Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000474480
• Subject: XR_001755697.2
• Aligned Length: 3918
• Identities: 3199
• Gaps: 685

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  GACTTTGGGGCTAGCGTTTAGAAAAGTCTCGACCTCCTCCGGCCCGGTCCCATCCCAAGAACCGACTAAGGCTG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TGAGTGTCCGGGAACCAGACCCGCTTGGAGGCCACAGCCCCGACGTCCCGCGCCCACGCGGCAGATCGGGCGCT  148

Query    1  ----------------------ATGCGGAGCAGGAGCAATTCCGGGGTCCGCTTGGACGGGTACGCGCGGCTGG  52
                                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCGGCCTGGGAGCCTCGGGGAGATGCGGAGCAGGAGCAATTCCGGGGTCCGCTTGGACGGGTACGCGCGGCTGG  222

Query   53  TGCAGCAAACCATCCTGTGTTACCAGAATCCCGTCACGGGGCTGCTGTCAGCCAGCCATGAGCAGAAGGATGCC  126
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGCAGCAAACCATCCTGTGTTACCAGAATCCCGTCACGGGGCTGCTGTCAGCCAGCCATGAGCAGAAGGATGCC  296

Query  127  TGGGTGCGGGATAACATCTACAGTATCCTGGCCGTGTGGGGCCTGGGCATGGCCTACCGTAAGAATGCAGACCG  200
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGGGTGCGGGATAACATCTACAGTATCCTGGCCGTGTGGGGCCTGGGCATGGCCTACCGTAAGAATGCAGACCG  370

Query  201  CGATGAGGACAAGGCCAAGGCCTACGAGCTGGAGCAGAACGTGGTGAAGCTGATGCGAGGTCTTCTCCAGTGCA  274
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CGATGAGGACAAGGCCAAGGCCTACGAGCTGGAGCAGAACGTGGTGAAGCTGATGCGAGGTCTTCTCCAGTGCA  444

Query  275  TGATGAGACAGGTGGCCAAAGTGGAGAAGTTCAAACACACTCAGAGCACCAAGGACAGCCTGCACGCCAAGTAC  348
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGATGAGACAGGTGGCCAAAGTGGAGAAGTTCAAACACACTCAGAGCACCAAGGACAGCCTGCACGCCAAGTAC  518

Query  349  AACACCGCCACCTGTGGCACGGTGGTGGGCGACGACCAGTGGGGCCACCTCCAGGTGGATGCCACCTCTCTCTT  422
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AACACCGCCACCTGTGGCACGGTGGTGGGCGACGACCAGTGGGGCCACCTCCAGGTGGATGCCACCTCTCTCTT  592

Query  423  CCTCCTGTTCCTGGCCCAGATGACCGCCTCAGGCTTACGTATCATTTTCACTCTCGATGAGGTGGCCTTCATAC  496
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCTCCTGTTCCTGGCCCAGATGACCGCCTCAGGCTTACGTATCATTTTCACTCTCGATGAGGTGGCCTTCATAC  666

Query  497  AGAATCTTGTCTTTTACATAGAAGCTGCATATAAAGTCGCTGATTATGGAATGTGGGAGCGTGGAGATAAGACT  570
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGAATCTTGTCTTTTACATAGAAGCTGCATATAAAGTCGCTGATTATGGAATGTGGGAGCGTGGAGATAAGACT  740

Query  571  AATCAGGGCATCCCGGAATTGAATGCAAGCTCCGTAGGAATGGCCAAGGCAGCTCTTGAGGCAATTGATGAACT  644
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AATCAGGGCATCCCGGAATTGAATGCAAGCTCCGTAGGAATGGCCAAGGCAGCTCTTGAGGCAATTGATGAACT  814

Query  645  GGACCTTTTTGGAGCCCATGGAGGACGCAAGTCAGTGATTCATGTTCTGCCAGATGAGGTCGAGCACTGCCAGT  718
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGACCTTTTTGGAGCCCATGGAGGACGCAAGTCAGTGATTCATGTTCTGCCAGATGAGGTCGAGCACTGCCAGT  888

Query  719  CTTATTCTTGTTCTCCATGCTGCCCAAGAAGCGTCGACATCTAAAGAAATTGATGCTGGACTTCTTTCCATTAT  792
            | ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  C-TATTC-TGTTCTCCATGCTG-CCAAG-AGCGTCGACATCTAAAGAAATTGATGCTGGACTTCTTTCCATTAT  958

Query  793  TTCCTTCCCGGCCTTTGCAGTGGAAGATGTAAACCTTGTAAATGTGACCAAAAATGAAATTATTTCTAAGCTCC  866
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  959  TTCCTTCCCGGCCTTTGCAGTGGAAGATGTAAACCTTGTAAATGTGACCAAAAATGAAATTATTTCTAAGCTCC  1032

Query  867  AGGGGCGTTATGGATGCTGTCGCTTCCTTCGAGATGGTTATAAAACTCCAAGAGAGGACCCTAATCGACTGCAT  940
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1033  AGGGGCGTTATGGATGCTGTCGCTTCCTTCGAGATGGTTATAAAACTCCAAGAGAGGACCCTAATCGACTGCAT  1106

Query  941  TATGACCCTGCTGAACTCAAGCTCTTCGAAAACATTGAATGTGAGTGGCCTGTGTTTTGGACATATTTTATAAT  1014
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1107  TATGACCCTGCTGAACTCAAGCTCTTCGAAAACATTGAATGTGAGTGGCCTGTGTTTTGGACATATTTTATAAT  1180

Query 1015  AGATGGAGTCTTCAGTGGTGATGCTGTTCAGGTCCAAGAATACCGAGAGGCCCTGGAGGGAATACTCATCAGAG  1088
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1181  AGATGGAGTCTTCAGTGGTGATGCTGTTCAGGTCCAAGAATACCGAGAGGCCCTGGAGGGAATACTCATCAGAG  1254

Query 1089  GCAAGAATGGGATCCGCCTGGTGCCTGAACTCTACGCTGTCCCGCCTAACAAGGTAGATGAAGAGTACAAGAAT  1162
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1255  GCAAGAATGGGATCCGCCTGGTGCCTGAACTCTACGCTGTCCCGCCTAACAAGGTAGATGAAGAGTACAAGAAT  1328

Query 1163  CCTCACACAGTAGACCGAGTTCCTATGGGGAAGGTGCCTCATCTGTGGGGCCAATCCTTGTACATCCTCAGCTC  1236
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1329  CCTCACACAGTAGACCGAGTTCCTATGGGGAAGGTGCCTCATCTGTGGGGCCAATCCTTGTACATCCTCAGCTC  1402

Query 1237  GCTGTTGGCAGAGGGATTCCTTGCCGCTGGTGAAATCGATCCCTTAAATAGAAGATTTTCCACTTCAGTCAAAC  1310
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1403  GCTGTTGGCAGAGGGATTCCTTGCCGCTGGTGAAATCGATCCCTTAAATAGAAGATTTTCCACTTCAGTCAAAC  1476

Query 1311  CTGATGTTGTAGTACAAGTTACTGTTTTGGCAGAAAACAATCACATTAAGGACTTATTGAGGAAACACGGGGTG  1384
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1477  CTGATGTTGTAGTACAAGTTACTGTTTTGGCAGAAAACAATCACATTAAGGACTTATTGAGGAAACACGGGGTG  1550

Query 1385  AACGTCCAGAGTATCGCGGACATTCATCCAATTCAAGTCCAGCCGGGCCGGATTCTTAGTCACATATATGCCAA  1458
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1551  AACGTCCAGAGTATCGCGGACATTCATCCAATTCAAGTCCAGCCGGGCCGGATTCTTAGTCACATATATGCCAA  1624

Query 1459  GCTTGGACGGAATAAGAATATGAATTTGAGTGGGCGACCGTATCGACATATTGGTGTCCTTGGAACCTCTAAAC  1532
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1625  GCTTGGACGGAATAAGAATATGAATTTGAGTGGGCGACCGTATCGACATATTGGTGTCCTTGGAACCTCTAAAC  1698

Query 1533  TATATGTGATTAGGAACCAAATCTTTACTTTTACACCCCAGTTCACCGACGAGCATCACTTCTACCTGGCCCTC  1606
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1699  TATATGTGATTAGGAACCAAATCTTTACTTTTACACCCCAGTTCACCGACCAGCATCACTTCTACCTGGCCCTC  1772

Query 1607  GACAATGAGATGATCGTGGAGATGCTAAGGATCGAGCTGGCCTACCTGTGCACCTGCTGGAGGATGACGGGCAG  1680
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1773  GACAATGAGATGATCGTGGAGATGCTAAGGATCGAGCTGGCCTACCTGTGCACCTGCTGGAGGATGACGGGCAG  1846

Query 1681  ACCCACACTCACCTTCCCCATCAGTCGCACCATGCTCACAAATGATGGCTCAGACATTCATTCTGCTGTGCTCT  1754
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1847  ACCCACACTCACCTTCCCCATCAGTCGCACCATGCTCACAAATGATGGCTCAGACATTCATTCTGCTGTGCTCT  1920

Query 1755  CCACAATTAGAAAACTAGAGGATGGATATTTTGGAGGAGCCAGAGTAAAATTAGGGAACCTTTCGGAATTTCTC  1828
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921  CCACAATTAGAAAACTAGAGGATGGATATTTTGGAGGAGCCAGAGTAAAATTAGGGAACCTTTCGGAATTTCTC  1994

Query 1829  ACCACATCGTTCTACACATATCTGACTTTTCTGGATCCAGACTGTGATGAGAAGTTGTTTGACAATGCCAGCGA  1902
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1995  ACCACATCGTTCTACACATATCTGACTTTTCTGGATCCAGACTGTGATGAGAAGTTGTTTGACAATGCCAGCGA  2068

Query 1903  AGGGACTTTCAGTCCTGATAGTGATTCAGATTTGGTAGGATATCTGGAAGACACCTGTAATCAAGAAAGCCAAG  1976
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2069  AGGGACTTTCAGTCCTGATAGTGATTCAGATTTGGTAGGATATCTGGAAGACACCTGTAATCAAGAAAGCCAAG  2142

Query 1977  ACGAACTTGACCATTATATCAACCACCTTCTGCAAAGCACATCGTTGAGGTCCTATCTGCCTCCTCTTTGTAAG  2050
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2143  ACGAACTTGACCATTATATCAACCACCTTCTGCAAAGCACATCGTTGAGGTCCTATCTGCCTCCTCTTTGTAAG  2216

Query 2051  AACACAGAAGACCGCCATGTCTTCAGTGCTATCCACTCCACGCGGGACATACTTTCTGTGATGGCAAAAGCAAA  2124
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2217  AACACAGAAGACCGCCATGTCTTCAGTGCTATCCACTCCACGCGGGACATACTTTCTGTGATGGCAAAAGCAAA  2290

Query 2125  GGGTTTGGAAGTTCCATTTGTTCCCATGACTTTGCCGACTAAAGTTCTAAGTGCCCACCGTAAATCACTGAATC  2198
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2291  GGGTTTGGAAGTTCCATTTGTTCCCATGACTTTGCCGACTAAAGTTCTAAGTGCCCACCGTAAATCACTGAATC  2364

Query 2199  TTGTTGATTCTCCTCAGCCACTCCTAGAAAAGGTTCCTGAAAGTGACTTTCAGTGGCCCAGAGATGACCATAGT  2272
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 2365  TTGTTGATTCTCCTCAGCCACTCCTAGAAAAGGTTCCTGAAAGTGACTTTCAGTGGCCCAGAGATGACCATGGT  2438

Query 2273  GACGTGGACTGTGAGAAGCTGGTTGAGCAGCTAAAAGATTGTTCGAACCTACAGGACCAAGCAGACATTCTGTA  2346
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2439  GACGTGGACTGTGAGAAGCTGGTTGAGCAGCTAAAAGATTGTTCGAACCTACAGGACCAAGCAGACATTCTGTA  2512

Query 2347  CATTCTTTATGTCATAAAGGGTCCCAGCTGGGACACAAATCTCTCTGGACAGCACGGGGTCACCGTTCAAAACC  2420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2513  CATTCTTTATGTCATAAAGGGTCCCAGCTGGGACACAAATCTCTCTGGACAGCACGGGGTCACCGTTCAAAACC  2586

Query 2421  TTCTTGGTGAGCTCTATGGGAAAGCCGGCTTGAACCAGGAGTGGGGTCTGATTCGCTACATCTCAGGCCTTCTC  2494
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2587  TTCTTGGTGAGCTCTATGGGAAAGCCGGCTTGAACCAGGAGTGGGGTCTGATTCGCTACATCTCAGGCCTTCTC  2660

Query 2495  AGGAAGAAAGTGGAGGTCCTGGCTGAGGCCTGCACAGACCTGCTTTCGCACCAGAAGCAGCTCACCGTGGGCCT  2568
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2661  AGGAAGAAAGTGGAGGTCCTGGCTGAGGCCTGCACAGACCTGCTTTCGCACCAGAAGCAGCTCACCGTGGGCCT  2734

Query 2569  GCCGCCCGAGCCCCGGGAGAAGATCATCTCTGCGCCCCTTCCCCCAGAGGAGCTCACAAAACTCATCTACGAGG  2642
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2735  GCCGCCCGAGCCCCGGGAGAAGATCATCTCTGCGCCCCTTCCCCCAGAGGAGCTCACAAAACTCATCTACGAGG  2808

Query 2643  CCAGTGGGCAGGACATCAGCATTGCCGTCCTCACGCAGGAGATTGTGGTTTACCTGGCCATGTATGTCAGGGCG  2716
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2809  CCAGTGGGCAGGACATCAGCATTGCCGTCCTCACGCAGGAGATTGTGGTTTACCTGGCCATGTATGTCAGGGCG  2882

Query 2717  CAGCCCAGCCTCTTTGTGGAGATGCTGAGACTCCGGATTGGACTGATCATTCAGGTGATGGCCACGGAGCTGGC  2790
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2883  CAGCCCAGCCTCTTTGTGGAGATGCTGAGACTCCGGATTGGACTGATCATTCAGGTGATGGCCACGGAGCTGGC  2956

Query 2791  ACGGAGCCTGAACTGCTCAGGAGAAGAGGCTTCTGAAAGTTTGATGAACCTCAGCCCTTTCGATATGAAAAATC  2864
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2957  ACGGAGCCTGAACTGCTCAGGAGAAGAGGCTTCTGAAAGTTTGATGAACCTCAGCCCTTTCGATATGAAAAATC  3030

Query 2865  TCCTGCACCATATTCTAAGTGGGAAAGAGTTTGGCGTTGAAAGAAGTGTGCGCCCTATCCACTC--TCACAATC  2936
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  .||||..|
Sbjct 3031  TCCTGCACCATATTCTAAGTGGGAAAGAGTTTGGCGTTGAAAGAAGTGTGCGCCCTATCCACTCCTCCACATCC  3104

Query 2937  AGCCCTA-CATCT-CAT-CACGAGGT--GTCATA-CGGAGTCA-CAAAACTGAGAGGAGTGGCATT-ACAGACT  3002
            ||||||| ||||| ||| ||||||||  |.|||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 3105  AGCCCTACCATCTCCATCCACGAGGTGGGCCATACCGGAGTCACCAAAACTGAGAGGAGTGGCATTAACAGACT  3178

Query 3003  GA-GAGTGAAATGAAACAGATGACTAGGCGGTTTAGTGCTGATGAACAGTTCTTTTCTGTGGGCCAGGCCGCGT  3075
            || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3179  GAGGAGTGAAATGAAACAGATGACTAGGCGGTTTAGTGCTGATGAACAGTTCTTTTCTGTGGGCCAGGCCGCGT  3252

Query 3076  CCAGCAGTGCGCATTCCTCCAAGTCTGCG-----AG-----------------GTCCAGCACCC---CATCCTC  3124
            |||||||||||||||||||||||||||||     ||                 |||| |..|||   |.|||||
Sbjct 3253  CCAGCAGTGCGCATTCCTCCAAGTCTGCGGTAACAGTGCCTCGGGATTATTGTGTCC-GTCCCCGCTCCTCCTC  3325

Query 3125  GC--CC--------ACTGGCACGTCATCCTCAGACTCGGGAGGACATCACATCG-GCTGGGGTGAGCGGCAGGG  3187
            ||  ||        .||..|||.||||.|.|| |||...|||||      .||| ||.|||.|||         
Sbjct 3326  GCGTCCTTCCTCATGCTCCCACCTCATGCCCA-ACTTCTGAGGA------TTCGAGCAGGGCTGA---------  3383

Query 3188  CCAGTGGCTGCGCAGGAGAAGGCTGGATGGGGCCATCAACAGGGTCCCC---GTGGGATTCTACCAGAGGGTGT  3258
              ||||..|.|         .||.|||||     .|| |||||.|||.|   .|||.|||||    ||||..|.
Sbjct 3384  --AGTGTTTTC---------AGCGGGATG-----CTC-ACAGGCTCCTCCAACTGGAATTCT----GAGGAGGA  3436

Query 3259  GGAAGATCCTCCAGAAGTGCCACGGTCTCTCCATCGATGGTTATGTCCTCCCATCCTCGACGACCCGAGAGATG  3332
            ||       |||||      |||                          |||||||                  
Sbjct 3437  GG-------TCCAG------CAC--------------------------CCCATCC------------------  3453

Query 3333  ACCCCGCATGAGATCAAGTTTGCTGTCCATGTCGAATCGGTGCTGAACCGCGTGCCGCAGCCCGAGTACCGGCA  3406
                                                                                      
Sbjct 3454  --------------------------------------------------------------------------  3453

Query 3407  GCTGCTGGTGGAAGCCATCATGGTGCTGACGCTGCTCTCGGACACGGAGATGACCAGCATCGGGGGCATCATCC  3480
                                                                                      
Sbjct 3454  --------------------------------------------------------------------------  3453

Query 3481  ACGTGGACCAGATCGTGCAGATGGCCAGTCAGCTGTTCTTGCAGGACCAGGTGTCAATTGGTGCCATGGACACC  3554
                                                                                      
Sbjct 3454  --------------------------------------------------------------------------  3453

Query 3555  CTGGAGAAAGACCAAGCCACAGGAATCTGCCACTTCTTTTATGACAGCGCTCCGAGTGGGGCTTATGGGACGAT  3628
                                                                                      
Sbjct 3454  --------------------------------------------------------------------------  3453

Query 3629  GACCTACCTAACAAGAGCAGTGGCTTCTTATTTGCAGGAATTGTTGCCCAATTCGGGCTGCCAGATGCAA  3698
                                                                                  
Sbjct 3454  ----------------------------------------------------------------------  3453