Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000474246
• Subject: NM_146219.1
• Aligned Length: 1856
• Identities: 1595
• Gaps: 25

Alignment

Query    1  ATGATGGAGGGAAGCAGGCAGACGCGAGTGTCTCGGCCATACAAGATCAGCGAATCATCAAAGGTATACCGCTG  74
               |||||||.|||||.|||||.|||.||.||.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||.||||.|||
Sbjct    1  ---ATGGAGGCAAGCAAGCAGATGCGGGTATCCCGGCCATACAAAATCAGTGAGTCTTCAAAGGTGTACCACTG  71

Query   75  GGCCGACCACTCAAGCACGGTGCTGCAGCGGCTGAACGAGCAGCGTCTCCGCGGGCTCTTCTGCGACGTCGTCC  148
            |.|.||||||||.|...||||||||||||||||||||||||||||.||.|.|||.||||||||||||||.||.|
Sbjct   72  GCCTGACCACTCTACTGCGGTGCTGCAGCGGCTGAACGAGCAGCGGCTGCACGGCCTCTTCTGCGACGTGGTGC  145

Query  149  TGGTGGCCGATGAGCAGCGTGTGCCAGCCCATCGCAACCTGCTGGCCGTGTGCAGCGACTACTTCAACTCCATG  222
            ||||||.|||.|||||||..|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  146  TGGTGGTCGAAGAGCAGCAAGTGCCAGCCCACCGCAACCTTCTGGCTGTGTGCAGCGACTACTTCAACTCCATG  219

Query  223  TTCACCATCGGCATGCGGGAAGCTTTCCAGAAGGAGGTGGAGCTGATCGGCGCCTCCTACATTGGGCTCAAGGC  296
            |||||..|.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|.|||.||||||||.|.|||||||||||
Sbjct  220  TTCACACTGGGCATGCGCGAAGCTTTCCAGAAGGAGGTGGAGCTGGTGGGCACCTCCTACGTGGGGCTCAAGGC  293

Query  297  CGTGGTGGACTTCCTGTACGGCGGGGAGCTGGTGCTGGATGGCGGCAACATTGACTACGTCCTGGAGACGGCTC  370
            ||||||.||.|||||.|||.||.|.|||||||.||||||.|||.||||||||||||||.|||||||||||||.|
Sbjct  294  CGTGGTAGATTTCCTCTACAGCAGCGAGCTGGAGCTGGACGGCAGCAACATTGACTACATCCTGGAGACGGCGC  367

Query  371  ACCTGCTGCAGATCTGGACGGTGGTAGACTTCTGCTGTGAGTACCTGGAGCAGGAGGTGAGCGAGGACAACTAC  444
            |.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  368  ATCTGCTGCAGATCTGGACCGTGGTGGATTTCTGCTGTGAGTACCTGGAGCAGGAGGTGAGCGAGGACAACTAT  441

Query  445  CTGTACCTGCAGGAGCTGGCCTCCATCTACAGCCTCAAGCGGCTTGATGCCTTCATCGATGGCTTCATCCTGAA  518
            ||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||.||||.|||||||||||||||.|||||.|.||||.
Sbjct  442  CTCTACCTACAGGAGCTGGCCTCCATCTACAGTCTCAAGAGGCTCGATGCCTTCATCGATAGCTTCGTACTGAG  515

Query  519  CCACTTCGGCACGCTGTCCTTTACGCCCGACTTCCTGCAGAACGTCTCCATGCAGAAGCTGTGTGTCTACCTGA  592
            |||||||.|||||||||||||.|||||.||||||||||||..|.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  516  CCACTTCAGCACGCTGTCCTTCACGCCTGACTTCCTGCAGTCCATCTCCGTGCAGAAGCTGTGTGTCTACCTGA  589

Query  593  GCAGCAGCGAGGTGCAGCGGGAGTGTGAGCACGACCTCTTGCAGGCCGCCCTGCAGTGGCTGACGCAGCAGCCC  666
            ||||..||.||||.||||...|.||.||..|||||||..||||||..||.|||||||||||.|||||||||||.
Sbjct  590  GCAGTGGCCAGGTACAGCACAAATGGGAATACGACCTGCTGCAGGTGGCTCTGCAGTGGCTCACGCAGCAGCCG  663

Query  667  GAGCGCGAGGCCCACGCCCGCCAGGTGCTGGAGAACATCCACTTCCCGCTCATCCCCAAGAACGACCTGCTGCA  740
            ||||||||||..|||.||||||..||.|||||||||||||.||||||.|||.|||||.||.||..||||||.||
Sbjct  664  GAGCGCGAGGTGCACACCCGCCGCGTTCTGGAGAACATCCGCTTCCCCCTCTTCCCCGAGGACATCCTGCTACA  737

Query  741  CCGCGTCAAGCCGGCCGTGTGCTCGCTGCTGCCCAAGGAGGCCAACTGCGAGGGCTTCATCGAGGAGGCCGTGC  814
            .||.||.||||.||||.|||||||.||||||||||..|||||||||.||||||||||..|.|||||||||.|||
Sbjct  738  GCGGGTGAAGCTGGCCATGTGCTCTCTGCTGCCCAGCGAGGCCAACGGCGAGGGCTTTGTGGAGGAGGCCATGC  811

Query  815  GCTACCACAACAACCTGGCGGCCCAGCCCGTCATGCAGACCAAGCGCACGGCGCTGCGCACCAACCAGGAGCGC  888
            .|||||||||||.|||||.|||||||||.|||.|||||||.|||||.|||..|||||||.|   |.|||||.||
Sbjct  812  ACTACCACAACAGCCTGGTGGCCCAGCCTGTCCTGCAGACGAAGCGAACGCTGCTGCGCTC---CGAGGAGTGC  882

Query  889  CTGCTGTTTGTGGGCGGCGAGGTCTCCGAGCGGTGTCTGGAGCTCAGTGACGACACCTGCTACCTGGACGCCAA  962
            .||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||.||||
Sbjct  883  TTGCTCTTCGTGGGGGGCGAGGTCTCTGAGCGGTGTCTGGAGCTGAGCGATGACACCTGCTACCTAGACACCAA  956

Query  963  GAGCGAGCAGTGGGTCAAAGAGACGCCGCTGCCCGCCCGGCGGAGCCACCACTGTGTCGCGGTGCTGGGGGGCT  1036
            ||..|||||||||||.||.|||||..|.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  957  GAATGAGCAGTGGGTGAAGGAGACATCCCTGCCGGCCCGCCGGAGCCACCACTGCGTCGCTGTGCTGGGGGGCT  1030

Query 1037  TCATCTTCATCGCCGGCGGCAGCTTCTCACGGGACAACGGAGGGGATGCGGCCTCCAATCTTCTTTATAGGTAT  1110
            ||||||||||.|||||.|||||||||||..|.||||||||||||.||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1031  TCATCTTCATTGCCGGGGGCAGCTTCTCGAGAGACAACGGAGGGAATGCCGCCTCCAACCTTCTTTATAGGTAT  1104

Query 1111  GACCCCCGCTGTAAACAGTGGATCAAGGTGGCCTCCATGAACCAGCGCCGTGTGGATTTCTACCTTGCCTCCAT  1184
            |||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1105  GACCCCCGCCGTAAACAGTGGATCAAGGTGGCGTCCATGAACCAGCGCCGTGTGGATTTCTACCTAGCTTCCAT  1178

Query 1185  CGAAGACATGCTGGTGGCCATCGGCGGCCGGAATGAGAACGGAGCGCTCTCTTCAGTAGAGACGTACAGTCCCA  1258
            .|||||||||||||||||..||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||
Sbjct 1179  TGAAGACATGCTGGTGGCTGTCGGTGGCCGGAACGAGAATGGAGCGCTGTCTTCTGTAGAGACCTACAGCCCCA  1252

Query 1259  AGACTGACTCCCGGTCCTATGTGGCCGGCTTGCCAAGGTTCACGTACGGCCACGCGGGCACCATCTACAAAGAC  1332
            ||||..|||||.||.||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1253  AGACCAACTCCTGGACCTACGTGGCCGGCTTGCCAAGGTTCACCTATGGCCACGCGGGCACCATCTACAAAGAC  1326

Query 1333  TTCGTGTACATCTCGGGGGGCCACGACTACCAAATTGGCCCCTACCGCAAGAACCTGCTATGCTACGACCACCG  1406
            ||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||
Sbjct 1327  TTTGTCTACATCTCAGGGGGCCACGACTACCAGATTGGCCCGTACCGCAAGAACCTGCTGTGTTATGACCACCG  1400

Query 1407  GACAGACGTGTGGGAGGAGCGGCGGCCCATGACCACGGCGCGCGGCTGGCACAGCATGTGCAGCCTGGGTGACA  1480
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1401  GACAGACGTGTGGGAGGAGAGGCGGCCCATGACAACAGCTCGGGGCTGGCACAGCATGTGCAGCCTGGGCGACA  1474

Query 1481  GCATCTACTCCATCGGGGGCAGCGATGACAACATCGAGTCCATGGAGCGCTTCGACGTGCTGGGCGTGGAGGCC  1554
            ||||||||||||||||||||||.||.|||.||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1475  GCATCTACTCCATCGGGGGCAGTGACGACCACATGGAGTCCATGGAGCGCTTCGATGTGCTGGGCGTGGAGGCC  1548

Query 1555  TACAGCCCGCAGTGCAACCAGTGGACCCGCGTGGCGCCGCTGCTGCACGCCAACAGCGAGTCGGGCGTGGCAGT  1628
            ||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1549  TACAGCCCACAGTGCAACCAGTGGACTCGCGTGGCGCCGCTGCTGCAGGCCAACAGCGAGTCAGGCGTGGCCGT  1622

Query 1629  GTGGGAGGGCCGCATCTACATCCTGGGCGGCTACAGCTGGGAGAACACTGCCTTCTCCAAGACCGTGCAGGTGT  1702
            ||||.||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||.|||.||||||||||.|.|.||||||||||
Sbjct 1623  GTGGCAGGGCCGCATCTACATCCTGGGGGGGTACAGCTGGGAGAGCACAGCCTTCTCCAGGGCTGTGCAGGTGT  1696

Query 1703  ACGACCGCGAGGCCGACAAGTGGAGCAGGGGCGTC--GACCTGCCCAAGGCCATCGCTGGCGGGTCCGCCTGTG  1774
            |.||..||||||||.|||.|||||||.|||  |||  |||||.|||||.|||||.||.||.|.|||.|||||||
Sbjct 1697  ATGATAGCGAGGCCAACAGGTGGAGCCGGG--GTCCTGACCTCCCCAACGCCATTGCGGGTGTGTCGGCCTGTG  1768

Query 1775  TCTGCGCCCTGGAGCCACGGCCAGAGGACAAGAAGAAGA-----AAGG-CAAAGGCAAGAGGCACCAGGACCGG  1842
            |.||.|||||..|.|||.|||..|||||.||||||||||     |||| ||||.|         |||||||||.
Sbjct 1769  TGTGTGCCCTCAACCCAAGGCTGGAGGAAAAGAAGAAGAGGAACAAGGACAAATG---------CCAGGACCGA  1833

Query 1843  GGCCAG  1848
            ||.|||
Sbjct 1834  GGTCAG  1839