Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000474611
• Subject: XM_006496841.3
• Aligned Length: 1101
• Identities: 898
• Gaps: 117

Alignment

Query    1  ------ATGGAGAAAGGTGGGAACATACAATTGGAGATTCCTGACTTCAGCAACTCTGTCCTGAGCCATCTAAA  68
                  |||||||||.||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct    1  ATGACCATGGAGAAAAGTGGGAACATACAATTGGAGATCCCCGACTTCAGCAACTCTGTTCTGAGCCATCTCAA  74

Query   69  CCAGTTGCGCATGCAGGGCCGTCTCTGTGATATTGTGGTCAATGTGCAAGGACAAGCTTTTCGGGCTCACAAAG  142
            ||||.|.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCAGCTACGAATGCAAGGCCGGCTCTGTGATATTGTGGTCAATGTGCAAGGACAAGCTTTTCGGGCTCACAAAG  148

Query  143  TGGTGCTGGCTGCCAGCTCCCCCTATTTCCGGGATCACATGTCCTTGAATGAGATGAGTACAGTCTCCATTTCA  216
            |.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.
Sbjct  149  TAGTACTGGCTGCCAGCTCCCCTTATTTCCGGGATCACATGTCCTTGAATGAAATGAGTACTGTGTCCATTTCT  222

Query  217  GTCATCAAGAACCCTACTGTTTTTGAACAGCTCCTTTCTTTCTGTTACACAGGGCGGATATGCCTGCAACTGGC  290
            ||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  223  GTCATCAAGAACCCTACTGTTTTTGAGCAACTTCTTTCTTTCTGTTACACAGGGCGGATATGCCTGCAACTAGC  296

Query  291  AGATATCATCAGCTACCTAACAGCTGCCAGTTTTCTGCAAATGCAGCATATTATAGACAAATGTACACAGATCC  364
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  297  AGATATCATCAGCTACCTAACAGCTGCTAGTTTTCTGCAGATGCAGCATATTATAGACAAATGTACGCAGATCC  370

Query  365  TGGAGGGCATTCATTTCAAAATTAATGTGGCTGAGGTTGAAGCAGAATTAAGTCAAACAAGGACAAAGCATCAA  438
            |.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TAGAGGGCATTCACTTCAAAATTAATGTGGCTGAGGTTGAAGCAGAATTAAGTCAAACAAGGACAAAGCATCAA  444

Query  439  GAGAGACCTCCAGAGTCTCACAGGGTTACACCAAATCTCAACCGCTCCCTTAGCCCACGACATAATACCCCAAA  512
            ||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||.||.||||
Sbjct  445  GAGAGACCTCCAGAGTCTCATAGGGCTACACCAAATCTAAACCGCTCACTTAGTCCACGGCATAATGCCTCAAA  518

Query  513  GGGAAACCGGCGAGGTCAGGTTAGTGCTGTGCTGGATATCAGAGAGCTAAGTCCTCCTGAGGAGTCCACCAGCC  586
            |||||||.||.||||.|||||.|||||.||||||||||||.|||||||.|||||.||.||||||.|||||||.|
Sbjct  519  GGGAAACTGGAGAGGGCAGGTCAGTGCCGTGCTGGATATCCGAGAGCTCAGTCCCCCGGAGGAGCCCACCAGTC  592

Query  587  CTCAGATCATTGAACCAAGTTCTGATGTAGAGAGCCGGGAGCCCATTCTTCGGATCAACCGAGCAGGACAGTGG  660
            |||||||.|||||||..||||||||||.|||..|||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||
Sbjct  593  CTCAGATAATTGAACAGAGTTCTGATGCAGAAGGCCGGGAGCCCATTCTTCGAATCAACAGAGCAGGACAGTGG  666

Query  661  TATGTGGAGACAGGAGTGGCGGACCGTGGGGGTCGGAGTGATGATGAAGTTAGAGTTCTTGGAGCAGTACACAT  734
            ||||||||.||||||.|.||.||||..||||..|||||||.|||.||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct  667  TATGTGGAAACAGGACTAGCAGACCAGGGGGCCCGGAGTGGTGACGAAGTTAGGGTTCTTGGAGCAGTGCACAT  740

Query  735  CAAAACTGAAAATCTGGAGGAGTGGCTTGGGCCTGAGAATCAGCCTTCTGGAGAAGATGGGAGTAGTGCAGAGG  808
            |||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAAAACTGAAAATCTAGAAGAGTGGCTTGGGCCAGAGAATCAGCCTTCTGGAGAAGATGGGAGTAGTGCAGAGG  814

Query  809  AAGTAACAGCCATGGTGATTGATACCACAGGCCATGGTTCTGTAGGACAGGAAAATTATACTTTAGGGTCTTCA  882
            ||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAGTCACAGCCATGGTGATTGACACCACAGGCCATGGTTCTATAGGACAGGAAAGTTATACTTTAGGGTCTTCA  888

Query  883  GGAGCCAAGGTGGCTCGGCCAACAAGCAGTGAAGTTGACAGATTTAGCCCCTCCGGCAGTGTTGTTCCCTTGAC  956
            |||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||                       .|||   
Sbjct  889  GGAGCCAAGGTAGCTCGGCCAACCAGCAGTGAAGTTGACAGCTT-----------------------ACTT---  936

Query  957  AGAGAGACACAGAGCCAGAAGTGAGTCTCCTGGGAGAATGGATGAGCCTAAGCAACCCAGCTCCCAGGTATG--  1028
                                          |||||||.|||                        |.|||||  
Sbjct  937  ------------------------------TGGGAGACTGG------------------------AAGTATGTC  956

Query 1029  ----GAGTTGTGGATTT--AGAACTGCTTTGGTGGTTGGAGGAATTGCTACTGTGTATGAA----  1083
                ||.|  ||.||||  ||.||               ||||  .|||.|||..|.||||    
Sbjct  957  AGAAGACT--TGCATTTTCAGCAC---------------AGGA--GGCTCCTGGATCTGAAATAT  1002