Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000474788
• Subject: XM_017008415.1
• Aligned Length: 2348
• Identities: 2231
• Gaps: 86

Alignment

Query    1  ATGGGAAATGGTTCAGTGAAACCTAAACATTCTAAGCACCCAGATGGACACTCTGGGAACCTCACCACTGATGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGAAATGGTTCAGTGAAACCTAAACATTCTAAGCACCCAGATGGACACTCTGGGAACCTCACCACTGATGC  74

Query   75  TCTGCGGAACAAGGTGACAGAGCTGGAGAGAGAGTTGAGGAGGAAGGATGCTGAGATCCAGGAGCGGGAGTACC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCTGCGGAACAAGGTGACAGAGCTGGAGAGAGAGTTGAGGAGGAAGGATGCTGAGATCCAGGAGCGGGAGTACC  148

Query  149  ATTTGAAGGAGCTGCGGGAGCAGCTGTCGAAGCAGACTGTGGCCATTGCTGAACTCACAGAGGAGCTCCAGAAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATTTGAAGGAGCTGCGGGAGCAGCTGTCGAAGCAGACTGTGGCCATTGCTGAACTCACAGAGGAGCTCCAGAAC  222

Query  223  AAGTGCATCCAGCTGAACAAGCTGCAGGATGTGGTGCATATGCAGGGAGGAAGCCCGCTTCAGGCCTCTCCAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAGTGCATCCAGCTGAACAAGCTGCAGGATGTGGTGCATATGCAGGGAGGAAGCCCGCTTCAGGCCTCTCCAGA  296

Query  297  TAAAGTGCCTCTTGAGGTCCACCGGAAGACCTCTGGATTGGTCTCTCTCCATAGCAGGAGGGGAGCAAAGGCTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TAAAGTGCCTCTTGAGGTCCACCGGAAGACCTCTGGATTGGTCTCTCTCCATAGCAGGAGGGGAGCAAAGGCTG  370

Query  371  GCGTGTCTGCTGAGCCAACAACCCGGACCTATGACCTGAACAAACCCCCTGAATTTTCCTTTGAGAAAGCAAGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCGTGTCTGCTGAGCCAACAACCCGGACCTATGACCTGAACAAACCCCCTGAATTTTCCTTTGAGAAAGCAAGA  444

Query  445  GTCAGAAAAGACTCCAGTGAGAAGAAGCTCATTACAGATGCCCTTAATAAAAATCAGTTTCTGAAAAGACTGGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTCAGAAAAGACTCCAGTGAGAAGAAGCTCATTACAGATGCCCTTAATAAAAATCAGTTTCTGAAAAGACTGGA  518

Query  519  TCCTCAGCAGATCAAAGACATGGTGGAATGCATGTATGGGAGAAACTATCAGCAAGGGAGTTACATTATTAAGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCCTCAGCAGATCAAAGACATGGTGGAATGCATGTATGGGAGAAACTATCAGCAAGGGAGTTACATTATTAAGC  592

Query  593  AAGGAGAACCAGGAAACCATATCTTTGTGCTGGCAGAGGGTCGACTAGAGGTGTTCCAAGGGGAGAAATTGCTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAGGAGAACCAGGAAACCATATCTTTGTGCTGGCAGAGGGTCGACTAGAGGTGTTCCAAGGGGAGAAATTGCTG  666

Query  667  TCCTCCATCCCTATGTGGACCACATTTGGGGAGCTTGCCATTTTATAC-ACTGTACAAGGACTGCCTCTGTGAA  739
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCCTCCATCCCTATGTGGACCACATTTGGGGAGCTTGCCATTTTATACAATTGTACAAGGACTGCCTCTGTGAA  740

Query  740  AGCTATTACCAATGTTAAAACATGGGCACTAGATCGAGAGGTATTCCAGAATATAATGGAGGAGGGACAGTCCA  813
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||.|||
Sbjct  741  AGCTATTACCAATGTTAAAACATGGGCACTAGATCGAGAGGTATTCCAGAATATAAT-GAGGA-GGACAGCCCA  812

Query  814  AGCTAGAGATGAACAATACAGAAACTTCCTCAGAAGTGTATCCTTGCTGAAGAATTTACCTGAAGATAAATTAA  887
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  813  AGCTAGAGATGAACAATACAGAAACTTCCTCAGAAGTGTATCCTTGCTGAAGAATTTACCTGAAGATAAATTAA  886

Query  888  CCAAGATCATTGACTGCTTGGAAGTGGAATACTATGACAAAGGAGATTACATCATTAGAGAGGGCGAGGAAGGA  961
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  887  CCAAGATCATTGACTGCTTGGAAGTGGAATACTATGACAAAGGAGATTACATCATTAGAGAGGGCGAGGAAGGA  960

Query  962  AGTACCTTTTTCATTTTGGCAAAAGGAAAGGTAAAAGTAACACAGAGCACAGAAGGCCATGATCAACCACAGCT  1035
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961  AGTACCTTTTTCATTTTGGCAAAAGGAAAGGTAAAAGTAACACAGAGCACAGAAGGCCATGATCAACCACAGCT  1034

Query 1036  GATAAAAACACTGCAGAAAGGAGAATACTTTGGAGAAAAAGCTCTTATCAGTGATGATGTCAGGTCAGCTAACA  1109
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1035  GATAAAAACACTGCAGAAAGGAGAATACTTTGGAGAAAAAGCTCTTATCAGTGATGATGTCAGGTCAGCTAACA  1108

Query 1110  TTATTGCTGAAGAAAATGATGTTGCATGCCTGGTTATAGATCGAGAAACATTCAACCAAACTGTCGGTACATTT  1183
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1109  TTATTGCTGAAGAAAATGATGTTGCATGCCTGGTTATAGATCGAGAAACATTCAACCAAACTGTCGGTACATTT  1182

Query 1184  GAAGAGCTGCAAAAATACCTTGAAGGATATGTGGCAAACCTGAACCGTGATGATGAAAAAAGACATGCGAAGCG  1257
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1183  GAAGAGCTGCAAAAATACCTTGAAGGATATGTGGCAAACCTGAACCGTGATGATGAAAAAAGACATGCGAAGCG  1256

Query 1258  GTCCATGTCTAACTGGAAGCTGTCCAAAGCACTCTCTCTGGAAATGATTCAGCTGAAGGAGAAGGTGGCCAGAT  1331
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1257  GTCCATGTCTAACTGGAAGCTGTCCAAAGCACTCTCTCTGGAAATGATTCAGCTGAAGGAGAAGGTGGCCAGAT  1330

Query 1332  TTTCCTCATCATCCCCATTCCAGAACCTTGAGATTATTGCAACACTGGGCGTTGGTGGGTTCGGAAGAGTTGAG  1405
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1331  TTTCCTCATCATCCCCATTCCAGAACCTTGAGATTATTGCAACACTGGGCGTTGGTGGGTTCGGAAGAGTTGAG  1404

Query 1406  CTTGTTAAAGTAAAAAATGAGAATGTTGCTTTTGCTATGAAGTGTATAAGGAAGAAGCACATAGTTGACACCAA  1479
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1405  CTTGTTAAAGTAAAAAATGAGAATGTTGCTTTTGCTATGAAGTGTATAAGGAAGAAGCACATAGTTGACACCAA  1478

Query 1480  GCAGCAGGAGCATGTCTACTCAGAGAAGAGATTCCTAGAGGAGCTGTGCTCTCCATTTCATTGTGAATTTATAT  1553
            ||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||| |||||||||||.||||||
Sbjct 1479  GCAGCAGGAGCATGTCTACTCAGAGAAGAGGATCCTAGAGGAGCTGTGCTCTCCA-TTCATTGTGAAATTATAT  1551

Query 1554  CGTACTTTCAAGGACAATAAGTATGTATACATGCTTCTGGAGCNNTGCTAGGNTGGGGAGCTCTGGAGTATATT  1627
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||...||||..|.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1552  CGTACTTTCAAGGACAATAAGTATGTATACATGCTTCTGGAGGCCTGCTTAGGTGGGGAGCTCTGGAGTATATT  1625

Query 1628  AAGGGACAGAGGCAGCTTTGATGAACCCACCTCCAAATTCTGCGTTGCTTGTGTGACAGAAGCATTTGATTACC  1701
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626  AAGGGACAGAGGCAGCTTTGATGAACCCACCTCCAAATTCTGCGTTGCTTGTGTGACAGAAGCATTTGATTACC  1699

Query 1702  TGCATCGACTAGGTATTATCTACAGAGACTTGAAACCAGAAAACTTAATTCTAGATGCTGAGGGTTACCTTAAA  1775
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1700  TGCATCGACTAGGTATTATCTACAGAGACTTGAAACCAGAAAACTTAATTCTAGATGCTGAGGGTTACCTTAAA  1773

Query 1776  TTGGTTGACTTTGGATTTGCGAAGAAAATAGGGTCTGGACAGAAAACATGGACATTCTGTGGGACTCCAGAATA  1849
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1774  TTGGTTGACTTTGGATTTGCGAAGAAAATAGGGTCTGGACAGAAAACATGGACATTCTGTGGGACTCCAGAATA  1847

Query 1850  TGTAGCTCCTGAAGTCATTCTCAACAAGGGACATGACTTCAGTGTGGATTTCTGGTCACTGGGAATTCTAGTGT  1923
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1848  TGTAGCTCCTGAAGTCATTCTCAACAAGGGACATGACTTCAGTGTGGATTTCTGGTCACTGGGAATTCTAGTGT  1921

Query 1924  ATGAGCTCCTAACGGGCAACCCACCCTTTTCTGGGGTTGACCAAATGATGACCTACAATTTGATTCTCAAAGGA  1997
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1922  ATGAGCTCCTAACGGGCAACCCACCCTTTTCTGGGGTTGACCAAATGATGACCTACAATTTGATTCTCAAAGGA  1995

Query 1998  ATTGAAAAAATGGATTTTCCCAGGAAGATAACACGACGACCTGAGGATTTGATTCGGAGGCTTTGCAGGCAAAA  2071
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1996  ATTGAAAAAATGGATTTTCCCAGGAAGATAACACGACGACCTGAGGATTTGATTCGGAGGCTTTGCAGGCAAAA  2069

Query 2072  TCCAACAGAAAGGCTGGGAAATCTGAAGAATGGAATAAATGACATTAAGAAACACAGGTGGTTAAATGGTTTTA  2145
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2070  TCCAACAGAAAGGCTGGGAAATCTGAAGAATGGAATAAATGACATTAAGAAACACAGGTGGTTAAATGGTTTTA  2143

Query 2146  ATTGGGAGGGACTGAAAGCACGGAGCCTTCCATCACCTTTGCAAAGAGAGCTCAAGGGA---------------  2204
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.| |..|.|               
Sbjct 2144  ATTGGGAGGGACTGAAAGCACGGAGCCTTCCATCACCTTTGCAAAGAGAGGT-ATTGTATTTATTATATTACTT  2216

Query 2205  ------------CCCATAGAT-----------CACAGCTACTTTGACAAATATCCTCCTGAAAAGGGAATGCCT  2255
                        ||||..|||           |||||  |.|||   |.||.|           |.|.|||..|
Sbjct 2217  TTTTATTTTTTTCCCAGGGATTTGTTTTTGTACACAG--ATTTT---AGATGT-----------GTGTATGTAT  2274

Query 2256  ----CCAGATGAGCTATCAGGCTGGG---------ATAAAG--------ACTTC  2288
                |||.|..||.|.|     ||||         .|||||        |.|| 
Sbjct 2275  ATGCCCATAACAGATTT-----TGGGTGTTTTTTTTTAAAGCAGTTTTTATTT-  2322