Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000474481
- Subject:
- XM_024446663.1
- Aligned Length:
- 2482
- Identities:
- 1841
- Gaps:
- 629
Alignment
Query 1 ATGGCGACCTCCGAGAGGGCTCTCCTGAGGACCAGAGCTGCCTCTCTCCTGAGAGGCTTGGGCAGATCCCGAAC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGACCTCCGAGAGGGCTCTCCTGAGGACCAGAGCTGCCTCTCTCCTGAGAGGCTTGGGCAGATCCCGAAC 74
Query 75 TGGAGCCCGATCGTTACAGTTTCGCGCAGAAAAAGAGCGTCAGCCTTGCTGGTCTTTTCCCATGGGGCAGAAGA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGGAGCCCGATCGTTACAGTTTCGCGCAGAAAAAGAGCGTCAGCCTTGCTGGTCTTTTCCCATGGGGCAGAAGA 148
Query 149 CGAAAGGCAGCTCTAACATAGCCTCCTCCTACCTGCTCCAGCAGCTCATGCACCGCTATCAGGAGCTGGACTCG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CGAAAGGCAGCTCTAACATAGCCTCCTCCTACCTGCTCCAGCAGCTCATGCACCGCTATCAGGAGCTGGACTCG 222
Query 223 GACGGAGATGAGGACCAGGGCGAGGGCGAGGCGGGATCCGAGGAGTCCTCAGAGTCCGAAATGCTGAATTTGGA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GACGGAGATGAGGACCAGGGCGAGGGCGAGGCGGGATCCGAGGAGTCCTCAGAGTCCGAAATGCTGAATTTGGA 296
Query 297 GGAGGAATTTGATGGGGTCCTGAGAGAGGAGGCTGTGGCCAAAGCACTCCATCACTTGGGGCGCTCAGGCTCTG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGAGGAATTTGATGGGGTCCTGAGAGAGGAGGCTGTGGCCAAAGCACTCCATCACTTGGGGCGCTCAGGCTCTG 370
Query 371 GGACTGAGCAAGTCTACCTCAATCTAACTTTATCAGGTTGTAATTTAATTGATGTTAGCATTCTCTGTGGATAT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GGACTGAGCAAGTCTACCTCAATCTAACTTTATCAGGTTGTAATTTAATTGATGTTAGCATTCTCTGTGGATAT 444
Query 445 GTTCATCTACAGAAGTTGGATCTTTCAGCGAATAAAATTGAAGATTTATCTTGTGTGAGTTGTATGCCTTATCT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GTTCATCTACAGAAGTTGGATCTTTCAGCGAATAAAATTGAAGATTTATCTTGTGTGAGTTGTATGCCTTATCT 518
Query 519 CCTAGAACTTAATGCTTCTCAAAATAATTTGACTACGTTCTTCAATTTCAAGCCACCCAAAAACCTCAAGAAAG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 519 CCTAGAACTTAATGCTTCTCAAAATAATTTGACTACGTTCTTCAATTTCAAGCCACCCAAAAACCTCAAGAAGG 592
Query 593 CGGATTTTTCCCACAACCAAATTTCTGAAATTTGTGATTTGTCAGCGTATCATGCTCTCACTAAACTAATTTTG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CGGATTTTTCCCACAACCAAATTTCTGAAATTTGTGATTTGTCAGCGTATCATGCTCTCACTAAACTAATTTTG 666
Query 667 GATGGCAATGAGATAGAAG-AATCAGTGGACTAGAGATGTGCA--CACCTAATTCACCTTAGTTTGGCC-ACAA 736
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| .||||||||||||||||||||||| ||||
Sbjct 667 GATGGCAATGAGATAGAAGAAATCAGTGGACTAGAGATGTGCAACAACCTAATTCACCTTAGTTTGGCCAACAA 740
Query 737 T-AGATCACGAC-ATTAATGGCTTAAACAAGTTACCAATCAAAATACTTTGTTCTGAGCAATAACCAGATTGAG 808
| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TAAGATCACGACAATTAATGGCTTAAACAAGTTACCAATCAAAATACTTTG-TCTGAGCAATAACCAGATTGAG 813
Query 809 ATGATCACAGGTTTGGAGGATCTGAAAGCCCTGCAGAACCTGGATCTGTCCCACAATCAGATAAGCAGCCTCCA 882
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 ATGATCACAGGTTTGGAGGATCTGAAAGCCCTGCAGAACCTGGATCTGTCCCACAATCAGATAAGCAGCCTCCA 887
Query 883 AGGCTTAGAGAATCATGACCTCCTGGAAGTGATCAACCTGGAGGATAATAAGATTGCTGAGCTGAGAGAAATAG 956
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 888 AGGCTTAGAGAATCATGACCTCCTGGAAGTGATCAACCTGGAGGATAATAAGATTGCTGAGCTGAGAGAAATAG 961
Query 957 AATACATTAAAAATTTACCCATCCTTCGAGTTCTCAATCTTCTAGAAAATCCAATTCAGGAAAAGTCTGAATAT 1030
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 962 AATACATTAAAAATTTACCCATCCTTCGAGTTCTCAATCTTCTAGAAAATCCAATTCAGGAAAAGTCTGAATAT 1035
Query 1031 TGGTTCTTCGTAATTTTTATGCTTCTGCGATTAACAGAATTAGATCAGAAGAAGATTAAAGTGGAAGAAAAGGT 1104
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036 TGGTTCTTCGTAATTTTTATGCTTCTGCGATTAACAGAATTAGATCAGAAGAAGATTAAAGTGGAAGAAAAGGT 1109
Query 1105 TTCAGCAGTGAATAAATATGATCCTCCCCCTGAAGTGGTTGCAGCTCAAGACCACCTGACCCATGTTGTCAACA 1178
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110 TTCAGCAGTGAATAAATATGATCCTCCCCCTGAAGTGGTTGCAGCTCAAGACCACCTGACCCATGTTGTCAACA 1183
Query 1179 GCGTGATGCAGCCGCAGAGGATCTTTGACAGCACTCTTCCCAGCCTGGATGCTCCTTATCCCATGCTGATACTA 1252
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1184 GCGTGATGCAGCCGCAGAGGATCTTTGACAGCACTCTTCCCAGCCTGGATGCCCCTTATCCCATGCTGATACTA 1257
Query 1253 GCTGGTCCTGAAGCTTGTGGGAAACGAGAGCTTGCCCATCGCCTCTGCAGACAGTTTAGCACTTACTTCAGATA 1326
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 GCTGGTCCTGAAGCTTGTGGGAAACGAGAGCTTGCCCATCGCCTCTGCAGACAGTTTAGCACTTACTTCAGATA 1331
Query 1327 TGGGGCCTGTCATACCACAAGACCACCTTACTTTGGAGAAGGGGATCGAGTTGATTATCATTTTATCTCTCAAG 1400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332 TGGGGCCTGTCATACCACAAGACCACCTTACTTTGGAGAAGGGGATCGAGTTGATTATCATTTTATCTCTCAAG 1405
Query 1401 ACGTTTTTGATGAAATGGTGAACATGGGGAAATTCATTCTAACATTTAGTTATGGTAATCACAAGTATGGATTA 1474
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406 ACGTTTTTGATGAAATGGTGAACATGGGGAAATTCATTCTAACATTTAGTTATGGTAATCACAAGTATGGATTA 1479
Query 1475 AATAGGGACACCGTAGAAGGTATCGCAAGAGATGGTTTGGCAAGCTGTATTCATATGGAAATAGAAGGTGTAAG 1548
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1480 AATAGGGACACCGTAGAAGGTATCGCAAGAGATGGTTTGGCAAGCTGTATTCATATGGAAATAGAAGGTGTAAG 1553
Query 1549 AAGTTTGAAATATTCCTATTTTGAGCCTCGTTATATCCTGGTGGTGCCCATGAACAAGGAAAAATATGAGGGAT 1622
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554 AAGTTTGAAATATTCCTATTTTGAGCCTCGTTATATCCTGGTGGTGCCCATGAACAAGGAAAAATATGAGGGAT 1627
Query 1623 ATTTGCGGAGAAAAGGATTATTCAGTCGTGCAGAAATTGAATTTGCTGTCTCCAGAGTGGACCTTTATAATAAA 1696
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||.||
Sbjct 1628 ATTTGCGGAGAAAAGGATTATTCAGTCGTGCAGAAATTGAATTTGCTGTCTCCAGAGTGGACCTTTAT-ATTAA 1700
Query 1697 AATTAATCAGAATTTTCCGGGGATATTTGAATGAGGTAATCAATGCAGATGATCTGGATG-TGCCTTACAAAAA 1769
|||||||||||||||||| |||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||.||||
Sbjct 1701 AATTAATCAGAATTTTCC-GGGATATTTTGATGAGGTAATCAATGCAGATGATCTGGATGTTGCC-TACCAAAA 1772
Query 1770 ACTGAGTCAGCTCATTAGAGAATACCTTGGATGGAATGAGGAACCTGCCAAGAGTTTGGCTACAACTGCAGATG 1843
||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1773 ACTGAGTCAGCTCATTAGAGAATACCTTGGATTGACTGAGGAACCTGCCAAGAGTTTGGCTACAACTGCAG--- 1843
Query 1844 TAAAGACATCCCACCTGAA---ACCTGAAGCGCATCCTACAAAGTATATTTCTTCGAATATGGGTGATTTCCTG 1914
.||| |||| ||| ||.|.|
Sbjct 1844 --GAGA---------TGAAGTGACC---AGGGTA---------------------------------------- 1863
Query 1915 CATTCTACAGACAGAAACTACCTCATTAAATTTTGGGCCAAACTTTCAGCCAAAAAAACACCAGCGGAAAGAGA 1988
Sbjct 1864 -------------------------------------------------------------------------- 1863
Query 1989 TTCTATACACAGACAGCACGAGGCAGCCCGGCAAGCTCTAATGGGAAGGATACGCCCTGATCACACACTCCTAT 2062
Sbjct 1864 -------------------------------------------------------------------------- 1863
Query 2063 TTCAAAGGGGTCCAGTACCAGCACCTCTCACCAGTGGTCTACACTATTATACAACTTTAGAAGAACTCTGGAAA 2136
Sbjct 1864 -------------------------------------------------------------------------- 1863
Query 2137 AGTTTTGATCTTTGTGAAGACTATTTTAAACCTCCATTTGGACCATATCCTGAAAAGAGTGGGAAGGATTCCTT 2210
Sbjct 1864 -------------------------------------------------------------------------- 1863
Query 2211 GGTTTCCATGAAATGTTCATTGTTTCGGTTCTGTCCGTGGTCAAAAGAATTGCCTTTCCAGCCTCCGGAGGGGA 2284
Sbjct 1864 -------------------------------------------------------------------------- 1863
Query 2285 GCATTTCTTCACACCTAGGATCAGGAGCCAGTGACAGTGAGACCGAAGAGACCCGGAAAGCACTACCTATACAA 2358
Sbjct 1864 -------------------------------------------------------------------------- 1863
Query 2359 TCATTTTCACATGAAAAAGAGTCTCACCAACACAGACAACACTCGGTCCCAGTCATCAGTCGCCCAGGTTCCAA 2432
Sbjct 1864 -------------------------------------------------------------------------- 1863
Query 2433 CGTCAAACCCACCCTCCCTCCAATCCCTCAGGGCCGCAGG 2472
Sbjct 1864 ---------------------------------------- 1863