Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000474959
• Subject: XM_011243432.2
• Aligned Length: 2487
• Identities: 1869
• Gaps: 285

Alignment

Query    1  ATGTACCCCCAGGGAAGGCACCCGACCCCGCTCCAGTCCGGCCAGCCCTTCAAGTTCTCGATCTTGGAGATCTG  74
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||..|..||||.|||||
Sbjct    1  ATGTACCCTCAGGGAAGGCACCCGACCCCGCTGCAGTCTGGCCAGCCTTTCAAGTTCTCAGTACTGGAAATCTG  74

Query   75  CGACCGCATCAAAGAAGAATTCCAGTTTCTTCAGGCTCAATACCACAGCCTCAAGCTAGAATGTGAGAAGCTGG  148
            .|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGACCGGATCAAAGAGGAATTCCAGTTTCTTCAAGCTCAGTACCACAGCCTCAAGCTAGAATGTGAGAAGCTGG  148

Query  149  CCAGCGAGAAGACGGAAATGCAGCGACATTATGTCATGTATTATGAGATGTCGTACGGGCTCAACATTGAAATG  222
            |||||||||||||.||||||||..|.||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||
Sbjct  149  CCAGCGAGAAGACAGAAATGCAAAGGCATTATGTGATGTACTACGAGATGTCCTACGGACTCAACATTGAGATG  222

Query  223  CATAAGCAGGCGGAGATTGTGAAGCGTCTGAGCGGTATCTGCGCTCAGATTATCCCCTTCCTGACCCAGGAGCA  296
            |||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.|..|||||.||.|||||..||||.|||||.||.||||||||
Sbjct  223  CATAAACAGGCTGAGATTGTGAAACGCCTCAGTGCGATCTGTGCCCAGATGGTCCCGTTCCTCACTCAGGAGCA  296

Query  297  TCAGCAGCAGGTGCTCCAGGCCGTAGAACGCGCCAAGCAGGTCACCGTGGGGGAGCTGAACAGCCTCATCGGGC  370
            |||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||.|.||||
Sbjct  297  TCAGCAGCAGGTGCTCCAGGCTGTGGACCGAGCCAAGCAGGTGACCGTGGGGGAACTGAACAGCCTCCTGGGGC  370

Query  371  AG------CAGCTCCAGCCGCTGTCCCACCACGCACCCCCTGTGCCCCTCACCCCCCGCCCAGCCGGGCTGGTG  438
            ||      |||||||||||||||||   ||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct  371  AGCAGAATCAGCTCCAGCCGCTGTC---CCACGCACCCCCCGTGCCTCTCACCCCGCGCCCAGCCGGCCTGGTG  441

Query  439  GGCGGCAGTGCTACGGGGCTGCTTGCTCTGTCTGGAGCCCTGGCTGCCCAGGCTCAGCTGGCGGCGGCTGTCAA  512
            ||.|.|.|.||.||.||||||||.||.||.|||||.||.||||||||.|||||.|||||||.|||.||.||.||
Sbjct  442  GGTGCCGGGGCCACTGGGCTGCTGGCCCTATCTGGGGCACTGGCTGCGCAGGCCCAGCTGGTGGCTGCCGTAAA  515

Query  513  GGAGGACCGTGCGGGCGTGGAGGCCGAGGGGTCCAGAGTGGAGAGAGCCCCGAGCAGGAGTGCATCTCCCTCGC  586
            |||.|||||||.|||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||..|.|||||||||.|.||.||.||.|
Sbjct  516  GGAAGACCGTGTGGGTGTGGACGCCGAGGGGTCCAGAGTGGACAGAGCTGCCAGCAGGAGTTCTTCCCCGTCTC  589

Query  587  CCCCTGAGAGTCTCGTGGAGGAGGAGCGACCGAGTGGCCCTGGTGGTGGCGGGA---AGCAGAGAGCAGATGAG  657
            |||||||||||||.|||||.|||||.|..||.||..|||..||.||..|.||||   ||||||||||.||.||.
Sbjct  590  CCCCTGAGAGTCTGGTGGAAGAGGACCATCCCAGCAGCCGAGGCGGCAGTGGGAAACAGCAGAGAGCTGAAGAC  663

Query  658  AAGGAGCCATCAGGACCTTATGAAAGCGACGAAGACAAGAGTGATTACAATCTGGTGGTGGACGAGGACCAACC  731
            |||||.|..|||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  664  AAGGATCTGTCAGGGCCTTATGACAGTGAGGAAGACAAGAGTGACTATAACCTGGTAGTGGATGAGGACCAACC  737

Query  732  CTCAGAGCCCCCCAGCCCGGCTACCACCCCCTGCGGAAAGGTACCCATCTGCATTCCTGCCCGTCGGGACCTGG  805
            .|||||||||||||||||.|..||||||||.||.||.||||..|||.||||||||||||||||..|||||||..
Sbjct  738  GTCAGAGCCCCCCAGCCCTGTGACCACCCCTTGTGGGAAGGCGCCCCTCTGCATTCCTGCCCGCAGGGACCTCA  811

Query  806  TGGACAGTCCAGCCTCCTTGGCCTCTAGCCTTGGCTCACCGCTGCCTAGAGCCAAGGAGCTCAT---CCTGAAT  876
            ..|||||||||||||||||||||||.||..|.||||||||.||.||.|||..|||.||   |||   ||||||.
Sbjct  812  CAGACAGTCCAGCCTCCTTGGCCTCCAGTTTGGGCTCACCACTCCCCAGAAGCAAAGA---CATAGCCCTGAAC  882

Query  877  GACCTTCCCGCCAGCACTCCTGCCTCCAAATCCTGTGACTCCTCCCCGCCCCAGGACGCTTCCACCCCCGGGCC  950
            ||.||||||.|..|||||||||||||||..||.||||...||||.||.|||||||||.|.||||||||.|||||
Sbjct  883  GATCTTCCCACAGGCACTCCTGCCTCCAGGTCATGTGGTACCTCTCCACCCCAGGACTCGTCCACCCCGGGGCC  956

Query  951  CAGCTCGGCCAGTCACCTCTGCCAGCTTGCTGCCAAGCCAGCACCTTCCACGGACAGCGTCGCCCTGAGGAGCC  1024
            ||||||.||||||||||||||||||||.||.||..||||.|||.|..||||.||||||.|||||||||||||.|
Sbjct  957  CAGCTCAGCCAGTCACCTCTGCCAGCTGGCGGCTCAGCCGGCAGCACCCACAGACAGCATCGCCCTGAGGAGTC  1030

Query 1025  CCCTGACTCTGTCCAGTCCCTTCACCACGTCCTTCAGCCTGGGCTCCCACAGCACTCTCAACGGAGACCTCTCC  1098
            |||||||..|||||||.||.||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||
Sbjct 1031  CCCTGACCTTGTCCAGCCCTTTCACCTCATCCTTCAGCCTGGGCTCCCACAGCACCCTCAATGGGGACCTCTCC  1104

Query 1099  GTGCCCAGCTCCTACGTCAGCCTCCACCTGTCCCCCCAGGTCAGCAGCTCTGTGGTGTACGGACGCTCCCCCGT  1172
            .||||..|||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||..|
Sbjct 1105  ATGCCTGGCTCCTATGTCGGCCTCCACCTGTCCCCCCAGGTCAGCAGCTCTGTCGTGTATGGACGCTCACCTCT  1178

Query 1173  ---GATGGCATTTGAGTCTCATCCCCATCTCCGAGGGTCATCCGTCTCTTCCTCCCTACCCAGCATCCCTGGGG  1243
               ||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||.||.||      ||||.|.||..|||||||||.||
Sbjct 1179  GCAGATGGCATTTGAATCGCACCCCCATCTCCGAGGCTCGTCTGT------CTCCTTGCCTGGCATCCCTGTGG  1246

Query 1244  GAAAGCCGGCCTACTCCTTCCACGTGTCTGCGGACGGGCAGATGCAGCCGGTTCCCTTCCCCTCGGATGCACTG  1317
            ..||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||
Sbjct 1247  CTAAGCCGGCTTACTCCTTCCACGTGTCTGCGGATGGCCAGATGCAGCCTGTGCCCTTCCCGTCTGATGCTCTG  1320

Query 1318  GTAGGCGCGGGCATCCCGCGGCACGCCCGGCAGCTGCACACGCTGGCCCATGGCGAGGTGGTCTGCGCGGTCAC  1391
            ||||||.|.||||||||.||.|||||..|||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||.||.|||||
Sbjct 1321  GTAGGCACAGGCATCCCTCGCCACGCAAGGCAGCTACACACGCTGGCCCACGGTGAGGTGGTGTGTGCCGTCAC  1394

Query 1392  CATCAGCGGCTCCACACAGCATGTGTACACGGGCGGCAAGGGCTGTGTGAAGGTGTGGGACGTGGGCCAGCCTG  1465
            |||||||.|||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1395  CATCAGCAGCTCCACACAGCACGTGTACACAGGCGGCAAAGGATGCGTGAAGGTGTGGGACGTGGGCCAGCCGG  1468

Query 1466  GGGCCAAGACGCCCGTGGCCCAGCTCGACTGCCTGAACCGAGACAACTACATTCGTTCCTGCAAGTTGCTGCCG  1539
            |...||||||.||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||.|||||||.
Sbjct 1469  GTAGCAAGACCCCTGTGGCACAGCTGGATTGCCTGAACCGAGACAACTACATCCGCTCCTGCAAGCTGCTGCCC  1542

Query 1540  GATGGCCGGAGTCTGATCGTGGGCGGTGAGGCCAGCACCTTGTCCATTTGGGACCTGGCGGCGCCCACCCCCCG  1613
            ||.||.|.|||.|||||.||.||.||.||||||||.|||.|||||||||||||||||||.||.|||||.||.||
Sbjct 1543  GACGGGCAGAGCCTGATTGTAGGTGGCGAGGCCAGTACCCTGTCCATTTGGGACCTGGCAGCACCCACACCACG  1616

Query 1614  TATCAAGGCCGAGCTGACTTCCTCAGCCCCAGCCTGCTACGCCCTGGCCGTCAGCCCCGACGCCAAGGTTTGCT  1687
            .|||||.||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||
Sbjct 1617  GATCAAAGCAGAGCTGACTTCGTCTGCCCCGGCCTGCTATGCTCTGGCCGTCAGTCCGGACGCCAAGGTCTGCT  1690

Query 1688  TCTCCTGCTGCAGCGATGGCAACATTGTGGTCTGGGACCTGCAGAATCAGACTATGGTCAGGCAGTTCCAGGGC  1761
            ||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||.|.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1691  TCTCCTGCTGCAGCGACGGTAACATCGTGGTCTGGGACCTGCAGAACCAGGCCATGGTCAGACAGTTCCAGGGC  1764

Query 1762  CACACGGACGGCGCCAGCTGCATTGATATTTCCGATTACGGCACTCGGCTCTGGACAGGGGGCCTGGACAACAC  1835
            |||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1765  CACACGGACGGGGCCAGCTGCATCGACATATCAGACTACGGGACCCGGCTGTGGACTGGGGGCCTGGACAACAC  1838

Query 1836  GGTGCGCTGCTGGGACCTGCGGGAGGGCCGCCAGCTGCAGCAGCATGACTTCAGCTCCCAGATTTTCTCCCTGG  1909
            .||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||..|||
Sbjct 1839  TGTGCGCTGCTGGGACCTGCGCGAGGGCCGCCAGCTTCAGCAGCATGACTTCAGTTCCCAGATTTTCTCATTGG  1912

Query 1910  GCCACTGCCCTAACCAGGACTGGCTGGCGGTCGGAATGGAGAGTAGCAACGTGGAGATCCTGCACGTCCGCAAG  1983
            |||||||.||.||.|||||||||.||||.||.||.||||||||.|||.||||||||.|||||||.||.||||||
Sbjct 1913  GCCACTGTCCCAATCAGGACTGGTTGGCTGTGGGGATGGAGAGCAGCCACGTGGAGGTCCTGCATGTGCGCAAG  1986

Query 1984  CCGGAGAAATACCAGCTGCACCTCCACGAGAGCTGCGTGCTGTCCCTGAAGTTTGCCTCCTGCGGACGGTGGTT  2057
            ||.|||||.||||||||.|.||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||
Sbjct 1987  CCTGAGAAGTACCAGCTCCGCCTCCATGAGAGCTGCGTGCTGTCACTCAAGTTCGCTTCCTGTGGACGCTGGTT  2060

Query 2058  TGTGAGCACCGGGAAGGACAACCTGCTCAACGCCTGGAGGACGCCGTACGGGGCCAGCATTTTCCAGTCCA---  2128
            |||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||.|||..||   
Sbjct 2061  TGTGAGCACAGGCAAGGACAACCTGCTCAATGCCTGGAGGACACCCTATGGGGCCAGCATTTTTCAGGTCACCT  2134

Query 2129  ---------------------AGGAGTCG--------TCCTCAGTCCTGAGTTGTGACATCTCC----------  2163
                                 .|||..||        |.||||..||||..|||      ||||          
Sbjct 2135  GCCCTGGATGGCTGGCCACTCGGGACACGGGCCCCTCTGCTCATACCTGGCTTG------CTCCCTCCTGGCTG  2202

Query 2164  ---------------------AGAAATAACAAATACATC----------------GTG--------------AC  2186
                                 |.|.||||||.||..|||                |||              ||
Sbjct 2203  GGTGGGGCTGGGGCACTGGGGAAATATAACACATTTATCAACTTGCTTTCTTTCTGTGTGTGTGTGAAGCGTAC  2276

Query 2187  AGGCTCGGGGGACAAGAAGGCC-ACCGTGTATGAG--------------------------------GTGG-TC  2226
            |||  .|.|||||       || ||.|.||||.||                                |||| ||
Sbjct 2277  AGG--TGAGGGAC-------CCGACTGGGTATCAGCCTTCATTTCTCTTTGCCCCAATTTTCAGAGTGTGGATC  2341

Query 2227  T-AC----------------------------------------------------------------------  2229
            | ||                                                                      
Sbjct 2342  TCACTAATGAGCCTCACAGACAGGTCAACATGCCCCAGGAATCCTCCTGTCTCTACCTACAGAGCTGGATCAGG  2415

Query 2230  ---------------------------------------------  2229
                                                         
Sbjct 2416  GATTTACACTCACTCCTTATCCTGCCTGGTGTGGGCTTTACCAAC  2460