Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000474581
• Subject: NM_001330303.2
• Aligned Length: 3066
• Identities: 2058
• Gaps: 1008

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAGTTCTCAACAGTTTCCTCGGTTAGGAGCCCCTTCTACCGGGCTGAGCCAGGCCCCTTCTCAGATTGCAAA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CAGTGGTTCTGCTGGATTGATAAACCCAGCTGCTACAGTCAATGATGAATCTGGTCGAGATTCTGAAGTCAGTG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  CCAGGGAGCACATGAGTTCCAGCAGCTCCCTCCAGTCCCGGGAGGAGAAGCAAGAGCCTGTTGTGGTAAGGCCC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  TATCCACAGGTGCAGATGTTGTCGACACACCATGCTGTCGCATCAGCCACACCTGTTGCAGTGACAGCCCCGCC  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  AGCACACCTGACGCCAGCAGTGCCACTTTCATTTTCGGAGGGACTTATGAAGCCGCCCCCGAAGCCCACCATGC  370

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  371  CTAGCCGTCCCATTGCTCCTGCTCCACCTTCTACCCTGTCACTTCCCCCCAAGGTTCCAGGGCAGGTTACCGTT  444

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  445  ACCATGGAGAGTAGCATCCCTCAAGCTTCAGCCATTCCTGTGGCAACAATCAGTGGACAACAGGGCCATCCCAG  518

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  519  TAACCTGCATCACATCATGACTACAAATGTGCAAATGTCTATCATCCGCAGCAATGCTCCTGGGCCCCCTCTTC  592

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  593  ACATTGGAGCTTCTCATTTACCTCGAGGTGCAGCTGCTGCTGCTGTGATGTCCAGTTCTAAAGTAACCACAGTC  666

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  667  CTGAGGCCGACCTCACAGCTGCCAAATGCTGCTACTGCTCAGCCAGCAGTACAGCACATCATTCACCAACCAAT  740

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  741  CCAGTCTCGGCCACCTGTGACCACCTCCAATGCCATCCCTCCTGCTGTGGTAGCAACTGTCTCAGCCACCAGAG  814

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  815  CTCAGTCTCCAGTCATCACTACGACAGCGGCGCATGCTACTGATTCAGCACTTAGTAGGCCAACCTTGTCTATC  888

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  889  CAGCATCCTCCATCTGCAGCAATCAGTATTCAGCGTCCTGCCCAGTCACGAGATGTCACAACAAGAATCACACT  962

Query    1  ----------------------------------------------ATGGCTCAGAAAACAATCTTCAGTACTG  28
                                                          ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ACCATCTCACCCTGCATTAGGGACGCCAAAACAGCAGCTTCATACAATGGCTCAGAAAACAATCTTCAGTACTG  1036

Query   29  GCACGCCAGTGGCTGCAGCCACAGTAGCACCTATTTTGGCAACCAACACCATTCCTTCAGCGACCACAGCTGGA  102
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCACGCCAGTGGCTGCAGCCACAGTAGCACCTATTTTGGCAACCAACACCATTCCTTCAGCGACCACAGCTGGA  1110

Query  103  TCTGTGTCACACACGCAAGCTCCCACAAGTACCATTGTTACCATGACAGTACCCTCCCATTCCTCCCATGCTAC  176
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCTGTGTCACACACGCAAGCTCCCACAAGTACCATTGTTACCATGACAGTACCCTCCCATTCCTCCCATGCTAC  1184

Query  177  TGCTGTGACCACCTCAAACATCCCAGTCGCCAAGGTGGTGCCCCAGCAGATCACGCACACTTCTCCTCGGATCC  250
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGCTGTGACCACCTCAAACATCCCAGTCGCCAAGGTGGTGCCCCAGCAGATCACGCACACTTCTCCTCGGATCC  1258

Query  251  AGCCAGACTACCCTGCCGAGAGGAGTAGCCTGATTCCCATCTCCGGACATCGGGCCTCTCCCAATCCTGTGGCC  324
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGCCAGACTACCCTGCCGAGAGGAGTAGCCTGATTCCCATCTCCGGACATCGGGCCTCTCCCAATCCTGTGGCC  1332

Query  325  ATGGAAACCCGAAGTGACAACAGACCGTCTGTTCCCGTTCAGTTCCAATATTTTTTGCCAACTTACCCCCCTTC  398
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATGGAAACCCGAAGTGACAACAGACCGTCTGTTCCCGTTCAGTTCCAATATTTTTTGCCAACTTACCCCCCTTC  1406

Query  399  TGCATACCCACTGGCGGCACATACCTACACCCCAATCACCAGTTCCGTGTCCACTATCCGACAGTATCCAGTTT  472
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGCATACCCACTGGCGGCACATACCTACACCCCAATCACCAGTTCCGTGTCCACTATCCGACAGTATCCAGTTT  1480

Query  473  CAGCTCAGGCTCCAAACTCTGCCATCACAGCTCAGACTGGTGTTGGGGTAGCGTCTACCGTCCACCTAAACCCC  546
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CAGCTCAGGCTCCAAACTCTGCCATCACAGCTCAGACTGGTGTTGGGGTAGCGTCTACCGTCCACCTAAACCCC  1554

Query  547  ATGCAGTTGATGACAGTGGATGCATCGCATGCTCGACATATTCAAGGGATCCAGCCAGCACCCATCAGTACCCA  620
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ATGCAGTTGATGACAGTGGATGCATCGCATGCTCGACATATTCAAGGGATCCAGCCAGCACCCATCAGTACCCA  1628

Query  621  GGGTATCCAGCCGGCCCCCATTGGGACCCCAGGGATACAGCCTGCACCACTTGGCACACAGGGAATTCACTCAG  694
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GGGTATCCAGCCGGCCCCCATTGGGACCCCAGGGATACAGCCTGCACCACTTGGCACACAGGGAATTCACTCAG  1702

Query  695  CAACCCCAATCAACACACAAGGGCTTCAGCCTGCACCTATGGGTACTCAGCAGCCTCAGCCTGAAGGAAAGACT  768
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CAACCCCAATCAACACACAAGGGCTTCAGCCTGCACCTATGGGTACTCAGCAGCCTCAGCCTGAAGGAAAGACT  1776

Query  769  TCAGCAGTGGTGTTGGCAGATGGAGCCACAATTGTGGCCAACCCTATTAGCAATCCATTCAGTGCTGCTCCAGC  842
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TCAGCAGTGGTGTTGGCAGATGGAGCCACAATTGTGGCCAACCCTATTAGCAATCCATTCAGTGCTGCTCCAGC  1850

Query  843  AGCAACAACCGTGGTGCAGACCCACAGCCAGAGTGCTAGCACCAACGCTCCCGCCCAGGGCTCATCGCCACGGC  916
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AGCAACAACCGTGGTGCAGACCCACAGCCAGAGTGCTAGCACCAACGCTCCCGCCCAGGGCTCATCGCCACGGC  1924

Query  917  CAAGCATACTCCGGAAGAAACCTGCCACAGATGGTGCCAAACCCAAGTCTGAAATCCACGTGTCTATGGCCACT  990
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CAAGCATACTCCGGAAGAAACCTGCCACAGATGGTGCCAAACCCAAGTCTGAAATCCACGTGTCTATGGCCACT  1998

Query  991  CCGGTCACTGTGTCCATGGAGACTGTATCCAATCAAAATAATGATCAGCCTACCATTGCCGTCCCTCCAACTGC  1064
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CCGGTCACTGTGTCCATGGAGACTGTATCCAATCAAAATAATGATCAGCCTACCATTGCCGTCCCTCCAACTGC  2072

Query 1065  CCAGCAGCCCCCACCGACCATTCCAACTATGATTGCAGCAGCCAGTCCCCCGTCACAACCAGCCGTTGCCCTTT  1138
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CCAGCAGCCCCCACCGACCATTCCAACTATGATTGCAGCAGCCAGTCCCCCGTCACAACCAGCCGTTGCCCTTT  2146

Query 1139  CAACCATTCCTGGAGCGGTCCCCATCACTCCACCCATCACCACCATTGCAGCTGCACCACCTCCATCAGTCACT  1212
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CAACCATTCCTGGAGCGGTCCCCATCACTCCACCCATCACCACCATTGCAGCTGCACCACCTCCATCAGTCACT  2220

Query 1213  GTGGGTGGCAGTCTTTCCTCCGTCTTGGGCCCTCCCGTTCCTGAAATTAAAGTGAAAGAAGAAGTAGAACCAAT  1286
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GTGGGTGGCAGTCTTTCCTCCGTCTTGGGCCCTCCCGTTCCTGAAATTAAAGTGAAAGAAGAAGTAGAACCAAT  2294

Query 1287  GGATATCATGAGGCCAGTTTCTGCAGTTCCTCCACTGGCTACCAACACTGTGTCTCCATCTCTTGCATTGCTGG  1360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GGATATCATGAGGCCAGTTTCTGCAGTTCCTCCACTGGCTACCAACACTGTGTCTCCATCTCTTGCATTGCTGG  2368

Query 1361  CAAACAACTTGTCCATGCCTACAAGTGACCTACCACCTGGTGCCTCCCCAAGGAAAAAGCCTCGAAAGCAACAG  1434
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  CAAACAACTTGTCCATGCCTACAAGTGACCTACCACCTGGTGCCTCCCCAAGGAAAAAGCCTCGAAAGCAACAG  2442

Query 1435  CATGTGATCTCAACAGAAGAAGGTGACATGATGGAGACAAACAGCACTGATGATGAGAAGTCCACTGCCAAGAG  1508
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  CATGTGATCTCAACAGAAGAAGGTGACATGATGGAGACAAACAGCACTGATGATGAGAAGTCCACTGCCAAGAG  2516

Query 1509  TCTTCTGGTGAAGGCTGAGAAGCGCAAGTCTCCTCCCAAGGAGTATATTGATGAGGAAGGTGTGAGATATGTCC  1582
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  TCTTCTGGTGAAGGCTGAGAAGCGCAAGTCTCCTCCCAAGGAGTATATTGATGAGGAAGGTGTGAGATATGTCC  2590

Query 1583  CAGTGCGTCCAAGACCCCCCATTACTTTGCTTCGTCACTATCGGAACCCCTGGAAAGCTGCTTACCACCACTTT  1656
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  CAGTGCGTCCAAGACCCCCCATTACTTTGCTTCGTCACTATCGGAACCCCTGGAAAGCTGCTTACCACCACTTT  2664

Query 1657  CAGAGGTACAGTGACGTCCGGGTCAAAGAGGAGAAGAAAGCTATGCTGCAGGAAATAGCTAATCAGAAAGGAGT  1730
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  CAGAGGTACAGTGACGTCCGGGTCAAAGAGGAGAAGAAAGCTATGCTGCAGGAAATAGCTAATCAGAAAGGAGT  2738

Query 1731  ATCCTGTCGTGCTCAAGGCTGGAAAGTCCACCTCTGTGCTGCCCAGTTACTACAGCTGACGAATCTAGAACATG  1804
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  ATCCTGTCGTGCTCAAGGCTGGAAAGTCCACCTCTGTGCTGCCCAGTTACTACAGCTGACGAATCTAGAACATG  2812

Query 1805  ATGTCTATGAAAGACTTACTAACCTGCAGGAAGGGATTATCCCAAAGAAAAAAGCAGCAACAGATGATGATCTC  1878
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  ATGTCTATGAAAGACTTACTAACCTGCAGGAAGGGATTATCCCAAAGAAAAAAGCAGCAACAGATGATGATCTC  2886

Query 1879  CACCGAATAAACGAACTGATACAGGGAAATATGCAGAGGTGTAAACTTGTGATGGATCAAATCAGTGAAGCCAG  1952
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  CACCGAATAAACGAACTGATACAGGGAAATATGCAGAGGTGTAAACTTGTGATGGATCAAATCAGTGAAGCCAG  2960

Query 1953  AGACTCCATGCTTAAGGTTTTAGATCATAAAGACCGTGTCCTGAAGCTGCTTAACAAGAACGGGACTGTCAAAA  2026
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  AGACTCCATGCTTAAGGTTTTAGATCATAAAGACCGTGTCCTGAAGCTGCTTAACAAGAACGGGACTGTCAAAA  3034

Query 2027  AAGTGTCCAAATTGAAGCGAAAGGAAAAAGTC  2058
            ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  AAGTGTCCAAATTGAAGCGAAAGGAAAAAGTC  3066