Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000474729
• Subject: XM_006711893.2
• Aligned Length: 1161
• Identities: 861
• Gaps: 300

Alignment

Query    1  ATGGAGGACGATGCACCAGTGATCTACGGGCTGGAGTTCCAGGCACGTGCCTTAACACCTCAAACTGCAGAAAC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AGATGCCATTCGGTTTTTGGTTGGGACGCAGTCTCTTAAATATGATAATCAGATCCATATCATAGATTTTGACG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ATGAAAACAACATTATAAATAAAAATGTCCTCCTCCATCAAGCGGGTGAAATCTGGCATATTAGCGCTAGCCCT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GCAGACAGAGGTGTGCTGACGACCTGCTACAACAGAACTTCAGACAGCAAAGTCCTGACATGTGCAGCCGTGTG  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GAGGATGCCGAAGGAATTGGAATCAGGCAGCCACGAGTCCCCTGATGATTCATCCAGCACTGCACAGACCCTGG  370
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----ATGCCGAAGGAATTGGAATCAGGCAGCCACGAGTCCCCTGATGATTCATCCAGCACTGCACAGACCCTGG  70

Query  371  AGCTGCTCTGTCACCTTGACAACACAGCCCATGGCAACATGGCCTGTGTCGTGTGGGAGCCAATGGGAGATGGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   71  AGCTGCTCTGTCACCTTGACAACACAGCCCATGGCAACATGGCCTGTGTCGTGTGGGAGCCAATGGGAGATGGG  144

Query  445  AAGAAAATCATTTCCTTGGCTGATAACCATATCCTGCTGTGGGATTTACAGGAAAGCTCGAGCCAGGCTGTGCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  145  AAGAAAATCATTTCCTTGGCTGATAACCATATCCTGCTGTGGGATTTACAGGAAAGCTCGAGCCAGGCTGTGCT  218

Query  519  GGCCAGCTCAGCGTCCCTGGAAGGGAAGGGACAACTGAAGTTCACCTCAGGACGGTGGAGCCCACATCATAACT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  219  GGCCAGCTCAGCGTCCCTGGAAGGGAAGGGACAACTGAAGTTCACCTCAGGACGGTGGAGCCCACATCATAACT  292

Query  593  GCACCCAGGTGGCCACAGCGAACGACACCACCCTCCGTGGCTGGGACACCCGGAGCATGAGCCAGATCTACTGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  293  GCACCCAGGTGGCCACAGCGAACGACACCACCCTCCGTGGCTGGGACACCCGGAGCATGAGCCAGATCTACTGC  366

Query  667  ATAGAGAATGCCCACGGACAGCTGGTGCGGGACCTTGACTTTAATCCCAATAAGCAGTACTACTTGGCCAGCTG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  367  ATAGAGAATGCCCACGGACAGCTGGTGCGGGACCTTGACTTTAATCCCAATAAGCAGTACTACTTGGCCAGCTG  440

Query  741  CGGAGACGACTGTAAGGTGAAGTTCTGGGACACCCGAAATGTCACCGAACCCGTGAAGACCCTGGAGGAGCACT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  441  CGGAGACGACTGTAAGGTGAAGTTCTGGGACACCCGAAATGTCACCGAACCCGTGAAGACCCTGGAGGAGCACT  514

Query  815  CCCACTGGGTGTGGAACGTCCGCTACAACCACTCTCATGACCAGCTGGTCCTCACGGGCAGCAGTGACAGCAGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  515  CCCACTGGGTGTGGAACGTCCGCTACAACCACTCTCATGACCAGCTGGTCCTCACGGGCAGCAGTGACAGCAGA  588

Query  889  GTCATCCTTTCCAACATGGTGTCCATCTCGTCGGAGCCCTTCGGCCACTTGGTAGACGACGATGACATCAGTGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  589  GTCATCCTTTCCAACATGGTGTCCATCTCGTCGGAGCCCTTCGGCCACTTGGTAGACGACGATGACATCAGTGA  662

Query  963  CCAGGAGGACCACCGTTCTGAAGAGAAGAGCAAGGAGCCCCTGCAGGACAACGTGATCGCCACCTACGAGGAGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  663  CCAGGAGGACCACCGTTCTGAAGAGAAGAGCAAGGAGCCCCTGCAGGACAACGTGATCGCCACCTACGAGGAGC  736

Query 1037  ACGAGGACAGCGTCTATGCCGTGGACTGGTCCTCGGCTGACCCGTGGCTGTTTGCCTCCCTGAGCTATGACGGG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  737  ACGAGGACAGCGTCTATGCCGTGGACTGGTCCTCGGCTGACCCGTGGCTGTTTGCCTCCCTGAGCTATGACGGG  810

Query 1111  AGGCTCGTGATCAACAGGGTGCCCAGGGCCCTGAAGTACCACATCCTGCTA  1161
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  811  AGGCTCGTGATCAACAGGGTGCCCAGGGCCCTGAAGTACCACATCCTGCTA  861