Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000474759
• Subject: NM_001371514.1
• Aligned Length: 1484
• Identities: 1321
• Gaps: 163

Alignment

Query    1  ATGGCCCTGACCCTGTTTGATACAGATGAATATAGACCTCCTGTTTGGAAATCTTACTTATATCAGCTACAACA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
Sbjct    1  ATGGCCCTGACCCTGTTTGATACAGATGAATATAGACCTCCTGTTTGGAAATCTTACT----------------  58

Query   75  GGAAGCCCCTCATCCTCGAAGAATTACCTGTACTTGCGAGGTGGAAAACAGACCAAAGTATTATGGAAGAGA--  146
                                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||  
Sbjct   59  ----------------------------------------GTGGAAAACAGACCAAAGTATTATGGAAGAGAAT  92

Query  147  --------------------------------------------------------------------------  146
                                                                                      
Sbjct   93  GGAGTTTCGCTTTTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGCGATCTCGGTTCACTATAACCTCCACCTCCCGGG  166

Query  147  -------------------------------GTTTCATGGCATGATCTCCAGAGAAGCAGCCGACCAGCTCTTG  189
                                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  167  TTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAGGTTTCATGGCATGATCTCCAGAGAAGCAGCCGACCAGCTCTTG  240

Query  190  ATTGTGGCTGAGGGGAGCTACCTCATCCGGGAGAGCCAGCGGCAGCCAGGGACCTACACTTTGGCTTTAAGATT  263
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  241  ATTGTGGCTGAGGGGAGCTACCTCATCCGGGAGAGCCAGCGGCAGCCAGGGACCTACACTTTGGCTTTAAGATT  314

Query  264  TGGAAGTCAAACCAGAAACTTCAGGCTCTACTACGATGGCAAGCACTTTGTTGGGGAGAAACGCTTTGAGTCCA  337
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  315  TGGAAGTCAAACCAGAAACTTCAGGCTCTACTACGATGGCAAGCACTTTGTTGGGGAGAAACGCTTTGAGTCCA  388

Query  338  TCCACGATCTGGTGACTGATGGCTTGATTACTCTCTATATTGAAACCAAGGCAGCAGAATACATTGCCAAGATG  411
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  389  TCCACGATCTGGTGACTGATGGCTTGATTACTCTCTATATTGAAACCAAGGCAGCAGAATACATTGCCAAGATG  462

Query  412  ACGATAAACCCAATTTATGAGCACGTAGGATACACAACCTTAAACAGAGAGCCAGCATACAAAAAACATATGCC  485
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  463  ACGATAAACCCAATTTATGAGCACGTAGGATACACAACCTTAAACAGAGAGCCAGCATACAAAAAACATATGCC  536

Query  486  AGTCCTGAAAGAGACACATGATGAGAGAGATTCTACAGGCCAGGATGGGGTGTCAGAGAAAAGGTTGACATCAC  559
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  537  AGTCCTGAAAGAGACACATGATGAGAGAGATTCTACAGGCCAGGATGGGGTGTCAGAGAAAAGGTTGACATCAC  610

Query  560  TTGTTAGAAGAGCAACTCTGAAAGAAAACGAGCAAATTCCAAAATATGAAAAGATTCACAATTTCAAGGTGCAT  633
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  611  TTGTTAGAAGAGCAACTCTGAAAGAAAACGAGCAAATTCCAAAATATGAAAAGATTCACAATTTCAAGGTGCAT  684

Query  634  ACATTCAGAGGGCCACACTGGTGTGAATACTGTGCCAACTTTATGTGGGGTCTCATTGCTCAGGGAGTGAAATG  707
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  685  ACATTCAGAGGGCCACACTGGTGTGAATACTGTGCCAACTTTATGTGGGGTCTCATTGCTCAGGGAGTGAAATG  758

Query  708  TGCAGATTGTGGTTTGAATGTTCATAAGCAGTGTTCCAAGATGGTCCCAAATGACTGTAAGCCAGACTTGAAGC  781
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  759  TGCAGATTGTGGTTTGAATGTTCATAAGCAGTGTTCCAAGATGGTCCCAAATGACTGTAAGCCAGACTTGAAGC  832

Query  782  ATGTCAAAAAGGTGTACAGCTGTGACCTTACGACGCTCGTGAAAGCACATACCACTAAGCGGCCAATGGTGGTA  855
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  833  ATGTCAAAAAGGTGTACAGCTGTGACCTTACGACGCTCGTGAAAGCACATACCACTAAGCGGCCAATGGTGGTA  906

Query  856  GACATGTGCATCAGGGAGATTGAGTCTAGAGGTCTTAATTCTGAAGGACTATACCGAGTATCAGGATTTAGTGA  929
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  907  GACATGTGCATCAGGGAGATTGAGTCTAGAGGTCTTAATTCTGAAGGACTATACCGAGTATCAGGATTTAGTGA  980

Query  930  CCTAATTGAAGATGTCAAGATGGCTTTCGACAGAGATGGTGAGAAGGCAGATATTTCTGTGAACATGTATGAAG  1003
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  981  CCTAATTGAAGATGTCAAGATGGCTTTCGACAGAGATGGTGAGAAGGCAGATATTTCTGTGAACATGTATGAAG  1054

Query 1004  ATATCAACATTATCACTGGTGCACTTAAACTGTACTTCAGGGATTTGCCAATTCCACTCATTACATATGATGCC  1077
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1055  ATATCAACATTATCACTGGTGCACTTAAACTGTACTTCAGGGATTTGCCAATTCCACTCATTACATATGATGCC  1128

Query 1078  TACCCTAAGTTTATAGAATCTGCCAAAATTATGGATCCGGATGAGCAATTGGAAACCCTTCATGAAGCACTGAA  1151
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1129  TACCCTAAGTTTATAGAATCTGCCAAAATTATGGATCCGGATGAGCAATTGGAAACCCTTCATGAAGCACTGAA  1202

Query 1152  ACTACTGCCACCTGCTCACTGCGAAACCCTCCGGTACCTCATGGCACATCTAAAGAGAGTGACCCTCCACGAAA  1225
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1203  ACTACTGCCACCTGCTCACTGCGAAACCCTCCGGTACCTCATGGCACATCTAAAGAGAGTGACCCTCCACGAAA  1276

Query 1226  AGGAGAATCTTATGAATGCAGAGAACCTTGGAATCGTCTTTGGACCCACCCTTATGAGATCTCCAGAACTAGAC  1299
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1277  AGGAGAATCTTATGAATGCAGAGAACCTTGGAATCGTCTTTGGACCCACCCTTATGAGATCTCCAGAACTAGAC  1350

Query 1300  GCCATGGCTGCATTGAATGATATACGGTATCAGAGACTGGTGGTGGAGCTGCTTATCAAAAACGAAGACATTTT  1373
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1351  GCCATGGCTGCATTGAATGATATACGGTATCAGAGACTGGTGGTGGAGCTGCTTATCAAAAACGAAGACATTTT  1424

Query 1374  ATTT  1377
            ||||
Sbjct 1425  ATTT  1428