Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000474158
- Subject:
- NR_023357.1
- Aligned Length:
- 1467
- Identities:
- 881
- Gaps:
- 463
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 AGTCCACGGCGGCGGGAACCCGCACCGCCCGACGCACGGGGCGGCCAGGCCGACGGCGGACGGCGCGGCGGGAG 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 ACTCCGGGCCACTCACTCTGAGGGAAGCCAACCAACCATCTTGGTCACTCAGGAAGCCTGTGGAGAGGTATATG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 TAAGAAGGAACTAGAGCTTCCAGCCAACAACCAACACCAACTGGCCAATCAGAGACAGCTGCATCTTCTGCAGT 222
Query 1 --------------ATGGGGAA---GGTGAAGGTCGGAGTCAACGGATTTGGTCGTATTGGGCGCCTGGTCACC 57
||.|..|| ||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 223 GCCAGCCTCATCCCATAGACAAAATGGTGAAGGTCGGCGTGAACGGATTTGGCCGTATTGGGCGCCTGGTTACC 296
Query 58 AGGG-------CTGCTTTTAACTCTGGTAAAGTGGATATTGTTGCCATCAATGACCCCTTCATTGACCTCAACT 124
|||| |||||.|..||| |||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 297 AGGGCTGCCGTCTGCTCTCCACT-TGGCAAAGTGGAGATTGTTGCCATCAACGACCCCTTCATTGACCTTAACT 369
Query 125 ACATGGTTTACATGTTCCAATATGATTCCACCCATGGCAAATTCCATGGCACCGTCAAGGCTGAGAACGGGAAG 198
|||||||.|||||||||||.|.|||.||||||||.|||||||||.|..||||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct 370 ACATGGTCTACATGTTCCAGTCTGACTCCACCCACGGCAAATTCAACAGCACAGTCAAGGCCGAGAATGGGAAG 443
Query 199 CTTGTCATCAATGGAAATCCCATCACCATCTTCCAGGAGCGAGATCCCTCCAAAATCAAGTGGGGCGATGCTGG 272
|||||||||||.||.||.||||||||..||||||||||||.||||||..|.||.||.||.|||||.||||||||
Sbjct 444 CTTGTCATCAACGGGAAGCCCATCACTGTCTTCCAGGAGCTAGATCCTGCTAACATTAAATGGGGTGATGCTGG 517
Query 273 CGCTGAGTACGTCGTGGAGTCCACTGGCGTCTTCACCACCATGGAGAAGGCTGGGGCTCATTTGCAGGGGGGAG 346
.||||||||.||.||||||||.||||||.||||.||||||||||.||||||||||||.||.|||.||||.||||
Sbjct 518 TGCTGAGTATGTTGTGGAGTCTACTGGCCTCTTTACCACCATGGGGAAGGCTGGGGCCCACTTGAAGGGTGGAG 591
Query 347 CCAAAAGGGTCATCATCTCTGCCCCCTCTGCTGACGCCCCCATGTTCGTCATGGGTGTGAACCATGAGAAGTAT 420
|||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 592 CCAAAAGGGTCATCATCTCTGCCCCTTCTGCTGATGCCCCCATGTTTGTGATGGGTGTGAACCACGAGAAATAT 665
Query 421 GACAACAGCCTCAAGATCATCAGCAATGCCTCCTGCACCACCAACTGCTTAGCACCCCTGGCCAAGGTCATCCA 494
||.|||...||.|||||..||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 666 GATAACTCACTAAAGATTGTCAGCAATGCATCCTGCACCACCAACTGCTTAGCCCCCCTGGCCAAGGTCATCCA 739
Query 495 TGACAACTTTGGTATCGTGGAAGGACTCATGACCACAGTCCATGCCATCACTGCCACCCAGAAGACTGTGGATG 568
||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.||||
Sbjct 740 TGACAACTTTGGCATCGTGGAAGGGCTCATGACCACAGTCCATGCCATCACTGCCACTCAGATGACTGTTGATG 813
Query 569 GCCCCTCCGGGAAACTGTGGCGTGATGGCCGCGGGGCTCTCCAGAACATCATCCCTGCCTCTACTGGCGCTGCC 642
|||||||..|.|||..|||||||||||||||.||||||..||||||||||||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct 814 GCCCCTCTAGAAAAGCGTGGCGTGATGGCCGTGGGGCTGCCCAGAACATCATCCCTGCATCCACTGGTGCTGCC 887
Query 643 AAGGCTGTGGGCAAGGTCATCCCTGAGCTGAACGGGAAGCTCACTGGCATGGCCTTCCGTGTCCCCACTGCCAA 716
|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||...|||
Sbjct 888 AAGGCTGTGGGCAAGGTCATCCCAGAGCTGAATGGGAAGCTCACTGGCATGGCCTTCCGTGTTCCTACCCTCAA 961
Query 717 CGTGTCAGTGGTGGACCTGACCTGCCGTCTAGAAAAACCTGCCAAATATGATGACATCAAGAAGGTGGTGAAGC 790
.||.||.||.|||||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 962 TGTATCCGTTGTGGATCTGACATGCCGCCTGGAGAAACCTGCCAAGTATGATGACATCAAGAAGGTGGTGAAGC 1035
Query 791 AGGCGTCGGAGGGCCCCCTCAAGGGCATCCTGGGCTACACTGAGCACCAGGTGGTCTCCTCTGACTTCAACAGC 864
||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||..||||||||||||
Sbjct 1036 AGGCATCTGAGGGCCCACTGAAGGGCATCCTGGGCTACACTGAGGACCAGGTTGTCTCCTACGACTTCAACAGC 1109
Query 865 GACACCCACTCCTCCACCTTCGACGCTGGGGCTGGCATTGCCCTCAACGACCACTTTGTCAAGCTCATTTCCTG 938
.||.||.||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||.|||||||.||||||||.|||||
Sbjct 1110 AACTCCTACTCTTCCACCTTTGATGCTGGGGCTGGCATTGCTCTCAATGACAACTTTGTAAAGCTCATATCCTG 1183
Query 939 GTATGACAACGAATTTGGCTACAGCAACAGGGTGGTGGACCTCATGGCCCACATGGCCTCCAAGGAG------- 1005
|||||||||.||||...|||||||||.|||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1184 GTATGACAATGAATACAGCTACAGCAGCAGGGTGGTGGACTTCATGGCCTACATGGCCTCCAAGGAGTAAGAAA 1257
Query 1006 -------------------------------------------------------------------------- 1005
Sbjct 1258 CCCTGGACCACCCACCCCAGCAAGGACACTGAGAGCAAGAGAGAGGCCCTCAGTTGCTGAGGAGTCCCTATCCC 1331
Query 1006 -------------------------------------------------------------------------- 1005
Sbjct 1332 AACTTGGCCTCAACACTGAGCATCTCCCTCACAATTTCCACCCCAGACCCCCATAATAATAGGAGGGGCCTAGG 1405
Query 1006 ------------------------------------------------------------- 1005
Sbjct 1406 GGGCCCTCCCTACTCTCTTGAATACCATCAATAAAGTTGCTGCACACCCCCCAAAAATCTC 1466