Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000474611
• Subject: XM_011238814.2
• Aligned Length: 1515
• Identities: 990
• Gaps: 435

Alignment

Query    1  ------ATGGAGAAAGGTGGGAACATACAATTGGAGATTCCTGACTTCAGCAACTCTGTCCTGAGCCATCTAAA  68
                  |||||||||.||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct    1  ATGACCATGGAGAAAAGTGGGAACATACAATTGGAGATCCCCGACTTCAGCAACTCTGTTCTGAGCCATCTCAA  74

Query   69  CCAGTTGCGCATGCAGGGCCGTCTCTGTGATATTGTGGTCAATGTGCAAGGACAAGCTTTTCGGGCTCACAAAG  142
            ||||.|.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCAGCTACGAATGCAAGGCCGGCTCTGTGATATTGTGGTCAATGTGCAAGGACAAGCTTTTCGGGCTCACAAAG  148

Query  143  TGGTGCTGGCTGCCAGCTCCCCCTATTTCCGGGATCACATGTCCTTGAATGAGATGAGTACAGTCTCCATTTCA  216
            |.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.
Sbjct  149  TAGTACTGGCTGCCAGCTCCCCTTATTTCCGGGATCACATGTCCTTGAATGAAATGAGTACTGTGTCCATTTCT  222

Query  217  GTCATCAAGAACCCTACTGTTTTTGAACAGCTCCTTTCTTTCTGTTACACAGGGCGGATATGCCTGCAACTGGC  290
            ||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  223  GTCATCAAGAACCCTACTGTTTTTGAGCAACTTCTTTCTTTCTGTTACACAGGGCGGATATGCCTGCAACTAGC  296

Query  291  AGATATCATCAGCTACCTAACAGCTGCCAGTTTTCTGCAAATGCAGCATATTATAGACAAATGTACACAGATCC  364
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  297  AGATATCATCAGCTACCTAACAGCTGCTAGTTTTCTGCAGATGCAGCATATTATAGACAAATGTACGCAGATCC  370

Query  365  TGGAGGGCATTCATTTCAAAATTAATGTGGCTGAGGTTGAAGCAGAATTAAGTCAAACAAGGACAAAGCATCAA  438
            |.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TAGAGGGCATTCACTTCAAAATTAATGTGGCTGAGGTTGAAGCAGAATTAAGTCAAACAAGGACAAAGCATCAA  444

Query  439  GAGAGACCTCCAGAGTCTCACAGGGTTACACCAAATCTCAACCGCTCCCTTAGCCCACGACATAATACCCCAAA  512
            ||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||.||.||||
Sbjct  445  GAGAGACCTCCAGAGTCTCATAGGGCTACACCAAATCTAAACCGCTCACTTAGTCCACGGCATAATGCCTCAAA  518

Query  513  GGGAAACCGGCGAGGTCAGGTTAGTGCTGTGCTGGATATCAGAGAGCTAAGTCCTCCTGAGGAGTCCACCAGCC  586
            |||||||.||.||||.|||||.|||||.||||||||||||.|||||||.|||||.||.||||||.|||||||.|
Sbjct  519  GGGAAACTGGAGAGGGCAGGTCAGTGCCGTGCTGGATATCCGAGAGCTCAGTCCCCCGGAGGAGCCCACCAGTC  592

Query  587  CTCAGATCATTGAACCAAGTTCTGATGTAGAGAGCCGGGAGCCCATTCTTCGGATCAACCGAGCAGGACAGTGG  660
            |||||||.|||||||..||||||||||.|||..|||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||
Sbjct  593  CTCAGATAATTGAACAGAGTTCTGATGCAGAAGGCCGGGAGCCCATTCTTCGAATCAACAGAGCAGGACAGTGG  666

Query  661  TATGTGGAGACAGGAGTGGCGGACCGTGGGGGTCGGAGTGATGATGAAGTTAGAGTTCTTGGAGCAGTACACAT  734
            ||||||||.||||||.|.||.||||..||||..|||||||.|||.||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct  667  TATGTGGAAACAGGACTAGCAGACCAGGGGGCCCGGAGTGGTGACGAAGTTAGGGTTCTTGGAGCAGTGCACAT  740

Query  735  CAAAACTGAAAATCTGGAGGAGTGGCTTGGGCCTGAGAATCAGCCTTCTGGAGAAGATGGGAGTAGTGCAGAGG  808
            |||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAAAACTGAAAATCTAGAAGAGTGGCTTGGGCCAGAGAATCAGCCTTCTGGAGAAGATGGGAGTAGTGCAGAGG  814

Query  809  AAGTAACAGCCATGGTGATTGATACCACAGGCCATGGTTCTGTAGGACAGGAAAATTATACTTTAGGGTCTTCA  882
            ||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAGTCACAGCCATGGTGATTGACACCACAGGCCATGGTTCTATAGGACAGGAAAGTTATACTTTAGGGTCTTCA  888

Query  883  GGAGCCAAGGTGGCTCGGCCAACAAGCAGTGAAGTTGACAGATTTAGCCCCTCCGGCAGTGTTGTTCCCTTGAC  956
            |||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct  889  GGAGCCAAGGTAGCTCGGCCAACCAGCAGTGAAGTTGACAGATTTAGTCCCTCCGGCAGTGTTGTTTCCATGAC  962

Query  957  AGAGAGACACAGAGCCAGAAGTGAGTCTCCTGGGAGAATGGATGAGCCTAAGCAACCCAGCTCCCAGGTA----  1026
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||    
Sbjct  963  AGAAAGACACAGAGCCAGAAGTGAGTCTCCTGGGAGAATGGATGAGCCTAAGCAACTTAGCTCCCAGGTAGAAG  1036

Query 1027  -------------TGGAGT---------TGTGGATT------------TAGAACTGCTTT------GGTGGTT-  1059
                         .|||||         ||||||.|            .||||.||   |      |.||||| 
Sbjct 1037  AGTCAGCAATGATGGGAGTAAGCGCCTATGTGGAGTATCTCCGAGAACAAGAAGTG---TCCGAACGATGGTTC  1107

Query 1060  -GGAGGAAT------------TG---CTACTGTG-------TATGAA---------------------------  1083
             ||...|||            ||   ||||||||       |.|.||                           
Sbjct 1108  CGGTATAATCCCCGTCTCACCTGCATCTACTGTGCCAAATCTTTCAACCAAAAGGGAAGTCTGGACCGCCACAT  1181

Query 1084  --------------------------------------------------------------------------  1083
                                                                                      
Sbjct 1182  GCGCCTGCATATGGGAATCACACCGTTTGTCTGCCGCATGTGTGGAAAAAAGTATACCCGGAAAGACCAGCTGG  1255

Query 1084  --------------------------------------------------------------------------  1083
                                                                                      
Sbjct 1256  AATATCACATCCGCAAGCACACAGGCAACAAGCCCTTTCACTGTCACGTTTGTGGCAAAAGTTTCCCCTTCCAG  1329

Query 1084  --------------------------------------------------------------------------  1083
                                                                                      
Sbjct 1330  GCCATCTTGAATCAGCACTTTCGAAAAAACCACCCTGGTTGTATACCCCTGGAAGGGCCTCATAGCATTTCTCC  1403

Query 1084  --------------------------------------------------------------------------  1083
                                                                                      
Sbjct 1404  TGAGACTACTGTCACTTCCCGGCAAGCTGAAGAAGGGTCACCTTCACACGAAGAAATAGTTGCTCCTGGAGAAT  1477

Query 1084  -----------------------------------  1083
                                               
Sbjct 1478  CTGCCCAGGGCTCAGTTTCTACTACTGGGCCAGAT  1512