Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000474729
• Subject: XM_011510385.2
• Aligned Length: 1199
• Identities: 1147
• Gaps: 40

Alignment

Query    1  -------------ATGGAGGACGATGCACC--------AG-----TGATCTACG------GGCTGGAG------  36
                         ||..|||| ||..|.||        ||     |.|||||.|      .|| .|||      
Sbjct    1  ATGCGATTAAATAATCCAGGA-GAGCCTCCTCATCTCAAGGTCCTTAATCTAAGCACATCAGC-AGAGTCCCTT  72

Query   37  TTCCAGGCACGTGCCTTAACACCTCAAACTGCAGAAACAGATGCCATTCGGTTTTTGGTTGGGACGCAGTCTCT  110
            |.||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   73  TACCGCGCACGTGCCTTAACACCTCAAACTGCAGAAACAGATGCCATTCGGTTTTTGGTTGGGACGCAGTCTCT  146

Query  111  TAAATATGATAATCAGATCCATATCATAGATTTTGACGATGAAAACAACATTATAAATAAAAATGTCCTCCTCC  184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  147  TAAATATGATAATCAGATCCATATCATAGATTTTGACGATGAAAACAACATTATAAATAAAAATGTCCTCCTCC  220

Query  185  ATCAAGCGGGTGAAATCTGGCATATTAGCGCTAGCCCTGCAGACAGAGGTGTGCTGACGACCTGCTACAACAGA  258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  221  ATCAAGCGGGTGAAATCTGGCATATTAGCGCTAGCCCTGCAGACAGAGGTGTGCTGACGACCTGCTACAACAGA  294

Query  259  ACTTCAGACAGCAAAGTCCTGACATGTGCAGCCGTGTGGAGGATGCCGAAGGAATTGGAATCAGGCAGCCACGA  332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  295  ACTTCAGACAGCAAAGTCCTGACATGTGCAGCCGTGTGGAGGATGCCGAAGGAATTGGAATCAGGCAGCCACGA  368

Query  333  GTCCCCTGATGATTCATCCAGCACTGCACAGACCCTGGAGCTGCTCTGTCACCTTGACAACACAGCCCATGGCA  406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  369  GTCCCCTGATGATTCATCCAGCACTGCACAGACCCTGGAGCTGCTCTGTCACCTTGACAACACAGCCCATGGCA  442

Query  407  ACATGGCCTGTGTCGTGTGGGAGCCAATGGGAGATGGGAAGAAAATCATTTCCTTGGCTGATAACCATATCCTG  480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  443  ACATGGCCTGTGTCGTGTGGGAGCCAATGGGAGATGGGAAGAAAATCATTTCCTTGGCTGATAACCATATCCTG  516

Query  481  CTGTGGGATTTACAGGAAAGCTCGAGCCAGGCTGTGCTGGCCAGCTCAGCGTCCCTGGAAGGGAAGGGACAACT  554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  517  CTGTGGGATTTACAGGAAAGCTCGAGCCAGGCTGTGCTGGCCAGCTCAGCGTCCCTGGAAGGGAAGGGACAACT  590

Query  555  GAAGTTCACCTCAGGACGGTGGAGCCCACATCATAACTGCACCCAGGTGGCCACAGCGAACGACACCACCCTCC  628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  591  GAAGTTCACCTCAGGACGGTGGAGCCCACATCATAACTGCACCCAGGTGGCCACAGCGAACGACACCACCCTCC  664

Query  629  GTGGCTGGGACACCCGGAGCATGAGCCAGATCTACTGCATAGAGAATGCCCACGGACAGCTGGTGCGGGACCTT  702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  665  GTGGCTGGGACACCCGGAGCATGAGCCAGATCTACTGCATAGAGAATGCCCACGGACAGCTGGTGCGGGACCTT  738

Query  703  GACTTTAATCCCAATAAGCAGTACTACTTGGCCAGCTGCGGAGACGACTGTAAGGTGAAGTTCTGGGACACCCG  776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  739  GACTTTAATCCCAATAAGCAGTACTACTTGGCCAGCTGCGGAGACGACTGTAAGGTGAAGTTCTGGGACACCCG  812

Query  777  AAATGTCACCGAACCCGTGAAGACCCTGGAGGAGCACTCCCACTGGGTGTGGAACGTCCGCTACAACCACTCTC  850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  813  AAATGTCACCGAACCCGTGAAGACCCTGGAGGAGCACTCCCACTGGGTGTGGAACGTCCGCTACAACCACTCTC  886

Query  851  ATGACCAGCTGGTCCTCACGGGCAGCAGTGACAGCAGAGTCATCCTTTCCAACATGGTGTCCATCTCGTCGGAG  924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  887  ATGACCAGCTGGTCCTCACGGGCAGCAGTGACAGCAGAGTCATCCTTTCCAACATGGTGTCCATCTCGTCGGAG  960

Query  925  CCCTTCGGCCACTTGGTAGACGACGATGACATCAGTGACCAGGAGGACCACCGTTCTGAAGAGAAGAGCAAGGA  998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961  CCCTTCGGCCACTTGGTAGACGACGATGACATCAGTGACCAGGAGGACCACCGTTCTGAAGAGAAGAGCAAGGA  1034

Query  999  GCCCCTGCAGGACAACGTGATCGCCACCTACGAGGAGCACGAGGACAGCGTCTATGCCGTGGACTGGTCCTCGG  1072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1035  GCCCCTGCAGGACAACGTGATCGCCACCTACGAGGAGCACGAGGACAGCGTCTATGCCGTGGACTGGTCCTCGG  1108

Query 1073  CTGACCCGTGGCTGTTTGCCTCCCTGAGCTATGACGGGAGGCTCGTGATCAACAGGGTGCCCAGGGCCCTGAAG  1146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1109  CTGACCCGTGGCTGTTTGCCTCCCTGAGCTATGACGGGAGGCTCGTGATCAACAGGGTGCCCAGGGCCCTGAAG  1182

Query 1147  TACCACATCCTGCTA  1161
            |||||||||||||||
Sbjct 1183  TACCACATCCTGCTA  1197