Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000474581
• Subject: NM_024545.4
• Aligned Length: 3144
• Identities: 2058
• Gaps: 1086

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGGCCCTCCGCGGCACCCCCAGGCCGGCGAGATAGAAGCGGGCGGTGCGGGCGGCGGGCGGCGGCTACAGGT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GGAAATGAGTTCTCAACAGTTTCCTCGGTTAGGAGCCCCTTCTACCGGGCTGAGCCAGGCCCCTTCTCAGATTG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  CAAACAGTGGTTCTGCTGGATTGATAAACCCAGCTGCTACAGTCAATGATGAATCTGGTCGAGATTCTGAAGTC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  AGTGCCAGGGAGCACATGAGTTCCAGCAGCTCCCTCCAGTCCCGGGAGGAGAAGCAAGAGCCTGTTGTGGTAAG  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  GCCCTATCCACAGGTGCAGATGTTGTCGACACACCATGCTGTCGCATCAGCCACACCTGTTGCAGTGACAGCCC  370

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  371  CGCCAGCACACCTGACGCCAGCAGTGCCACTTTCATTTTCGGAGGGACTTATGAAGCCGCCCCCGAAGCCCACC  444

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  445  ATGCCTAGCCGTCCCATTGCTCCTGCTCCACCTTCTACCCTGTCACTTCCCCCCAAGGTTCCAGGGCAGGTTAC  518

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  519  CGTTACCATGGAGAGTAGCATCCCTCAAGCTTCAGCCATTCCTGTGGCAACAATCAGTGGACAACAGGGCCATC  592

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  593  CCAGTAACCTGCATCACATCATGACTACAAATGTGCAAATGTCTATCATCCGCAGCAATGCTCCTGGGCCCCCT  666

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  667  CTTCACATTGGAGCTTCTCATTTACCTCGAGGTGCAGCTGCTGCTGCTGTGATGTCCAGTTCTAAAGTAACCAC  740

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  741  AGTCCTGAGGCCGACCTCACAGCTGCCAAATGCTGCTACTGCTCAGCCAGCAGTACAGCACATCATTCACCAAC  814

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  815  CAATCCAGTCTCGGCCACCTGTGACCACCTCCAATGCCATCCCTCCTGCTGTGGTAGCAACTGTCTCAGCCACC  888

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  889  AGAGCTCAGTCTCCAGTCATCACTACGACAGCGGCGCATGCTACTGATTCAGCACTTAGTAGGCCAACCTTGTC  962

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  963  TATCCAGCATCCTCCATCTGCAGCAATCAGTATTCAGCGTCCTGCCCAGTCACGAGATGTCACAACAAGAATCA  1036

Query    1  --------------------------------------------------ATGGCTCAGAAAACAATCTTCAGT  24
                                                              ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CACTACCATCTCACCCTGCATTAGGGACGCCAAAACAGCAGCTTCATACAATGGCTCAGAAAACAATCTTCAGT  1110

Query   25  ACTGGCACGCCAGTGGCTGCAGCCACAGTAGCACCTATTTTGGCAACCAACACCATTCCTTCAGCGACCACAGC  98
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ACTGGCACGCCAGTGGCTGCAGCCACAGTAGCACCTATTTTGGCAACCAACACCATTCCTTCAGCGACCACAGC  1184

Query   99  TGGATCTGTGTCACACACGCAAGCTCCCACAAGTACCATTGTTACCATGACAGTACCCTCCCATTCCTCCCATG  172
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGGATCTGTGTCACACACGCAAGCTCCCACAAGTACCATTGTTACCATGACAGTACCCTCCCATTCCTCCCATG  1258

Query  173  CTACTGCTGTGACCACCTCAAACATCCCAGTCGCCAAGGTGGTGCCCCAGCAGATCACGCACACTTCTCCTCGG  246
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTACTGCTGTGACCACCTCAAACATCCCAGTCGCCAAGGTGGTGCCCCAGCAGATCACGCACACTTCTCCTCGG  1332

Query  247  ATCCAGCCAGACTACCCTGCCGAGAGGAGTAGCCTGATTCCCATCTCCGGACATCGGGCCTCTCCCAATCCTGT  320
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATCCAGCCAGACTACCCTGCCGAGAGGAGTAGCCTGATTCCCATCTCCGGACATCGGGCCTCTCCCAATCCTGT  1406

Query  321  GGCCATGGAAACCCGAAGTGACAACAGACCGTCTGTTCCCGTTCAGTTCCAATATTTTTTGCCAACTTACCCCC  394
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGCCATGGAAACCCGAAGTGACAACAGACCGTCTGTTCCCGTTCAGTTCCAATATTTTTTGCCAACTTACCCCC  1480

Query  395  CTTCTGCATACCCACTGGCGGCACATACCTACACCCCAATCACCAGTTCCGTGTCCACTATCCGACAGTATCCA  468
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTTCTGCATACCCACTGGCGGCACATACCTACACCCCAATCACCAGTTCCGTGTCCACTATCCGACAGTATCCA  1554

Query  469  GTTTCAGCTCAGGCTCCAAACTCTGCCATCACAGCTCAGACTGGTGTTGGGGTAGCGTCTACCGTCCACCTAAA  542
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GTTTCAGCTCAGGCTCCAAACTCTGCCATCACAGCTCAGACTGGTGTTGGGGTAGCGTCTACCGTCCACCTAAA  1628

Query  543  CCCCATGCAGTTGATGACAGTGGATGCATCGCATGCTCGACATATTCAAGGGATCCAGCCAGCACCCATCAGTA  616
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CCCCATGCAGTTGATGACAGTGGATGCATCGCATGCTCGACATATTCAAGGGATCCAGCCAGCACCCATCAGTA  1702

Query  617  CCCAGGGTATCCAGCCGGCCCCCATTGGGACCCCAGGGATACAGCCTGCACCACTTGGCACACAGGGAATTCAC  690
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CCCAGGGTATCCAGCCGGCCCCCATTGGGACCCCAGGGATACAGCCTGCACCACTTGGCACACAGGGAATTCAC  1776

Query  691  TCAGCAACCCCAATCAACACACAAGGGCTTCAGCCTGCACCTATGGGTACTCAGCAGCCTCAGCCTGAAGGAAA  764
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TCAGCAACCCCAATCAACACACAAGGGCTTCAGCCTGCACCTATGGGTACTCAGCAGCCTCAGCCTGAAGGAAA  1850

Query  765  GACTTCAGCAGTGGTGTTGGCAGATGGAGCCACAATTGTGGCCAACCCTATTAGCAATCCATTCAGTGCTGCTC  838
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GACTTCAGCAGTGGTGTTGGCAGATGGAGCCACAATTGTGGCCAACCCTATTAGCAATCCATTCAGTGCTGCTC  1924

Query  839  CAGCAGCAACAACCGTGGTGCAGACCCACAGCCAGAGTGCTAGCACCAACGCTCCCGCCCAGGGCTCATCGCCA  912
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CAGCAGCAACAACCGTGGTGCAGACCCACAGCCAGAGTGCTAGCACCAACGCTCCCGCCCAGGGCTCATCGCCA  1998

Query  913  CGGCCAAGCATACTCCGGAAGAAACCTGCCACAGATGGTGCCAAACCCAAGTCTGAAATCCACGTGTCTATGGC  986
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CGGCCAAGCATACTCCGGAAGAAACCTGCCACAGATGGTGCCAAACCCAAGTCTGAAATCCACGTGTCTATGGC  2072

Query  987  CACTCCGGTCACTGTGTCCATGGAGACTGTATCCAATCAAAATAATGATCAGCCTACCATTGCCGTCCCTCCAA  1060
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CACTCCGGTCACTGTGTCCATGGAGACTGTATCCAATCAAAATAATGATCAGCCTACCATTGCCGTCCCTCCAA  2146

Query 1061  CTGCCCAGCAGCCCCCACCGACCATTCCAACTATGATTGCAGCAGCCAGTCCCCCGTCACAACCAGCCGTTGCC  1134
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CTGCCCAGCAGCCCCCACCGACCATTCCAACTATGATTGCAGCAGCCAGTCCCCCGTCACAACCAGCCGTTGCC  2220

Query 1135  CTTTCAACCATTCCTGGAGCGGTCCCCATCACTCCACCCATCACCACCATTGCAGCTGCACCACCTCCATCAGT  1208
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CTTTCAACCATTCCTGGAGCGGTCCCCATCACTCCACCCATCACCACCATTGCAGCTGCACCACCTCCATCAGT  2294

Query 1209  CACTGTGGGTGGCAGTCTTTCCTCCGTCTTGGGCCCTCCCGTTCCTGAAATTAAAGTGAAAGAAGAAGTAGAAC  1282
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CACTGTGGGTGGCAGTCTTTCCTCCGTCTTGGGCCCTCCCGTTCCTGAAATTAAAGTGAAAGAAGAAGTAGAAC  2368

Query 1283  CAATGGATATCATGAGGCCAGTTTCTGCAGTTCCTCCACTGGCTACCAACACTGTGTCTCCATCTCTTGCATTG  1356
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  CAATGGATATCATGAGGCCAGTTTCTGCAGTTCCTCCACTGGCTACCAACACTGTGTCTCCATCTCTTGCATTG  2442

Query 1357  CTGGCAAACAACTTGTCCATGCCTACAAGTGACCTACCACCTGGTGCCTCCCCAAGGAAAAAGCCTCGAAAGCA  1430
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  CTGGCAAACAACTTGTCCATGCCTACAAGTGACCTACCACCTGGTGCCTCCCCAAGGAAAAAGCCTCGAAAGCA  2516

Query 1431  ACAGCATGTGATCTCAACAGAAGAAGGTGACATGATGGAGACAAACAGCACTGATGATGAGAAGTCCACTGCCA  1504
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  ACAGCATGTGATCTCAACAGAAGAAGGTGACATGATGGAGACAAACAGCACTGATGATGAGAAGTCCACTGCCA  2590

Query 1505  AGAGTCTTCTGGTGAAGGCTGAGAAGCGCAAGTCTCCTCCCAAGGAGTATATTGATGAGGAAGGTGTGAGATAT  1578
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  AGAGTCTTCTGGTGAAGGCTGAGAAGCGCAAGTCTCCTCCCAAGGAGTATATTGATGAGGAAGGTGTGAGATAT  2664

Query 1579  GTCCCAGTGCGTCCAAGACCCCCCATTACTTTGCTTCGTCACTATCGGAACCCCTGGAAAGCTGCTTACCACCA  1652
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  GTCCCAGTGCGTCCAAGACCCCCCATTACTTTGCTTCGTCACTATCGGAACCCCTGGAAAGCTGCTTACCACCA  2738

Query 1653  CTTTCAGAGGTACAGTGACGTCCGGGTCAAAGAGGAGAAGAAAGCTATGCTGCAGGAAATAGCTAATCAGAAAG  1726
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  CTTTCAGAGGTACAGTGACGTCCGGGTCAAAGAGGAGAAGAAAGCTATGCTGCAGGAAATAGCTAATCAGAAAG  2812

Query 1727  GAGTATCCTGTCGTGCTCAAGGCTGGAAAGTCCACCTCTGTGCTGCCCAGTTACTACAGCTGACGAATCTAGAA  1800
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  GAGTATCCTGTCGTGCTCAAGGCTGGAAAGTCCACCTCTGTGCTGCCCAGTTACTACAGCTGACGAATCTAGAA  2886

Query 1801  CATGATGTCTATGAAAGACTTACTAACCTGCAGGAAGGGATTATCCCAAAGAAAAAAGCAGCAACAGATGATGA  1874
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  CATGATGTCTATGAAAGACTTACTAACCTGCAGGAAGGGATTATCCCAAAGAAAAAAGCAGCAACAGATGATGA  2960

Query 1875  TCTCCACCGAATAAACGAACTGATACAGGGAAATATGCAGAGGTGTAAACTTGTGATGGATCAAATCAGTGAAG  1948
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  TCTCCACCGAATAAACGAACTGATACAGGGAAATATGCAGAGGTGTAAACTTGTGATGGATCAAATCAGTGAAG  3034

Query 1949  CCAGAGACTCCATGCTTAAGGTTTTAGATCATAAAGACCGTGTCCTGAAGCTGCTTAACAAGAACGGGACTGTC  2022
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  CCAGAGACTCCATGCTTAAGGTTTTAGATCATAAAGACCGTGTCCTGAAGCTGCTTAACAAGAACGGGACTGTC  3108

Query 2023  AAAAAAGTGTCCAAATTGAAGCGAAAGGAAAAAGTC  2058
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  AAAAAAGTGTCCAAATTGAAGCGAAAGGAAAAAGTC  3144