Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000474910
• Subject: NM_001243952.1
• Aligned Length: 2058
• Identities: 2037
• Gaps: 21

Alignment

Query    1  ---------------------ATGGTAACATCTTTAAATGAAGATAATGAAAGTGTAACTGTTGAATGGATAGA  53
                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGCCGAATACATCAAGCAATGGTAACATCTTTAAATGAAGATAATGAAAGTGTAACTGTTGAATGGATAGA  74

Query   54  AAATGGAGATACAAAAGGCAAAGAGATTGACCTGGAGAGCATCTTTTCACTTAACCCTGACCTTGTTCCTGATG  127
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AAATGGAGATACAAAAGGCAAAGAGATTGACCTGGAGAGCATCTTTTCACTTAACCCTGACCTTGTTCCTGATG  148

Query  128  AAGAAATTGAACCCAGTCCAGAAACACCTCCACCTCCAGCATCCTCAGCCAAAGTAAACAAAATTGTAAAGAAT  201
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAGAAATTGAACCCAGTCCAGAAACACCTCCACCTCCAGCATCCTCAGCCAAAGTAAACAAAATTGTAAAGAAT  222

Query  202  CGACGGACTGTAGCTTCTATTAAGAATGACCCTCCTTCAAGAGATAATAGAGTGGTTGGTTCAGCACGTGCACG  275
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGACGGACTGTAGCTTCTATTAAGAATGACCCTCCTTCAAGAGATAATAGAGTGGTTGGTTCAGCACGTGCACG  296

Query  276  GCCCAGTCAATTTCCTGAACAGTCTTCCTCTGCACAACAGAATGGTAGTGTTTCAGATATATCTCCAGTTCAAG  349
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCCCAGTCAATTTCCTGAACAGTCTTCCTCTGCACAACAGAATGGTAGTGTTTCAGATATATCTCCAGTTCAAG  370

Query  350  CTGCAAAAAAGGAATTTGGACCCCCTTCACGTAGAAAATCTAATTGTGTGAAAGAAGTAGAAAAACTGCAAGAA  423
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTGCAAAAAAGGAATTTGGACCCCCTTCACGTAGAAAATCTAATTGTGTGAAAGAAGTAGAAAAACTGCAAGAA  444

Query  424  AAACGAGAGAAAAGGAGATTGCAACAGCAAGAACTTAGAGAAAAAAGAGCCCAGGACGTTGATGCTACAAACCC  497
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAACGAGAGAAAAGGAGATTGCAACAGCAAGAACTTAGAGAAAAAAGAGCCCAGGACGTTGATGCTACAAACCC  518

Query  498  AAATTATGAAATTATGTGTATGATCAGAGACTTTAGAGGAAGTTTGGATTATAGACCATTAACAACAGCAGATC  571
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAATTATGAAATTATGTGTATGATCAGAGACTTTAGAGGAAGTTTGGATTATAGACCATTAACAACAGCAGATC  592

Query  572  CTATTGATGAACATAGGATATGTGTGTGTGTAAGAAAACGACCACTCAATAAAAAAGAAACTCAAATGAAAGAT  645
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTATTGATGAACATAGGATATGTGTGTGTGTAAGAAAACGACCACTCAATAAAAAAGAAACTCAAATGAAAGAT  666

Query  646  CTTGATGTAATCACAATTCCTAGTAAAGATGTTGTGATGGTACATGAACCAAAACAAAAAGTAGATTTAACAAG  719
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTTGATGTAATCACAATTCCTAGTAAAGATGTTGTGATGGTACATGAACCAAAACAAAAAGTAGATTTAACAAG  740

Query  720  GTACCTAGAAAACCAAACATTTCGTTTTGATTATGCCTTTGATGACTCAGCTCCTAATGAAATGGTTTACAGGT  793
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GTACCTAGAAAACCAAACATTTCGTTTTGATTATGCCTTTGATGACTCAGCTCCTAATGAAATGGTTTACAGGT  814

Query  794  TTACTGCTAGACCACTAGTGGAAACTATATTTGAAAGGGGAATGGCTACATGCTTTGCTTATGGGCAGACTGGA  867
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTACTGCTAGACCACTAGTGGAAACTATATTTGAAAGGGGAATGGCTACATGCTTTGCTTATGGGCAGACTGGA  888

Query  868  AGTGGAAAAACTCATACTATGGGTGGTGACTTTTCAGGAAAGAACCAAGATTGTTCTAAAGGAATTTATGCATT  941
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGTGGAAAAACTCATACTATGGGTGGTGACTTTTCAGGAAAGAACCAAGATTGTTCTAAAGGAATTTATGCATT  962

Query  942  AGCAGCTCGAGATGTCTTTTTAATGCTAAAGAAGCCAAACTATAAGAAGCTAGAACTTCAAGTATATGCAACCT  1015
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGCAGCTCGAGATGTCTTTTTAATGCTAAAGAAGCCAAACTATAAGAAGCTAGAACTTCAAGTATATGCAACCT  1036

Query 1016  TCTTTGAAATTTATAGTGGAAAGGTGTTTGACTTGCTAAACAGGAAAACAAAATTAAGAGTTCTAGAAGATGGA  1089
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCTTTGAAATTTATAGTGGAAAGGTGTTTGACTTGCTAAACAGGAAAACAAAATTAAGAGTTCTAGAAGATGGA  1110

Query 1090  AAACAGCAGGTTCAAGTGGTGGGATTACAGGAACGGGAGGTCAAATGTGTTGAAGATGTACTGAAACTCATTGA  1163
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAACAGCAGGTTCAAGTGGTGGGATTACAGGAACGGGAGGTCAAATGTGTTGAAGATGTACTGAAACTCATTGA  1184

Query 1164  CATAGGCAACAGTTGCAGAACATCCGGTCAAACATCTGCAAATGCACATTCATCTCGGAGCCATGCAGTGTTTC  1237
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CATAGGCAACAGTTGCAGAACATCCGGTCAAACATCTGCAAATGCACATTCATCTCGGAGCCATGCAGTGTTTC  1258

Query 1238  AGATTATTCTTAGAAGGAAAGGAAAACTACATGGCAAATTTTCTCTCATTGATTTGGCTGGAAATGAAAGAGGA  1311
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGATTATTCTTAGAAGGAAAGGAAAACTACATGGCAAATTTTCTCTCATTGATTTGGCTGGAAATGAAAGAGGA  1332

Query 1312  GCTGATACTTCCAGTGCGGACAGGCAAACTAGGCTTGAAGGTGCTGAAATTAATAAAAGCCTTTTAGCACTCAA  1385
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCTGATACTTCCAGTGCGGACAGGCAAACTAGGCTTGAAGGTGCTGAAATTAATAAAAGCCTTTTAGCACTCAA  1406

Query 1386  GGAGTGCATCAGAGCCTTAGGTAGAAATAAACCTCATACTCCTTTCCGTGCAAGTAAACTCACTCAGGTGTTAA  1459
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGAGTGCATCAGAGCCTTAGGTAGAAATAAACCTCATACTCCTTTCCGTGCAAGTAAACTCACTCAGGTGTTAA  1480

Query 1460  GAGATTCTTTCATAGGTGAAAACTCTCGTACCTGCATGATTGCCACAATCTCTCCAGGAATGGCATCCTGTGAA  1533
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GAGATTCTTTCATAGGTGAAAACTCTCGTACCTGCATGATTGCCACAATCTCTCCAGGAATGGCATCCTGTGAA  1554

Query 1534  AATACTCTTAATACATTAAGATATGCAAATAGGGTCAAAGAATTGACTGTAGATCCAACTGCTGCTGGTGATGT  1607
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AATACTCTTAATACATTAAGATATGCAAATAGGGTCAAAGAATTGACTGTAGATCCAACTGCTGCTGGTGATGT  1628

Query 1608  TCGTCCAATAATGCACCATCCACCAAACCAGATTGATGACTTAGAGACACAGTGGGGTGTGGGGAGTTCCCCTC  1681
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TCGTCCAATAATGCACCATCCACCAAACCAGATTGATGACTTAGAGACACAGTGGGGTGTGGGGAGTTCCCCTC  1702

Query 1682  AGAGAGATGATCTAAAACTTCTTTGTGAACAAAATGAAGAAGAAGTCTCTCCACAGTTGTTTACTTTCCACGAA  1755
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AGAGAGATGATCTAAAACTTCTTTGTGAACAAAATGAAGAAGAAGTCTCTCCACAGTTGTTTACTTTCCACGAA  1776

Query 1756  GCTGTTTCACAAATGGTAGAAATGGAAGAACAAGTTGTAGAAGATCACAGGGCAGTGTTCCAGGAATCTATTCG  1829
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GCTGTTTCACAAATGGTAGAAATGGAAGAACAAGTTGTAGAAGATCACAGGGCAGTGTTCCAGGAATCTATTCG  1850

Query 1830  GTGGTTAGAAGATGAAAAGGCCCTCTTAGAGATGACTGAAGAAGTAGATTATGATGTCGATTCATATGCTACAC  1903
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GTGGTTAGAAGATGAAAAGGCCCTCTTAGAGATGACTGAAGAAGTAGATTATGATGTCGATTCATATGCTACAC  1924

Query 1904  AACTTGAAGCTATTCTTGAGCAAAAAATAGACATTTTAACTGAACTGCGGGATAAAGTGAAATCTTTCCGTGCA  1977
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AACTTGAAGCTATTCTTGAGCAAAAAATAGACATTTTAACTGAACTGCGGGATAAAGTGAAATCTTTCCGTGCA  1998

Query 1978  GCTCTACAAGAGGAGGAACAAGCCAGCAAGCAAATCAACCCGAAGAGACCCCGTGCCCTT  2037
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GCTCTACAAGAGGAGGAACAAGCCAGCAAGCAAATCAACCCGAAGAGACCCCGTGCCCTT  2058