Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000474290
Subject:
NM_001364411.1
Aligned Length:
3265
Identities:
2741
Gaps:
170

Alignment

Query    1  ATGGCCTGCTCACCTGATGCAGTCGTCTCTCCGTCTTCCGCTTTCTTAAGGTCTGGCTCAGTTTATGAACCTCT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TAAAAGCATTAATCTTCCAAGACCTGATAATGAAACTCTCTGGGATAAGTTGGACCATTATTACAGAATTGTCA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AGTCAACATTGCTGCTGTATCAAAGTCCAACTACCGGTCTCTTTCCCACTAAAACATGCGGTGGTGACCAGAAG  222
                    .|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||..|||||
Sbjct    1  --------ATGCTGATGTATCAAAGTCCAACTACCGGTCTCTTTCCTACTAAAACATGTGGTGGAGAAGAGAAG  66

Query  223  GCCAAGATCCAGGACAGCCTATACTGCGCTGCTGGGGCCTGGGCTTTGGCTCTTGCATACAGGCGAATTGATGA  296
            .||||..|.||.||.||.||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct   67  TCCAAAGTGCACGAGAGTCTGTACTGTGCTGCGGGTGCCTGGGCCTTGGCGCTAGCATACAGGCGCATTGATGA  140

Query  297  CGACAAGGGAAGGACCCATGAGCTGGAGCACTCAGCTATAAAATGCATGAGAGGAATTCTCTACTGCTATATGC  370
            .|||||||||.||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  141  TGACAAGGGACGGACCCATGAGCTGGAGCACTCGGCCATAAAGTGTATGAGAGGAATTCTCTACTGCTACATGC  214

Query  371  GTCAGGCCGATAAGGTCCAGCAGTTTAAGCAGGATCCACGCCCAACAACATGTCTTCACTCTGTTTTCAATGTG  444
            |.|||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  215  GGCAGGCTGATAAGGTCCAACAGTTTAAACAAGATCCCCGGCCCACAACATGTCTTCACTCTGTTTTCAGTGTG  288

Query  445  CATACAGGAGATGAGTTGCTTTCCTATGAGGAATATGGTCATCTTCAGATAAATGCAGTGTCACTTTATCTCCT  518
            ||.||.||.|||||||||||...||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|.||||||
Sbjct  289  CACACTGGGGATGAGTTGCTCAGCTATGAAGAATATGGCCATCTTCAGATAAATGCAGTCTCACTCTTTCTCCT  362

Query  519  TTACCTTGTGGAAATGATTTCCTCAGGACTCCAGATTATCTACAACACTGATGAGGTCTCTTTTATTCAAAACC  592
            ||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  363  TTACCTGGTAGAAATGATTTCCTCAGGCCTCCAGATAATCTATAACACGGATGAGGTTTCTTTTATTCAAAACC  436

Query  593  TTGTATTTTGTGTGGAAAGAGTTTACCGTGTGCCTGACTTTGGTGTCTGGGAAAGAGGAAGCAAATATAATAAT  666
            |||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  437  TTGTATTTTGTGTAGAGAGAGTTTACCGTGTTCCTGACTTTGGTGTCTGGGAAAGAGGAAGCAAATATAACAAT  510

Query  667  GGCAGCACAGAGCTACATTCGAGCTCGGTTGGTTTAGCAAAAGCAGCTCTAGAAGCAATTAATGGATTCAACCT  740
            ||.||.||.||.||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  511  GGTAGTACCGAACTGCACTCAAGCTCTGTTGGTTTAGCAAAAGCAGCCTTAGAAGCAATTAATGGATTTAACCT  584

Query  741  TTTTGGCAACCAGGGCTGTTCGTGGTCAGTTATATTTGTGGATCTCGATGCTCACAATCGCAACAGGCAAACTT  814
            .|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|
Sbjct  585  CTTTGGAAACCAGGGGTGTTCCTGGTCAGTTATATTTGTGGATCTCGATGCTCACAACCGCAACAGGCAGACAT  658

Query  815  TGTGCTCGCTGTTACCCAGAGAATCAAGATCACATAATACAGATGCTGCCCTGCTCCCCTGCATCAGTTATCCT  888
            |||||||.||||||||||||||||||.|.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct  659  TGTGCTCACTGTTACCCAGAGAATCACGCTCTCATAACACAGATGCTGCCCTGCTCCCGTGCATCAGTTACCCT  732

Query  889  GCATTTGCCCTGGATGATGAAGTTCTTTTTAGCCAGACACTTGATAAAGTGGTTAGAAAATTAAAAGGAAAATA  962
            ||.||||||.||||||||||||..||.||.|||||||||||||||||||||.|.||||||||.|||||||||||
Sbjct  733  GCGTTTGCCTTGGATGATGAAGCACTGTTCAGCCAGACACTTGATAAAGTGATAAGAAAATTGAAAGGAAAATA  806

Query  963  TGGATTTAAACGTTTCTTGAGAGATGGGTATAGAACATCATTGGAAGATCCCAACAGATGCTACTACAAGCCAG  1036
            |||||||||.|||||||||.||||||||||.|||||..||||||||||||||||||||.||||.|||||.||||
Sbjct  807  TGGATTTAAGCGTTTCTTGCGAGATGGGTACAGAACGCCATTGGAAGATCCCAACAGACGCTATTACAAACCAG  880

Query 1037  CTGAAATTAAGCTATTTGATGGCATTGAATGTGAATTTCCCATATTTTTCCTTTATATGATGATTGATGGAGTT  1110
            |.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct  881  CAGAGATTAAGCTGTTTGATGGCATTGAATGTGAATTTCCCATATTCTTCCTTTACATGATGATCGATGGTGTT  954

Query 1111  TTTAGAGGCAATCCTAAGCAAGTACAGGAATATCAGGATCTTTTGACTCCAGTACTTCATCATACCACAGAAGG  1184
            |||||||||||||.|.|.|||||..|||||||||||||.||||||||.||..|.||||||||.|||||||||||
Sbjct  955  TTTAGAGGCAATCTTGAACAAGTCAAGGAATATCAGGACCTTTTGACACCTTTGCTTCATCAGACCACAGAAGG  1028

Query 1185  ATATCCTGTTGTACCAAAGTACTATTATGTGCCAGCTGACTTTGTAGAATATGAAAAAAATAACCCTGGTAGTC  1258
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||..|||||||||||||
Sbjct 1029  ATATCCTGTTGTGCCAAAGTACTATTATGTGCCAGCTGACTTTGTAGAATGTGAAAAAAGAAACCCTGGTAGTC  1102

Query 1259  AAAAACGATTTCCTAGCAACTGTGGCCGTGATGGAAAACTGTTTCTTTGGGGACAAGCACTTTATATCATCGCA  1332
            |.||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.||..|||||||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 1103  AGAAGCGGTTTCCAAGTAACTGTGGCCGTGATGGGAAGTTGTTTCTTTGGGGACAAGCTCTTTATATCATTGCA  1176

Query 1333  AAACTCCTGGCTGATGAACTTATTAGTCCTAAAGACATTGATCCTGTCCAGCGCTATGTCCCACTAAAGGATCA  1406
            ||||||||.||||||||..|.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||..||.||||
Sbjct 1177  AAACTCCTAGCTGATGAGTTAATCAGCCCTAAAGACATTGACCCTGTCCAGCGCTTTGTCCCACTTCAGAATCA  1250

Query 1407  ACGTAACGTGAGCATGAGGTTTTCCAATCAGGGCCCACTGGAAAATGACTTGGTAGTTCATGTGGCACTTATAG  1480
            ||||||||||||||||||.|..||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||.|||
Sbjct 1251  ACGTAACGTGAGCATGAGATACTCCAATCAGGGCCCACTGGAAAATGACTTGGTGGTTCATGTAGCACTTGTAG  1324

Query 1481  CAGAAAGCCAAAGACTTCAAGTTTTTCTGAACACATATGGTATTCAAACTCAAACTCCTCAACAAGTAGAACCC  1554
            |||||||||||.|.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||
Sbjct 1325  CAGAAAGCCAACGCCTTCAAGTTTTTCTCAATACATATGGTATTCAAACCCAAACTCCTCAGCAGGTGGAACCC  1398

Query 1555  ATTCAGATATGGCCTCAGCAGGAGCTTGTGAAAGCTTATTTGCAGCTGGGTATCAATGAAAAGTTAGGACTCTC  1628
            ||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 1399  ATTCAGATCTGGCCTCAGCAGGAGCTTGTAAAAGCTTATTTCCACCTGGGAATCAATGAAAAGTTGGGTCTGTC  1472

Query 1629  TGGAAGGCCAGACAGGCCCATTGGCTGCCTCGGGACATCAAAGATTTATCGCATTCTAGGAAAGACTGTGGTTT  1702
            ||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1473  TGGAAGGCCAGATAGGCCCATTGGCTGCCTTGGTACATCAAAGATTTATCGCATTCTAGGAAAGACTGTGGTTT  1546

Query 1703  GTTACCCGATTATTTTCGACCTAAGTGATTTCTACATGTCTCAGGATGTTTTCCTGCTGATAGATGACATAAAG  1776
            |||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||.|.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 1547  GTTACCCTATCATCTTTGACCTGAGTGATTTCTACATGTCTCAGGACGTTCTGCTGCTCATAGATGACATAAAG  1620

Query 1777  AATGCGCTGCAGTTCATTAAACAATATTGGAAAATGCATGGACGTCCACTTTTCCTTGTTCTCATCCGGGAAGA  1850
            ||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1621  AACGCACTACAGTTCATTAAGCAATATTGGAAAATGCATGGACGCCCACTTTTTCTTGTTCTCATCCGAGAAGA  1694

Query 1851  CAATATAAGAGGTAGCCGGTTCAACCCCATATTAGATATGCTGGCAGCCCTTAAAAAAGGAATAATTGGAGGAG  1924
            |||.||||||||||||.|.||||||||.||||||||.||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1695  CAACATAAGAGGTAGCAGATTCAACCCAATATTAGACATGCTGGCAGCCTTTAAAAAGGGAATAATTGGAGGAG  1768

Query 1925  TCAAAGTTCATGTGGATCGTCTACAGACACTAATATCTGGAGCTGTGGTAGAACAACTTGATTTCCTACGAATC  1998
            |||||||||||||.||||||.||||||||.|.|||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.||||||||.
Sbjct 1769  TCAAAGTTCATGTTGATCGTTTACAGACATTGATATCCGGAGCTGTAGTAGAGCAGCTTGACTTTCTACGAATT  1842

Query 1999  AGTGACACAGAAGAGCTTCCAGAATTTAAGAGTTTTGAGGAACTAGAACCTCCCAAACATTCAAAAGTCAAACG  2072
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||.|||||||||..|||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1843  AGTGACACAGAAAAGCTTCCAGAATTTAAGAGCTTTGAAGAACTAGAATTTCCTAAGCATTCAAAAGTCAAACG  1916

Query 2073  GCAAAGCAGCACCCCTAG-TGCTCCTGAACTGGG----ACAGCAGCCGGATGTCAACATTAGTGAATGGAAGGA  2141
            |||.|||||.|||.| || |||||||||    ||    |||..||||.|...|||.|||||..||.|||||..|
Sbjct 1917  GCAGAGCAGTACCGC-AGATGCTCCTGA----GGCGCAACACGAGCCAGGCATCACCATTACCGAGTGGAAAAA  1985

Query 2142  CAAACCCACCCATGAAATTCTTCAAAAACTGAATGATTGCAGTTGTCTGGCTAGCCAAGCCATCCTGCTGGGTA  2215
            ||||.|||||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||.|||||||||||.|.|||.|||||||||||||||
Sbjct 1986  CAAATCCACCCACGAAATCCTTCAGAAGCTGAATGACTGCGGTTGTCTGGCTGGTCAAACCATCCTGCTGGGTA  2059

Query 2216  TACTGCTCAAAAGAGAAGGCCCCAACTTCATCACAAAGGAAGGTACCGTTTCTGATCACATTGAGAGAGTCTAT  2289
            ||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||.||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 2060  TACTGCTCAAAAGAGAGGGCCCTAACTTTATCACAATGGAAGGAACTGTGTCTGATCACATTGAGAGAGTGTAT  2133

Query 2290  AGAAGAGCTGGCAGCCAAAAACTTTGGTCGGTTGTACGCCGTGCAGCAAGTCTTTTAAGTAAAGTAGTGGACAG  2363
            |||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2134  AGAAGAGCTGGCAGCAAAAAGCTTTGGTCGGTTGTACGCCGTGCAGCAAGTCTTTTAAATAAAGTAGTGGACAG  2207

Query 2364  CCTGGCCCCATCCATTACTAATGTTTTAGTGCAGGGCAAACAGGTAACTCTGGGTGCCTTTGGGCATGAAGAAG  2437
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|
Sbjct 2208  CCTGGCCCCATCCATTACTAATGTTTTAGTGCAGGGCAAACAGGTAACTCTAGGTGCCTTTGGACATGAAGAGG  2281

Query 2438  AAGTTATCTCTAATCCTTTGTCTCCAAGAGTGATTCAAAACATCATCTATTATAAGTGTAACACCCATGATGAG  2511
            |.||.||||||||.||..|||||||||||||||||.|.|||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct 2282  AGGTCATCTCTAACCCACTGTCTCCAAGAGTGATTAAGAACATAATCTATTATAAGTGCAATACCCACGATGAG  2355

Query 2512  AGGGAAGCGGTCATTCAGCAAGAACTGGTCATCCATATTGGCTGGATCATCTCCAATAACCCTGAGTTATTCAG  2585
            |||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|.|||||||||.|||||
Sbjct 2356  AGGGAGGCAGTCATTCAGCAAGAACTGGTCATCCACATCGGCTGGATCATCTCCAACAGCCCTGAGTTGTTCAG  2429

Query 2586  TGGCATGCTGAAAATACGAATCGGGTGGATCATCCATGCCATGGAGTATGAACTTCAGATCCGTGGCGGAGACA  2659
            .|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||.||||.|||||.||.|
Sbjct 2430  CGGCATGCTGAAAATACGCATTGGGTGGATCATCCACGCCATGGAGTATGAACTGCAGGTCCGGGGCGGGGATA  2503

Query 2660  AGCCAGCCTTGGACTTGTATCAGCTGTCACCTAGTGAAGTTAAACAGCTTCTGCTGGATATTCTGCAGCCTCAA  2733
            |||||||..||||||||||.|||||.||.||.||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 2504  AGCCAGCTGTGGACTTGTACCAGCTCTCGCCCAGTGAAGTGAAGCAGCTGCTGCTAGACATTCTCCAGCCTCAA  2577

Query 2734  CAGAATGGAAGATGTTGGCTGAACAGGCGTCAGATCGATGGGTCTTTGAATAGAACTCCCACCGG-GTTCTATG  2806
            ||||.|||||||||||||.||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||| |||| .|||||||
Sbjct 2578  CAGAGTGGAAGATGTTGGTTGAATAGACGTCAGATTGATGGGTCATTGAATAGAACACCC-CCGGAATTCTATG  2650

Query 2807  ACCGAGTGTGGCAGATTCTGGAGCGCACGCCCAATGGGATCATTGTTGCTGGGAAGCATTTGCCTCAGCAACCA  2880
            ||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||.||||.|||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 2651  ACCGAGTGTGGCAGATCCTGGAACGCACACCTAATGGTATCGTTGTAGCTGGAAAGCATTTGCCACAGCAACCA  2724

Query 2881  ACCCTGTCAGATATGACCATGTATGAGATGAATTTCTCTCTCCTTGTTGAAGACACGTTGGGAAATATTGACCA  2954
            ||..||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|.|.|||||||.||||||||
Sbjct 2725  ACTTTGTCGGATATGACCATGTATGAGATGAATTTTTCTCTCCTTGTTGAAGATATGCTGGGAAACATTGACCA  2798

Query 2955  GCCACAGTACAGACAGATCGTTGTAGAGTTACTTATGGTTGTATCCATTGTACTGGAAAGAAACCCCGAGCTAG  3028
            ||||.||||.|||||||||.|.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.|
Sbjct 2799  GCCAAAGTATAGACAGATCATAGTTGAGTTACTAATGGTCGTATCCATTGTGCTGGAAAGAAACCCTGAACTGG  2872

Query 3029  AATTTCAAGACAAAGTAGATCTAGACAGACTGGTCAAAGAAGCATTTAATGAATTTCAAAAAGATCAGAGTCGG  3102
            |.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||.||||.||||||||||||.||||||||
Sbjct 2873  AGTTTCAAGACAAAGTGGATCTGGACAGACTGGTTAAAGAAGCGTTTCATGAGTTTCAAAAAGATGAGAGTCGG  2946

Query 3103  CTAAAGGAAATTGAAAAACAAGATGACATGACTTCCTTTTACAACACTCCTCCCCTGGGAAAAAGAGGAACATG  3176
            |||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 2947  CTAAAAGAAATCGAAAAACAAGATGATATGACTTCCTTTTACAACACGCCCCCACTGGGAAAAAGAGGAACCTG  3020

Query 3177  CAGCTATTTGACAAAGGCGGTGATGAATCT-GCTGCTGGAAGGAGAAGTCAAGCCAAACAATGATGACCCGTGT  3249
            ||||||.|||||.||||..|||||||| || .|||||.||.||||||||||||||.|.||||||.|||.|.||.
Sbjct 3021  CAGCTACTTGACGAAGGTTGTGATGAA-CTCACTGCTCGAGGGAGAAGTCAAGCCCAGCAATGAGGACTCCTGC  3093

Query 3250  CTGATTAGC  3258
            |||.|||||
Sbjct 3094  CTGGTTAGC  3102