Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000474635
• Subject: XM_006505231.3
• Aligned Length: 993
• Identities: 878
• Gaps: 0

Alignment

Query   1  ATGTTTCACAAAGCAGAAGAATTATTTTCTAAAACAACAAACAATGAAGTGGATGACATGGACACGTCAGATAC  74
           |||||||||||..||||.||.||.|||.|.||.|..|||.|||..||.|||||.|||||||||||.||.||.||
Sbjct   1  ATGTTTCACAAGACAGAGGAGTTCTTTCCCAAGAAGACAGACAGCGATGTGGACGACATGGACACATCGGACAC  74

Query  75  CCAGTGGGGCTGGTTTTACTTGGCAGAATGTGGGAAGTGGCACATGTTTCAGCCGGATACCAACAGTCAGTGTT  148
           .||||||||||||||.|||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||
Sbjct  75  ACAGTGGGGCTGGTTCTACCTGGCGGAATGTGGGAAGTGGCACATGTTTCAGCCGGATACCAACATTCAATGTT  148

Query 149  CAGTTAGCAGTGAAGATATCGAAAAAAGCTTCAAAACAAACCCTTGTGGCTCCATTTCTTTTACTACTTCCAAA  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 149  CAGTTAGCAGTGAAGATATCGAAAAAAGCTTCAAAACAAACCCTTGTGGCTCCATTTCCTTTACTACTTCCAAA  222

Query 223  TTCAGCTACAAGATAGACTTTGCAGAAATGAAGCAAATGAATCTCACCACTGGAAAGCAGCGCTTAATAAAAAG  296
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||...||||||.||.||||||.|||||||.||
Sbjct 223  TTCAGCTACAAGATAGACTTTGCAGAAATGAAGCAGATGAATCTTGTCACTGGGAAACAGCGCCTAATAAAGAG  296

Query 297  AGCCCCCTTTTCTATCAGTGCTTTCAGTTACATCTGTGAAAACGAGGCCATCCCTATGCCACCACACTGGGAGA  370
           .||.||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||.|.||||||||||
Sbjct 297  GGCTCCTTTCTCCATCAGTGCCTTCAGTTACATCTGTGAGAATGAGGCCATCCCCATGCCAACCCACTGGGAGA  370

Query 371  ATGTGAATACTCAAGTACCATATCAGCTTATTCCTCTGCACAATCAAACACATGAATATAATGAAGTTGCTAAT  444
           |.|||||..||.|.||.||.||.|||||..||.|.|||||.||.||.||.||.||.|||||||||||.||.|.|
Sbjct 371  ACGTGAACCCTGACGTTCCCTACCAGCTGGTTTCCCTGCAGAACCAGACGCACGAGTATAATGAAGTGGCCAGT  444

Query 445  CTCTTTGGGAAGACGATGGATCGCAACCGAATTAAAAGAATTCAGAGAATTCAAAACCTAGATTTGTGGGAGTT  518
           ||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||||||.||||.||.||||||||
Sbjct 445  CTTTTTGGGAAAACAATGGATCGGAACCGAATTAAAAGGATTCAAAGGATCCAAAACTTAGACTTATGGGAGTT  518

Query 519  CTTTTGCAGGAAAAAGGCTCAGCTCAAGAAAAAAAGAGGTGTGCCTCAGATTAATGAACAAATGCTGTTTCATG  592
           |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||
Sbjct 519  CTTTTGCAGGAAAAAGGCTCAGCTCAAGAAAAAGAGAGGTGTCCCCCAGATCAATGAGCAGATGCTATTTCATG  592

Query 593  GTACCAGCAGTGAATTTGTGGAAGCAATCTGCATTCATAACTTTGATTGGAGAATAAATGGTATACATGGTGCT  666
           |.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||||||.|.||.||.|||
Sbjct 593  GCACCAGCAGTGAATTTGTGGAAGCAATTTGCATTCACAACTTTGACTGGAGAATCAATGGTGTGCACGGGGCT  666

Query 667  GTCTTTGGAAAAGGAACCTATTTTGCTAGAGATGCTGCTTATTCCAGTCGTTTCTGCAAAGATGACATAAAGCA  740
           |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 667  GTCTTTGGAAAAGGAACCTATTTCGCTAGAGATGCTGCGTACTCCAGTCGTTTCTGCAAAGATGACATCAAGCA  740

Query 741  TGGGAACACATTCCAAATTCATGGTGTCAGCTTGCAACAGCGGCATCTGTTTAGAACATATAAATCTATGTTTC  814
           .||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||
Sbjct 741  CGGGAACACATTCCAGATTCATGGGGTCAGCTTGCAGCAGCGACATCTGTTCAGAACCTATAAATCCATGTTTC  814

Query 815  TTGCTCGAGTGCTAATTGGAGATTACATAAACGGAGACTCCAAATACATGCGACCTCCTTCCAAAGACGGGAGC  888
           |||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 815  TTGCTCGAGTGCTAATTGGTGATTACATAAATGGAGACTCGAAATACATGAGACCTCCTTCCAAAGACGGGAGC  888

Query 889  TATGTGAATTTATATGACAGCTGTGTGGATGATACCTGGAACCCAAAGATCTTTGTGGTTTTTGATGCCAACCA  962
           |||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889  TATGTGAATTTGTATGACAGCTGTGTGGATGACACCTGGAACCCAAAGATCTTTGTGGTTTTTGATGCCAACCA  962

Query 963  AATCTATCCTGAGTACTTGATAGACTTTCAT  993
           .|||||.|||||||||.||||||||||.||.
Sbjct 963  GATCTACCCTGAGTACCTGATAGACTTCCAC  993