCGGCAGGAACGACTCAAGGAGGACCAGCAGACAGTCCTAAAGCCCCAGTT 1775
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1252 CTCCAGCAGGAGGAAAAAGTGAAGCGGCAGGAACGACTCAAGGAGGACCAGCAGACAGTCCTAAAGCCCCAGTT 1325
Query 1776 TTATGAGATCAAAGCAGGAGAAGAATTTAGAAGCTTCAAAGATTCTGCCACAAAGCAGAAACTGATGAACAAAA 1849
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1326 TTATGAGATCAAAGCAGGAGAAGAATTTAGAAGCTTCAAAGATTCTGCCACAAAGCAGAAACTGATGAACAAAA 1399
Query 1850 CCCTTGAAGATCGTTTGAAAATTGAAGCAAAAAATGGGACATTGAGTGTATCCGACACCACCGTTGGCAGCAAA 1923
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1400 CCCTTGAAGATCGTTTGAAAATTGAAGCAAAAAATGGGACATTGAGTGTATCCGACACCACCGTTGGCAGCAAA 1473
Query 1924 CAATTGACATTCACGTTAAAGAGGTCTGAACAGCAGAAGAAGCAACAGGAGGCTGAGAAACTGCATCGACAAGA 1997
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1474 CAATTGACATTCACGTTAAAGAGGTCTGAACAGCAGAAGAAGCAACAGGAGGCTGAGAAACTGCATCGACAAGA 1547
Query 1998 AAGGAAAAGACTCCGTCGTTCGGCCGGACACCTGAAGTCAAGACACAAAAGAGGACGGTCGTTTCAT 2064
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1548 AAGGAAAAGACTCCGTCGTTCGGCCGGACACCTGAAGTCAAGACACAAAAGAGGACGGTCGTTTCAT 1614