Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000474369
• Subject: NM_001145134.2
• Aligned Length: 2316
• Identities: 2213
• Gaps: 102

Alignment

Query    1  ATGGCGGAAGCTCACCAGGCCGTGGCCTTCCAGTTCACGGTGACCCCAGACGGGGTCGACTTCCGGCTCAGTCG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGAAGCTCACCAGGCCGTGGCCTTCCAGTTCACGGTGACCCCAGACGGGGTCGACTTCCGGCTCAGTCG  74

Query   75  GGAGGCCCTGAAACACGTCTACCTGTCTGGGATCAACTCCTGGAAGAAACGCCTGATCCGCATCAAGAATGGCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGAGGCCCTGAAACACGTCTACCTGTCTGGGATCAACTCCTGGAAGAAACGCCTGATCCGCATCAAGAATGGCA  148

Query  149  TCCTCAGGGGCGTGTACCCTGGCAGCCCCACCAGCTGGCTGGTCGTCATCATGGCAACAGTGGGTTCCTCCTTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCCTCAGGGGCGTGTACCCTGGCAGCCCCACCAGCTGGCTGGTCGTCATCATGGCAACAGTGGGTTCCTCCTTC  222

Query  223  TGCAACGTGGACATCTCCTTGGGGCTGGTCAGTTGCATCCAGAGATGCCTCCCTCAGGGGTGTGGCCCCTACCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGCAACGTGGACATCTCCTTGGGGCTGGTCAGTTGCATCCAGAGATGCCTCCCTCAGGGGTGTGGCCCCTACCA  296

Query  297  GACCCCGCAGACCCGGGCACTTCTCAGCATGGCCATCTTCTCCACGGGCGTCTGGGTGACGGGCATCTTCTTCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GACCCCGCAGACCCGGGCACTTCTCAGCATGGCCATCTTCTCCACGGGCGTCTGGGTGACGGGCATCTTCTTCT  370

Query  371  TCCGCCAAACCCTGAAGCTGCTTCTCTGCTACCATGGGTGGATGTTTGAGATGCATGGCAAGACCAGCAACTTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCCGCCAAACCCTGAAGCTGCTTCTCTGCTACCATGGGTGGATGTTTGAGATGCATGGCAAGACCAGCAACTTG  444

Query  445  ACCAGGATCTGGGCTATGTGTATCCGCCTTCTATCCAGCCGGCACCCTATGCTCTACAGCTTCCAGACATCTCT  518
            |||||||||||||||                                                           
Sbjct  445  ACCAGGATCTGGGCT-----------------------------------------------------------  459

Query  519  GCCCAAGCTTCCTGTGCCCAGGGTGTCAGCCACAATTCAGCGGTACCTAGAGTCTGTGCGCCCCTTGTTGGATG  592
                                                       |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  460  -------------------------------------------TACCTAGAGTCTGTGCGCCCCTTGTTGGATG  490

Query  593  ATGAGGAATATTACCGCATGGAGTTGCTGGCCAAAGAATTCCAGGACAAGACTGCCCCCAGGCTGCAGAAATAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  491  ATGAGGAATATTACCGCATGGAGTTGCTGGCCAAAGAATTCCAGGACAAGACTGCCCCCAGGCTGCAGAAATAC  564

Query  667  CTGGTGCTCAAGTCATGGTGGGCAAGTAACTATGTGAGTGACTGGTGGGAAGAGTACATCTACCTTCGAGGCAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  565  CTGGTGCTCAAGTCATGGTGGGCAAGTAACTATGTGAGTGACTGGTGGGAAGAGTACATCTACCTTCGAGGCAG  638

Query  741  GAGCCCTCTCATGGTGAACAGCAACTATTATGTCATGGACCTTGTGCTCATCAAGAATACAGACGTGCAGGCAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  639  GAGCCCTCTCATGGTGAACAGCAACTATTATGTCATGGACCTTGTGCTCATCAAGAATACAGACGTGCAGGCAG  712

Query  815  CCCGCCTGGGAAACATCATCCACGCCATGATCATGTATCGCCGTAAACTGGACCGTGAAGAAATCAAGCCTGTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  713  CCCGCCTGGGAAACATCATCCACGCCATGATCATGTATCGCCGTAAACTGGACCGTGAAGAAATCAAGCCTGTG  786

Query  889  ATGGCACTGGGCATAGTGCCTATGTGCTCCTACCAGATGGAGGGGATGTTCAACACCACTCGGATCCCGGGCAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  787  ATGGCACTGGGCATAGTGCCTATGTGCTCCTACCAGATGGAGAGGATGTTCAACACCACTCGGATCCCGGGCAA  860

Query  963  GGACACAGATGTGCTACAGCACCTCTCAGACAGCCGGCACGTGGCTGTCTACCACAAGGGACGCTTCTTCAAGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  861  GGACACAGATGTGCTACAGCACCTCTCAGACAGCCGGCACGTGGCTGTCTACCACAAGGGACGCTTCTTCAAGC  934

Query 1037  TGTGGCTCTATGAGGGCGCCCGTCTGCTCAAGCCTCAGGATCTGGAGATGCAGTTCCAGAGGATCCTGGACGAC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  935  TGTGGCTCTATGAGGGCGCCCGTCTGCTCAAGCCTCAGGATCTGGAGATGCAGTTCCAGAGGATCCTGGACGAC  1008

Query 1111  CCCTCCCCACCTCAGCCTGGGGAGGAGAAGCTGGCAGCCCTCACTGCAGGAGGAAGGGTGGAGTGGGCGCAGGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1009  CCCTCCCCACCTCAGCCTGGGGAGGAGAAGCTGGCAGCCCTCACTGCAGGAGGAAGGGTGGAGTGGGCGCAGGC  1082

Query 1185  ACGCCAGGCCTTCTTTAGCTCTGGAAAGAATAAGGCTGCCTTGGAGGCCATCGAGCGTGCCGCTTTCTTCGTGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1083  ACGCCAGGCCTTCTTTAGCTCTGGAAAGAATAAGGCTGCCTTGGAGGCCATCGAGCGTGCCGCTTTCTTCGTGG  1156

Query 1259  CCCTGGATGAGGAATCCTACTCCTATGACCCCGAAGATGAGGCCAGCCTCAGCCTCTATGGCAAGGCCCTGCTA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1157  CCCTGGATGAGGAATCCTACTCCTATGACCCCGAAGATGAGGCCAGCCTCAGCCTCTATGGCAAGGCCCTGCTA  1230

Query 1333  CATGGCAACTGCTACAACAGGTGGTTTGACAAATCCTTCACTCTCATTTCCTTCAAGAATGGCCAGTTGGGTCT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1231  CATGGCAACTGCTACAACAGGTGGTTTGACAAATCCTTCACTCTCATTTCCTTCAAGAATGGCCAGTTGGGTCT  1304

Query 1407  CAATGCAGAGCATGCGTGGGCAGATGCTCCCATCATTGGGCACCTCTGGGAGTTTGTCCTGGGCACAGACAGCT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1305  CAATGCAGAGCATGCGTGGGCAGATGCTCCCATCATTGGGCACCTCTGGGAGTTTGTCCTGGGCACAGACAGCT  1378

Query 1481  TCCACCTGGGCTACACGGAGACCGGGCACTGCCTGGGCAAACCGAACCCTGCGCTCGCACCTCCTACACGGCTG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1379  TCCACCTGGGCTACACGGAGACCGGGCACTGCCTGGGCAAACCGAACCCTGCGCTCGCACCTCCTACACGGCTG  1452

Query 1555  CAGTGGGACATTCCAAAACAGTGCCAGGCGGTCATCGAGAGTTCCTACCAGGTGGCCAAGGCGTTGGCAGACGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1453  CAGTGGGACATTCCAAAACAGTGCCAGGCGGTCATCGAGAGTTCCTACCAGGTGGCCAAGGCGTTGGCAGACGA  1526

Query 1629  CGTGGAGTTGTACTGCTTCCAGTTCCTGCCCTTTGGCAAAGGCCTCATCAAGAAGTGCCGGACCAGCCCTGATG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1527  CGTGGAGTTGTACTGCTTCCAGTTCCTGCCCTTTGGCAAAGGCCTCATCAAGAAGTGCCGGACCAGCCCTGATG  1600

Query 1703  CCTTTGTGCAGATCGCGCTGCAGCTGGCTCACTTCCGGGACAGGGGTAAGTTCTGCCTGACCTATGAGGCCTCA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1601  CCTTTGTGCAGATCGCGCTGCAGCTGGCTCACTTCCGGGACAGGGGTAAGTTCTGCCTGACCTATGAGGCCTCA  1674

Query 1777  ATGACCAGAATGTTCCGGGAGGGACGGACTGAGACTGTGCGTTCCTGTACCAGCGAGTCCACAGCCTTTGTGCA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1675  ATGACCAGAATGTTCCGGGAGGGACGGACTGAGACTGTGCGTTCCTGTACCAGCGAGTCCACAGCCTTTGTGCA  1748

Query 1851  GGCCATGATGGAGGGGTCCCACACAAAAGCAGACCTGCGAGATCTCTTCCAGAAGGCTGCTAAGAAGCACCAGA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1749  GGCCATGATGGAGGGGTCCCACACAAAAGCAGACCTGCGAGATCTCTTCCAGAAGGCTGCTAAGAAGCACCAGA  1822

Query 1925  ATATGTACCGCCTGGCCATGACCGGGGCAGGGATCGACAGGCACCTCTTCTGCCTTTACTTGGTCTCCAAGTAC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1823  ATATGTACCGCCTGGCCATGACCGGGGCAGGGATCGACAGGCACCTCTTCTGCCTTTACTTGGTCTCCAAGTAC  1896

Query 1999  CTAGGAGTCAGCTCTCCTTTCCTTGCTGAGGTGCTCTCGGAACCCTGGCGTCTCTCCACCAGCCAGATCCCCCA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1897  CTAGGAGTCAGCTCTCCTTTCCTTGCTGAGGTGCTCTCGGAACCCTGGCGTCTCTCCACCAGCCAGATCCCCCA  1970

Query 2073  ATCCCAGATCCGCATGTTCGACCCAGAGCAGCACCCCAATCACCTGGGCGCTGGAGGTGGCTTTGGCCCTGTAG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1971  ATCCCAGATCCGCATGTTCGACCCAGAGCAGCACCCCAATCACCTGGGCGCTGGAGGTGGCTTTGGCCCTGTAG  2044

Query 2147  CAGATGATGGCTATGGAGTTTCCTACATGATTGCAGGCGAGAACACGATCTTCTTCCACATCTCCAGCAAGTTC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2045  CAGATGATGGCTATGGAGTTTCCTACATGATTGCAGGCGAGAACACGATCTTCTTCCACATCTCCAGCAAGTTC  2118

Query 2221  TCAAGCTCAGAGACGAACGCCCAGCGCTTTGGAAACCACATCCGCAAAGCCCTGCTGGACATTGCTGATCTTTT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2119  TCAAGCTCAGAGACGAACGCCCAGCGCTTTGGAAACCACATCCGCAAAGCCCTGCTGGACATTGCTGATCTTTT  2192

Query 2295  CCAAGTTCCCAAGGCCTACAGC  2316
            ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2193  CCAAGTTCCCAAGGCCTACAGC  2214