Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000474228
- Subject:
- XM_017004500.2
- Aligned Length:
- 1425
- Identities:
- 1284
- Gaps:
- 129
Alignment
Query 1 ATGCAGAAATCTACAAATTCTGATACTTCCGTGGAAACACTGAATTCTACCCGCCAAGGCACAGGAGCTGTGCA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 AATGAGAATCAAAAATGCCAACAGCCACCATGACAGGCTCAGCCAAAGTAAATCCATGATCCTCACCGATGTCG 148
|||.|||..|| |.||| || |.||.|..||||
Sbjct 1 -----------------------------ATGGCAGTTTC------AATAA---CA-GGTCATTGCCGA----- 30
Query 149 GGAAGGTCACTGAACCTATATCCAGACACAGAAGGAATCATTCACAGCATATCTTGAAAGATGTCATTCCTCCA 222
|||...|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 31 -----------GAAAAGATATCCAGACACAGAAGGAATCATTCACAGCATATCTTGAAAGATGTCATTCCTCCA 93
Query 223 TTGGAACAACTGATGGTTGAAAAAGAAGGTTATCTGCAAAAAGCTAAAATTGCAGATGGAGGAAAGAAACTAAG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 94 TTGGAACAACTGATGGTTGAAAAAGAAGGTTATCTGCAAAAAGCTAAAATTGCAGATGGAGGAAAGAAACTAAG 167
Query 297 GAAAAACTGGTCTACTTCCTGGATTGTTCTTTCTAGTCGAAGAATTGAATTTTACAAAGAATCCAAGCAACAGG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 168 GAAAAACTGGTCTACTTCCTGGATTGTTCTTTCTAGTCGAAGAATTGAATTTTACAAAGAATCCAAGCAACAGG 241
Query 371 CTCTGTCCAATATGAAAACTGGGCACAAACCAGAAAGTGTGGATTTGTGTGGAGCACACATTGAATGGGCCAAG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 242 CTCTGTCCAATATGAAAACTGGGCACAAACCAGAAAGTGTGGATTTGTGTGGAGCACACATTGAATGGGCCAAG 315
Query 445 GAAAAATCGAGCAGAAAGAATGTCTTTCAGATCACAACAGTATCAGGAAATGAGTTCCTTCTACAGTCAGATAT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 316 GAAAAATCGAGCAGAAAGAATGTCTTTCAGATCACAACAGTATCAGGAAATGAGTTCCTTCTACAGTCAGATAT 389
Query 519 TGACTTCATCATATTGGATTGGTTCCACGCTATCAAAAATGCAATTGACAGATTGCCAAAGGATTCAAGTTGTC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 390 TGACTTCATCATATTGGATTGGTTCCACGCTATCAAAAATGCAATTGACAGATTGCCAAAGGATTCAAGTTGTC 463
Query 593 CATCAAGAAACCTGGAATTATTCAAAATCCAAAGATCCTCTAGCACTGAATTGCTAAGTCACTACGACAGTGAT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 464 CATCAAGAAACCTGGAATTATTCAAAATCCAAAGATCCTCTAGCACTGAATTGCTAAGTCACTACGACAGTGAT 537
Query 667 ATAAAAGAACAGAAACCAGAGCACAGAAAATCTTTAATGTTCAGACTGCATCACAGTGCTTCCGATACAAGCGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 538 ATAAAAGAACAGAAACCAGAGCACAGAAAATCTTTAATGTTCAGACTGCATCACAGTGCTTCCGATACAAGCGA 611
Query 741 CAAAAATCGAGTTAAAAGCAGATTAAAGAAGTTTATTACCCGAAGACCTTCCCTGAAAACTCTGCAAGAAAAAG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 612 CAAAAATCGAGTTAAAAGCAGATTAAAGAAGTTTATTACCCGAAGACCTTCCCTGAAAACTCTGCAAGAAAAAG 685
Query 815 GACTTATTAAAGATCAAATTTTTGGCTCTCATCTGCACAAAGTGTGTGAACGTGAAAATTCCACAGTTCCGTGG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 686 GACTTATTAAAGATCAAATTTTTGGCTCTCATCTGCACAAAGTGTGTGAACGTGAAAATTCCACAGTTCCGTGG 759
Query 889 TTTGTAAAGCAATGCATTGAAGCTGTTGAGAAAAGAGGTCTAGATGTTGATGGAATATATCGAGTTAGTGGCAA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 760 TTTGTAAAGCAATGCATTGAAGCTGTTGAGAAAAGAGGTCTAGATGTTGATGGAATATATCGAGTTAGTGGCAA 833
Query 963 TCTGGCAACAATACAGAAGTTAAGATTTATTGTCAACCAAGAAGAGAAGCTGAATTTGGACGACAGCCAGTGGG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 834 TCTGGCAACAATACAGAAGTTAAGATTTATTGTCAACCAAGAAGAGAAGCTGAATTTGGACGACAGCCAGTGGG 907
Query 1037 AGGACATCCACGTTGTCACCGGAGCACTGAAGATGTTTTTCCGGGAGCTGCCTGAGCCGCTCTTCCCTTACAGT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 908 AGGACATCCACGTTGTCACCGGAGCACTGAAGATGTTTTTCCGGGAGCTGCCTGAGCCGCTCTTCCCTTACAGT 981
Query 1111 TTCTTTGAGCAGTTTGTGGAAGCGATCAAAAAGCAAGACAACAACACAAGAATTGAAGCTGTAAAATCTCTTGT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 982 TTCTTTGAGCAGTTTGTGGAAGCGATCAAAAAGCAAGACAACAACACAAGAATTGAAGCTGTAAAATCTCTTGT 1055
Query 1185 ACAAAAACTCCCTCCGCCAAATCGTGACACCATGAAAGTCCCCTTTGGACATCTAACTAAGATAGTGGCCAAAG 1258
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1056 ACAAAAACTCCCTCCGCCAAATCGTGACACCATGAAAGTCCTCTTTGGACATCTAACTAAGATAGTGGCCAAAG 1129
Query 1259 CCTCCAAGAACCTCATGTCCACGCAAAGCTTGGGGATTGTATTTGGACCTACCCTTCTGCGAGCTGAAAATGAA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1130 CCTCCAAGAACCTCATGTCCACGCAAAGCTTGGGGATTGTATTTGGACCTACCCTTCTGCGAGCTGAAAATGAA 1203
Query 1333 ACAGGAAACATGGCGATCCACATGGTCTACCAGAACCAGATAGCTGAGCTCATGCTGAGTGAGTACAGTAAGAT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1204 ACAGGAAACATGGCGATCCACATGGTCTACCAGAACCAGATAGCTGAGCTCATGCTGAGTGAGTACAGTAAGAT 1277
Query 1407 CTTCGGCTCAGAGGAAGAC 1425
|||||||||||||||||||
Sbjct 1278 CTTCGGCTCAGAGGAAGAC 1296