Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000474279
• Subject: NM_001278441.2
• Aligned Length: 1356
• Identities: 1171
• Gaps: 183

Alignment

Query    1  ATGGACGACATTTTCACTCAGTGCCGGGAGGGCAACGCAGTCGCCGTTCGCCTGTGGCTGGACAACACGGAGAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACGACATTTTCACTCAGTGCCGGGAGGGCAACGCAGTCGCCGTTCGCCTGTGGCTGGACAACACGGAGAA  74

Query   75  CGACCTCAACCAGGGGGACGATCATGGCTTCTCCCCCTTGCACTGGGCCTGCCGAGAGGGCCGCTCTGCTGTGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGACCTCAACCAGGGGGACGATCATGGCTTCTCCCCCTTGCACTGGGCCTGCCGAGAGGGCCGCTCTGCTGTGG  148

Query  149  TTGAGATGTTGATCATGCGGGGGGCACGGATCAATGTAATGAACCGTGGGGATGACACCCCCCTGCATCTGGCA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTGAGATGTTGATCATGCGGGGGGCACGGATCAATGTAATGAACCGTGGGGATGACACCCCCCTGCATCTGGCA  222

Query  223  GCCAGTCATGGACACCGTGATATTGTACAGAAGCTATTGCAGTACAAGGCAGACATCAATGCAGTGAATGAACA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCCAGTCATGGACACCGTGATATTGTACAGAAGCTATTGCAGTACAAGGCAGACATCAATGCAGTGAATGAACA  296

Query  297  TGGGAATGTGCCCCTGCACTATGCCTGTTTTTGGGGCCAAGATCAAGTGGCAGAGGACCTGGTGGCAAATGGGG  370
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                      
Sbjct  297  CGGGAATGTGCCCCTGCACTATGCCTGTTTTTGGGGCCAAGATCAAGTGGCA----------------------  348

Query  371  CCCTTGTCAGCATCTGTAACAAGTATGGAGAGATGCCTGTGGACAAAGCCAAGGCACCCCTGAGAGAGCTTCTC  444
                                                                                      
Sbjct  349  --------------------------------------------------------------------------  348

Query  445  CGAGAGCGGGCAGAGAAGATGGGCCAGAATCTCAACCGTATTCCATACAAGGACACATTCTGGAAGGGGACCAC  518
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  349  -GAGAGCGGGCAGAGAAGATGGGCCAGAATCTCAACCGTATTCCATACAAGGACACATTCTGGAAGGGGACCAC  421

Query  519  CCGCACTCGGCCCCGAAATGGAACCCTGAACAAACACTCTGGCATTGACTTCAAACAGCTTAACTTCCTGACGA  592
            ||||||||||||||                                                            
Sbjct  422  CCGCACTCGGCCCC------------------------------------------------------------  435

Query  593  AGCTCAACGAGAATCACTCTGGAGAGCTATGGAAGGGCCGCTGGCAGGGCAATGACATTGTCGTGAAGGTGCTG  666
                                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  436  --------------------------CTATGGAAGGGCCGCTGGCAGGGCAATGACATTGTCGTGAAGGTGCTG  483

Query  667  AAGGTTCGAGACTGGAGTACAAGGAAGAGCAGGGACTTCAATGAAGAGTGTCCCCGGCTCAGGATTTTCTCGCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  484  AAGGTTCGAGACTGGAGTACAAGGAAGAGCAGGGACTTCAATGAAGAGTGTCCCCGGCTCAGGATTTTCTCGCA  557

Query  741  TCCAAATGTGCTCCCAGTGCTAGGTGCCTGCCAGTCTCCACCTGCTCCTCATCCTACTCTCATCACACACTGGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  558  TCCAAATGTGCTCCCAGTGCTAGGTGCCTGCCAGTCTCCACCTGCTCCTCATCCTACTCTCATCACACACTGGA  631

Query  815  TGCCATATGGATCCCTCTACAATGTACTACATGAAGGCACCAATTTCGTCGTGGACCAGAGCCAGGCTGTGAAG  888
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  632  TGCCGTATGGATCCCTCTACAATGTACTACATGAAGGCACCAATTTCGTCGTGGACCAGAGCCAGGCTGTGAAG  705

Query  889  TTTGCTTTGGACATGGCAAGGGGCATGGCCTTCCTACACACACTAGAGCCCCTCATCCCACGACATGCACTCAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  706  TTTGCTTTGGACATGGCAAGGGGCATGGCCTTCCTACACACACTAGAGCCCCTCATCCCACGACATGCACTCAA  779

Query  963  TAGCCGTAGTGTAATGATTGATGAGGACATGACTGCCCGAATTAGCATGGCTGATGTCAAGTTCTCTTTCCAAT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  780  TAGCCGTAGTGTAATGATTGATGAGGACATGACTGCCCGAATTAGCATGGCTGATGTCAAGTTCTCTTTCCAAT  853

Query 1037  GTCCTGGTCGCATGTATGCACCTGCCTGGGTAGCCCCCGAAGCTCTGCAGAAGAAGCCTGAAGACACAAACAGA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  854  GTCCTGGTCGCATGTATGCACCTGCCTGGGTAGCCCCCGAAGCTCTGCAGAAGAAGCCTGAAGACACAAACAGA  927

Query 1111  CGCTCAGCAGACATGTGGAGTTTTGCAGTGCTTCTGTGGGAACTGGTGACACGGGAGGTACCCTTTGCTGACCT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  928  CGCTCAGCAGACATGTGGAGTTTTGCAGTGCTTCTGTGGGAACTGGTGACACGGGAGGTACCCTTTGCTGACCT  1001

Query 1185  CTCCAATATGGAGATTGGAATGAAGGTGGCATTGGAAGGCCTTCGGCCTACCATCCCACCAGGTATTTCCCCTC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1002  CTCCAATATGGAGATTGGAATGAAGGTGGCATTGGAAGGCCTTCGGCCTACCATCCCACCAGGTATTTCCCCTC  1075

Query 1259  ATGTGTGTAAGCTCATGAAGATCTGCATGAATGAAGACCCTGCAAAGCGACCCAAATTTGACATGATTGTGCCT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1076  ATGTGTGTAAGCTCATGAAGATCTGCATGAATGAAGACCCTGCAAAGCGACCCAAATTTGACATGATTGTGCCT  1149

Query 1333  ATCCTTGAGAAGATGCAGGACAAG  1356
            ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1150  ATCCTTGAGAAGATGCAGGACAAG  1173