Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000474141
- Subject:
- XM_017012264.1
- Aligned Length:
- 2418
- Identities:
- 1862
- Gaps:
- 522
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCCACTTCACAGCATTTGCACTTCGACCGAGAGCAGCCCTGTCTTTTGCCTGAGGAGCTCTCACAATGGAGT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TGCCATTGTCAGCAAACAATTAGAGTGCCCGCTTTTAGGGGGCCAGCTGAGAGGTTGTATTTGCTGTGGGAAAC 148
Query 1 --------ATGGAGTC-----------------GCCAA-------CAAA-------GGAGATTGAAGAATTTGA 35
.||||||| |||.| |||| ||||| .||||||...|
Sbjct 149 CCTGGGCTTTGGAGTCACACGCAGATTTATCATGCCCATTAGTTGCAAATGAAGCTGGAGA--CAAGAATGCCA 220
Query 36 GAGC-------------------------------AACTCTCT---GAAATACCTGCAACCGGA-------ACA 68
||.| ||||.||| |||.|.||| ||.| || |||
Sbjct 221 GACCACTGGCCCGCTTCTCTCGGTCTAAGTCACAGAACTGTCTGTGGAACTCCCT-CATC--GATGGGCTCACA 291
Query 69 G--------ATCGAGAA------------AATCTG-------GCTTCGGCTCC--GCGG--------GCTGAGG 105
| |..||||| ||| || .|.|||.|.|| |.|| |||||.|
Sbjct 292 GGGAATGTCAAGGAGAAGCCAAGGCCAACAAT-TGTCCATGACCCTCGACCCCCAGAGGAGATCCTAGCTGATG 364
Query 106 AAAT-----------ATA---------------AGAAAACGTCCCAGAGATTACGGTCTTTGGTCAAACAATTA 153
||.| ||| .|||.||.|||...|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 365 AATTGCCACAGCTGGATAGCCCAGAAGTCTTGGTGAAGACATCCTTCAGATTACGGTCTTTGGTCAAACAATTA 438
Query 154 GAGAGAGGGGAAGCTTCAGTGGTAGATCTTAAGAAGAATTTGGAATATGCAGCCACAGTGCTTGAATCTGTGTA 227
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 439 GAGAGAGGGGAAGCTTCAGTGGTAGATCTTAAGAAGAATTTGGAATATGCAGCCACAGTGCTTGAATCTGTGTA 512
Query 228 TATTGATGAAACAAGGAGACTCCTGGATACAGAGGATGAGCTCAGTGACATTCAGTCAGATGCTGTGCCTTCTG 301
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 513 TATTGATGAAACAAGGAGACTCCTGGATACAGAGGATGAGCTCAGTGACATTCAGTCAGATGCTGTGCCTTCTG 586
Query 302 AGGTCCGAGACTGGCTGGCCTCCACCTTCACGCGGCAGATGGGGATGATGCTCAGGAGGAGCGACGAGAAGCCC 375
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 587 AGGTCCGAGACTGGCTGGCCTCCACCTTCACGCGGCAGATGGGGATGATGCTCAGGAGGAGCGACGAGAAGCCC 660
Query 376 CGGTTCAAGAGCATCGTTCACGCAGTGCAGGCTGGGATATTTGTGGAGAGAATGTATAGACGGACATCAAACAT 449
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 661 CGGTTCAAGAGCATCGTTCACGCAGTGCAGGCTGGGATATTTGTGGAGAGAATGTATAGACGGACATCAAACAT 734
Query 450 GGTTGGACTGAGCTATCCACCAGCTGTTATTGAGGCATTAAAGGATGTGGACAAGTGGTCATTTGACGTCTTTT 523
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 735 GGTTGGACTGAGCTATCCACCAGCTGTTATTGAGGCATTAAAGGATGTGGACAAGTGGTCCTTTGACGTCTTTT 808
Query 524 CCCTCAATGAGGCCAGTGGGGATCATGCACTGAAATTTATTTTCTATGAACTACTCACACGTTATGATCTGATC 597
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 809 CCCTCAATGAGGCCAGTGGGGATCATGCACTGAAATTTATTTTCTATGAACTACTCACACGTTATGATCTGATC 882
Query 598 AGCCGTTTCAAGATCCCCATTTCTGCACTTGTCTCATTTGTGGAGGCCCTGGAAGTGGGATACAGCAAGCACAA 671
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 883 AGCCGTTTCAAGATCCCCATTTCTGCACTTGTCTCATTTGTGGAGGCCCTGGAAGTGGGATACAGCAAGCACAA 956
Query 672 AAATCCTTACCATAACTTAATGCACGCTGCCGATGTTACACAGACAGTGCATTACCTCCTCTATAAGACAGGAG 745
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 957 AAATCCTTACCATAACTTAATGCACGCTGCCGATGTTACACAGACAGTGCATTACCTCCTCTATAAGACAGGAG 1030
Query 746 TGGCGAACTGGCTGACGGAGCTGGAGATCTTTGCTATAATCTTCTCAGCTGCCATCCATGACTACGAGCATACC 819
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1031 TGGCGAACTGGCTGACGGAGCTGGAGATCTTTGCTATAATCTTCTCAGCTGCCATCCATGACTACGAGCATACC 1104
Query 820 GGAACCACCAACAATTTCCACATTCAGACTCGGTCTGATCCAGCTATTCTGTATAATGACAGATCTGTACTGGA 893
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1105 GGAACCACCAACAATTTCCACATTCAGACTCGGTCTGATCCAGCTATTCTGTATAATGACAGATCTGTACTGGA 1178
Query 894 GAATCACCATTTAAGTGCAGCTTATCGCCTTCTGCAAGATGACGAGGAAATGAATATTTTGATTAACCTCTCAA 967
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1179 GAATCACCATTTAAGTGCAGCTTATCGCCTTCTGCAAGATGACGAGGAAATGAATATTTTGATTAACCTCTCAA 1252
Query 968 AGGATGACTGGAGGGAGTTTCGAACCTTGGTAATTGAAATGGTGATGGCCACAGATATGTCTTGTCACTTCCAA 1041
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1253 AGGATGACTGGAGGGAGTTTCGAACCTTGGTAATTGAAATGGTGATGGCCACAGATATGTCTTGTCACTTCCAA 1326
Query 1042 CAAATCAAAGCAATGAAGACTGCTCTGCAGCAGCCAGAAGCCATTGAAAAGCCAAAAGCCTTATCCCTTATGCT 1115
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1327 CAAATCAAAGCAATGAAGACTGCTCTGCAGCAGCCAGAAGCCATTGAAAAGCCAAAAGCCTTATCCCTTATGCT 1400
Query 1116 GCATACAGCAGATATTAGCCATCCAGCAAAAGCATGGGACCTCCATCATCGCTGGACAATGTCACTCCTGGAGG 1189
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1401 GCATACAGCAGATATTAGCCATCCAGCAAAAGCATGGGACCTCCATCATCGCTGGACAATGTCACTCCTGGAGG 1474
Query 1190 AGTTCTTCAGACAGGGTGACAGAGAAGCAGAGCTGGGGCTGCCTTTTTCTCCTCTGTGTGACCGAAAGTCCACT 1263
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1475 AGTTCTTCAGACAGGGTGACAGAGAAGCAGAGCTGGGGCTGCCTTTTTCTCCTCTGTGTGACCGAAAGTCCACT 1548
Query 1264 ATGGTTGCTCAGTCACAAGTAGGTTTCATTGATTTCATCGTGGAACCCACCTTCACTGTGCTTACGGACATGAC 1337
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1549 ATGGTTGCTCAGTCACAAGTAGGTTTCATTGATTTCATCGTGGAACCCACCTTCACTGTGCTTACGGACATGAC 1622
Query 1338 CGAGAAGATTGTGAGTCCATTAATCGATGAAACCTCTCAAACTGGTGGGACAGGACAGAGGCGTTCGAGTTTGA 1411
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1623 CGAGAAGATTGTGAGTCCATTAATCGATGAAACCTCTCAAACTGGTGGGACAGGACAGAGGCGTTCGAGTTTGA 1696
Query 1412 ATAGCATCAGCTCGTCAGATGCCAAGCGATCAGGTGTCAAGACCTCTGGTTCAGAGGGAAGTGCCCCGATCAAC 1485
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1697 ATAGCATCAGCTCGTCAGATGCCAAGCGATCAGGTGTCAAGACCTCTGGTTCAGAGGGAAGTGCCCCGATCAAC 1770
Query 1486 AATTCTGTCATCTCCGTTGACTATAAGAGCTTTAAAGCTACTTGGACGGAAGTGGTGCACATCAATCGGGAGAG 1559
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1771 AATTCTGTCATCTCCGTTGACTATAAGAGCTTTAAAGCTACTTGGACGGAAGTGGTGCACATCAATCGGGAGAG 1844
Query 1560 ATGGAGGGCCAAGGTACCCAAAGAGGAGAAGGCCAAGAAGGAAGCAGAGGAAAAGGCTCGCATGGCCGCAGAGG 1633
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1845 ATGGAGGGCCAAGGTACCCAAAGAGGAGAAGGCCAAGAAGGAAGCAGAGGAAAAGGCTCGCCTGGCCGCAGAGG 1918
Query 1634 AGCAGCAAAAGGAAATGGAAGCCAAAAGCCAGGCTGAAGAAGGCGCATCTGGCAAAGCTGAGAAAAAGACGTCT 1707
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1919 AGCAGCAAAAGGAAATGGAAGCCAAAAGCCAGGCTGAAGAAGGCGCATCTGGCAAAGCTGAGAAAAAGACGTCT 1992
Query 1708 GGAGAAACTAAGAATCAAGTCAATGGAACACGGGCAAACAAAAGTGACAACCCTCGTGGGAAAAATTCCAAAGC 1781
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1993 GGAGAAACTAAGAATCAAGTCAATGGAACACGGGCAAACAAAAGTGACAACCCTCGTGGGAAAAACTCCAAAGC 2066
Query 1782 CGAGAAGTCATCAGGAGAACAGCAACAGAATGGTGACTTCAAAGATGGTAAAAATAAGACAGACAAGAAGGATC 1855
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2067 CGAGAAGTCATCAGGAGAACAGCAACAGAATGGTGACTTCAAAGATGGTAAAAATAAGACAGACAAGAAGGATC 2140
Query 1856 ACTCTAACATCGGAAATGATTCAAAGAAAACAGATGATTCACAAGAG--------------------------- 1902
||||||||||||||||||||||||||||||||||||...||.||.||
Sbjct 2141 ACTCTAACATCGGAAATGATTCAAAGAAAACAGATGGCACAAAACAGCGTTCTCACGGCTCACCAGCCCCAAGC 2214
Query 1903 -------------------------------------------------------------------------- 1902
Sbjct 2215 ACCAGCTCCACGTGTCGCCTTACGTTGCCAGTCATCAAGCCTCCTTTGCGTCATTTTAAACGCCCTGCTTACGC 2288
Query 1903 -------------------------------------------------------------------------- 1902
Sbjct 2289 ATCTAGCTCCTATGCACCTTCAGTCTCAAAGAAAACTGATGAGCATCCTGCAAGGTACAAGATGCTGGATCAGA 2362
Query 1903 -------------------------------------------------- 1902
Sbjct 2363 GGATCAAAATGAAAAAGATTCAGAACATCTCACATAACTGGAACAGAAAA 2412