Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000474279
• Subject: XM_017017672.1
• Aligned Length: 1356
• Identities: 1201
• Gaps: 153

Alignment

Query    1  ATGGACGACATTTTCACTCAGTGCCGGGAGGGCAACGCAGTCGCCGTTCGCCTGTGGCTGGACAACACGGAGAA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CGACCTCAACCAGGGGGACGATCATGGCTTCTCCCCCTTGCACTGGGCCTGCCGAGAGGGCCGCTCTGCTGTGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TTGAGATGTTGATCATGCGGGGGGCACGGATCAATGTAATGAACCGTGGGGATGACACCCCCCTGCATCTGGCA  222
                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -----ATGTTGATCATGCGGGGGGCACGGATCAATGTAATGAACCGTGGGGATGACACCCCCCTGCATCTGGCA  69

Query  223  GCCAGTCATGGACACCGTGATATTGTACAGAAGCTATTGCAGTACAAGGCAGACATCAATGCAGTGAATGAACA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   70  GCCAGTCATGGACACCGTGATATTGTACAGAAGCTATTGCAGTACAAGGCAGACATCAATGCAGTGAATGAACA  143

Query  297  TGGGAATGTGCCCCTGCACTATGCCTGTTTTTGGGGCCAAGATCAAGTGGCAGAGGACCTGGTGGCAAATGGGG  370
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  144  CGGGAATGTGCCCCTGCACTATGCCTGTTTTTGGGGCCAAGATCAAGTGGCAGAGGACCTGGTGGCAAATGGGG  217

Query  371  CCCTTGTCAGCATCTGTAACAAGTATGGAGAGATGCCTGTGGACAAAGCCAAGGCACCCCTGAGAGAGCTTCTC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  218  CCCTTGTCAGCATCTGTAACAAGTATGGAGAGATGCCTGTGGACAAAGCCAAGGCACCCCTGAGAGAGCTTCTC  291

Query  445  CGAGAGCGGGCAGAGAAGATGGGCCAGAATCTCAACCGTATTCCATACAAGGACACATTCTGGAAGGGGACCAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  292  CGAGAGCGGGCAGAGAAGATGGGCCAGAATCTCAACCGTATTCCATACAAGGACACATTCTGGAAGGGGACCAC  365

Query  519  CCGCACTCGGCCCCGAAATGGAACCCTGAACAAACACTCTGGCATTGACTTCAAACAGCTTAACTTCCTGACGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  366  CCGCACTCGGCCCCGAAATGGAACCCTGAACAAACACTCTGGCATTGACTTCAAACAGCTTAACTTCCTGACGA  439

Query  593  AGCTCAACGAGAATCACTCTGGAGAGCTATGGAAGGGCCGCTGGCAGGGCAATGACATTGTCGTGAAGGTGCTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  440  AGCTCAACGAGAATCACTCTGGAGAGCTATGGAAGGGCCGCTGGCAGGGCAATGACATTGTCGTGAAGGTGCTG  513

Query  667  AAGGTTCGAGACTGGAGTACAAGGAAGAGCAGGGACTTCAATGAAGAGTGTCCCCGGCTCAGGATTTTCTCGCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  514  AAGGTTCGAGACTGGAGTACAAGGAAGAGCAGGGACTTCAATGAAGAGTGTCCCCGGCTCAGGATTTTCTCGCA  587

Query  741  TCCAAATGTGCTCCCAGTGCTAGGTGCCTGCCAGTCTCCACCTGCTCCTCATCCTACTCTCATCACACACTGGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  588  TCCAAATGTGCTCCCAGTGCTAGGTGCCTGCCAGTCTCCACCTGCTCCTCATCCTACTCTCATCACACACTGGA  661

Query  815  TGCCATATGGATCCCTCTACAATGTACTACATGAAGGCACCAATTTCGTCGTGGACCAGAGCCAGGCTGTGAAG  888
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  662  TGCCGTATGGATCCCTCTACAATGTACTACATGAAGGCACCAATTTCGTCGTGGACCAGAGCCAGGCTGTGAAG  735

Query  889  TTTGCTTTGGACATGGCAAGGGGCATGGCCTTCCTACACACACTAGAGCCCCTCATCCCACGACATGCACTCAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  736  TTTGCTTTGGACATGGCAAGGGGCATGGCCTTCCTACACACACTAGAGCCCCTCATCCCACGACATGCACTCAA  809

Query  963  TAGCCGTAGTGTAATGATTGATGAGGACATGACTGCCCGAATTAGCATGGCTGATGTCAAGTTCTCTTTCCAAT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  810  TAGCCGTAGTGTAATGATTGATGAGGACATGACTGCCCGAATTAGCATGGCTGATGTCAAGTTCTCTTTCCAAT  883

Query 1037  GTCCTGGTCGCATGTATGCACCTGCCTGGGTAGCCCCCGAAGCTCTGCAGAAGAAGCCTGAAGACACAAACAGA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  884  GTCCTGGTCGCATGTATGCACCTGCCTGGGTAGCCCCCGAAGCTCTGCAGAAGAAGCCTGAAGACACAAACAGA  957

Query 1111  CGCTCAGCAGACATGTGGAGTTTTGCAGTGCTTCTGTGGGAACTGGTGACACGGGAGGTACCCTTTGCTGACCT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  958  CGCTCAGCAGACATGTGGAGTTTTGCAGTGCTTCTGTGGGAACTGGTGACACGGGAGGTACCCTTTGCTGACCT  1031

Query 1185  CTCCAATATGGAGATTGGAATGAAGGTGGCATTGGAAGGCCTTCGGCCTACCATCCCACCAGGTATTTCCCCTC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1032  CTCCAATATGGAGATTGGAATGAAGGTGGCATTGGAAGGCCTTCGGCCTACCATCCCACCAGGTATTTCCCCTC  1105

Query 1259  ATGTGTGTAAGCTCATGAAGATCTGCATGAATGAAGACCCTGCAAAGCGACCCAAATTTGACATGATTGTGCCT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1106  ATGTGTGTAAGCTCATGAAGATCTGCATGAATGAAGACCCTGCAAAGCGACCCAAATTTGACATGATTGTGCCT  1179

Query 1333  ATCCTTGAGAAGATGCAGGACAAG  1356
            ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1180  ATCCTTGAGAAGATGCAGGACAAG  1203