Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000474486
• Subject: XR_001781124.1
• Aligned Length: 1393
• Identities: 1066
• Gaps: 242

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  AGGCCCGCTCCGCTTCGCAGCCCGATCCTGAGCGCAAGCCTGAGCGTTCTCTTCAGCCAAGTCCCCCGGCGCGT  74

Query    1  -----------------------------ATGGCGGCGGAGATCCAGCCCAAGCCTCTGACCCGCAAGCCGATC  45
                                         |||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCGGCTGCTCCCCGGGCGCGCCCCCTCCGATGGCGGCGGAGATCCAGCCCCAGCCACTGACCCGCAAGCCGATC  148

Query   46  CTGCTGCAGCGGATGGAGGGGTCCCAGGAGGTGGTGAATATGGCCGTGATCGTGCCCAAAGAGGAGGGCGTCAT  119
            ||||||||||||.|.||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.|||||.|||||.|||||
Sbjct  149  CTGCTGCAGCGGGTCGAGGGGTCGCAGGAGGTGGTCAACATGGCGGTGATTGTACCTAAAGAAGAGGGTGTCAT  222

Query  120  CAGCGTCTCCGAGGACAGGACAGTTCGTGTTTGGTTAAAGAGAGACAGTGGACAGTATTGGCCAAGCGTATACC  193
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.|.||||
Sbjct  223  CAGCGTCTCGGAGGACAGGACAGTTCGTGTTTGGTTAAAGAGGGACAGTGGACAGTACTGGCCAAGCATCTACC  296

Query  194  ATGCAATGCCTTCTCCATGTTCATGCATGTCTTTTAACCCGGAAACAAGAAGACTGTCCATAGGTCTAGACAAT  267
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATGCAATGCCTTCTCCATGTTCATGCATGTCTTTTAACCCGGAAACAAGAAGACTGTCCATAGGTCTAGACAAT  370

Query  268  GGTACAATCTCAGAGTTTATATTGTCAGAAGATTATAACAAGATGACTCCTGTGAAAAACTATCAAGCGCATCA  341
            ||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  371  GGTACAATCTCAGAGTTTATTTTGTCTGAAGATTATAACAAGATGACACCTGTGAAAAACTATCAAGCACATCA  444

Query  342  GAGCAGAGTGACGATGATCCTGTTTGTCCTGGAGCTGGAGTGGGTGCTGAGCACAGGACAGGACAAGCAATTTG  415
            |||||||||.||||||.||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct  445  GAGCAGAGTAACGATGGTCCTGTTTGTTCTGGAACTGGAGTGGGTGCTGAGCACAGGACAGGACAAGCAGTTCG  518

Query  416  CCTGGCACTGCTCTGAGAGTGGGCAGCGCCTGGGAGGTTATCGGACCAGTGCTGTGGCCTCAGGCCTGCAATTT  489
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCTGGCACTGCTCTGAGAGTGGACAGCGCCTGGGAGGTTACCGCACCAGTGCTGTGGCCTCAGGCCTGCAATTT  592

Query  490  GATGTTGAAACCCGGCATGTGTTTATCGGTGACCACTCAGGCCAAGTAACAATCCTCAAACTGGAGCAAGAAAA  563
            ||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct  593  GATGTTGAAACCCGTCATGTGTTTATTGGCGATCACTCGGGCCAAGTAACCATCCTCAAACTGGAACAAGAAAA  666

Query  564  CTGCACCCTGGTCACAACATTCAGAGGACACACAGGTGGGGTGACCGCTCTCTGTTGGGACCCAGTCCAGCGGG  637
            ||||||.|||.|||||.|.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||.|
Sbjct  667  CTGCACACTGCTCACATCCTTCAGAGGGCACACAGGAGGGGTGACAGCACTCTGCTGGGACCCGGTGCAGCGCG  740

Query  638  TGTTGTTCTCAGGCAGTTCAGATCACTCTGTCATCATGTGGGACATCGGTGGGAGAAAAGGAACAGCCATCGAG  711
            ||.|.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.
Sbjct  741  TGCTATTCTCAGGCAGTTCCGATCACTCTGTCATCATGTGGGACATCGGTGGGAGAAAAGGCACGGCCATCGAA  814

Query  712  CTCCAAGGACACAACGACAGAGTCCAGGCCCTCTCCTATGCACAGCACACGCGACAATTGATCTCCTGTGGCGG  785
            ||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||..|.|||||.||||||||
Sbjct  815  CTCCAAGGACACAATGACAAAGTCCAGGCCCTCTCCTATGCACAGCACACACGACAGCTCATCTCATGTGGCGG  888

Query  786  TGATGGTGGGATTGTCGTCTGGAACATGGACGTGGAGAGGCAGGAGACCCCTGAATGGTTGGACAGTGATTCCT  859
            |||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct  889  TGACGGTGGCATTGTCGTCTGGAACATGGATGTGGAAAGGCAGGAGACCCCTGAGTGGTTGGACAGTGACTCCT  962

Query  860  GCCAAAAGTGTGATCAGCCTTTCTTCTGGAACTTCAAGCAAATGTGGGACAGTAAGAAAATTGGTCTAAGACAG  933
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  963  GCCAAAAGTGTGACCAGCCTTTCTTCTGGAACTTCAAGCAAATGTGGGACAGTAAGAAAATTGGACTAAGACAG  1036

Query  934  CACCACTGCCGCAAGTGTGGGAAGGCCGTCTGTGGCAAGTGCAGCTCCAAGCGCTCCTCCATCCCCCTGATGGG  1007
            |||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||
Sbjct 1037  CACCACTGCCGGAAGTGTGGGAAGGCCGTGTGCGGCAAGTGTAGCTCCAAGCGCTCTTCCATCCCACTCATGGG  1110

Query 1008  CTTCGAGTTTGAAGTGAGGGTCTGTGACAGCTGCCACGAGGCCATCACAGATGAAGA-----------------  1064
            |||.||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||                 
Sbjct 1111  CTTTGAGTTTGAAGTGCGGGTCTGCGACAGCTGCCACGAGGCCATCACAGATGAAGAGTAAGTCCCACGCCCTG  1184

Query 1065  -------------------------------------------------------------------------A  1065
                                                                                     |
Sbjct 1185  CACCCTCCGGGTTATGGACAAAGCCCAGCCTGAGAATTCCTCCAGAGAAATTCCACCTGCCTGGCTTGCTGGGA  1258

Query 1066  CGTGCACCCACAGCCACCTTCCATGACAGTAAACATAACATTGTGCATGTGCATTTCGATGCAACCAGAGGATG  1139
            ||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1259  CGCGCCCCCACAGCCACCTTCCATGACAGTAAGCATAACATTGTGCATGTGCATTTCGATGCAACCAGGGGATG  1332

Query 1140  GTTACTGACTTCTGGAACTGACAAGGTTATTAAGTTGTGGGATATGACCCCAGTCGTGTCT  1200
            ||||||||||||                                                 
Sbjct 1333  GTTACTGACTTC-------------------------------------------------  1344