Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000474228
• Subject: XM_011511483.1
• Aligned Length: 1455
• Identities: 1132
• Gaps: 294

Alignment

Query    1  ATGCAGAAATCTACAAATTCTGATACTTCCGTGGAAACACTGAATTCTACCCGCCAAGGCACAGGAGCTGTGCA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AATGAGAATCAAAAATGCCAACAGCCACCATGACAGGCTCAGCCAAAGTAAATCCATGATCCTCACCGATGTCG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GGAAGGTCACTGAACCTATATCCAGACACAGAAGGAATCATTCACAGC-ATATCTTGAAAGATGTCATTCCTCC  221
                                                   ||     || ||||    |||          ||.|
Sbjct    1  ---------------------------------------AT-----GCTATAT----AAA----------CTGC  16

Query  222  AT--TGG-AACAACTGATGGTTGAAAAAGAAGGTTAT-CTGCAAAAAGCTAAAATTGCAGATGGAGGAAAGAAA  291
            ||  ||| |.|||  || |||||       .||||.| ||||..|...||       |.|              
Sbjct   17  ATGCTGGTAGCAA--GA-GGTTG-------TGGTTTTCCTGCCCAGCCCT-------CCG--------------  59

Query  292  CTAAGGAAAAACTGGTCTACTTCCTGGA------------TTGTTCTTTCTAGT-CGAAGAATTGA---ATTT-  348
                    ..|||||.||     .||||            |.||.|.||||.|| ||      |||   .||| 
Sbjct   60  --------CCACTGGGCT-----GTGGAGCCCGCTGCTGCTGGTGCATTCTTGTACG------TGAGGTGTTTC  114

Query  349  -----TACAAAGAATCCAAGCAACA---GGCTCTGTCCAATATGAAAACTGGGCACAAACCAGAAAGTGTGGAT  414
                 |.|     |.||..|||.||   |.||||.|||   ..|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  115  TCCTGTCC-----AGCCTGGCACCACTGGCCTCTTTCC---CCGAAAACTGGGCACAAACCAGAAAGTGTGGAT  180

Query  415  TTGTGTGGAGCACACATTGAATGGGCCAAGGAAAAATCGAGCAGAAAGAATGTCTTTCAGATCACAACAGTATC  488
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  181  TTGTGTGGAGCACACATTGAATGGGCCAAGGAAAAATCGAGCAGAAAGAATGTCTTTCAGATCACAACAGTATC  254

Query  489  AGGAAATGAGTTCCTTCTACAGTCAGATATTGACTTCATCATATTGGATTGGTTCCACGCTATCAAAAATGCAA  562
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  255  AGGAAATGAGTTCCTTCTACAGTCAGATATTGACTTCATCATATTGGATTGGTTCCACGCTATCAAAAATGCAA  328

Query  563  TTGACAGATTGCCAAAGGATTCAAGTTGTCCATCAAGAAACCTGGAATTATTCAAAATCCAAAGATCCTCTAGC  636
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  329  TTGACAGATTGCCAAAGGATTCAAGTTGTCCATCAAGAAACCTGGAATTATTCAAAATCCAAAGATCCTCTAGC  402

Query  637  ACTGAATTGCTAAGTCACTACGACAGTGATATAAAAGAACAGAAACCAGAGCACAGAAAATCTTTAATGTTCAG  710
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  403  ACTGAATTGCTAAGTCACTACGACAGTGATATAAAAGAACAGAAACCAGAGCACAGAAAATCTTTAATGTTCAG  476

Query  711  ACTGCATCACAGTGCTTCCGATACAAGCGACAAAAATCGAGTTAAAAGCAGATTAAAGAAGTTTATTACCCGAA  784
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  477  ACTGCATCACAGTGCTTCCGATACAAGCGACAAAAATCGAGTTAAAAGCAGATTAAAGAAGTTTATTACCCGAA  550

Query  785  GACCTTCCCTGAAAACTCTGCAAGAAAAAGGACTTATTAAAGATCAAATTTTTGGCTCTCATCTGCACAAAGTG  858
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  551  GACCTTCCCTGAAAACTCTGCAAGAAAAAGGACTTATTAAAGATCAAATTTTTGGCTCTCATCTGCACAAAGTG  624

Query  859  TGTGAACGTGAAAATTCCACAGTTCCGTGGTTTGTAAAGCAATGCATTGAAGCTGTTGAGAAAAGAGGTCTAGA  932
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  625  TGTGAACGTGAAAATTCCACAGTTCCGTGGTTTGTAAAGCAATGCATTGAAGCTGTTGAGAAAAGAGGTCTAGA  698

Query  933  TGTTGATGGAATATATCGAGTTAGTGGCAATCTGGCAACAATACAGAAGTTAAGATTTATTGTCAACCAAGAAG  1006
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  699  TGTTGATGGAATATATCGAGTTAGTGGCAATCTGGCAACAATACAGAAGTTAAGATTTATTGTCAACCAAGAAG  772

Query 1007  AGAAGCTGAATTTGGACGACAGCCAGTGGGAGGACATCCACGTTGTCACCGGAGCACTGAAGATGTTTTTCCGG  1080
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  773  AGAAGCTGAATTTGGACGACAGCCAGTGGGAGGACATCCACGTTGTCACCGGAGCACTGAAGATGTTTTTCCGG  846

Query 1081  GAGCTGCCTGAGCCGCTCTTCCCTTACAGTTTCTTTGAGCAGTTTGTGGAAGCGATCAAAAAGCAAGACAACAA  1154
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  847  GAGCTGCCTGAGCCGCTCTTCCCTTACAGTTTCTTTGAGCAGTTTGTGGAAGCGATCAAAAAGCAAGACAACAA  920

Query 1155  CACAAGAATTGAAGCTGTAAAATCTCTTGTACAAAAACTCCCTCCGCCAAATCGTGACACCATGAAAGTCCCCT  1228
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  921  CACAAGAATTGAAGCTGTAAAATCTCTTGTACAAAAACTCCCTCCGCCAAATCGTGACACCATGAAAGTCCTCT  994

Query 1229  TTGGACATCTAACTAAGATAGTGGCCAAAGCCTCCAAGAACCTCATGTCCACGCAAAGCTTGGGGATTGTATTT  1302
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  995  TTGGACATCTAACTAAGATAGTGGCCAAAGCCTCCAAGAACCTCATGTCCACGCAAAGCTTGGGGATTGTATTT  1068

Query 1303  GGACCTACCCTTCTGCGAGCTGAAAATGAAACAGGAAACATGGCGATCCACATGGTCTACCAGAACCAGATAGC  1376
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1069  GGACCTACCCTTCTGCGAGCTGAAAATGAAACAGGAAACATGGCGATCCACATGGTCTACCAGAACCAGATAGC  1142

Query 1377  TGAGCTCATGCTGAGTGAGTACAGTAAGATCTTCGGCTCAGAGGAAGAC  1425
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1143  TGAGCTCATGCTGAGTGAGTACAGTAAGATCTTCGGCTCAGAGGAAGAC  1191