Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000474228
• Subject: XM_011511481.2
• Aligned Length: 1426
• Identities: 1288
• Gaps: 122

Alignment

Query    1  ATGCAGAAATCTACAAATTCTGATACTTCCGTGGAAACACTGAATTCTACCCGCCAAGGCACAGGAGCTGTGCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCAGAAATCTACAAATTCTGATACTTCCGTGGAAACACTGAATTCTACCCGCCAAGGCACAGGAGCTGTGCA  74

Query   75  AATGAGAATCAAAAATGCCAACAGCCACCATGACAGGCTCAGCCAAAGTAAATCCATGATCCTCACCGATGTCG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AATGAGAATCAAAAATGCCAACAGCCACCATGACAGGCTCAGCCAAAGTAAATCCATGATCCTCACCGATGTCG  148

Query  149  GGAAGGTCACTGAACCTATATCCAGACACAGAAGGAATCATTCACAGCATATCTTGAAAGATGTCATTCCTCCA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGAAGGTCACTGAACCTATATCCAGACACAGAAGGAATCATTCACAGCATATCTTGAAAGATGTCATTCCTCCA  222

Query  223  TTGGAACAACTGATGGTTGAAAAAGAAGGTTATCTGCAAAAAGCTAAAATTGCAGATGGAGGAAAGAAACTAAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTGGAACAACTGATGGTTGAAAAAGAAGGTTATCTGCAAAAAGCTAAAATTGCAGATGGAGGAAAGAAACTAAG  296

Query  297  GAAAAACTGGTCTACTTCCTGGATTGTTCTTTCTAGTCGAAGAATTGAATTTTACAAAGAATCCAAGCAACAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAAAAACTGGTCTACTTCCTGGATTGTTCTTTCTAGTCGAAGAATTGAATTTTACAAAGAATCCAAGCAACAGG  370

Query  371  CTCTGTCCAATATGAAAACTGGGCACAAACCAGAAAGTGTGGATTTGTGTGGAGCACACATTGAATGGGCCAAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTCTGTCCAATATGAAAACTGGGCACAAACCAGAAAGTGTGGATTTGTGTGGAGCACACATTGAATGGGCCAAG  444

Query  445  GAAAAATCGAGCAGAAAGAATGTCTTTCAGATCACAACAGTATCAGGAAATGAGTTCCTTCTACAGTCAGATAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAAAAATCGAGCAGAAAGAATGTCTTTCAGATCACAACAGTATCAGGAAATGAGTTCCTTCTACAGTCAGATAT  518

Query  519  TGACTTCATCATATTGGATTGGTTCCACGCTATCAAAAATGCAATTGACAGATTGCCAAAGGATTCAAGTTGTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGACTTCATCATATTGGATTGGTTCCACGCTATCAAAAATGCAATTGACAGATTGCCAAAGGATTCAAGTTGTC  592

Query  593  CATCAAGAAACCTGGAATTATTCAAAATCCAAAGATCCTCTAGCACTGAATTGCTAAGTCACTACGACAGTGAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CATCAAGAAACCTGGAATTATTCAAAATCCAAAGATCCTCTAGCACTGAATTGCTAAGTCACTACGACAGTGAT  666

Query  667  ATAAAAGAACAGAAACCAGAGCACAGAAAATCTTTAATGTTCAGACTGCATCACAGTGCTTCCGATACAAGCGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATAAAAGAACAGAAACCAGAGCACAGAAAATCTTTAATGTTCAGACTGCATCACAGTGCTTCCGATACAAGCGA  740

Query  741  CAAAAATCGAGTTAAAAGCAGATTAAAGAAGTTTATTACCCGAAGACCTTCCCTGAAAACTCTGCAAGAAAAAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAAAAATCGAGTTAAAAGCAGATTAAAGAAGTTTATTACCCGAAGACCTTCCCTGAAAACTCTGCAAGAAAAAG  814

Query  815  GACTTATTAAAGATCAAATTTTTGGCTCTCATCTGCACAAAGTGTGTGAACGTGAAAATTCCACAGTTCCGTGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GACTTATTAAAGATCAAATTTTTGGCTCTCATCTGCACAAAGTGTGTGAACGTGAAAATTCCACAGTTCCGTGG  888

Query  889  TTTGTAAAGCAATGCATTGAAGCTGTTGAGAAAAGAGGTCTAGATGTTGATGGAATATATCGAGTTAGTGGCAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTTGTAAAGCAATGCATTGAAGCTGTTGAGAAAAGAGGTCTAGATGTTGATGGAATATATCGAGTTAGTGGCAA  962

Query  963  TCTGGCAACAATACAGAAGTTAAGATTTATTGTCAACCAAGAAGAGAAGCTGAATTTGGACGACAGCCAGTGGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCTGGCAACAATACAGAAGTTAAGATTTATTGTCAACCAAGAAGAGAAGCTGAATTTGGACGACAGCCAGTGGG  1036

Query 1037  AGGACATCCACGTTGTCACCGGAGCACTGAAGATGTTTTTCCGGGAGCTGCCTGAGCCGCTCTTCCCTTACAGT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGGACATCCACGTTGTCACCGGAGCACTGAAGATGTTTTTCCGGGAGCTGCCTGAGCCGCTCTTCCCTTACAGT  1110

Query 1111  TTCTTTGAGCAGTTTGTGGAAGCGATCAAAAAGCAAGACAACAACACAAGAATTGAAGCTGTAAAATCTCTTGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTCTTTGAGCAGTTTGTGGAAGCGATCAAAAAGCAAGACAACAACACAAGAATTGAAGCTGTAAAATCTCTTGT  1184

Query 1185  ACAAAAACTCCCTCCGCCAAATCGTGACACCATGAAAGTCCCCTTTGGACATCTAACTAAGATAGTGGCCAAAG  1258
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||           
Sbjct 1185  ACAAAAACTCCCTCCGCCAAATCGTGACACCATGAAAGTCCTCTTTGGACATCTAACTAAGAT-----------  1247

Query 1259  CCTCCAAGA-ACCTCATGTCCACGCAAAGCTTGGGGATTGTATTTGGACCTACCCTTCTGCGAGCTGAAAATGA  1331
                |.||| ||..||||       |||||  ||        |||..|..|||..||      |||||...|| 
Sbjct 1248  ----CCAGACACACCATG-------AAAGC--GG--------TTTCAAGTTACAATT------GCTGATGTTG-  1293

Query 1332  AACAGGAAACATGGCGATCCACATGGTCTACCAGAACCAGATAGCTGAGCTCATGCTGAGTGAGTACAGTAAGA  1405
             .|.||||.||     ||                                                        
Sbjct 1294  -CCTGGAATCA-----AT--------------------------------------------------------  1305

Query 1406  TCTTCGGCTCAGAGGAAGAC  1425
                                
Sbjct 1306  --------------------  1305