Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000474141
- Subject:
- NM_001191058.4
- Aligned Length:
- 2313
- Identities:
- 1860
- Gaps:
- 417
Alignment
Query 1 ----------------------------------------------------------------ATGG------ 4
||||
Sbjct 1 ATGACGGACGCCGGCAACAGGAAGGAGGGCTTCAAAAAATGCCGGAGCGCCACTTTCAGCATCGATGGCTACAG 74
Query 5 ---------AGTCGCCAACAAA---GGAGATTGAAGAATTTGAGAGC--------------------------- 39
|||.||.||..|| ||||| .||||||...|||.|
Sbjct 75 CTTCACCATAGTTGCAAATGAAGCTGGAGA--CAAGAATGCCAGACCACTGGCCCGCTTCTCTCGGTCTAAGTC 146
Query 40 ----AACTCTCT---GAAATACCTGCAACCGGA-------ACAG--------ATCGAGAA------------AA 79
||||.||| |||.|.||| ||.| || |||| |..||||| ||
Sbjct 147 ACAGAACTGTCTGTGGAACTCCCT-CATC--GATGGGCTCACAGGGAATGTCAAGGAGAAGCCAAGGCCAACAA 217
Query 80 TCTG-------GCTTCGGCTCC--GCGG--------GCTGAGGAAAT-----------ATA------------- 112
| || .|.|||.|.|| |.|| |||||.|||.| |||
Sbjct 218 T-TGTCCATGACCCTCGACCCCCAGAGGAGATCCTAGCTGATGAATTGCCACAGCTGGATAGCCCAGAAGTCTT 290
Query 113 --AGAAAACGTCCCAGAGATTACGGTCTTTGGTCAAACAATTAGAGAGAGGGGAAGCTTCAGTGGTAGATCTTA 184
.|||.||.|||...||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 291 GGTGAAGACATCCTTCAGATTACGGTCTTTGGTCAAACAATTAGAGAGAGGGGAAGCTTCAGTGGTAGATCTTA 364
Query 185 AGAAGAATTTGGAATATGCAGCCACAGTGCTTGAATCTGTGTATATTGATGAAACAAGGAGACTCCTGGATACA 258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 365 AGAAGAATTTGGAATATGCAGCCACAGTGCTTGAATCTGTGTATATTGATGAAACAAGGAGACTCCTGGATACA 438
Query 259 GAGGATGAGCTCAGTGACATTCAGTCAGATGCTGTGCCTTCTGAGGTCCGAGACTGGCTGGCCTCCACCTTCAC 332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 439 GAGGATGAGCTCAGTGACATTCAGTCAGATGCTGTGCCTTCTGAGGTCCGAGACTGGCTGGCCTCCACCTTCAC 512
Query 333 GCGGCAGATGGGGATGATGCTCAGGAGGAGCGACGAGAAGCCCCGGTTCAAGAGCATCGTTCACGCAGTGCAGG 406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 513 GCGGCAGATGGGGATGATGCTCAGGAGGAGCGACGAGAAGCCCCGGTTCAAGAGCATCGTTCACGCAGTGCAGG 586
Query 407 CTGGGATATTTGTGGAGAGAATGTATAGACGGACATCAAACATGGTTGGACTGAGCTATCCACCAGCTGTTATT 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 587 CTGGGATATTTGTGGAGAGAATGTATAGACGGACATCAAACATGGTTGGACTGAGCTATCCACCAGCTGTTATT 660
Query 481 GAGGCATTAAAGGATGTGGACAAGTGGTCATTTGACGTCTTTTCCCTCAATGAGGCCAGTGGGGATCATGCACT 554
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 GAGGCATTAAAGGATGTGGACAAGTGGTCCTTTGACGTCTTTTCCCTCAATGAGGCCAGTGGGGATCATGCACT 734
Query 555 GAAATTTATTTTCTATGAACTACTCACACGTTATGATCTGATCAGCCGTTTCAAGATCCCCATTTCTGCACTTG 628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 735 GAAATTTATTTTCTATGAACTACTCACACGTTATGATCTGATCAGCCGTTTCAAGATCCCCATTTCTGCACTTG 808
Query 629 TCTCATTTGTGGAGGCCCTGGAAGTGGGATACAGCAAGCACAAAAATCCTTACCATAACTTAATGCACGCTGCC 702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 809 TCTCATTTGTGGAGGCCCTGGAAGTGGGATACAGCAAGCACAAAAATCCTTACCATAACTTAATGCACGCTGCC 882
Query 703 GATGTTACACAGACAGTGCATTACCTCCTCTATAAGACAGGAGTGGCGAACTGGCTGACGGAGCTGGAGATCTT 776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 883 GATGTTACACAGACAGTGCATTACCTCCTCTATAAGACAGGAGTGGCGAACTGGCTGACGGAGCTGGAGATCTT 956
Query 777 TGCTATAATCTTCTCAGCTGCCATCCATGACTACGAGCATACCGGAACCACCAACAATTTCCACATTCAGACTC 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 957 TGCTATAATCTTCTCAGCTGCCATCCATGACTACGAGCATACCGGAACCACCAACAATTTCCACATTCAGACTC 1030
Query 851 GGTCTGATCCAGCTATTCTGTATAATGACAGATCTGTACTGGAGAATCACCATTTAAGTGCAGCTTATCGCCTT 924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1031 GGTCTGATCCAGCTATTCTGTATAATGACAGATCTGTACTGGAGAATCACCATTTAAGTGCAGCTTATCGCCTT 1104
Query 925 CTGCAAGATGACGAGGAAATGAATATTTTGATTAACCTCTCAAAGGATGACTGGAGGGAGTTTCGAACCTTGGT 998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1105 CTGCAAGATGACGAGGAAATGAATATTTTGATTAACCTCTCAAAGGATGACTGGAGGGAGTTTCGAACCTTGGT 1178
Query 999 AATTGAAATGGTGATGGCCACAGATATGTCTTGTCACTTCCAACAAATCAAAGCAATGAAGACTGCTCTGCAGC 1072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1179 AATTGAAATGGTGATGGCCACAGATATGTCTTGTCACTTCCAACAAATCAAAGCAATGAAGACTGCTCTGCAGC 1252
Query 1073 AGCCAGAAGCCATTGAAAAGCCAAAAGCCTTATCCCTTATGCTGCATACAGCAGATATTAGCCATCCAGCAAAA 1146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1253 AGCCAGAAGCCATTGAAAAGCCAAAAGCCTTATCCCTTATGCTGCATACAGCAGATATTAGCCATCCAGCAAAA 1326
Query 1147 GCATGGGACCTCCATCATCGCTGGACAATGTCACTCCTGGAGGAGTTCTTCAGACAGGGTGACAGAGAAGCAGA 1220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1327 GCATGGGACCTCCATCATCGCTGGACAATGTCACTCCTGGAGGAGTTCTTCAGACAGGGTGACAGAGAAGCAGA 1400
Query 1221 GCTGGGGCTGCCTTTTTCTCCTCTGTGTGACCGAAAGTCCACTATGGTTGCTCAGTCACAAGTAGGTTTCATTG 1294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1401 GCTGGGGCTGCCTTTTTCTCCTCTGTGTGACCGAAAGTCCACTATGGTTGCTCAGTCACAAGTAGGTTTCATTG 1474
Query 1295 ATTTCATCGTGGAACCCACCTTCACTGTGCTTACGGACATGACCGAGAAGATTGTGAGTCCATTAATCGATGAA 1368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1475 ATTTCATCGTGGAACCCACCTTCACTGTGCTTACGGACATGACCGAGAAGATTGTGAGTCCATTAATCGATGAA 1548
Query 1369 ACCTCTCAAACTGGTGGGACAGGACAGAGGCGTTCGAGTTTGAATAGCATCAGCTCGTCAGATGCCAAGCGATC 1442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1549 ACCTCTCAAACTGGTGGGACAGGACAGAGGCGTTCGAGTTTGAATAGCATCAGCTCGTCAGATGCCAAGCGATC 1622
Query 1443 AGGTGTCAAGACCTCTGGTTCAGAGGGAAGTGCCCCGATCAACAATTCTGTCATCTCCGTTGACTATAAGAGCT 1516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1623 AGGTGTCAAGACCTCTGGTTCAGAGGGAAGTGCCCCGATCAACAATTCTGTCATCTCCGTTGACTATAAGAGCT 1696
Query 1517 TTAAAGCTACTTGGACGGAAGTGGTGCACATCAATCGGGAGAGATGGAGGGCCAAGGTACCCAAAGAGGAGAAG 1590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1697 TTAAAGCTACTTGGACGGAAGTGGTGCACATCAATCGGGAGAGATGGAGGGCCAAGGTACCCAAAGAGGAGAAG 1770
Query 1591 GCCAAGAAGGAAGCAGAGGAAAAGGCTCGCATGGCCGCAGAGGAGCAGCAAAAGGAAATGGAAGCCAAAAGCCA 1664
||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1771 GCCAAGAAGGAAGCAGAGGAAAAGGCTCGCCTGGCCGCAGAGGAGCAGCAAAAGGAAATGGAAGCCAAAAGCCA 1844
Query 1665 GGCTGAAGAAGGCGCATCTGGCAAAGCTGAGAAAAAGACGTCTGGAGAAACTAAGAATCAAGTCAATGGAACAC 1738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1845 GGCTGAAGAAGGCGCATCTGGCAAAGCTGAGAAAAAGACGTCTGGAGAAACTAAGAATCAAGTCAATGGAACAC 1918
Query 1739 GGGCAAACAAAAGTGACAACCCTCGTGGGAAAAATTCCAAAGCCGAGAAGTCATCAGGAGAACAGCAACAGAAT 1812
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1919 GGGCAAACAAAAGTGACAACCCTCGTGGGAAAAACTCCAAAGCCGAGAAGTCATCAGGAGAACAGCAACAGAAT 1992
Query 1813 GGTGACTTCAAAGATGGTAAAAATAAGACAGACAAGAAGGATCACTCTAACATCGGAAATGATTCAAAGAAAAC 1886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1993 GGTGACTTCAAAGATGGTAAAAATAAGACAGACAAGAAGGATCACTCTAACATCGGAAATGATTCAAAGAAAAC 2066
Query 1887 AGATGATTCACAAGAG---------------------------------------------------------- 1902
|||||...||.||.||
Sbjct 2067 AGATGGCACAAAACAGCGTTCTCACGGCTCACCAGCCCCAAGCACCAGCTCCACGTGTCGCCTTACGTTGCCAG 2140
Query 1903 -------------------------------------------------------------------------- 1902
Sbjct 2141 TCATCAAGCCTCCTTTGCGTCATTTTAAACGCCCTGCTTACGCATCTAGCTCCTATGCACCTTCAGTCTCAAAG 2214
Query 1903 -------------------------------------------------------------------------- 1902
Sbjct 2215 AAAACTGATGAGCATCCTGCAAGGTACAAGATGCTGGATCAGAGGATCAAAATGAAAAAGATTCAGAACATCTC 2288
Query 1903 ------------------- 1902
Sbjct 2289 ACATAACTGGAACAGAAAA 2307