Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000474759
• Subject: NM_001206602.2
• Aligned Length: 1395
• Identities: 958
• Gaps: 411

Alignment

Query    1  ATGGCCCTGACCCTGTTTGATACAGATGAATATAGACCTCCTGTTTGGAAATCTTACTTATATCAGCTACAACA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGAAGCCCCTCATCCTCGAAGAATTACCTGTACTTGCGAGGTGGAAAACAGACCAAAGTATTATGGAAGAGAGT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TTCATGGCATGATCTCCAGAGAAGCAGCCGACCAGCTCTTGATTGT--GGCTGAGGGGAGCTACCTCATCCGGG  220
               |||.||     ||||.|||             .|||||   ||  ||  ||||..|.|||           
Sbjct    1  ---ATGCCA-----TCCAAAGA-------------GTCTTG---GTCAGG--GAGGAAAACTA-----------  37

Query  221  AGAGCCAGCGGCAGCCAGGGACCTACACTTTGGCTTTAAGATTTGGAAGTCAAACCAGAAA----CTTCAG---  287
            |.||  .||.||||         |.|||                  ||.|||||.|| |.|    |.||||   
Sbjct   38  ATAG--GGCTGCAG---------TTCAC------------------AAATCAAAACA-AGAGGGCCGTCAGCAA  81

Query  288  GCTCTACTACGATGGCAAGCACTTTGTTGGGGA--GAAACGCTTTGAGTCCATCCA----CGATCTGGTGACTG  355
            |.|.||.|  |||.|| ||| |||     ||||  |||||    ||.||.| ||||    || ||| |||||  
Sbjct   82  GATTTATT--GATAGC-AGC-CTT-----GGGAATGAAAC----TGGGTTC-TCCAAAGTCG-TCT-GTGAC--  137

Query  356  A---TGGCTTGATTACTCTCTATATTGAAACCAAGGCAGCAGAATACATTGCCAAGATGACGATAAACCCAATT  426
            |   ||||      |..|||     ||||||              .|.||||                     |
Sbjct  138  AATCTGGC------AACCTC-----TGAAAC--------------TCTTTGC---------------------T  165

Query  427  TATGAGCACGTAGGATACACAACCTTAAACAGAGAGCCAGCATACAAAAAACATATGCCAGTCCTGAAAGAGAC  500
            |||..|||                                                                  
Sbjct  166  TATTCGCA------------------------------------------------------------------  173

Query  501  ACATGATGAGAGAGATTCTACAGGCCAGGATGGGGTGTCAGAGAAAAGGTTGACATCACTTGTTAGAAGAGCAA  574
                                                            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  174  ------------------------------------------------GTTGACATCACTTGTTAGAAGAGCAA  199

Query  575  CTCTGAAAGAAAACGAGCAAATTCCAAAATATGAAAAGATTCACAATTTCAAGGTGCATACATTCAGAGGGCCA  648
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  200  CTCTGAAAGAAAACGAGCAAATTCCAAAATATGAAAAGATTCACAATTTCAAGGTGCATACATTCAGAGGGCCA  273

Query  649  CACTGGTGTGAATACTGTGCCAACTTTATGTGGGGTCTCATTGCTCAGGGAGTGAAATGTGCAGATTGTGGTTT  722
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  274  CACTGGTGTGAATACTGTGCCAACTTTATGTGGGGTCTCATTGCTCAGGGAGTGAAATGTGCAGATTGTGGTTT  347

Query  723  GAATGTTCATAAGCAGTGTTCCAAGATGGTCCCAAATGACTGTAAGCCAGACTTGAAGCATGTCAAAAAGGTGT  796
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  348  GAATGTTCATAAGCAGTGTTCCAAGATGGTCCCAAATGACTGTAAGCCAGACTTGAAGCATGTCAAAAAGGTGT  421

Query  797  ACAGCTGTGACCTTACGACGCTCGTGAAAGCACATACCACTAAGCGGCCAATGGTGGTAGACATGTGCATCAGG  870
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  422  ACAGCTGTGACCTTACGACGCTCGTGAAAGCACATACCACTAAGCGGCCAATGGTGGTAGACATGTGCATCAGG  495

Query  871  GAGATTGAGTCTAGAGGTCTTAATTCTGAAGGACTATACCGAGTATCAGGATTTAGTGACCTAATTGAAGATGT  944
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  496  GAGATTGAGTCTAGAGGTCTTAATTCTGAAGGACTATACCGAGTATCAGGATTTAGTGACCTAATTGAAGATGT  569

Query  945  CAAGATGGCTTTCGACAGAGATGGTGAGAAGGCAGATATTTCTGTGAACATGTATGAAGATATCAACATTATCA  1018
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  570  CAAGATGGCTTTCGACAGAGATGGTGAGAAGGCAGATATTTCTGTGAACATGTATGAAGATATCAACATTATCA  643

Query 1019  CTGGTGCACTTAAACTGTACTTCAGGGATTTGCCAATTCCACTCATTACATATGATGCCTACCCTAAGTTTATA  1092
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  644  CTGGTGCACTTAAACTGTACTTCAGGGATTTGCCAATTCCACTCATTACATATGATGCCTACCCTAAGTTTATA  717

Query 1093  GAATCTGCCAAAATTATGGATCCGGATGAGCAATTGGAAACCCTTCATGAAGCACTGAAACTACTGCCACCTGC  1166
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  718  GAATCTGCCAAAATTATGGATCCGGATGAGCAATTGGAAACCCTTCATGAAGCACTGAAACTACTGCCACCTGC  791

Query 1167  TCACTGCGAAACCCTCCGGTACCTCATGGCACATCTAAAGAGAGTGACCCTCCACGAAAAGGAGAATCTTATGA  1240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  792  TCACTGCGAAACCCTCCGGTACCTCATGGCACATCTAAAGAGAGTGACCCTCCACGAAAAGGAGAATCTTATGA  865

Query 1241  ATGCAGAGAACCTTGGAATCGTCTTTGGACCCACCCTTATGAGATCTCCAGAACTAGACGCCATGGCTGCATTG  1314
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  866  ATGCAGAGAACCTTGGAATCGTCTTTGGACCCACCCTTATGAGATCTCCAGAACTAGACGCCATGGCTGCATTG  939

Query 1315  AATGATATACGGTATCAGAGACTGGTGGTGGAGCTGCTTATCAAAAACGAAGACATTTTATTT  1377
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  940  AATGATATACGGTATCAGAGACTGGTGGTGGAGCTGCTTATCAAAAACGAAGACATTTTATTT  1002