Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000474228
- Subject:
- XM_006498399.3
- Aligned Length:
- 1426
- Identities:
- 1195
- Gaps:
- 83
Alignment
Query 1 ATGCAGAAATCTACAAATTCTGATACTTCCGTGGAAACACTGAATTCTACCCGCCAAGGCACAGGAGCTGTGCA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 AATGAGAATCAAAAATGCCAACAGCCACCATGACAGGCTCAGCCAAAGTAAATCCATGATCCTCACCGATGTCG 148
|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||..|||||||.|||||||||||||||||||||||..|
Sbjct 1 -ATGAGAATCAAAAATGCCAACAGCCACCAAGACAGGCAGAGCCAAACTAAATCCATGATCCTCACCGATGCTG 73
Query 149 GGAAGGTCACTGAACCTATATCCAGACACAGAAGGAATCATTCACAGCATATCTTGAAAGATGTCATTCCTCCA 222
|||||||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 74 GGAAGGTCACTGAACCTATTTCCCGGCACAGAAGGAATCATTCACAGCATGTGTTGAAAGATGTCATTCCACCA 147
Query 223 TTGGAACAACTGATGGTTGAAAAAGAAGGTTATCTGCAAAAAGCTAAAATTGCAGATGGAGGAAAGAAACTAAG 296
.|.|||||.|..|||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 148 CTAGAACATCCAATGGTTGAAAAAGAAGGGTATCTTCAAAAAGCCAAAATTGCAGATGGAGGAAAGAAACTAAG 221
Query 297 GAAAAACTGGTCTACTTCCTGGATTGTTCTTTCTAGTCGAAGAATTGAATTTTACAAAGAATCCAAGCAACAGG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||.||||||||.||.|
Sbjct 222 GAAAAACTGGTCTACTTCCTGGATTGTTCTTTCTGGTCGAAAAATTGAATTTTACAAAGACTCCAAGCAGCAAG 295
Query 371 CTCTGTCC-AATATGAAAACTGGGCACAAACCAGAAAGTGTGGATTTGTGTGGAGCACACATTGAATGGGCCAA 443
|||| ||| ||.||||||||..|||||||....||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct 296 CTCT-TCCTAACATGAAAACCAGGCACAACGTGGAAAGTGTGGATTTGTGTGGTGCACATATAGAATGGGCCAA 368
Query 444 GGAAAAATCGAGCAGAAAGAATGTCTTTCAGATCACAACAGTATCAGGAAATGAGTTCCTTCTACAGTCAGATA 517
.||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 369 AGAAAAATCAAGCAGAAAGAGTGTCTTTCAGATCACAACAGTGTCAGGAAATGAGTTCCTTCTACAGTCAGATA 442
Query 518 TTGACTTCATCATATTGGATTGGTTCCACGCTATCAAAAATGCAATTGACAGATTGCCAAAGGATTCAAGTTGT 591
||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 443 TTGACTTCCTCATATTGGATTGGTTCCAAGCTATCAAAAATGCAATTGACAGATTGCCAAAGAATCCAAGTTGT 516
Query 592 CCATCAAGAAACCTGGAATTATTCAAAATCCAAAGATCCTCTAGCACTGAATTGCTAAGTCACTACGACAGTGA 665
...|| ||||||.||.|||||..|.||.||||||||.||..|||||.|||..|||||||.|.|||..||
Sbjct 517 GGGTC------CCTGGAGTTGTTCAATTTGCAGAGATCCTCAAGTTCTGAACTGCCGAGTCACTGCCACATCGA 584
Query 666 TATAAAAGAACAGAAACCAGAGCACAGAAAATCTTTAATGTTCAGACTGCATCACAGTGCTTCCGATACAAGCG 739
||.||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||..|||||||.|||||||||||.||||||||.|
Sbjct 585 TAGAAAAGAACAGAAACCAGAACACAGGAAGTCCTTCATGTTTCGACTGCACCACAGTGCTTCTGATACAAGTG 658
Query 740 ACAAAAATCGAGTTAAAAGCAGATTAAAGAAGTTTATTACCCGAAGACCTTCCCTGAAAACTCTGCAAGAAAAA 813
||||.|||||.||.||.||||||.|.||||||||.||..||.||||||||||.|||||||||.||||.|||||.
Sbjct 659 ACAAGAATCGCGTGAAGAGCAGACTGAAGAAGTTCATCTCCAGAAGACCTTCTCTGAAAACTTTGCAGGAAAAG 732
Query 814 GGACTTATTAAAGATCAAATTTTTGGCTCTCATCTGCACAAAGTGTGTGAACGTGAAAATTCCACAGTTCCGTG 887
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||.|||||||||||||.||
Sbjct 733 GGACTCATTAAAGATCAAATTTTTGGCTCTCATCTGCACACAGTGTGTGAACGAGAACATTCCACAGTTCCATG 806
Query 888 GTTTGTAAAGCAATGCATTGAAGCTGTTGAGAAAAGAGGTCTAGATGTTGATGGAATATATCGAGTTAGTGGCA 961
||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 807 GTTTGTAAAGCAATGCATTGAAGCTGTTGAAAAAAGAGGCCTAGACGTTGATGGAATTTATCGAGTTAGTGGCA 880
Query 962 ATCTGGCAACAATACAGAAGTTAAGATTTATTGTCAACCAAGAAGAGAAGCTGAATTTGGACGACAGCCAGTGG 1035
||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 881 ATCTTGCAACAATACAGAAGTTAAGATTTATTGTCAACCAAGAAGAGAAGCTGAATTTGGATGACAGCCAGTGG 954
Query 1036 GAGGACATCCACGTTGTCACCGGAGCACTGAAGATGTTTTTCCGGGAGCTGCCTGAGCCGCTCTTCCCTTACAG 1109
||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||
Sbjct 955 GAGGACATCCACGTCGTCACCGGAGCACTGAAGATGTTTTTCCGGGAGCTGTCTGAACCGCTCTTCCCTTACAG 1028
Query 1110 TTTCTTTGAGCAGTTTGTGGAAGCGATCAAAAAGCAAGACAACAACACAAGAATTGAAGCTGTAAAATCTCTTG 1183
|||||||||||.|||||||||.|||||||||||.|||||||.|||...||.|||||||.||.|.|..|||||.|
Sbjct 1029 TTTCTTTGAGCGGTTTGTGGAGGCGATCAAAAAACAAGACAGCAATGAAAAAATTGAAACTATGAGGTCTCTGG 1102
Query 1184 TACAAAAACTCCCTCCGCCAAATCGTGACACCATGAAAGTCCCCTTTGGACATCTAACTAAGATAGTGGCCAAA 1257
||.||...||||||||.|||||||.|||.|||||||||.|||.|||..||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1103 TAAAACGTCTCCCTCCACCAAATCATGATACCATGAAAATCCTCTTCAGACATCTAACCAAGATAGTGGCCAAA 1176
Query 1258 GCCTCCAAGAACCTCATGTCCACGCAAAGCTTGGGGATTGTATTTGGACCTACCCTTCTGCGAGCTGAAAATGA 1331
||||||.||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1177 GCCTCCCAGAATCTCATGTCCACCCAAAGCTTGGGGATTGTGTTTGGACCCACCCTTCTGCGAGCGGAAAATGA 1250
Query 1332 AACAGGAAACATGGCGATCCACATGGTCTACCAGAACCAGATAGCTGAGCTCATGCTGAGTGAGTACAGTAAGA 1405
..||||.||..|.|||.||||||||||.|||||.|||||||||||.|||.|||||||||.|||||||..|||||
Sbjct 1251 GTCAGGGAATGTAGCGGTCCACATGGTATACCAAAACCAGATAGCAGAGTTCATGCTGACTGAGTACGATAAGA 1324
Query 1406 TCTTCGGCTCAGAGGAAGAC 1425
|||||.||||||||||||||
Sbjct 1325 TCTTCAGCTCAGAGGAAGAC 1344