Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000474290
Subject:
NM_199446.2
Aligned Length:
3265
Identities:
2883
Gaps:
17

Alignment

Query    1  ATGGCCTGCTCACCTGATGCAGTCGTCTCTCCGTCTTCCGCTTTCTTAAGGTCTGGCTCAGTTTATGAACCTCT  74
            ||||||..||||||||||||||.|.|||||   ||..|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCAACTCACCTGATGCAGCCTTCTCT---TCACCTGCTTTGTTAAGGTCTGGCTCAGTTTATGAACCTCT  71

Query   75  TAAAAGCATTAATCTTCCAAGACCTGATAATGAAACTCTCTGGGATAAGTTGGACCATTATTACAGAATTGTCA  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct   72  TAAAAGCATTAATCTTCCAAGACCTGATAATGAAACTCTATGGGATAAGTTGGATCATTATTACAGAATTGTCA  145

Query  149  AGTCAACATTGCTGCTGTATCAAAGTCCAACTACCGGTCTCTTTCCCACTAAAACATGCGGTGGTGACCAGAAG  222
            |||||||..|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||..|||||
Sbjct  146  AGTCAACGATGCTGATGTATCAAAGTCCAACTACCGGTCTCTTTCCTACTAAAACATGTGGTGGAGAAGAGAAG  219

Query  223  GCCAAGATCCAGGACAGCCTATACTGCGCTGCTGGGGCCTGGGCTTTGGCTCTTGCATACAGGCGAATTGATGA  296
            .||||..|.||.||.||.||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  220  TCCAAAGTGCACGAGAGTCTGTACTGTGCTGCGGGTGCCTGGGCCTTGGCGCTAGCATACAGGCGCATTGATGA  293

Query  297  CGACAAGGGAAGGACCCATGAGCTGGAGCACTCAGCTATAAAATGCATGAGAGGAATTCTCTACTGCTATATGC  370
            .|||||||||.||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  294  TGACAAGGGACGGACCCATGAGCTGGAGCACTCGGCCATAAAGTGTATGAGAGGAATTCTCTACTGCTACATGC  367

Query  371  GTCAGGCCGATAAGGTCCAGCAGTTTAAGCAGGATCCACGCCCAACAACATGTCTTCACTCTGTTTTCAATGTG  444
            |.|||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  368  GGCAGGCTGATAAGGTCCAACAGTTTAAACAAGATCCCCGGCCCACAACATGTCTTCACTCTGTTTTCAGTGTG  441

Query  445  CATACAGGAGATGAGTTGCTTTCCTATGAGGAATATGGTCATCTTCAGATAAATGCAGTGTCACTTTATCTCCT  518
            ||.||.||.|||||||||||...||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|.||||||
Sbjct  442  CACACTGGGGATGAGTTGCTCAGCTATGAAGAATATGGCCATCTTCAGATAAATGCAGTCTCACTCTTTCTCCT  515

Query  519  TTACCTTGTGGAAATGATTTCCTCAGGACTCCAGATTATCTACAACACTGATGAGGTCTCTTTTATTCAAAACC  592
            ||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  516  TTACCTGGTAGAAATGATTTCCTCAGGCCTCCAGATAATCTATAACACGGATGAGGTTTCTTTTATTCAAAACC  589

Query  593  TTGTATTTTGTGTGGAAAGAGTTTACCGTGTGCCTGACTTTGGTGTCTGGGAAAGAGGAAGCAAATATAATAAT  666
            |||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  590  TTGTATTTTGTGTAGAGAGAGTTTACCGTGTTCCTGACTTTGGTGTCTGGGAAAGAGGAAGCAAATATAACAAT  663

Query  667  GGCAGCACAGAGCTACATTCGAGCTCGGTTGGTTTAGCAAAAGCAGCTCTAGAAGCAATTAATGGATTCAACCT  740
            ||.||.||.||.||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  664  GGTAGTACCGAACTGCACTCAAGCTCTGTTGGTTTAGCAAAAGCAGCCTTAGAAGCAATTAATGGATTTAACCT  737

Query  741  TTTTGGCAACCAGGGCTGTTCGTGGTCAGTTATATTTGTGGATCTCGATGCTCACAATCGCAACAGGCAAACTT  814
            .|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|
Sbjct  738  CTTTGGAAACCAGGGGTGTTCCTGGTCAGTTATATTTGTGGATCTCGATGCTCACAACCGCAACAGGCAGACAT  811

Query  815  TGTGCTCGCTGTTACCCAGAGAATCAAGATCACATAATACAGATGCTGCCCTGCTCCCCTGCATCAGTTATCCT  888
            |||||||.||||||||||||||||||.|.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct  812  TGTGCTCACTGTTACCCAGAGAATCACGCTCTCATAACACAGATGCTGCCCTGCTCCCGTGCATCAGTTACCCT  885

Query  889  GCATTTGCCCTGGATGATGAAGTTCTTTTTAGCCAGACACTTGATAAAGTGGTTAGAAAATTAAAAGGAAAATA  962
            ||.||||||.||||||||||||..||.||.|||||||||||||||||||||.|.||||||||.|||||||||||
Sbjct  886  GCGTTTGCCTTGGATGATGAAGCACTGTTCAGCCAGACACTTGATAAAGTGATAAGAAAATTGAAAGGAAAATA  959

Query  963  TGGATTTAAACGTTTCTTGAGAGATGGGTATAGAACATCATTGGAAGATCCCAACAGATGCTACTACAAGCCAG  1036
            |||||||||.|||||||||.||||||||||.|||||..||||||||||||||||||||.||||.|||||.||||
Sbjct  960  TGGATTTAAGCGTTTCTTGCGAGATGGGTACAGAACGCCATTGGAAGATCCCAACAGACGCTATTACAAACCAG  1033

Query 1037  CTGAAATTAAGCTATTTGATGGCATTGAATGTGAATTTCCCATATTTTTCCTTTATATGATGATTGATGGAGTT  1110
            |.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 1034  CAGAGATTAAGCTGTTTGATGGCATTGAATGTGAATTTCCCATATTCTTCCTTTACATGATGATCGATGGTGTT  1107

Query 1111  TTTAGAGGCAATCCTAAGCAAGTACAGGAATATCAGGATCTTTTGACTCCAGTACTTCATCATACCACAGAAGG  1184
            |||||||||||||.|.|.|||||..|||||||||||||.||||||||.||..|.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1108  TTTAGAGGCAATCTTGAACAAGTCAAGGAATATCAGGACCTTTTGACACCTTTGCTTCATCAGACCACAGAAGG  1181

Query 1185  ATATCCTGTTGTACCAAAGTACTATTATGTGCCAGCTGACTTTGTAGAATATGAAAAAAATAACCCTGGTAGTC  1258
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||..|||||||||||||
Sbjct 1182  ATATCCTGTTGTGCCAAAGTACTATTATGTGCCAGCTGACTTTGTAGAATGTGAAAAAAGAAACCCTGGTAGTC  1255

Query 1259  AAAAACGATTTCCTAGCAACTGTGGCCGTGATGGAAAACTGTTTCTTTGGGGACAAGCACTTTATATCATCGCA  1332
            |.||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.||..|||||||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 1256  AGAAGCGGTTTCCAAGTAACTGTGGCCGTGATGGGAAGTTGTTTCTTTGGGGACAAGCTCTTTATATCATTGCA  1329

Query 1333  AAACTCCTGGCTGATGAACTTATTAGTCCTAAAGACATTGATCCTGTCCAGCGCTATGTCCCACTAAAGGATCA  1406
            ||||||||.||||||||..|.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||..||.||||
Sbjct 1330  AAACTCCTAGCTGATGAGTTAATCAGCCCTAAAGACATTGACCCTGTCCAGCGCTTTGTCCCACTTCAGAATCA  1403

Query 1407  ACGTAACGTGAGCATGAGGTTTTCCAATCAGGGCCCACTGGAAAATGACTTGGTAGTTCATGTGGCACTTATAG  1480
            ||||||||||||||||||.|..||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||.|||
Sbjct 1404  ACGTAACGTGAGCATGAGATACTCCAATCAGGGCCCACTGGAAAATGACTTGGTGGTTCATGTAGCACTTGTAG  1477

Query 1481  CAGAAAGCCAAAGACTTCAAGTTTTTCTGAACACATATGGTATTCAAACTCAAACTCCTCAACAAGTAGAACCC  1554
            |||||||||||.|.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||
Sbjct 1478  CAGAAAGCCAACGCCTTCAAGTTTTTCTCAATACATATGGTATTCAAACCCAAACTCCTCAGCAGGTGGAACCC  1551

Query 1555  ATTCAGATATGGCCTCAGCAGGAGCTTGTGAAAGCTTATTTGCAGCTGGGTATCAATGAAAAGTTAGGACTCTC  1628
            ||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 1552  ATTCAGATCTGGCCTCAGCAGGAGCTTGTAAAAGCTTATTTCCACCTGGGAATCAATGAAAAGTTGGGTCTGTC  1625

Query 1629  TGGAAGGCCAGACAGGCCCATTGGCTGCCTCGGGACATCAAAGATTTATCGCATTCTAGGAAAGACTGTGGTTT  1702
            ||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626  TGGAAGGCCAGATAGGCCCATTGGCTGCCTTGGTACATCAAAGATTTATCGCATTCTAGGAAAGACTGTGGTTT  1699

Query 1703  GTTACCCGATTATTTTCGACCTAAGTGATTTCTACATGTCTCAGGATGTTTTCCTGCTGATAGATGACATAAAG  1776
            |||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||.|.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 1700  GTTACCCTATCATCTTTGACCTGAGTGATTTCTACATGTCTCAGGACGTTCTGCTGCTCATAGATGACATAAAG  1773

Query 1777  AATGCGCTGCAGTTCATTAAACAATATTGGAAAATGCATGGACGTCCACTTTTCCTTGTTCTCATCCGGGAAGA  1850
            ||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 1774  AACGCACTACAGTTCATTAAGCAATATTGGAAAATGCATGGACGCCCACTTTTTCTTGTTCTCATCCGAGAAGA  1847

Query 1851  CAATATAAGAGGTAGCCGGTTCAACCCCATATTAGATATGCTGGCAGCCCTTAAAAAAGGAATAATTGGAGGAG  1924
            |||.||||||||||||.|.||||||||.||||||||.||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1848  CAACATAAGAGGTAGCAGATTCAACCCAATATTAGACATGCTGGCAGCCTTTAAAAAGGGAATAATTGGAGGAG  1921

Query 1925  TCAAAGTTCATGTGGATCGTCTACAGACACTAATATCTGGAGCTGTGGTAGAACAACTTGATTTCCTACGAATC  1998
            |||||||||||||.||||||.||||||||.|.|||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.||||||||.
Sbjct 1922  TCAAAGTTCATGTTGATCGTTTACAGACATTGATATCCGGAGCTGTAGTAGAGCAGCTTGACTTTCTACGAATT  1995

Query 1999  AGTGACACAGAAGAGCTTCCAGAATTTAAGAGTTTTGAGGAACTAGAACCTCCCAAACATTCAAAAGTCAAACG  2072
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||.|||||||||..|||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1996  AGTGACACAGAAAAGCTTCCAGAATTTAAGAGCTTTGAAGAACTAGAATTTCCTAAGCATTCAAAAGTCAAACG  2069

Query 2073  GCAAAGCAGCACCCCTAG-TGCTCCTGAACTGGG----ACAGCAGCCGGATGTCAACATTAGTGAATGGAAGGA  2141
            |||.|||||.|||.| || |||||||||    ||    |||..||||.|...|||.|||||..||.|||||..|
Sbjct 2070  GCAGAGCAGTACCGC-AGATGCTCCTGA----GGCGCAACACGAGCCAGGCATCACCATTACCGAGTGGAAAAA  2138

Query 2142  CAAACCCACCCATGAAATTCTTCAAAAACTGAATGATTGCAGTTGTCTGGCTAGCCAAGCCATCCTGCTGGGTA  2215
            ||||.|||||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||.|||||||||||.|.|||.|||||||||||||||
Sbjct 2139  CAAATCCACCCACGAAATCCTTCAGAAGCTGAATGACTGCGGTTGTCTGGCTGGTCAAACCATCCTGCTGGGTA  2212

Query 2216  TACTGCTCAAAAGAGAAGGCCCCAACTTCATCACAAAGGAAGGTACCGTTTCTGATCACATTGAGAGAGTCTAT  2289
            ||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||.||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 2213  TACTGCTCAAAAGAGAGGGCCCTAACTTTATCACAATGGAAGGAACTGTGTCTGATCACATTGAGAGAGTGTAT  2286

Query 2290  AGAAGAGCTGGCAGCCAAAAACTTTGGTCGGTTGTACGCCGTGCAGCAAGTCTTTTAAGTAAAGTAGTGGACAG  2363
            |||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2287  AGAAGAGCTGGCAGCAAAAAGCTTTGGTCGGTTGTACGCCGTGCAGCAAGTCTTTTAAATAAAGTAGTGGACAG  2360

Query 2364  CCTGGCCCCATCCATTACTAATGTTTTAGTGCAGGGCAAACAGGTAACTCTGGGTGCCTTTGGGCATGAAGAAG  2437
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|
Sbjct 2361  CCTGGCCCCATCCATTACTAATGTTTTAGTGCAGGGCAAACAGGTAACTCTAGGTGCCTTTGGACATGAAGAGG  2434

Query 2438  AAGTTATCTCTAATCCTTTGTCTCCAAGAGTGATTCAAAACATCATCTATTATAAGTGTAACACCCATGATGAG  2511
            |.||.||||||||.||..|||||||||||||||||.|.|||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct 2435  AGGTCATCTCTAACCCACTGTCTCCAAGAGTGATTAAGAACATAATCTATTATAAGTGCAATACCCACGATGAG  2508

Query 2512  AGGGAAGCGGTCATTCAGCAAGAACTGGTCATCCATATTGGCTGGATCATCTCCAATAACCCTGAGTTATTCAG  2585
            |||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|.|||||||||.|||||
Sbjct 2509  AGGGAGGCAGTCATTCAGCAAGAACTGGTCATCCACATCGGCTGGATCATCTCCAACAGCCCTGAGTTGTTCAG  2582

Query 2586  TGGCATGCTGAAAATACGAATCGGGTGGATCATCCATGCCATGGAGTATGAACTTCAGATCCGTGGCGGAGACA  2659
            .|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||.||||.|||||.||.|
Sbjct 2583  CGGCATGCTGAAAATACGCATTGGGTGGATCATCCACGCCATGGAGTATGAACTGCAGGTCCGGGGCGGGGATA  2656

Query 2660  AGCCAGCCTTGGACTTGTATCAGCTGTCACCTAGTGAAGTTAAACAGCTTCTGCTGGATATTCTGCAGCCTCAA  2733
            |||||||..||||||||||.|||||.||.||.||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 2657  AGCCAGCTGTGGACTTGTACCAGCTCTCGCCCAGTGAAGTGAAGCAGCTGCTGCTAGACATTCTCCAGCCTCAA  2730

Query 2734  CAGAATGGAAGATGTTGGCTGAACAGGCGTCAGATCGATGGGTCTTTGAATAGAACTCCCACCGG-GTTCTATG  2806
            ||||.|||||||||||||.||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||| |||| .|||||||
Sbjct 2731  CAGAGTGGAAGATGTTGGTTGAATAGACGTCAGATTGATGGGTCATTGAATAGAACACCC-CCGGAATTCTATG  2803

Query 2807  ACCGAGTGTGGCAGATTCTGGAGCGCACGCCCAATGGGATCATTGTTGCTGGGAAGCATTTGCCTCAGCAACCA  2880
            ||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||.||||.|||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 2804  ACCGAGTGTGGCAGATCCTGGAACGCACACCTAATGGTATCGTTGTAGCTGGAAAGCATTTGCCACAGCAACCA  2877

Query 2881  ACCCTGTCAGATATGACCATGTATGAGATGAATTTCTCTCTCCTTGTTGAAGACACGTTGGGAAATATTGACCA  2954
            ||..||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|.|.|||||||.||||||||
Sbjct 2878  ACTTTGTCGGATATGACCATGTATGAGATGAATTTTTCTCTCCTTGTTGAAGATATGCTGGGAAACATTGACCA  2951

Query 2955  GCCACAGTACAGACAGATCGTTGTAGAGTTACTTATGGTTGTATCCATTGTACTGGAAAGAAACCCCGAGCTAG  3028
            ||||.||||.|||||||||.|.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||.|
Sbjct 2952  GCCAAAGTATAGACAGATCATAGTTGAGTTACTAATGGTCGTATCCATTGTGCTGGAAAGAAACCCTGAACTGG  3025

Query 3029  AATTTCAAGACAAAGTAGATCTAGACAGACTGGTCAAAGAAGCATTTAATGAATTTCAAAAAGATCAGAGTCGG  3102
            |.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||.||||.||||||||||||.||||||||
Sbjct 3026  AGTTTCAAGACAAAGTGGATCTGGACAGACTGGTTAAAGAAGCGTTTCATGAGTTTCAAAAAGATGAGAGTCGG  3099

Query 3103  CTAAAGGAAATTGAAAAACAAGATGACATGACTTCCTTTTACAACACTCCTCCCCTGGGAAAAAGAGGAACATG  3176
            |||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 3100  CTAAAAGAAATCGAAAAACAAGATGATATGACTTCCTTTTACAACACGCCCCCACTGGGAAAAAGAGGAACCTG  3173

Query 3177  CAGCTATTTGACAAAGGCGGTGATGAATCT-GCTGCTGGAAGGAGAAGTCAAGCCAAACAATGATGACCCGTGT  3249
            ||||||.|||||.||||..|||||||| || .|||||.||.||||||||||||||.|.||||||.|||.|.||.
Sbjct 3174  CAGCTACTTGACGAAGGTTGTGATGAA-CTCACTGCTCGAGGGAGAAGTCAAGCCCAGCAATGAGGACTCCTGC  3246

Query 3250  CTGATTAGC  3258
            |||.|||||
Sbjct 3247  CTGGTTAGC  3255