Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000474831
• Subject: XM_011510752.2
• Aligned Length: 1547
• Identities: 1416
• Gaps: 121

Alignment

Query    1  ATGTATACCAGTCATGAAGATATTGGGTATGATTTTGAAGATGGCCCCAAAGACAAAAAGACACTGAAGCCCCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTATACCAGTCATGAAGATATTGGGTATGATTTTGAAGATGGCCCCAAAGACAAAAAGACACTGAAGCCCCA  74

Query   75  CCCAAACATTGATGGCGGATGGGCTTGGATGATGGTGCTCTCCTCTTTCTTTGTGCACATCCTCATCATGGGCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCCAAACATTGATGGCGGATGGGCTTGGATGATGGTGCTCTCCTCTTTCTTTGTGCACATCCTCATCATGGGCT  148

Query  149  CCCAGATGGCCCTGGGTGTCCTCAACGTGGAATGGCTGGAAGAATTCCACCAGAGCCGCGGCCTGACCGCCTGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCCAGATGGCCCTGGGTGTCCTCAACGTGGAATGGCTGGAAGAATTCCACCAGAGCCGCGGCCTGACCGCCTGG  222

Query  223  GTCAGCTCCCTCAGCATGGGCATCACCTTGATAGTGGGCCCTTTCATCGGCTTGTTCATTAACACCTGTGGGTG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTCAGCTCCCTCAGCATGGGCATCACCTTGATAGTGGGCCCTTTCATCGGCTTGTTCATTAACACCTGTGGGTG  296

Query  297  CCGCCAGACTGCGATCATTGGAGGGCTCGTCAACTCCCTGGGCTGGGTGTTGAGTGCCTATGCTGCAAACGTGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCGCCAGACTGCGATCATTGGAGGGCTCGTCAACTCCCTGGGCTGGGTGTTGAGTGCCTATGCTGCAAACGTGC  370

Query  371  ATTATCTCTTCATTACTTTTGGAGTCGCAGCTGGCCTGGGCAGCGGGATGGCCTACCTGCCAGCGGTGGTCATG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATTATCTCTTCATTACTTTTGGAGTCGCAGCTGGCCTGGGCAGCGGGATGGCCTACCTGCCAGCGGTGGTCATG  444

Query  445  GTGGGCAGGTATTTCCAGAAGAGACGCGCCCTCGCCCAGGGCCTCAGCACCACGGGGACCGGATTCGGTACGTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTGGGCAGGTATTTCCAGAAGAGACGCGCCCTCGCCCAGGGCCTCAGCACCACGGGGACCGGATTCGGTACGTT  518

Query  519  CCTAATGACTGTGCTGCTGAAGTACCTGTGCGCAGAGTACGGCTGGAGGAATGCCATGTTGATCCAAGGTGCCG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCTAATGACTGTGCTGCTGAAGTACCTGTGCGCAGAGTACGGCTGGAGGAATGCCATGTTGATCCAAGGTGCCG  592

Query  593  TTTCCCTAAACCTGTGTGTTTGTGGGGCGCTCATGAGGCCCCTCTCTCCTGGTAAAAACCCAAACGACCCAGGA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTTCCCTAAACCTGTGTGTTTGTGGGGCGCTCATGAGGCCCCTCTCTCCTGGTAAAAACCCAAACGACCCAGGA  666

Query  667  GAGAAAGATGTGCGTGGCCTGCCAGCGCACTCCACAGAATCTGTGAAGTCAACTGGACAGCAGGGAAGAACAGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGAAAGATGTGCGTGGCCTGCCAGCGCACTCCACAGAATCTGTGAAGTCAACTGGACAGCAGGGAAGAACAGA  740

Query  741  AGAGAAGGATGGTGGGCTCGGGAACGAGGAGACCCTCTGCGACCTGCAAGCCCAGGAGTGCCCCGATCAGGCCG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGAGAAGGATGGTGGGCTCGGGAACGAGGAGACCCTCTGCGACCTGCAAGCCCAGGAGTGCCCCGATCAGGCCG  814

Query  815  GGCACAGGAAGAACATGTGTGCCCTCCGGATTCTGAAGACTGTCAGCTGGCTCACCATGAGAGTCAGGAAGGGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGCACAGGAAGAACATGTGTGCCCTCCGGATTCTGAAGACTGTCAGCTGGCTCACCATGAGAGTCAGGAAGGGC  888

Query  889  TTCGAGGACTGGTATTCGGGCTACTTTGGGACAGCCTCTCTATTTACAAATCGAATGTTTGTAGCCTTTATTTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTCGAGGACTGGTATTCGGGCTACTTTGGGACAGCCTCTCTATTTACAAATCGAATGTTTGTAGCCTTTATTTT  962

Query  963  CTGGGCTTTGTTTGCATACAGCAGCTTTGTCATCCCCTTCATTCACCTCCCAGAAATCGTCAATTTGTATAACT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTGGGCTTTGTTTGCATACAGCAGCTTTGTCATCCCCTTCATTCACCTCCCAGAAATCGTCAATTTGTATAACT  1036

Query 1037  TATCGGAGCAAAACGACGTTTTCCCTCTGACGTCAATTATAGCAATAGTTCACATCTTTGGAAAAGTGATCCTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TATCGGAGCAAAACGACGTTTTCCCTCTGACGTCAATTATAGCAATAGTTCACATCTTTGGAAAAGTGATCCTG  1110

Query 1111  GGCGTCATAGCCGACTTGCCTTGCATTAGTGTTTGGAATGTCTTCCTGTTGGCCAACTTCACCCTTGTCCTCAG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGCGTCATAGCCGACTTGCCTTGCATTAGTGTTTGGAATGTCTTCCTGTTGGCCAACTTCACCCTTGTCCTCAG  1184

Query 1185  TATTTTTATTCTGCCGTTGATGCACACGTACGCTGGCCTGGCGGTCATCTGTGCGCTGATAGGGTTTTCCAGTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TATTTTTATTCTGCCGTTGATGCACACGTACGCTGGCCTGGCGGTCATCTGTGCGCTGATAGGGTTTTCCAGTG  1258

Query 1259  GTTATTTCTCCCTAATGCCCGTAGTGACTGAAGACTTGGTTGGCATTGAACACCTGGCCAATGCCTACGGCATC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GTTATTTCTCCCTAATGCCCGTAGTGACTGAAGACTTGGTTGGCATTGAACACCTGGCCAATGCCTACGGCATC  1332

Query 1333  ATCATCTGTGCTAATGGCATCTCTGCATTGCTGGGACCACCTTTTGCAGG---------GTGGAT--CTATGAC  1395
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ...|||  |.||||.
Sbjct 1333  ATCATCTGTGCTAATGGCATCTCTGCATTGCTGGGACCACCTTTTGCAGGCCAAGAAGCCAAGATTGCAATGAG  1406

Query 1396  AT-CACGCAAAAATATGATTTTTCC-TTCTACATATGTG----GTTTGCTTTACATGATAGGAATACTCTTTTT  1463
            || ||.||.|             || ||     ||||||    ||..|||   || ||.               
Sbjct 1407  ATGCAAGCCA-------------CCGTT-----TATGTGCACTGTGGGCT---CA-GAG---------------  1443

Query 1464  ACTTATTCAGCCGTGCATTCGAATTATAGAACAATCCAGAAGAAAATACATGGATGGTGCACATGTT  1530
                                                                               
Sbjct 1444  -------------------------------------------------------------------  1443