Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000474337
- Subject:
- NM_005126.5
- Aligned Length:
- 1741
- Identities:
- 1206
- Gaps:
- 521
Alignment
Query 1 ATGGAGGTGAATGCAGGAGGTGTGATTGCCTATATCAGTTCTTCCAGCTCAGCCTCAAGCCCTGCCTCTTGTCA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGGTGAATGCAGGAGGTGTGATTGCCTATATCAGTTCTTCCAGCTCAGCCTCAAGCCCTGCCTCTTGTCA 74
Query 75 CAGTGAGGGTTCTGAGAATAGTTTCCAGTCCTCCTCCTCTTCTGTTCCATCTTCTCCAAATAGCTCTAATTCTG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CAGTGAGGGTTCTGAGAATAGTTTCCAGTCCTCCTCCTCTTCTGTTCCATCTTCTCCAAATAGCTCTAATTCTG 148
Query 149 ATACCAATGGTAATCCCAAGAATGGTGATCTCGCCAATATTGAAGGCATCTTGAAGAATGATCGAATAGATTGT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATACCAATGGTAATCCCAAGAATGGTGATCTCGCCAATATTGAAGGCATCTTGAAGAATGATCGAATAGATTGT 222
Query 223 TCTATGAAAACAAGCAAATCGAGTGCACCTGGGATGACAAAAAGTCATAGTGGTGTGACAAAATTTAGTGGCAT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TCTATGAAAACAAGCAAATCGAGTGCACCTGGGATGACAAAAAGTCATAGTGGTGTGACAAAATTTAGTGGCAT 296
Query 297 GGTTCTACTGTGTAAAGTCTGTGGGGATGTGGCGTCAGGATTCCACTATGGAGTTCATGCTTGCGAAGGCTGTA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGTTCTACTGTGTAAAGTCTGTGGGGATGTGGCGTCAGGATTCCACTATGGAGTTCATGCTTGCGAAGGCTGTA 370
Query 371 AGGGTTTCTTTCGGAGAAGTATTCAACAAAACATCCAGTACAAGAAGTGCCTGAAGAATGAAAACTGTTCTATA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGGGTTTCTTTCGGAGAAGTATTCAACAAAACATCCAGTACAAGAAGTGCCTGAAGAATGAAAACTGTTCTATA 444
Query 445 ATGAGAATGAATAGGAACAGATGTCAGCAATGTCGCTTCAAAAAGTGTCTGTCTGTTGGAATGTCAAGAGATGC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ATGAGAATGAATAGGAACAGATGTCAGCAATGTCGCTTCAAAAAGTGTCTGTCTGTTGGAATGTCAAGAGATGC 518
Query 519 TGTTCGGTTTGGTCGTATTCCTAAGCGTGAAAAACAGAGGATGCTAATTGAAATGCAAAGTGCAATGAAGACCA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGTTCGGTTTGGTCGTATTCCTAAGCGTGAAAAACAGAGGATGCTAATTGAAATGCAAAGTGCAATGAAGACCA 592
Query 593 TGATGAACAGCCAGTTCAGTGGTCACTTGCAAAATGACACATTAGTAGAACATCATGAACAGACAGCCTTGCCA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGATGAACAGCCAGTTCAGTGGTCACTTGCAAAATGACACATTAGTAGAACATCATGAACAGACAGCCTTGCCA 666
Query 667 GCCCAGGAACAGCTGCGACCCAAGCCCCAACTGGAGCAAGAAAACATCAAAAGCTCTTCTCCTCCATCTTCTGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GCCCAGGAACAGCTGCGACCCAAGCCCCAACTGGAGCAAGAAAACATCAAAAGCTCTTCTCCTCCATCTTCTGA 740
Query 741 TTTTGCAAAGGAAGAAGTGATTGGCATGGTGACCAGAGCTCACAAGGATACCTTTATGTATAATCAAGAGCAGC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TTTTGCAAAGGAAGAAGTGATTGGCATGGTGACCAGAGCTCACAAGGATACCTTTATGTATAATCAAGAGCAGC 814
Query 815 AAGAAAACTCAGCTGAGAGCATGCAGCCCCAGAGAGGAGAACGGATTCCCAAGAACATGGAGCAATATAATTTA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AAGAAAACTCAGCTGAGAGCATGCAGCCCCAGAGAGGAGAACGGATTCCCAAGAACATGGAGCAATATAATTTA 888
Query 889 AATCATGATCATTGCGGCAATGGGCTTAGCAGCCATTTTCCCTGTAGTGAGAGCCAGCAGCATCTCAATGGACA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AATCATGATCATTGCGGCAATGGGCTTAGCAGCCATTTTCCCTGTAGTGAGAGCCAGCAGCATCTCAATGGACA 962
Query 963 GTTCAAAGGGAGGAATATAATGCATTACCCAAATGGTCATGCCATTTGTATTGCAAATGGACATTGTATGAACT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GTTCAAAGGGAGGAATATAATGCATTACCCAAATGGTCATGCCATTTGTATTGCAAATGGACATTGTATGAACT 1036
Query 1037 TCTCCAATGCTTATACTCAAAGAGTATGTGATAGAGTTCCGATAGATGGATTTTCTCAGAATGAGAACAAGAAT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TCTCCAATGCTTATACTCAAAGAGTATGTGATAGAGTTCCGATAGATGGATTTTCTCAGAATGAGAACAAGAAT 1110
Query 1111 AGTTACCTGTGCAACACTGGAGGAAGAATGCATCT--------------GTACAGTGTTCATAT--------TC 1162
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||.|.||||| ||
Sbjct 1111 AGTTACCTGTGCAACACTGGAGGAAGAATGCATCTGGTTTGTCCAATGAGTA-AGTCTCCATATGTGGATCCTC 1183
Query 1163 A--------GCCA--AAAT----------------------TTCA--CCA------AAA--------------- 1181
| |.|| |||| |||| ||| |||
Sbjct 1184 ATAAATCAGGACATGAAATCTGGGAAGAATTTTCGATGAGCTTCACTCCAGCAGTGAAAGAAGTGGTGGAATTT 1257
Query 1182 --ACAGCAGTA--------------------CCACACCATTTCCAG--------TTTAAACCATGAAGTCCTT- 1224
|.||| ||| .|.||.|||..|||| ||||||...|| |..|||
Sbjct 1258 GCAAAGC-GTATTCCTGGGTTCAGAGATCTCTCTCAGCATGACCAGGTCAACCTTTTAAAGGCTG--GGACTTT 1328
Query 1225 -------------------------------------------------------------------------- 1224
Sbjct 1329 TGAGGTTTTAATGGTACGGTTCGCATCATTATTTGATGCAAAGGAACGTACTGTCACCTTTTTAAGTGGAAAGA 1402
Query 1225 -------------------------------------------------------------------------- 1224
Sbjct 1403 AATATAGTGTGGATGATTTACACTCAATGGGAGCAGGGGATCTGCTAAACTCTATGTTTGAATTTAGTGAGAAG 1476
Query 1225 -------------------------------------------------------------------------- 1224
Sbjct 1477 CTAAATGCCCTCCAACTTAGTGATGAAGAGATGAGTTTGTTTACAGCTGTTGTCCTGGTATCTGCAGATCGATC 1550
Query 1225 -------------------------------------------------------------------------- 1224
Sbjct 1551 TGGAATAGAAAACGTCAACTCTGTGGAGGCTTTGCAGGAAACTCTCATTCGTGCACTAAGGACCTTAATAATGA 1624
Query 1225 -------------------------------------------------------------------------- 1224
Sbjct 1625 AAAACCATCCAAATGAGGCCTCTATTTTTACAAAACTGCTTCTAAAGTTGCCAGATCTTCGATCTTTAAACAAC 1698
Query 1225 --------------------------------------- 1224
Sbjct 1699 ATGCACTCTGAGGAGCTCTTGGCCTTTAAAGTTCACCCT 1737