Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000474694
- Subject:
- NM_172992.3
- Aligned Length:
- 2255
- Identities:
- 2000
- Gaps:
- 16
Alignment
Query 1 ATGGCGTCCAAAGTCACAGATGCTATAGTCTGGTATCAAAAGAAGATTGGAGCATATGATCAACAAATATGGGA 74
||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGTCCAGAGTCACAGATGCTATAGTCTGGTATCAGAAGAAGATTGGAGCCTATGATCAACAAATATGGGA 74
Query 75 AAAATCTGTTGAACAGAGAGAAATCAAGTTTATTAAACTGGGGC-TAAGGAATAAACCAAAGAAAACAGCACAT 147
|||.|||||||||||.||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AAAGTCTGTTGAACAAAGAGAAATCAA-------------GGGCTTAAGGAATAAACCAAAGAAAACAGCACAT 135
Query 148 GTGAAACCAGACCTCATAGATGTTGATCTTGTAAGAGGGTCTGCATTTGCAAAGGCAAAGCCTGAAAGTCCTTG 221
|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 136 GTGAAACCAGACCTCATCGATGTTGATCTTGTGAGAGGGTCTGCATTTGCTAAGGCAAAGCCTGAAAGTCCTTG 209
Query 222 GACTTCTCTGACCA-GAAAGGGAATTGTTCGAGTTGTATTTTTCCCCTTTTTCTTCCGGTGGTGGTTACAAGTA 294
||||||||||||.| ||||||| ||||||||||||||.||||||||.||.||||.|||.|||||||||||||||
Sbjct 210 GACTTCTCTGACAAGGAAAGGG-ATTGTTCGAGTTGTCTTTTTCCCTTTCTTCTCCCGCTGGTGGTTACAAGTA 282
Query 295 ACATCAAAGGTCATCTTTTTCTGGCTTCTTGTCCTTTATCTTCTTCAAGTTGCTGCAATAGTATTATTCTGCTC 368
||.||.|..||||||||.|.||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 283 ACGTCCAGAGTCATCTTCTCCTGGCTTCTTGTTCTCTATCTTCTCCAAGTTGCTGCAATAGTATTATTCTGTTC 356
Query 369 CACTTCTAGCCCACACAGCATACCTCTGACAGAGGTGATTGGGCCGATATGGCTGATGCTGCTCCTGGGAACTG 442
|.||.||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||.|
Sbjct 357 CGCTCCTAGCCCACATAGCATACCTCTAACTGAAGTGATTGGGCCAATATGGCTGATGCTGCTTTTGGGAACCG 430
Query 443 TGCATTGCCAGATTGTTTCCACAAGAACACCCAAACCTCCTCTAAGTACAGGGGGTAAAAGAAGAAGGAAATTA 516
|||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||.|.|||||.||||||.||||||||||||||
Sbjct 431 TGCATTGCCAGATTGTTTCAACAAGAACACCCAAGCCTCCACTAGGCACAGGCGGTAAACGAAGAAGGAAATTA 504
Query 517 AGAAAAGCAGCCCATTTGGAAGTACATAGGGAAGGAGATGGTTCTAGTACCACAGATAACACACAAGAGGGAGC 590
|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 505 AGAAAAGCAGCCCATTTGGAAGTCCACAGGGAAGGGGACGGTTCTAGCACCACAGATAACACACAGGAGGGAGC 578
Query 591 AGTTCAGAACCACGGTACAAGCACCTCTCACAGCGTTGGCACTGTCTTCAGAGATCTCTGGCATGCTGCTTTCT 664
.||.||||.||||||..||.||.||.||.||||.||||||||||||||||||||.||.||||.|||||||||||
Sbjct 579 GGTGCAGAGCCACGGCGCAGGCGCCCCTTACAGTGTTGGCACTGTCTTCAGAGACCTTTGGCTTGCTGCTTTCT 652
Query 665 TTTTATCAGGATCAAAGAAAGCAAAGAATTCAATTGATAAATCAACTGAAACTGACAATGGCTATGTATCCCTT 738
|.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 653 TCTTATCAGGGTCAAAGAAGGCAAAGAATTCAATTGATAAGTCAACCGAGACTGACAATGGCTATGTGTCCCTC 726
Query 739 GATGGGAAGAAGACTGTTAAAAGCGGTGAAGATGGAATACAAAACCATGAACCTCAGTGTGAAACTATTCGACC 812
||||||||||.||||||.||||||.||||.||||||..|||..|||||||.|||||||||||||||.||.||||
Sbjct 727 GATGGGAAGAGGACTGTAAAAAGCAGTGAGGATGGAGCACAGTACCATGAGCCTCAGTGTGAAACTGTTGGACC 800
Query 813 AGAAGAGACAGCCTGGAACACAGGAACACTGAGGAATGGTCCTAGCAAAGATACCCAAAGGACAATAACAAATG 886
||||||..||||||||..||||.||||.|..||||.||.||||..|||||||||||||||.|..||||||||||
Sbjct 801 AGAAGACGCAGCCTGGGCCACACGAACGCCAAGGAGTGTTCCTGCCAAAGATACCCAAAGAAAGATAACAAATG 874
Query 887 TCTCTGATGAAGTCTCCAGTGAGGAAGGTCCTGAAACAGGATACTCATTACGTCGTCATGTGGACAGGACTTCT 960
|||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||.||||.|||.|||||||||||||.||||||
Sbjct 875 TCTCTGATGAAGTATCCAGTGAGGAGGGTCCCGAAACAGGATACCCATTGCGTGGTCATGTGGACAGAACTTCT 948
Query 961 GAAGGTGTTCTTCGGAATAGAAAGTCACACCATTATAAGAAACATTACCCTAATGAGGACGCCCCTAAATCGGG 1034
|||.|.|.||||||.|||||||||.|||||||||||||.||.|||||..|.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 949 GAAAGCGGTCTTCGAAATAGAAAGCCACACCATTATAAAAAGCATTATGCAAATGAGGATGCCCCTAAATCGGG 1022
Query 1035 TACTAGTTGCAGCTCTCGCTGTTCAAGTTCCAGACAGGATTCTGAGAGTGCAAGGCCAGAATCTGAAACAGAAG 1108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1023 TACTAGTTGCAGCTCTCGCTGTTCAAGTTCCAGACAGGATTCTGAGAGCACAAGGCCAGAATCTGAAACCGAAG 1096
Query 1109 ATGTGTTATGGGAAGACTTGTTACATTGTGCAGAATGCCATTCATCTTGTACCAGTGAGACAGATGTGGAAAAT 1182
||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||..||||||||||||||||||||||||||||.|||.
Sbjct 1097 ATGTATTATGGGAAGACTTGTTACACTGTGCGGAATGCCGCTCATCTTGTACCAGTGAGACAGATGTGGGAAAC 1170
Query 1183 CATCAGATTAATCCATGTGTGAAAAAAGAATATAGAGATGACCCTTTTCATCAGAGTCATTTGCCCTGGCTCCA 1256
|.||||||.||||||||||.|||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1171 CCTCAGATAAATCCATGTGGGAAGAAAGAATATAGAGACGACCCTTTTCATCAGAGTCATTTGCCCTGGCTTCA 1244
Query 1257 TAGTTCCCACCCAGGATTAGAAAAAATAAGTGCTATAGTATGGGAAGGTAATGATTGTAAGAAAGCAGACATGT 1330
|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1245 TAGTTCCCACCCAGGATTAGAAAAAATCAGTGCTATAGTGTGGGAAGGTAACGACTGTAAGAAAGCAGACATGT 1318
Query 1331 CTGTACTTGAAATCAGTGGAATGATAATGAACAGAGTGAACAGCCATATACCAGGAATAGGATACCAGATTTTT 1404
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||.|.|||||.||||||||||||.|.|||
Sbjct 1319 CTGTACTTGAAATCAGTGGGATGATAATGAACAGAGTGAACAACCATGTCCCAGGCATAGGATACCAGGTATTT 1392
Query 1405 GGAAATGCAGTCTCTCTCATACTGGGTTTAACTCCATTTGTTTTCCGACTTTCTCAAGCTACAGACTTGGAACA 1478
||||||||..|||||||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||
Sbjct 1393 GGAAATGCCATCTCTCTAATCCTGGGCTTGACCCCATTTGTTTTCCGACTGTCACAAGCAACAGACTTGGAGCA 1466
Query 1479 ACTCACAGCACATTCTGCTTCAGAACTTTATGTGATTGCATTTGGTTCTAATGAAGATGTCATAGTTCTTTCTA 1552
.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct 1467 GCTCACAGCCCATTCTGCGTCAGAACTTTATGTGATTGCGTTTGGCTCTAACGAAGATGTCATGGTTCTTTCTA 1540
Query 1553 TGGTTATAATAAGTTTTGTGGTTCGCGTGTCTCTTGTGTGGATTTTCTTTTTTTTGCTCTGTGTAGCAGAAAGA 1626
||||..|.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1541 TGGTCCTGATAAGTTTTGTGGTTCGAGTCTCTCTTGTGTGGATCTTCTTTTTTTTGCTGTGTGTAGCAGAAAGA 1614
Query 1627 ACTTATAAACAGCGATTACTTTTTGCAAAACTCTTTGGACATTTAACATCTGCAAGGAGGGCTCGAAAATCTGA 1700
||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1615 ACATATAAGCAACGATTACTCTTTGCAAAACTCTTTGGACACTTGACGTCTGCAAGGAGAGCTCGCAAATCTGA 1688
Query 1701 GGTTCCTCATTTCCGGTTGAAGAAAGTACAGAATATAAAAATGTGGCTATCTCTCCGTTCCTATCTTAAGCGTC 1774
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1689 GGTTCCGCATTTCCGGTTGAAGAAAGTACAGAATATAAAAATGTGGCTGTCTCTGCGTTCCTATCTTAAGCGCC 1762
Query 1775 GAGGTCCTCAGCGATCAGTTGATGTAATAGTTTCATCTGCTTTCTTATTGACTATCTCAGTTGTATTTATCTGT 1848
||||.|||||||||||.||.|||||.||.||.|||||.||.||||||.||||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct 1763 GAGGCCCTCAGCGATCTGTGGATGTCATTGTCTCATCGGCCTTCTTACTGACAATCTCAGTTGTGTTTATCTGC 1836
Query 1849 TGTGCCCAGCTACTTCATGTACACGAGATCTTCCTTGATTGTCACTACAATTGGGAATTGGTAATCTGGTGCAT 1922
|||||.|||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||..||||.|||||||||||
Sbjct 1837 TGTGCACAGCTGCTCCACGTGCACGAGATCTTCCTTGACTGTCACTATAACTGGGAGCTGGTGATCTGGTGCAT 1910
Query 1923 CTCGTTAACACTTTTTCTCCTAAGATTTGTTACCCTTGGATCAGAAACAAGTAAAAAATATAGTAATACCTCAA 1996
|||.|||||.||.||.|||||.||.||.|||||.||||||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||
Sbjct 1911 CTCCTTAACGCTGTTCCTCCTGAGGTTCGTTACTCTTGGATCAGAAACCAGCAAGAAATACAGCAATACCTCAA 1984
Query 1997 TATTACTTACTGAACAGATAAACCTCTACTTGAAAATGGAGAAAAAACCTAACAAAAAGGAGGAACTGACACTA 2070
|..|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.
Sbjct 1985 TCCTACTTACGGAACAGATAAACCTCTACTTGAAAATGGAGAAGAAACCTAACAAAAAGGAGGAGCTGACCCTT 2058
Query 2071 GTGAATAATGTTTTAAAACTGGCTACTAAACTGCTAAAGGAGTTGGACAGTCCTTTTAGATTATATGGGCTTAC 2144
|||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||||
Sbjct 2059 GTGAATAATGTGTTAAAGCTGGCTACGAAACTGCTGAAGGAATTGGACAGTCCCTTTAGGTTGTATGGACTTAC 2132
Query 2145 AATGAATCCGCTGCTTTATAACATCACCCAGGTTGTTATCCTGTCAGCTGTTTCTGGTGTTATCAGTGACTTGC 2218
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 2133 AATGAATCCGCTGCTGTATAACATCACCCAGGTTGTCATCCTTTCGGCTGTTTCCGGTGTCATCAGTGACTTGC 2206
Query 2219 TTGGATTTAATTTAAAGCTATGGAAGATTAAGTCA 2253
|||||||||||||||||||.||||||||.||.||.
Sbjct 2207 TTGGATTTAATTTAAAGCTGTGGAAGATCAAATCG 2241