Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000474279
Subject:
NM_001278442.1
Aligned Length:
1356
Identities:
953
Gaps:
402

Alignment

Query    1  ATGGACGACATTTTCACTCAGTGCCGGGAGGGCAACGCAGTCGCCGTTCGCCTGTGGCTGGACAACACGGAGAA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CGACCTCAACCAGGGGGACGATCATGGCTTCTCCCCCTTGCACTGGGCCTGCCGAGAGGGCCGCTCTGCTGTGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TTGAGATGTTGATCATGCGGGGGGCACGGATCAATGTAATGAACCGTGGGGATGACACCCCCCTGCATCTGGCA  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GCCAGTCATGGACACCGTGATATTGTACAGAAGCTATTGCAGTACAAGGCAGACATCAATGCAGTGAATGAACA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  TGGGAATGTGCCCCTGCACTATGCCTGTTTTTGGGGCCAAGATCAAGTGGCAGAGGACCTGGTGGCAAATGGGG  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  CCCTTGTCAGCATCTGTAACAAGTATGGAGAGATGCCTGTGGACAAAGCCAAGGCACCCCTGAGAGAGCTTCTC  444
                                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --------------------------------ATGCCTGTGGACAAAGCCAAGGCACCCCTGAGAGAGCTTCTC  42

Query  445  CGAGAGCGGGCAGAGAAGATGGGCCAGAATCTCAACCGTATTCCATACAAGGACACATTCTGGAAGGGGACCAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   43  CGAGAGCGGGCAGAGAAGATGGGCCAGAATCTCAACCGTATTCCATACAAGGACACATTCTGGAAGGGGACCAC  116

Query  519  CCGCACTCGGCCCCGAAATGGAACCCTGAACAAACACTCTGGCATTGACTTCAAACAGCTTAACTTCCTGACGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  117  CCGCACTCGGCCCCGAAATGGAACCCTGAACAAACACTCTGGCATTGACTTCAAACAGCTTAACTTCCTGACGA  190

Query  593  AGCTCAACGAGAATCACTCTGGAGAGCTATGGAAGGGCCGCTGGCAGGGCAATGACATTGTCGTGAAGGTGCTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  191  AGCTCAACGAGAATCACTCTGGAGAGCTATGGAAGGGCCGCTGGCAGGGCAATGACATTGTCGTGAAGGTGCTG  264

Query  667  AAGGTTCGAGACTGGAGTACAAGGAAGAGCAGGGACTTCAATGAAGAGTGTCCCCGGCTCAGGATTTTCTCGCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  265  AAGGTTCGAGACTGGAGTACAAGGAAGAGCAGGGACTTCAATGAAGAGTGTCCCCGGCTCAGGATTTTCTCGCA  338

Query  741  TCCAAATGTGCTCCCAGTGCTAGGTGCCTGCCAGTCTCCACCTGCTCCTCATCCTACTCTCATCACACACTGGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  339  TCCAAATGTGCTCCCAGTGCTAGGTGCCTGCCAGTCTCCACCTGCTCCTCATCCTACTCTCATCACACACTGGA  412

Query  815  TGCCATATGGATCCCTCTACAATGTACTACATGAAGGCACCAATTTCGTCGTGGACCAGAGCCAGGCTGTGAAG  888
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  413  TGCCGTATGGATCCCTCTACAATGTACTACATGAAGGCACCAATTTCGTCGTGGACCAGAGCCAGGCTGTGAAG  486

Query  889  TTTGCTTTGGACATGGCAAGGGGCATGGCCTTCCTACACACACTAGAGCCCCTCATCCCACGACATGCACTCAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  487  TTTGCTTTGGACATGGCAAGGGGCATGGCCTTCCTACACACACTAGAGCCCCTCATCCCACGACATGCACTCAA  560

Query  963  TAGCCGTAGTGTAATGATTGATGAGGACATGACTGCCCGAATTAGCATGGCTGATGTCAAGTTCTCTTTCCAAT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  561  TAGCCGTAGTGTAATGATTGATGAGGACATGACTGCCCGAATTAGCATGGCTGATGTCAAGTTCTCTTTCCAAT  634

Query 1037  GTCCTGGTCGCATGTATGCACCTGCCTGGGTAGCCCCCGAAGCTCTGCAGAAGAAGCCTGAAGACACAAACAGA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  635  GTCCTGGTCGCATGTATGCACCTGCCTGGGTAGCCCCCGAAGCTCTGCAGAAGAAGCCTGAAGACACAAACAGA  708

Query 1111  CGCTCAGCAGACATGTGGAGTTTTGCAGTGCTTCTGTGGGAACTGGTGACACGGGAGGTACCCTTTGCTGACCT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  709  CGCTCAGCAGACATGTGGAGTTTTGCAGTGCTTCTGTGGGAACTGGTGACACGGGAGGTACCCTTTGCTGACCT  782

Query 1185  CTCCAATATGGAGATTGGAATGAAGGTGGCATTGGAAGGCCTTCGGCCTACCATCCCACCAGGTATTTCCCCTC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  783  CTCCAATATGGAGATTGGAATGAAGGTGGCATTGGAAGGCCTTCGGCCTACCATCCCACCAGGTATTTCCCCTC  856

Query 1259  ATGTGTGTAAGCTCATGAAGATCTGCATGAATGAAGACCCTGCAAAGCGACCCAAATTTGACATGATTGTGCCT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  857  ATGTGTGTAAGCTCATGAAGATCTGCATGAATGAAGACCCTGCAAAGCGACCCAAATTTGACATGATTGTGCCT  930

Query 1333  ATCCTTGAGAAGATGCAGGACAAG  1356
            ||||||||||||||||||||||||
Sbjct  931  ATCCTTGAGAAGATGCAGGACAAG  954