Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000474279
• Subject: XM_006507389.3
• Aligned Length: 1452
• Identities: 1245
• Gaps: 96

Alignment

Query    1  ATGGACGACATTTTCACTCAGTGCCGGGAGGGCAACGCAGTCGCCGTTCGCCTGTGGCTGGACAACACGGAGAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||.||||||||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGGACGACATTTTCACTCAGTGCCGGGAGGGCAACGCGGTGGCGGTGCGCTTGTGGCTGGACAACACAGAGAA  74

Query   75  CGACCTCAACCAGGGGGACGATCATGGCTTCTCCCCCTTGCACTGGGCCTGCCGAGAGGGCCGCTCTGCTGTGG  148
            |||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct   75  CGACCTCAATCAGGGGGATGATCATGGCTTCTCCCCCTTGCACTGGGCCTGCCGAGAAGGCCGCTCTGCGGTGG  148

Query  149  TTGAGATGTTGATCATGCGGGGGGCACGGATCAATGTAATGAACCGTGGGGATGACACCCCCCTGCATCTGGCA  222
            ||||.|||.||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct  149  TTGAAATGCTGATCATGCGTGGAGCACGGATTAATGTGATGAATCGTGGGGATGATACCCCCCTGCACCTGGCA  222

Query  223  GCCAGTCATGGACACCGTGATATTGTACAGAAGCTATTGCAGTACAAGGCAGACATCAATGCAGTGAATGAACA  296
            ||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||
Sbjct  223  GCTAGTCATGGACACCGTGACATTGTACAGAAGCTGTTGCAATACAAGGCTGACATCAATGCAGTGAATGAGCA  296

Query  297  TGGGAATGTGCCCCTGCACTATGCCTGTTTTTGGGGCCAAGATCAAGTGGCAGAGGACCTGGTGGCAAATGGGG  370
            .||.||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct  297  CGGCAATGTGCCACTTCACTATGCATGTTTCTGGGGCCAAGACCAGGTGGCAGAGGACCTGGTGGCTAACGGGG  370

Query  371  CCCTTGTCAGCATCTGTAACAAGTATGGAGAGATGCCTGTGGACAAAGCCAAGGCACCCCTGAGAGAGCTTCTC  444
            |.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  371  CTCTTGTGAGCATCTGTAACAAGTATGGAGAGATGCCTGTGGACAAAGCCAAGGCACCCCTTAGAGAGCTTCTC  444

Query  445  CGAGAGCGGGCAGAGAAGATGGGCCAGAATCTCAACCGTATTCCATACAAGGACACATTCTGGAAGGGGACCAC  518
            |||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CGAGAACGGGCAGAGAAAATGGGCCAGAATCTCAACCGTATTCCATACAAGGACACATTCTGGAAGGGGACCAC  518

Query  519  CCGCACTCGGCCCCGAAATGGAACCCTGAACAAACACTCTGGCATTGACTTCAAACAGCTTAACTTCCTGACGA  592
            .|||||..|||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||.|.|
Sbjct  519  TCGCACAAGGCCCCGAAATGGGACCCTGAACAAACACTCCGGTATTGACTTCAAACAGCTCAACTTTCTGGCAA  592

Query  593  AGCTCAACGAGAATCACTCTGGAGAGCTATGGAAGGGCCGCTGGCAGGGCAATGACATTGTCGTGAAGGTGCTG  666
            |||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct  593  AGCTCAATGAGAATCATTCTGGAGAGCTTTGGAAAGGCCGCTGGCAGGGCAATGATATTGTTGTGAAGGTGCTG  666

Query  667  AAGGTTCGAGACTGGAGTACAAGGAAGAGCAGGGACTTCAATGAAGAGTGTCCCCGGCT---------------  725
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||               
Sbjct  667  AAGGTTCGAGACTGGAGTACAAGGAAAAGCAGGGACTTCAATGAGGAATGTCCCCGGCTCAGGTGGGACACTGA  740

Query  726  --------------------------------------------------------------------------  725
                                                                                      
Sbjct  741  ATTGGAAGCTGTTGTGTCCAAGGCACCCCAAGTAGTACTGAAAAGTGAGATTCTGTTGGGTCTCACCACTCTTT  814

Query  726  -------CAGGATTTTCTCGCATCCAAATGTGCTCCCAGTGCTAGGTGCCTGCCAGTCTCCACCTGCTCCTCAT  792
                   ||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||.||||.||.||.||.||.
Sbjct  815  TCCTCCCCAGGATTTTCTCACACCCTAACGTGCTCCCAGTGCTAGGTGCTTGCCAGGCTCCCCCAGCCCCCCAC  888

Query  793  CCTACTCTCATCACACACTGGATGCCATATGGATCCCTCTACAATGTACTACATGAAGGCACCAATTTCGTCGT  866
            ||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  889  CCAACCCTCATCACACACTGGATGCCATATGGATCTCTCTACAATGTTCTACATGAAGGCACCAATTTCGTTGT  962

Query  867  GGACCAGAGCCAGGCTGTGAAGTTTGCTTTGGACATGGCAAGGGGCATGGCCTTCCTACACACACTAGAGCCCC  940
            ||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.|
Sbjct  963  GGACCAGAGCCAAGCTGTAAAGTTTGCTTTGGACATGGCAAGAGGCATGGCTTTTCTTCACACACTAGAGCCTC  1036

Query  941  TCATCCCACGACATGCACTCAATAGCCGTAGTGTAATGATTGATGAGGACATGACTGCCCGAATTAGCATGGCT  1014
            ||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1037  TCATACCCCGGCATGCACTCAATAGCCGCAGTGTAATGATCGATGAAGATATGACTGCCCGAATCAGCATGGCT  1110

Query 1015  GATGTCAAGTTCTCTTTCCAATGTCCTGGTCGCATGTATGCACCTGCCTGGGTAGCCCCCGAAGCTCTGCAGAA  1088
            |||||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||
Sbjct 1111  GATGTTAAGTTTTCTTTCCAGTGCCCTGGGCGCATGTATGCGCCTGCCTGGGTGGCCCCTGAAGCCCTGCAGAA  1184

Query 1089  GAAGCCTGAAGACACAAACAGACGCTCAGCAGACATGTGGAGTTTTGCAGTGCTTCTGTGGGAACTGGTGACAC  1162
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GAAGCCTGAAGACACAAACAGACGCTCAGCAGACATGTGGAGTTTCGCGGTGCTTCTGTGGGAACTGGTGACAC  1258

Query 1163  GGGAGGTACCCTTTGCTGACCTCTCCAATATGGAGATTGGAATGAAGGTGGCATTGGAAGGCCTTCGGCCTACC  1236
            |.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GAGAGGTGCCCTTTGCTGACCTCTCTAATATGGAGATTGGGATGAAGGTGGCACTGGAAGGCCTTCGGCCTACC  1332

Query 1237  ATCCCACCAGGTATTTCCCCTCATGTGTGTAAGCTCATGAAGATCTGCATGAATGAAGACCCTGCAAAGCGACC  1310
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATCCCACCAGGTATTTCCCCCCATGTGTGTAAGCTCATGAAGATTTGCATGAATGAAGACCCTGCAAAGCGACC  1406

Query 1311  CAAATTTGACATGATTGTGCCTATCCTTGAGAAGATGCAGGACAAG  1356
            |||.|||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CAAGTTTGACATGATTGTGCCTATCTTGGAGAAGATGCAGGACAAG  1452