Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000474279
• Subject: XM_024448500.1
• Aligned Length: 1449
• Identities: 953
• Gaps: 495

Alignment

Query    1  ATGGACGACATTTTCACTCAGTGCCGGGAGGGCAACGCAGTCGCCGTTCGCCTGTGGCTGGACAACACGGAGAA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CGACCTCAACCAGGGGGACGATCATGGCTTCTCCCCCTTGCACTGGGCCTGCCGAGAGGGCCGCTCTGCTGTGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TTGAGATGTTGATCATGCGGGGGGCACGGATCAATGTAATGAACCGTGGGGATGACACCCCCCTGCATCTGGCA  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GCCAGTCATGGACACCGTGATATTGTACAGAAGCTATTGCAGTACAAGGCAGACATCAATGCAGTGAATGAACA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  TGGGAATGTGCCCCTGCACTATGCCTGTTTTTGGGGCCAAGATCAAGTGGCAGAGGACCTGGTGGCAAATGGGG  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  CCCTTGTCAGCATCTGTAACAAGTATGGAGAGATGCCTGTGGACAAAGCCAAGGCACCCCTGAGAGAGCTTCTC  444
                                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --------------------------------ATGCCTGTGGACAAAGCCAAGGCACCCCTGAGAGAGCTTCTC  42

Query  445  CG------------------------------------------------------------------------  446
            ||                                                                        
Sbjct   43  CGAGGTCCATCTCCCCATCCCCTAGCTTGTGTCCTCTCGTCCCTTCCCACCTGTCTTCTCCCTCTGTACCACAG  116

Query  447  ---------------------AGAGCGGGCAGAGAAGATGGGCCAGAATCTCAACCGTATTCCATACAAGGACA  499
                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  117  CTTAGGTTGTTTTTCTTCCCTAGAGCGGGCAGAGAAGATGGGCCAGAATCTCAACCGTATTCCATACAAGGACA  190

Query  500  CATTCTGGAAGGGGACCACCCGCACTCGGCCCCGAAATGGAACCCTGAACAAACACTCTGGCATTGACTTCAAA  573
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  191  CATTCTGGAAGGGGACCACCCGCACTCGGCCCCGAAATGGAACCCTGAACAAACACTCTGGCATTGACTTCAAA  264

Query  574  CAGCTTAACTTCCTGACGAAGCTCAACGAGAATCACTCTGGAGAGCTATGGAAGGGCCGCTGGCAGGGCAATGA  647
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  265  CAGCTTAACTTCCTGACGAAGCTCAACGAGAATCACTCTGGAGAGCTATGGAAGGGCCGCTGGCAGGGCAATGA  338

Query  648  CATTGTCGTGAAGGTGCTGAAGGTTCGAGACTGGAGTACAAGGAAGAGCAGGGACTTCAATGAAGAGTGTCCCC  721
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  339  CATTGTCGTGAAGGTGCTGAAGGTTCGAGACTGGAGTACAAGGAAGAGCAGGGACTTCAATGAAGAGTGTCCCC  412

Query  722  GGCTCAGGATTTTCTCGCATCCAAATGTGCTCCCAGTGCTAGGTGCCTGCCAGTCTCCACCTGCTCCTCATCCT  795
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  413  GGCTCAGGATTTTCTCGCATCCAAATGTGCTCCCAGTGCTAGGTGCCTGCCAGTCTCCACCTGCTCCTCATCCT  486

Query  796  ACTCTCATCACACACTGGATGCCATATGGATCCCTCTACAATGTACTACATGAAGGCACCAATTTCGTCGTGGA  869
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  487  ACTCTCATCACACACTGGATGCCGTATGGATCCCTCTACAATGTACTACATGAAGGCACCAATTTCGTCGTGGA  560

Query  870  CCAGAGCCAGGCTGTGAAGTTTGCTTTGGACATGGCAAGGGGCATGGCCTTCCTACACACACTAGAGCCCCTCA  943
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  561  CCAGAGCCAGGCTGTGAAGTTTGCTTTGGACATGGCAAGGGGCATGGCCTTCCTACACACACTAGAGCCCCTCA  634

Query  944  TCCCACGACATGCACTCAATAGCCGTAGTGTAATGATTGATGAGGACATGACTGCCCGAATTAGCATGGCTGAT  1017
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  635  TCCCACGACATGCACTCAATAGCCGTAGTGTAATGATTGATGAGGACATGACTGCCCGAATTAGCATGGCTGAT  708

Query 1018  GTCAAGTTCTCTTTCCAATGTCCTGGTCGCATGTATGCACCTGCCTGGGTAGCCCCCGAAGCTCTGCAGAAGAA  1091
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  709  GTCAAGTTCTCTTTCCAATGTCCTGGTCGCATGTATGCACCTGCCTGGGTAGCCCCCGAAGCTCTGCAGAAGAA  782

Query 1092  GCCTGAAGACACAAACAGACGCTCAGCAGACATGTGGAGTTTTGCAGTGCTTCTGTGGGAACTGGTGACACGGG  1165
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  783  GCCTGAAGACACAAACAGACGCTCAGCAGACATGTGGAGTTTTGCAGTGCTTCTGTGGGAACTGGTGACACGGG  856

Query 1166  AGGTACCCTTTGCTGACCTCTCCAATATGGAGATTGGAATGAAGGTGGCATTGGAAGGCCTTCGGCCTACCATC  1239
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  857  AGGTACCCTTTGCTGACCTCTCCAATATGGAGATTGGAATGAAGGTGGCATTGGAAGGCCTTCGGCCTACCATC  930

Query 1240  CCACCAGGTATTTCCCCTCATGTGTGTAAGCTCATGAAGATCTGCATGAATGAAGACCCTGCAAAGCGACCCAA  1313
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  931  CCACCAGGTATTTCCCCTCATGTGTGTAAGCTCATGAAGATCTGCATGAATGAAGACCCTGCAAAGCGACCCAA  1004

Query 1314  ATTTGACATGATTGTGCCTATCCTTGAGAAGATGCAGGACAAG  1356
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1005  ATTTGACATGATTGTGCCTATCCTTGAGAAGATGCAGGACAAG  1047