Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000474290
- Subject:
- NM_000293.3
- Aligned Length:
- 3305
- Identities:
- 3201
- Gaps:
- 73
Alignment
Query 1 ATGGCCTG----------CTCAC------------CTGATGCAGTCGTCT------------CTCCGTCTTC-- 38
|||||..| ||||| ||| |.|| |||| |||.|.| |
Sbjct 1 ATGGCGGGGGCGGCGGGACTCACGGCAGAAGTGAGCTG--GAAG--GTCTTGGAGCGAAGAGCTCGGAC--CAA 68
Query 39 -CGCTTTCTTAAGGTCTGGCTCAGTTTATGAACCTCTTAAAAGCATTAATCTTCCAAGACCTGATAATGAAACT 111
||| ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 69 GCGC----------TCAGGCTCAGTTTATGAACCTCTTAAAAGCATTAATCTTCCAAGACCTGATAATGAAACT 132
Query 112 CTCTGGGATAAGTTGGACCATTATTACAGAATTGTCAAGTCAACATTGCTGCTGTATCAAAGTCCAACTACCGG 185
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 133 CTCTGGGATAAGTTGGACCATTATTACAGAATTGTCAAGTCAACATTGCTGCTGTATCAAAGTCCAACTACCGG 206
Query 186 TCTCTTTCCCACTAAAACATGCGGTGGTGACCAGAAGGCCAAGATCCAGGACAGCCTATACTGCGCTGCTGGGG 259
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 207 TCTCTTTCCCACTAAAACATGCGGTGGTGACCAGAAGGCCAAGATCCAGGACAGCCTATACTGCGCTGCTGGGG 280
Query 260 CCTGGGCTTTGGCTCTTGCATACAGGCGAATTGATGACGACAAGGGAAGGACCCATGAGCTGGAGCACTCAGCT 333
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 281 CCTGGGCTTTGGCTCTTGCATACAGGCGAATTGATGATGACAAGGGAAGGACCCATGAGCTGGAGCACTCAGCT 354
Query 334 ATAAAATGCATGAGAGGAATTCTCTACTGCTATATGCGTCAGGCCGATAAGGTCCAGCAGTTTAAGCAGGATCC 407
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 355 ATAAAATGCATGAGAGGAATTCTCTACTGCTATATGCGTCAGGCCGATAAGGTCCAGCAGTTTAAGCAGGATCC 428
Query 408 ACGCCCAACAACATGTCTTCACTCTGTTTTCAATGTGCATACAGGAGATGAGTTGCTTTCCTATGAGGAATATG 481
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 429 ACGCCCAACAACATGTCTTCACTCTGTTTTCAATGTGCATACAGGAGATGAGTTGCTTTCCTATGAGGAATATG 502
Query 482 GTCATCTTCAGATAAATGCAGTGTCACTTTATCTCCTTTACCTTGTGGAAATGATTTCCTCAGGACTCCAGATT 555
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 503 GTCATCTTCAGATAAATGCAGTGTCACTTTATCTCCTTTACCTTGTGGAAATGATTTCCTCAGGACTCCAGATT 576
Query 556 ATCTACAACACTGATGAGGTCTCTTTTATTCAAAACCTTGTATTTTGTGTGGAAAGAGTTTACCGTGTGCCTGA 629
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 577 ATCTACAACACTGATGAGGTCTCTTTTATTCAAAACCTTGTATTTTGTGTGGAAAGAGTTTACCGTGTGCCTGA 650
Query 630 CTTTGGTGTCTGGGAAAGAGGAAGCAAATATAATAATGGCAGCACAGAGCTACATTCGAGCTCGGTTGGTTTAG 703
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 651 CTTTGGTGTCTGGGAAAGAGGAAGCAAATATAATAATGGCAGCACAGAGCTACATTCGAGCTCGGTTGGTTTAG 724
Query 704 CAAAAGCAGCTCTAGAAGCAATTAATGGATTCAACCTTTTTGGCAACCAGGGCTGTTCGTGGTCAGTTATATTT 777
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 725 CAAAAGCAGCTCTAGAAGCAATTAATGGATTCAACCTTTTTGGCAACCAGGGCTGTTCGTGGTCAGTTATATTT 798
Query 778 GTGGATCTCGATGCTCACAATCGCAACAGGCAAACTTTGTGCTCGCTGTTACCCAGAGAATCAAGATCACATAA 851
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 799 GTGGATCTCGATGCTCACAATCGCAACAGGCAAACTTTGTGCTCGCTGTTACCCAGAGAATCAAGATCACATAA 872
Query 852 TACAGATGCTGCCCTGCTCCCCTGCATCAGTTATCCTGCATTTGCCCTGGATGATGAAGTTCTTTTTAGCCAGA 925
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 873 TACAGATGCTGCCCTGCTCCCCTGCATCAGTTATCCTGCATTTGCCCTGGATGATGAAGTTCTTTTTAGCCAGA 946
Query 926 CACTTGATAAAGTGGTTAGAAAATTAAAAGGAAAATATGGATTTAAACGTTTCTTGAGAGATGGGTATAGAACA 999
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 947 CACTTGATAAAGTGGTTAGAAAATTAAAAGGAAAATATGGATTTAAACGTTTCTTGAGAGATGGGTATAGAACA 1020
Query 1000 TCATTGGAAGATCCCAACAGATGCTACTACAAGCCAGCTGAAATTAAGCTATTTGATGGCATTGAATGTGAATT 1073
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 TCATTGGAAGATCCCAACAGATGCTACTACAAGCCAGCTGAAATTAAGCTATTTGATGGCATTGAATGTGAATT 1094
Query 1074 TCCCATATTTTTCCTTTATATGATGATTGATGGAGTTTTTAGAGGCAATCCTAAGCAAGTACAGGAATATCAGG 1147
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1095 TCCCATATTTTTCCTTTATATGATGATTGATGGAGTTTTTAGAGGCAATCCTAAGCAAGTACAGGAATATCAGG 1168
Query 1148 ATCTTTTGACTCCAGTACTTCATCATACCACAGAAGGATATCCTGTTGTACCAAAGTACTATTATGTGCCAGCT 1221
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1169 ATCTTTTGACTCCAGTACTTCATCATACCACAGAAGGATATCCTGTTGTACCAAAGTACTATTATGTGCCAGCT 1242
Query 1222 GACTTTGTAGAATATGAAAAAAATAACCCTGGTAGTCAAAAACGATTTCCTAGCAACTGTGGCCGTGATGGAAA 1295
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1243 GACTTTGTAGAATATGAAAAAAATAACCCTGGTAGTCAAAAACGATTTCCTAGCAACTGTGGCCGTGATGGAAA 1316
Query 1296 ACTGTTTCTTTGGGGACAAGCACTTTATATCATCGCAAAACTCCTGGCTGATGAACTTATTAGTCCTAAAGACA 1369
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1317 ACTGTTTCTTTGGGGACAAGCACTTTATATCATCGCAAAACTCCTGGCTGATGAACTTATTAGTCCTAAAGACA 1390
Query 1370 TTGATCCTGTCCAGCGCTATGTCCCACTAAAGGATCAACGTAACGTGAGCATGAGGTTTTCCAATCAGGGCCCA 1443
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1391 TTGATCCTGTCCAGCGCTATGTCCCACTAAAGGATCAACGTAACGTGAGCATGAGGTTTTCCAATCAGGGCCCA 1464
Query 1444 CTGGAAAATGACTTGGTAGTTCATGTGGCACTTATAGCAGAAAGCCAAAGACTTCAAGTTTTTCTGAACACATA 1517
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1465 CTGGAAAATGACTTGGTAGTTCATGTGGCACTTATAGCAGAAAGCCAAAGACTTCAAGTTTTTCTGAACACATA 1538
Query 1518 TGGTATTCAAACTCAAACTCCTCAACAAGTAGAACCCATTCAGATATGGCCTCAGCAGGAGCTTGTGAAAGCTT 1591
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1539 TGGTATTCAAACTCAAACTCCTCAACAAGTAGAACCCATTCAGATATGGCCTCAGCAGGAGCTTGTGAAAGCTT 1612
Query 1592 ATTTGCAGCTGGGTATCAATGAAAAGTTAGGACTCTCTGGAAGGCCAGACAGGCCCATTGGCTGCCTCGGGACA 1665
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1613 ATTTGCAGCTGGGTATCAATGAAAAGTTAGGACTCTCTGGAAGGCCAGACAGGCCCATTGGCTGCCTCGGGACA 1686
Query 1666 TCAAAGATTTATCGCATTCTAGGAAAGACTGTGGTTTGTTACCCGATTATTTTCGACCTAAGTGATTTCTACAT 1739
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1687 TCAAAGATTTATCGCATTCTAGGAAAGACTGTGGTTTGTTACCCGATTATTTTCGACCTAAGTGATTTCTACAT 1760
Query 1740 GTCTCAGGATGTTTTCCTGCTGATAGATGACATAAAGAATGCGCTGCAGTTCATTAAACAATATTGGAAAATGC 1813
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1761 GTCTCAGGATGTTTTCCTGCTGATAGATGACATAAAGAATGCGCTGCAGTTCATTAAACAATATTGGAAAATGC 1834
Query 1814 ATGGACGTCCACTTTTCCTTGTTCTCATCCGGGAAGACAATATAAGAGGTAGCCGGTTCAACCCCATATTAGAT 1887
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1835 ATGGACGTCCACTTTTCCTTGTTCTCATCCGGGAAGACAATATAAGAGGTAGCCGGTTCAACCCCATATTAGAT 1908
Query 1888 ATGCTGGCAGCCCTTAAAAAAGGAATAATTGGAGGAGTCAAAGTTCATGTGGATCGTCTACAGACACTAATATC 1961
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1909 ATGCTGGCAGCCCTTAAAAAAGGAATAATTGGAGGAGTCAAAGTTCATGTGGATCGTCTACAGACACTAATATC 1982
Query 1962 TGGAGCTGTGGTAGAACAACTTGATTTCCTACGAATCAGTGACACAGAAGAGCTTCCAGAATTTAAGAGTTTTG 2035
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1983 TGGAGCTGTGGTAGAACAACTTGATTTCCTACGAATCAGTGACACAGAAGAGCTTCCAGAATTTAAGAGTTTTG 2056
Query 2036 AGGAACTAGAACCTCCCAAACATTCAAAAGTCAAACGGCAAAGCAGCACCCCTAGTGCTCCTGAACTGGGACAG 2109
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2057 AGGAACTAGAACCTCCCAAACATTCAAAAGTCAAACGGCAAAGCAGCACCCCTAGTGCTCCTGAACTGGGACAG 2130
Query 2110 CAGCCGGATGTCAACATTAGTGAATGGAAGGACAAACCCACCCATGAAATTCTTCAAAAACTGAATGATTGCAG 2183
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2131 CAGCCGGATGTCAACATTAGTGAATGGAAGGACAAACCCACCCACGAAATTCTTCAAAAACTGAATGATTGCAG 2204
Query 2184 TTGTCTGGCTAGCCAAGCCATCCTGCTGGGTATACTGCTCAAAAGAGAAGGCCCCAACTTCATCACAAAGGAAG 2257
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2205 TTGTCTGGCTAGCCAAGCCATCCTGCTGGGTATACTGCTCAAAAGAGAAGGCCCCAACTTCATCACAAAGGAAG 2278
Query 2258 GTACCGTTTCTGATCACATTGAGAGAGTCTATAGAAGAGCTGGCAGCCAAAAACTTTGGTCGGTTGTACG---C 2328
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||..||.|| |
Sbjct 2279 GTACCGTTTCTGATCACATTGAGAGAGTCTATAGAAGAGCTGGCAGCCAAAAACTTTGGTTGGCGGTGCGCTAC 2352
Query 2329 CGTGCAGCAAGTCTTTTA---AGTAAAGTAGTGGACAGCC----TGGCCCCATCCATTACTAATGTTTTAGTGC 2395
.|.||.||| |||| ||.|| |...|..|| |.||||||..||||||||.|.||.|.||.|
Sbjct 2353 GGGGCTGCA-----TTTACCCAGAAA-----TTTTCTTCCTCTATAGCCCCACACATTACTACTTTTCTGGTAC 2416
Query 2396 AGGGCAAACAGGTAACTCTGGGTGCCTTTGGGCATGAAGAAGAAGTTATCTCTAATCCTTTGTCTCCAAGAGTG 2469
|.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2417 ATGGGAAACAGGTAACTCTGGGTGCCTTTGGGCATGAAGAAGAAGTTATCTCTAATCCTTTGTCTCCAAGAGTG 2490
Query 2470 ATTCAAAACATCATCTATTATAAGTGTAACACCCATGATGAGAGGGAAGCGGTCATTCAGCAAGAACTGGTCAT 2543
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2491 ATTCAAAACATCATCTATTATAAGTGTAACACCCATGATGAGAGGGAAGCGGTCATTCAGCAAGAACTGGTCAT 2564
Query 2544 CCATATTGGCTGGATCATCTCCAATAACCCTGAGTTATTCAGTGGCATGCTGAAAATACGAATCGGGTGGATCA 2617
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2565 CCATATTGGCTGGATCATCTCCAATAACCCTGAGTTATTCAGTGGCATGCTGAAAATACGAATCGGGTGGATCA 2638
Query 2618 TCCATGCCATGGAGTATGAACTTCAGATCCGTGGCGGAGACAAGCCAGCCTTGGACTTGTATCAGCTGTCACCT 2691
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2639 TCCATGCCATGGAGTATGAACTTCAGATCCGTGGCGGAGACAAGCCAGCCTTGGACTTGTATCAGCTGTCACCT 2712
Query 2692 AGTGAAGTTAAACAGCTTCTGCTGGATATTCTGCAGCCTCAACAGAATGGAAGATGTTGGCTGAACAGGCGTCA 2765
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2713 AGTGAAGTTAAACAGCTTCTGCTGGATATTCTGCAGCCTCAACAGAATGGAAGATGTTGGCTGAACAGGCGTCA 2786
Query 2766 GATCGATGGGTCTTTGAATAGAACTCCCACCGGGTTCTATGACCGAGTGTGGCAGATTCTGGAGCGCACGCCCA 2839
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2787 GATCGATGGGTCTTTGAATAGAACTCCCACCGGGTTCTATGACCGAGTGTGGCAGATTCTGGAGCGCACGCCCA 2860
Query 2840 ATGGGATCATTGTTGCTGGGAAGCATTTGCCTCAGCAACCAACCCTGTCAGATATGACCATGTATGAGATGAAT 2913
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2861 ATGGGATCATTGTTGCTGGGAAGCATTTGCCTCAGCAACCAACCCTGTCAGATATGACCATGTATGAGATGAAT 2934
Query 2914 TTCTCTCTCCTTGTTGAAGACACGTTGGGAAATATTGACCAGCCACAGTACAGACAGATCGTTGTAGAGTTACT 2987
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2935 TTCTCTCTCCTTGTTGAAGACACGTTGGGAAATATTGACCAGCCACAGTACAGACAGATCGTTGTAGAGTTACT 3008
Query 2988 TATGGTTGTATCCATTGTACTGGAAAGAAACCCCGAGCTAGAATTTCAAGACAAAGTAGATCTAGACAGACTGG 3061
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3009 TATGGTTGTATCCATTGTACTGGAAAGAAACCCCGAGCTAGAATTTCAAGACAAAGTAGATCTAGACAGACTGG 3082
Query 3062 TCAAAGAAGCATTTAATGAATTTCAAAAAGATCAGAGTCGGCTAAAGGAAATTGAAAAACAAGATGACATGACT 3135
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3083 TCAAAGAAGCATTTAATGAATTTCAAAAAGATCAGAGTCGGCTAAAGGAAATTGAAAAACAAGATGACATGACT 3156
Query 3136 TCCTTTTACAACACTCCTCCCCTGGGAAAAAGAGGAACATGCAGCTATTTGACAAAGGCGGTGATGAATCTGCT 3209
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3157 TCCTTTTACAACACTCCTCCCCTGGGAAAAAGAGGAACATGCAGCTATTTGACAAAGGCGGTGATGAATCTGCT 3230
Query 3210 GCTGGAAGGAGAAGTCAAGCCAAACAATGATGACCCGTGTCTGATTAGC 3258
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3231 GCTGGAAGGAGAAGTCAAGCCAAACAATGATGACCCGTGTCTGATTAGC 3279