Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000474851
- Subject:
- NM_153065.3
- Aligned Length:
- 2305
- Identities:
- 2019
- Gaps:
- 35
Alignment
Query 1 ATGCTTGCGGACCTCGGCTTAATCGGAACCATAGGCGAGGATGACGAGGTGCCGGTGGAGCCCGAGTCTGACTC 74
|||||.|||||.||||||||.|||.|.|||||.||||||.||||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1 ATGCTGGCGGAGCTCGGCTTCATCCGGACCATCGGCGAGAATGACGAGGTGCCGGTTGAGCCCGAGTCGGACTC 74
Query 75 CGGGGACGAGGAAGAGGAGGGGCCCATTGTGCTGGGCAGACGA-CAAAAAGCTTTGGGGAAGAACCGCAGTGCT 147
|||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||.| |.| ||.|||||.|||..||||||||||||||||
Sbjct 75 CGGAGACGAGGAGGAGGAGGGACCCATTGTGCTGGGCCG-CAAGCAGAAAGCCTTGCAGAAGAACCGCAGTGCT 147
Query 148 GATTTCAACCCTGATTTCGTTTTCACTGAGAAGGAGGGGACGTACGATGGCAGCTGGGCCCTGGCTGATGTCAT 221
||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|.|||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 148 GACTTCAACCCTGACTTTGTTTTCACTGAGAAGGAGGGCATGTATGATGGCAGCTGGGCCCTGGCTGATGTCAT 221
Query 222 GAGCCAACTCAAGAAGAAGAGGGCAGCCACTACATTAGATGAGAAGATTGAGAAAGTTCGAAAGAAAAGGAAAA 295
||||||.||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||.||||.||||||..
Sbjct 222 GAGCCAGCTCAAGAAGAAGCGGGCAGCCACTACACTAGATGAGAAGATTGAGAAAGTCCGGAAGAGAAGGAAGG 295
Query 296 CAGAGGATAAAGAAGCCAAGTCTGGGAAGTTGGAAAAGGAGAAAGAAGCAAAGGAAGGCTCTGAACCAAAGGAG 369
|||||||.||.||||||||||||||||||.||| ||||||||||||...|||.||.||||||.|..||||.|
Sbjct 296 CAGAGGACAAGGAAGCCAAGTCTGGGAAGGTGG---AGGAGAAAGAAGGCCAGGCAGACTCTGACCTGAAGGGG 366
Query 370 CAGGAAGACCTTCAAGAGAAT---------GATGAGGAAGGCTCAGAAGATGAAGCCTCGGAGACTGACTACTC 434
||| |||||| |||||||.||||||..|.|||||||.|||.||||||||||||||
Sbjct 367 CAG------------GAGAATCCGGGTGAGGATGAGGCAGGCTCCAAGGATGAAGACTCTGAGACTGACTACTC 428
Query 435 ATCAGCTGATGAGAACATCCTCACCAAAGCAGATACACTCAAAGTAAAGGATCGGAAGAAGAAGAAGAAGAAAG 508
.||.|..||||||.|.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||| ||||||||||||||||||.|
Sbjct 429 CTCTGAGGATGAGGAAATCCTCACCAAAGCAGACACACTCAAAGTGAAGGA---GAAGAAGAAGAAGAAGAAGG 499
Query 509 GACAGGAAGCAGGAGGATTTTTTGAAGATGCATCTCAGTACGATGAAAACCTCTCGTTCCAGGACATGAACCTT 582
|.||||.||||||||||||.||||||||||||||..||||.||..|||.|||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct 500 GCCAGGCAGCAGGAGGATTCTTTGAAGATGCATCCGAGTATGACAAAAGCCTGTCCTTCCAGGACATGAACCTC 573
Query 583 TCCCGCCCTCTTCTGAAGGCCATTACAGCCATGGGCTTCAAGCAGCCCACCCCGATCCAGAAGGCGTGCATACC 656
|||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||
Sbjct 574 TCCCGGCCCCTCCTGAAGGCCATTACAGCCATGGGCTTCAAGCAGCCCACGCCAATCCAGAAGGCGTGTATCCC 647
Query 657 TGTGGGTCTATTGGGGAAGGACATCTGTGCCTGTGCAGCCACTGGGACAGGTAAAACTGCCGCCTTTGCCCTGC 730
|||||||||..||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||
Sbjct 648 TGTGGGTCTGCTGGGGAAGGACATCTGCGCCTGTGCAGCCACTGGGACAGGCAAAACTGCAGCCTTTGCACTGC 721
Query 731 CTGTTTTGGAGCGTCTGATTTATAAACCCCGCCAGGCTCCAGTCACCCGCGTGCTGGTGCTAGTGCCCACCCGA 804
|.||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||.|||||||.||||||||||||||.||.|||||..||
Sbjct 722 CCGTCTTGGAGCGTCTGATCTACAAGCCCCGCCAGGCTGCAGTCACTCGCGTGCTGGTGCTGGTCCCCACGAGA 795
Query 805 GAGCTGGGCATCCAGGTGCACTCTGTCACCAGACAGCTGGCCCAGTTCTGCAACATCACCACCTGCCTGGCTGT 878
||||||||||||||.||||||||||||||||..|||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||
Sbjct 796 GAGCTGGGCATCCAAGTGCACTCTGTCACCAAGCAGCTGGCCCAGTTCTGCAGCATCACTACCTGCCTGGCTGT 869
Query 879 GGGCGGCTTGGATGTGAAGTCTCAGGAAGCAGCTCTTCGGGCAGCGCCTGACATCCTCATCGCCACCCCAGGCC 952
|||.|||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.||||
Sbjct 870 GGGTGGCCTGGATGTGAAGTCTCAGGAAGCCGCTCTTCGGGCAGCACCAGACATCCTCATTGCCACACCTGGCC 943
Query 953 GGCTCATCGATCACCTCCACAACTGCCCTTCCTTCCACCTGAGCAGCATCGAGGTGCTCATCCTGGACGAGGCT 1026
||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||.||||.||||||
Sbjct 944 GGCTCATCGACCACCTCCATAACTGCCCCTCCTTCCACCTGAGCAGCATTGAAGTGCTCATCTTGGATGAGGCT 1017
Query 1027 GACAGGATGCTGGATGAGTACTTTGAGGAGCAGATGAAGGAGATCATCCGAATGTGTTCCCACCACCGCCAGAC 1100
||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1018 GACAGGATGCTGGATGAGTATTTCGAGGAGCAGATGAAGGAGATTATCCGAATGTGTTCCCACCACCGCCAGAC 1091
Query 1101 CATGCTCTTCTCGGCCACCATGACAGACGAGGTGAAAGATCTGGCTTCTGTCTCCTTGAAGAATCCTGTCCGGA 1174
|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1092 CATGCTCTTCTCGGCCACCATGACAGATGAGGTGAAAGATCTGGCTTCGGTCTCCTTAAAGAATCCTGTGCGGA 1165
Query 1175 TATTTGTGAACAGCAACACAGATGTGGCTCCCTTTCTGCGGCAGGAGTTCATCCGGATCCGGCCTAATCGTGAA 1248
|||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||.|.|||
Sbjct 1166 TATTTGTGAACAGCAACACAGATGTCGCTCCCTTCCTGCGGCAAGAGTTCATACGGATCCGGCCTAATAGGGAA 1239
Query 1249 GGAGACCGGGAAGCCATCGTGGCAGCTTTGTTGACGAGGACCTTCACTGACCATGTGATGCTGTTCACGCAAAC 1322
||.||||||||.|||||.|||||||||.||.|||.|||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||
Sbjct 1240 GGGGACCGGGAGGCCATTGTGGCAGCTCTGCTGATGAGAACCTTCACTGACCACGTGATGCTCTTCACCCAGAC 1313
Query 1323 CAAGAAGCAGGCCCACCGCATGCACATCCTCCTGGGGCTCATGGGGCTGCAGGTGGGTGAGCTCCATGGCAACT 1396
|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 1314 CAAGAAGCAGGCCCATCGCATGCACATCCTCCTGGGGCTGCTGGGGCTGCAGGTGGGCGAGCTCCACGGCAACT 1387
Query 1397 TGTCACAGACGCAGCGGCTGGAGGCCCTCCGGCGTTTTAAGGATGAACAGATTGACATCCTCGTGGCCACTGAT 1470
||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1388 TGTCACAGACCCAGCGCCTGGAGGCCCTCCGGCGCTTTAAGGACGAACAGATTGACATCCTGGTGGCCACAGAT 1461
Query 1471 GTGGCAGCCCGTGGACTTGACATTGAGGGGGTCAAAACGGTAATCAACTTCACAATGCCTAATACCATCAAACA 1544
|||||||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||.||..|.|||||
Sbjct 1462 GTGGCAGCCCGCGGTCTTGACATTGAAGGAGTGAAAACAGTGATCAACTTCACCATGCCCAACACTGTTAAACA 1535
Query 1545 TTATGTCCACCGGGTGGGGCGAACAGCACGTGCTGGCAGGGCTGGGCGCTCAGTCTCTCTGGTGGGAGAAGATG 1618
.|||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||.|
Sbjct 1536 CTATGTGCACCGGGTGGGGCGGACGGCCCGTGCTGGCAGGGCTGGACGCTCTGTCTCCCTAGTGGGAGAGGAGG 1609
Query 1619 AGCGGAAGATGCTGAAGGAGATTGTAAAAGCTGCCAAGGCCCCTGTGAAGGCCAGGATACTTCCCCAAGATGTC 1692
||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||..||||.||||||||.|||||.
Sbjct 1610 AGCGGAAGATGCTGAAGGAGATCGTGAAGGCTGCCAAGGCGCCAGTGAAGGCTCGGATCCTTCCCCAGGATGTT 1683
Query 1693 ATCCTCAAATTCCGGGACAAGATTGAGAAAATGGAGAAAGATGTGTATGCAGTTCTGCAGCTAGAGGCGGAGGA 1766
||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1684 ATCCTCAAGTTCCGGGACAAGATTGAGAAATTGGAGAAAGATGTGTATGCAGTGCTGCAGCTGGAGGCGGAGGA 1757
Query 1767 AAAAGAGATGCAGCAGTCAGAAGCCCAGATCAATACAGCAAAGCGGCTCCTGGAGAAGGGGAAGGAGGCAGTGG 1840
||||||||||||||||||.|||||||||||..|.||||||.||||.|||.|.|..||.|||||.|||.|||..|
Sbjct 1758 AAAAGAGATGCAGCAGTCGGAAGCCCAGATTGACACAGCACAGCGACTCTTAGCCAAAGGGAAAGAGACAGCAG 1831
Query 1841 TCCAAGAGCCCGAGAGGAGCTGGTTCCAGACCAAAGAAGAGAGGAAGAAGGAGAAAATTGCCAAAGCTCTGCAG 1914
.|||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||
Sbjct 1832 ACCAGGAGCCTGAGAGGAGCTGGTTCCAGACCAAAGAAGAGAGGAAGAAGGAGAAGATTGCTAAGGCTCTACAG 1905
Query 1915 GAATTTGACTTGGCCTTAAGAGGAAAGAAGAAAAGGAAGAAGTTTATGAAGGATGCCAAAAAAAAGGGGGAGAT 1988
||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1906 GAGTTTGACTTGGCCTTAAGAGGAAAGAAGAAAAGGAAGAAGTTTATGAAGGATGCCAAGAAAAAGGGGGAGAT 1979
Query 1989 GACAGCAGAGGAAAGGTCTCAGTTTGAAATCCTCAAGGCGCAGATGTTTGCTGAACGGCTAGCGAAGAGGAATC 2062
|||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||||||||||
Sbjct 1980 GACGGCAGAGGAGAGGTCCCAGTTTGAAATCCTCAAGGCACAGATGTTTGCAGAGCGGCTGGCCAAGAGGAATC 2053
Query 2063 GCAGAGCCAAGCGGGCCCGAGCAATGCCCGAGGAGGAGCCAGTGAGAGGTCCTGCCAAGAAGCAAAAGCAGGGG 2136
|||||.|||||||.||.||.||||||||.|||||.||||| .|.|||.|||||.||.|||||.||||||..|
Sbjct 2054 GCAGAACCAAGCGAGCACGGGCAATGCCTGAGGACGAGCC---TACAGGCCCTGCTAAAAAGCAGAAGCAGCAG 2124
Query 2137 AAGAAATCTGTATTTGATGAAGAACTCACCAACACAAGCAAGAAGGCCCTGAAACAGTATCGAGCTAGCCCTTC 2210
.||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||
Sbjct 2125 CAGAAGTCTGTGTTTGATGAAGAACTCACCAACACAAGCAAGAAGGCCCTGAAACAGTATCGGGCTGGCCCTTC 2198
Query 2211 CTTTGAAGAAAGGAAACAGTTGGGCTTGCCCCACCAGAGACGAGGAGGAAACTTTAAATCTAAATCCAGATACA 2284
|||||||||.||||||||||..||..||||||.|||||| || ||||.|||||.||||||||.|||||.||||
Sbjct 2199 CTTTGAAGAGAGGAAACAGTCAGGTCTGCCCCGCCAGAG--GA-GAGGGAACTTCAAATCTAAGTCCAGGTACA 2269
Query 2285 AGAGGAGGAAG 2295
||||.|.||||
Sbjct 2270 AGAGAAAGAAG 2280