Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000474279
• Subject: XM_024448496.1
• Aligned Length: 1449
• Identities: 1354
• Gaps: 93

Alignment

Query    1  ATGGACGACATTTTCACTCAGTGCCGGGAGGGCAACGCAGTCGCCGTTCGCCTGTGGCTGGACAACACGGAGAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACGACATTTTCACTCAGTGCCGGGAGGGCAACGCAGTCGCCGTTCGCCTGTGGCTGGACAACACGGAGAA  74

Query   75  CGACCTCAACCAGGGGGACGATCATGGCTTCTCCCCCTTGCACTGGGCCTGCCGAGAGGGCCGCTCTGCTGTGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGACCTCAACCAGGGGGACGATCATGGCTTCTCCCCCTTGCACTGGGCCTGCCGAGAGGGCCGCTCTGCTGTGG  148

Query  149  TTGAGATGTTGATCATGCGGGGGGCACGGATCAATGTAATGAACCGTGGGGATGACACCCCCCTGCATCTGGCA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTGAGATGTTGATCATGCGGGGGGCACGGATCAATGTAATGAACCGTGGGGATGACACCCCCCTGCATCTGGCA  222

Query  223  GCCAGTCATGGACACCGTGATATTGTACAGAAGCTATTGCAGTACAAGGCAGACATCAATGCAGTGAATGAACA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCCAGTCATGGACACCGTGATATTGTACAGAAGCTATTGCAGTACAAGGCAGACATCAATGCAGTGAATGAACA  296

Query  297  TGGGAATGTGCCCCTGCACTATGCCTGTTTTTGGGGCCAAGATCAAGTGGCAGAGGACCTGGTGGCAAATGGGG  370
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGGGAATGTGCCCCTGCACTATGCCTGTTTTTGGGGCCAAGATCAAGTGGCAGAGGACCTGGTGGCAAATGGGG  370

Query  371  CCCTTGTCAGCATCTGTAACAAGTATGGAGAGATGCCTGTGGACAAAGCCAAGGCACCCCTGAGAGAGCTTCTC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCCTTGTCAGCATCTGTAACAAGTATGGAGAGATGCCTGTGGACAAAGCCAAGGCACCCCTGAGAGAGCTTCTC  444

Query  445  CG------------------------------------------------------------------------  446
            ||                                                                        
Sbjct  445  CGAGGTCCATCTCCCCATCCCCTAGCTTGTGTCCTCTCGTCCCTTCCCACCTGTCTTCTCCCTCTGTACCACAG  518

Query  447  ---------------------AGAGCGGGCAGAGAAGATGGGCCAGAATCTCAACCGTATTCCATACAAGGACA  499
                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTTAGGTTGTTTTTCTTCCCTAGAGCGGGCAGAGAAGATGGGCCAGAATCTCAACCGTATTCCATACAAGGACA  592

Query  500  CATTCTGGAAGGGGACCACCCGCACTCGGCCCCGAAATGGAACCCTGAACAAACACTCTGGCATTGACTTCAAA  573
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CATTCTGGAAGGGGACCACCCGCACTCGGCCCCGAAATGGAACCCTGAACAAACACTCTGGCATTGACTTCAAA  666

Query  574  CAGCTTAACTTCCTGACGAAGCTCAACGAGAATCACTCTGGAGAGCTATGGAAGGGCCGCTGGCAGGGCAATGA  647
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGCTTAACTTCCTGACGAAGCTCAACGAGAATCACTCTGGAGAGCTATGGAAGGGCCGCTGGCAGGGCAATGA  740

Query  648  CATTGTCGTGAAGGTGCTGAAGGTTCGAGACTGGAGTACAAGGAAGAGCAGGGACTTCAATGAAGAGTGTCCCC  721
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CATTGTCGTGAAGGTGCTGAAGGTTCGAGACTGGAGTACAAGGAAGAGCAGGGACTTCAATGAAGAGTGTCCCC  814

Query  722  GGCTCAGGATTTTCTCGCATCCAAATGTGCTCCCAGTGCTAGGTGCCTGCCAGTCTCCACCTGCTCCTCATCCT  795
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGCTCAGGATTTTCTCGCATCCAAATGTGCTCCCAGTGCTAGGTGCCTGCCAGTCTCCACCTGCTCCTCATCCT  888

Query  796  ACTCTCATCACACACTGGATGCCATATGGATCCCTCTACAATGTACTACATGAAGGCACCAATTTCGTCGTGGA  869
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACTCTCATCACACACTGGATGCCGTATGGATCCCTCTACAATGTACTACATGAAGGCACCAATTTCGTCGTGGA  962

Query  870  CCAGAGCCAGGCTGTGAAGTTTGCTTTGGACATGGCAAGGGGCATGGCCTTCCTACACACACTAGAGCCCCTCA  943
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCAGAGCCAGGCTGTGAAGTTTGCTTTGGACATGGCAAGGGGCATGGCCTTCCTACACACACTAGAGCCCCTCA  1036

Query  944  TCCCACGACATGCACTCAATAGCCGTAGTGTAATGATTGATGAGGACATGACTGCCCGAATTAGCATGGCTGAT  1017
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCCCACGACATGCACTCAATAGCCGTAGTGTAATGATTGATGAGGACATGACTGCCCGAATTAGCATGGCTGAT  1110

Query 1018  GTCAAGTTCTCTTTCCAATGTCCTGGTCGCATGTATGCACCTGCCTGGGTAGCCCCCGAAGCTCTGCAGAAGAA  1091
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTCAAGTTCTCTTTCCAATGTCCTGGTCGCATGTATGCACCTGCCTGGGTAGCCCCCGAAGCTCTGCAGAAGAA  1184

Query 1092  GCCTGAAGACACAAACAGACGCTCAGCAGACATGTGGAGTTTTGCAGTGCTTCTGTGGGAACTGGTGACACGGG  1165
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCCTGAAGACACAAACAGACGCTCAGCAGACATGTGGAGTTTTGCAGTGCTTCTGTGGGAACTGGTGACACGGG  1258

Query 1166  AGGTACCCTTTGCTGACCTCTCCAATATGGAGATTGGAATGAAGGTGGCATTGGAAGGCCTTCGGCCTACCATC  1239
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGGTACCCTTTGCTGACCTCTCCAATATGGAGATTGGAATGAAGGTGGCATTGGAAGGCCTTCGGCCTACCATC  1332

Query 1240  CCACCAGGTATTTCCCCTCATGTGTGTAAGCTCATGAAGATCTGCATGAATGAAGACCCTGCAAAGCGACCCAA  1313
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CCACCAGGTATTTCCCCTCATGTGTGTAAGCTCATGAAGATCTGCATGAATGAAGACCCTGCAAAGCGACCCAA  1406

Query 1314  ATTTGACATGATTGTGCCTATCCTTGAGAAGATGCAGGACAAG  1356
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  ATTTGACATGATTGTGCCTATCCTTGAGAAGATGCAGGACAAG  1449