Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000474584
• Subject: NM_178016.3
• Aligned Length: 1335
• Identities: 996
• Gaps: 159

Alignment

Query    1  ATGGCCGTCACCGACAGCCTCA----GCCG--GGCTGC---GACTGTCTTGGCAACTGTGTTGCTCTTGTCCTT  65
            |||||.|.|.||..|..|||||    ||.|  ||||.|   |.|.|.||||||         |||||||||..|
Sbjct    1  ATGGCGGCCCCCTGCTTCCTCACTCTGCGGGTGGCTACCCTGGCCGCCTTGGC---------GCTCTTGTCTCT  65

Query   66  CGGCAGCGTGGCCGCTAGTCATATCGAGGATCAAGCAGAACAATTCTTTAGAAGTGGCCATACAAACAACTGGG  139
            |||||||...||||||.|.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||
Sbjct   66  CGGCAGCTCTGCCGCTGGACACATCGAGGATCAAGCCGAACAGTTCTTTAGAAGTGGACACACAAATAACTGGG  139

Query  140  CTGTTCTGGTGTGTACATCCCGATTCTGGTTTAATTATCGACATGTTGCAAATACCCTTTCTGTTTATAGAAGT  213
            |||||.|||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct  140  CTGTTTTGGTGTGCACATCCCGATTCTGGTTTAACTACCGACATGTTGCAAATACTCTTTCTGTTTATAGAAGC  213

Query  214  GTCAAGAGGCTAGGTATTCCTGACAGTCACATTGTCCTAATGCTTGCAGATGATATGGCCTGTAATCCTAGAAA  287
            |||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||.||.|.||
Sbjct  214  GTCAAGAGGCTAGGTATCCCGGACAGTCACATTGTCCTGATGCTTGCTGATGACATGGCGTGCAATGCTCGGAA  287

Query  288  TCCCAAACCAGCTACAGTGTTTAGTCACAAGAATATGGAACTAAATGTGTATGGAGATGATGTGGAAGTGGATT  361
            .|||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct  288  CCCCAAGCCAGCCACAGTGTTCAGCCACAAGAACATGGAGCTCAATGTGTATGGAGACGATGTGGAAGTGGACT  361

Query  362  ATAGAAGTTATGAGGTAACTGTGGAGAATTTTTTACGGGTATTAACTGGGAGGATCCCACCTAGTACTCCTCGG  435
            |.|||||.||||||||||||||||||||.||||||.|||||||.||.||||||.|.|||||.|||||.|||||.
Sbjct  362  ACAGAAGCTATGAGGTAACTGTGGAGAACTTTTTAAGGGTATTGACCGGGAGGGTTCCACCCAGTACCCCTCGC  435

Query  436  TCAAAACGTCTTCTTTCTGATGACAGAAGCAATATTCTAATTTATATGACAG----------------------  487
            |||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||                      
Sbjct  436  TCAAAGCGTCTTCTTTCCGACGACAGAAGCAATATCCTCATTTATATGACAGAGTCCGCTCCTGCCACACCCGC  509

Query  488  --------------------------------------------------------------------------  487
                                                                                      
Sbjct  510  TCTGGCTTTTGTCCCCCTTGGGTCGTCCTTCTCAGCACATAATAGAACTGCAGATCTGCCCTTCTCTGCCGCAC  583

Query  488  ---------------------------------------------GGCATGGTGGAAATGGTTTCTTAAAATTT  516
                                                         |.|||||.||.|||||||||||.|||||.
Sbjct  584  ACTCCCAAATTCTACTTTTGAAGGATTTACTCAGTAACTCCTTGAGTCATGGAGGGAATGGTTTCTTGAAATTC  657

Query  517  CAAGATTCTGAAGAAATTACCAACATAGAACTCGCGGATGCTTTTGAACAAATGTGGCAGAAAAGACGCTACAA  590
            |||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct  658  CAAGATTCTGAAGAAATCACCAACATAGAACTTGCAGATGCGTTTGAACAGATGTGGCAGAAGAGACGCTACAA  731

Query  591  TGAGCTACTGTTTATTATTGATACTTGCCAAGGAGCATCCATGTATGAACGATTTTATTCTCCTAACATAATGG  664
            ||||||.|||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||.||.||.||.|||||||||||.||||
Sbjct  732  TGAGCTGCTGTTCATTATTGACACTTGCCAGGGCGCGTCCATGTACGAGCGGTTCTACTCTCCTAACATCATGG  805

Query  665  CTCTAGCTAGTAGTCAAGTGGGAGAAGATTCACTCTCGCATCAACCTGATCCTGCAATTGGAGTCCATCTTATG  738
            |..|.||||||||.||.||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  806  CCTTGGCTAGTAGCCAGGTGGGAGAGGATTCGCTGTCGCACCAGCCTGACCCTGCGATTGGAGTTCATCTTATG  879

Query  739  GATAGATACACATTTTATGTCTTGGAATTTTTGGAAGAAATTAACCCAGCTAGCCAAACTAATATGAATGACCT  812
            |||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  880  GATAGGTACACGTTTTATGTCTTGGAATTTTTGGAAGAAATTAATCCAGCTAGCCAAACTAACATGAACGACCT  953

Query  813  TTTTCAGGTATGTCCCAAAAGTCTGTGTGTGTCTACTCCTGGACATCGCACTGATCTTTTTCAGAGGGATCCTA  886
            ||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||.|.|||||.|
Sbjct  954  TTTTCAAGTGTGTCCCAAAAGTCTCTGTGTGTCGACCCCTGGACATCGCACTGACCTTTTCCAGCGAGATCCAA  1027

Query  887  AAAATGTACTGATAACTGATTTCTTTGGAAGTGTACGGAAAGTGGAAATTACAACAGAGACTATTAAATTGCAA  960
            |||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||||||||||..||.|..|||||.
Sbjct 1028  AAAATGTCCTGATCACCGATTTCTTCGGAAGTGTGCGCAAGGTGGAAATCACAACAGAGAAGATCAGTTTGCAG  1101

Query  961  CAGGATTCAGAAATCATGGAAAGCAGCTATAAGGAAGACCAGATGGATGAGAAACTAATGGAACCTCTGAAATA  1034
            ..|||||||.||.||.||||.|||||.|.|||.||||||...|.||..|||.|.|..||||.||||||.||.||
Sbjct 1102  TGGGATTCACAAGTCGTGGACAGCAGTTCTAAAGAAGACGGCACGGCCGAGGAGCGCATGGGACCTCTCAAGTA  1175

Query 1035  TGCTGAACAACTTCCTGTAGCTCAGATAATACACCAGAAACCGAAGCTGAAAGACTGGCATCCTCCTGGGGGCT  1108
            ||||||.||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||.||||.||.|||||||||.|||||.||.||||
Sbjct 1176  TGCTGAGCAGCTCCCGGTGGCTCAGATAATACACCAGAAGCCAAAGCCGAGAGACTGGCACCCTCCCGGAGGCT  1249

Query 1109  TTATTCTGGGATTATGGGCACTTATTATCATGGTTTTCTTCAAAACTTATGGAATTAAGCATATGAAGTTCATT  1182
            |.||.|||||..|.|||||.||.||.||||||||.||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 1250  TCATCCTGGGGCTGTGGGCGCTCATCATCATGGTCTTCTTCAAGACCTATGGGATCAAGCATATGAAGTTCATT  1323

Query 1183  TTT  1185
            ||.
Sbjct 1324  TTC  1326